快慢羽鸡的翼羽长度与相关基因表达分析

PRLR和SPEF2基因重复是鸡快慢羽表型的分子基础，为探究羽型的分子调控机制，本试验量测了19和21胚龄（E）的快慢羽坝上长尾鸡和太行鸡主翼羽和覆主翼羽长度，采用RT-qPCR检测鸡胚翅羽PRLR、SPEF2、BMP2和FST的表达变化。结果显示19E时坝上长尾慢羽鸡主翼羽比覆主翼羽长1.35 mm(P<0.05)，慢羽表型不明显；而此时太行慢羽鸡主翼羽长于覆主翼羽0.42 mm(P>0.05)，慢羽表型明显。PRLR和SPEF2在2个品种慢羽鸡的表达均显著高于快羽鸡（P<0.05），分别在1.4和2.0倍以上；SPEF2在21E坝上长尾快慢羽鸡表达均显著高于19E(P<0.05)。BMP2表达在坝上长尾慢羽鸡中显著高于快羽鸡（P<0.05），而在不同胚龄太行快慢羽鸡中则无显著差异（P>0.05）;FST在19E坝上长尾慢羽鸡中表达量最低（P<0.05），而太行鸡19E的慢羽鸡表达量最高（P<0.05）。综上，太行鸡在19E已表现慢羽表型，而坝上长尾鸡的慢羽表型在21E才呈现；推测PRLR和SPEF2在慢羽翅羽毛囊中的高表达，以及BMP2和FST在太行鸡和坝上长尾鸡翅羽毛囊中的差异表达，参与慢羽表型的形成。本试验的研究发现为阐明鸡羽型形成的分子调控提供理论依据。     

番鸭MC1R基因多态性与羽毛相关性分析

为探讨黑素皮质素受体1(melanocortin-1 receptor,简称MC1R)基因对番鸭羽色的影响,采用PCR和直接测序法对番鸭MC1R基因编码区进行多态性分析,比较不同羽色番鸭群体遗传参数和基因型分布卡方检验。结果表明:在番鸭MC1R基因编码区发现G274A、G279A、C485A突变,使第92处氨基酸由谷氨酸(E)变为赖氨酸(K),第162处的氨基酸由苏氨酸(T)变为天冬氨酸(N)。通过各个位点不同羽色番鸭群体基因型、等位基因频率的比较分析,同时结合不同群体间基因型分布卡方检测,发现在第279处的G-A突变中白羽番鸭仅有GG型,而其他3个携带大量黑羽的番鸭群体都以GA、AA型存在;同时全白番鸭与其他3个番鸭群体之间卡方值最大,推测此位点对番鸭的羽色影响较大。而从其他2个突变位点的数据分析推测,它们对番鸭的羽色几乎没有影响。研究结果为开展番鸭羽色研究和育种工作奠定了基础。     

不同羽色及羽速坝上长尾鸡产蛋性能比较

本试验旨在研究河北省优秀地方家禽品种资源坝上长尾鸡不同羽色群体及不同羽速群体在30~45周龄间产蛋性能的差异。研究结果表明,在快羽中麻羽具有产蛋率高的优势,在慢羽中白羽和黑羽更具产蛋优势;快、慢羽群体中相同羽色的产蛋率变化趋势也不尽相同,说明快、慢羽群体间存在差异。在后期突发腹泻期间,在不同羽色间,白羽鸡比黑羽鸡、麻羽鸡产蛋率下降快。在不同羽速间,慢羽鸡产蛋率下降较快,快羽鸡产蛋率有较低的升高,产蛋率差距缩小。在抗病能力方面,白羽比麻羽、黑羽性能差,快羽比慢羽性能差。     

固原鸡不同群体AMPD1基因遗传特性的研究

本研究以鸡肌苷酸合成代谢相关酶腺苷一磷酸脱氨酶(AMPD1)基因为候选基因,以宁夏地方品种固原鸡(白羽、麻羽、红羽),以及引进肉鸡品种AA鸡和蛋用品种罗曼鸡为研究对象,利用PCR-SCCP技术对AMPD1基因多态性进行了检测,并对其基因型、基因频率以及遗传特性进行了相关的统计.研究结果表明:AMPD1基因有2个等位基因(A、B),3种基因型(AA、AB、BB).固原鸡各品系BB基因型频率均高于AA鸡和罗曼鸡,尤其以固原鸡红羽为最高(0.822 2),与AA鸡之间存在着极显著的差异(P<0.01).对AMPD1基因的遗传特性统计分析结果表明,在所检测的几个品种鸡中杂合度均小于0.5.在多态信息含量中,固原鸡白羽、红羽在AMPD1基因多态位点上属于低度多态(PIC<0.25),其他各品种各多态位点多态信息含量(PIC)均处于中度多态(0.5>PIC>0.25).本研究结果将为宁夏地方品种固原鸡开发利用及肉质品质的改良提供重要的理论根据.     

安徽两个地方鸡品种遗传多样性的微卫星DNA分析

利用29个微卫星DNA标记对两个安徽地方鸡品种进行遗传多样性分析,评估品种内的遗传变异和品种间的遗传分化.在29个微卫星位点共检测到210个等位基因,每个位点的等位基因数从2到21不等,所有位点平均的期望杂合度和PIC值分别为0.6214和0.59.淮南麻黄鸡和皖南三黄鸡29个微卫星位点平均有效等位基因数分别为5.55和6.38,平均基因杂合度为0.6194和0.6442,群体分化系数为4.8%,两个鸡品种间的Reynolds遗传距离和Nm分别为0.0513和4.7500.两个安徽地方鸡品种均表现出较高的群体杂合度和丰富的遗传多样性.     

鸭色素合成相关基因TYR外显子1单核苷酸多态性及其与羽色性状相关性分析

【目的】旨在探究鸭羽色群体中TYR外显子1单核苷酸多态性与羽色性状的相关性。【方法】以樱桃谷鸭D系与连城白鸭杂交后代F1自群繁育得到的四个羽色群体为实验样本,对其进行采血提取DNA并记录羽色性状,扩增得到TYR基因外显子1序列,送至测序并分析其SNP位点分布与羽色性状的相关性。【结果】结果表明:鸭TYR基因外显子1长843 bp,编码281个氨基酸,核苷酸序列与鸡相似性为99%,A+T共417个碱基(49.46%),C+G共438个碱基(51.95%)。A+T含量与G+C含量大致相同;比对外显子1序列后发现,存在1个新发现的SNP位点(507 T→C),属无义突变,该位点存在3种基因型(TT CT CC);通过卡方标准检验,表明基因型分布在各个羽色群体中分布差异不显著;得到羽色性状分布与C基因频率(P=0.07)、CC基因型频率的相关系数(P=0.055),可知羽色性状分布与C基因型频率存在一致性,但不显著。【结论】TYR可能并非控制羽色的主效基因,但它和羽色存在相关性。     

4个鸡品种VIPR-1基因遗传多样性分析

采用PCR-RFLP方法,对茶花鸡、泰和丝羽乌骨鸡、固始鸡和隐性白洛克鸡VIPR-1基因的20个位点的遗传多样性进行研究。结果表明,20个位点的基因频率在这4个群体中分布差异很大,绝大部分的SNP最小等位基因频率均大于5%。独立χ2分析显示,除位点C1704887T外,其他19个位点基因型分布在不同鸡品种间存在显著或极显著差异(P0.05、P0.01)。茶花鸡、泰和丝羽乌骨鸡、固始鸡与隐性白洛克鸡4个群体的平均多样性分别为0.3658(±0.0238)、0.3609(±0.0315)、0.3836(±0.0299)和0.3598(±0.0401),显著性检验差异均不显著。单倍型分析发现,在所研究的区域,泰和丝羽乌骨鸡有2个单倍型块,固始鸡有4个单倍型块,茶花鸡和隐性白洛克鸡有5个单倍型块。研究发现鸡VIPR-1基因中5个位点,单倍型块C1660256T～A1660309G以及G1680779T～C1693306T的12kb区域可能与早期生长速度有关。     

山东地方鸡与海兰褐鸡蛋品质的比较研究

[目的]比较山东地方鸡品种与高产蛋鸡品种之间蛋品质的差异。[方法]选取山东省3个地方鸡品种济宁百日鸡、汶上芦花鸡、莱芜黑鸡和引进的高产蛋鸡海兰褐鸡,进行蛋品质的比较研究。[结果]山东地方鸡的蛋黄比例、蛋形指数和蛋壳强度均显著高于海兰褐鸡（P〈0.05）,而平均蛋重和哈氏单位显著低于海兰褐鸡（P〈0.05）。山东地方鸡鸡蛋内的人体必需氨基酸以及亚油酸含量都显著高于海兰褐鸡（P〈0.05）,但维生素A和维生素E的含量以及总氨基酸和脂肪酸含量在地方品种与海兰褐鸡之间差异不显著（P〉0.05）。[结论]该试验研究了不同品种鸡蛋品质的差异,为今后蛋鸡品种的改良提供了参考。     

鸡IGFIR基因遗传多样性分析

采用PCR-RFLP方法,对红色原鸡、杏花鸡、隐性白洛克鸡和丝羽乌骨鸡的IGFIR基因的18个位点的遗传多样性进行研究.结果表明,18个位点的基因频率在这4个群体中的分布差异很大,绝大部分的SNP最小等位基因频率均大于5％;独立x2分析显示,除了位点G17445596A、T17416994G、A17313488G和C17337042G,其他14个位点的基因型分布在不同鸡品种间存在显著或极显著差异(P＜0.05和P＜0.01);红色原鸡、杏花鸡、隐性白洛克鸡和丝羽乌骨鸡4个群体之间的平均多样性差异均不显著.单倍型分析发现,在所研究的区域,红色原鸡、杏花鸡、隐性白洛克鸡、丝羽乌骨鸡等在鸡IGFIR基因内分别划分为5、4、4、3个单倍型块;每个块内2～3个单倍型就可以代表整个块90％以上的遗传信息.此外,还发现鸡IGFIR基因中9个SNP位点可能与复杂经济性状有关,这为以后在经济性状上对该基因的进一步研究提供了参考依据.     

6个地方鸡种羽毛性状遗传的研究

 以丝羽乌骨鸡（S）、仙居鸡（X）、固始鸡（G）、萧山鸡（XIS）、北京油鸡（Y）、狼山鸡（L）6个地方鸡种为试验素材,通过品种间的正反交试验、回交试验、横交试验,观测羽型性状、羽色性状、羽速性状在不同组合下产生的F1和F2代中的表现和分离比例,分析各性状遗传规律。结果表明：羽型性状受常染色体基因H/h控制,片状羽型对丝状羽型为显性,片状羽型在仙居鸡、固始鸡、萧山鸡、北京油鸡、狼山鸡群体中均为显性纯合,遗传符合孟德尔遗传规律,观测值与理论值相一致（P>0.05）;狼山鸡的黑羽,北京油鸡的红羽和萧山鸡、仙居鸡、固始鸡的黄羽对丝羽乌骨鸡隐性白羽的遗传方式是完全显性遗传;各鸡种具有独特的羽速种质特性,丝羽乌骨鸡、仙居鸡为快羽型,固始鸡、北京油鸡、萧山鸡为慢羽型,狼山鸡为快慢羽混合型,伴性快慢羽基因（k/K）在6个地方鸡种中遗传稳定,符合伴性遗传规律,观测值与理论值相一致（P>0.05）。      

安徽省4个地方鸡品种OCX-32基因外显子4的多态性及其与淮南麻黄鸡蛋品质的相关分析

【目的】研究OCX-32基因在淮南麻黄鸡、五华鸡、淮北麻鸡和皖南三黄鸡等4个安徽省地方鸡品种中的遗传多态性及OCX-32基因与淮南麻黄鸡蛋品质的相关性,为揭示这些群体的遗传特征提供基础数据。【方法】采用PCR-RFLP技术,对淮南麻黄鸡、五华鸡、淮北麻鸡和皖南三黄鸡4个地方鸡品种的OCX-32基因外显子4进行遗传多态性研究,并对外显子4遗传多态性与淮南麻黄鸡蛋品质的相关性进行分析。【结果】OCX-32基因外显子4存在A494C1个单核苷酸多态性位点。该位点在安徽省4个地方鸡品种中的基因频率和基因型频率分布差异不大,C等位基因频率较高。4个地方鸡品种群体在A494C位点处于Hardy-Weinberg平衡状态,均表现为中度多态。相关分析结果表明,OCX-32基因外显子4的A494C位点基因多态性与淮南麻黄鸡的开产蛋质量、30周龄蛋质量、蛋白高度和哈氏单位显著相关(P0.05);CC基因型的开产蛋质量和30周龄蛋质量显著高于AA基因型,AA和CC基因型的蛋白高度显著高于AC基因,AA基因型的哈氏单位显著高于AC基因型(P0.05)。【结论】OCX-32基因与淮南麻黄鸡蛋品质存在一定的相关性,可作为发掘淮南麻黄鸡蛋品质的分子育种标记。     

太行鸡、海兰灰蛋鸡生长期消化道主要酶系变化规律比较

以1日龄的太行鸡和海兰灰蛋鸡为对象,测试第5、9、14、21、28、35、42、49、56、63、77、91天十二指肠和空肠内的淀粉酶、脂肪酶、胰蛋白酶及盲肠内的纤维素酶活性,探讨太行鸡与海兰灰蛋鸡营养物质利用率差异的原因以及消化道酶的变化规律。结果表明,太行鸡粗脂肪、粗蛋白、Ca、P等营养物质消化率分别比海兰灰蛋鸡低2.50%、8.99%、8.40%和10.90%。太行鸡和海兰灰蛋鸡消化道酶的发育规律基本一致,消化道内各酶随日龄增长逐渐增加,达到峰值后趋于稳定。但各酶活性达到峰值的时间不同。太行鸡和海兰灰蛋鸡十二指肠淀粉酶、脂肪酶、胰蛋白酶活性达到峰值的时间分别为第35、35、42天和第35、35、42天,空肠则分别为第21、35、35天和第28、35、35天;盲肠内纤维素酶活性达峰值时间为第49、56天。太行鸡十二指肠和空肠淀粉酶、脂肪酶活性均比海兰灰蛋鸡低,胰蛋白酶活性比海兰灰蛋鸡高,盲肠纤维素酶活性比海兰灰蛋鸡高。太行鸡、海兰灰蛋鸡空肠内淀粉酶、脂肪酯和胰蛋白酶活性比十二指肠内相应的酶高。     

鸡Lpin1基因3'-UTR遗传变异及其对miRNA结合位点的潜在效应

[目的]研究鸡Lpin1基因3'-UTR遗传变异、单倍型及其在品种间的分布,并预测这些变异对miRNA结合位点的潜在效应.[方法]根据鸡Lpin1基因组序列(GenBank登录号:NC_006090)设计一对特异性引物,采用PCR直接测序结合克隆测序的方法,进行鸡Lpin1基因3'-UTR及其邻近外显子在品种间的遗传变异/单倍型分析.[结果]①从6个品种中发现了8个变异位点,包含两个插入/缺失变异.这些变异均位于鸡Lpin1基因的3'-UTR,3'-UTR的变异频率为17SNPs/kb;②在鸡Lpin1基因3'-UTR区域,从固始鸡,卢氏绿壳蛋鸡中分别检测到7个变异位点,未检测到河南斗鸡品种内的变异;③用次要等位基因频率≥5％的6个变异位点(g.11A＞T,g.77C＞G,g.108_109delinsG,g.110_111delinsG,g.270A＞G和g.348G＞T)进行单倍型的构建和分析,从6个品种鸡中共检测到6种单倍型,其中P1和P4单倍型是群体的优势单倍型,频率均大于30％,河南斗鸡仅包含一种单倍型;④g.77C＞G变异可引起多个miRNA结合位点的增加、丢失.[结论]鸡Lpin1基因3'-UTR具有丰富的变异,3'-UTR变异位点/单倍型在品种间的分布存在明显的差异.     

仿土黄羽广源肉鸡三系配套杂交的羽色遗传原理及对江-13隐性白羽系的测交选择

 为了利用江-13白洛克品种鸡的优良肉用性状，用以和优质地方黄羽鸡种构成优质高产的肉鸡繁育体系——广源鸡繁育体系，使商品肉鸡具有与广东地方鸡羽色相似的浅黄羽色，参加杂交的江-13白洛克鸡必须是隐性白羽，而且基因型为iiccOObbeess最为理想。通过用棕黄羽的海红黄鸡与江-13白洛克鸡进行正反交试验，弄清了控制江-13白洛克鸡白羽的基因型有iiccOOAAPP和IiccOOAAPP两种，此外还带有B、E、S等基因。在此基础上选出了符合育种要求的、隐性白羽率达95%以上的小群体，并扩群在生产中使用。隐性白羽江-13白洛克品系与棕黄羽色的海红黄鸡杂交，后代的羽色接近浅黄色，可见白羽还具有冲淡羽色素的作用。单交种母鸡与杏花鸡杂交，使所得商品肉鸡杏花型广源鸡羽色近似杏花土种鸡，符合消费者的要求。     

鸡Lpin1基因3′-UTR遗传变异及其对miRNA结合位点的潜在效应

【目的】研究鸡Lpin1基因3′-UTR遗传变异/单倍型及其在品种间的分布，并预测这些变异对miRNA结合位点的潜在效应。【方法】根据鸡Lpin1基因组序列（GenBank登录号：NC_006090）设计一对特异性引物，采用PCR直接测序结合克隆测序的方法，进行鸡Lpin1基因3′-UTR及其邻近外显子在品种间的遗传变异/单倍型分析。【结果】①从6个品种中发现了8个变异位点，包含两个插入/缺失变异。这些变异均位于鸡Lpin1基因的3′-UTR，3′-UTR的变异频率为17SNPs/kb；②在鸡Lpin1基因3′-UTR区域，从固始鸡、卢氏绿壳蛋鸡中分别检测到7个变异位点，未检测到河南斗鸡品种内的变异；③用次要等位基因频率≥5%的6个变异位点（g.11A＞T，g.77C＞G，g.108_109delinsG，g.110_111delinsG，g.270A＞G和g.348G＞T）进行单倍型的构建和分析，从6个品种鸡中共检测到6种单倍型，其中P1和P4单倍型是群体的优势单倍型，频率均大于30%，河南斗鸡仅包含一种单倍型；④g.77C＞G变异可引起多个miRNA结合位点的增加/丢失。【结论】鸡Lpin1基因3′-UTR具有丰富的变异，3′-UTR变异位点/单倍型在品种间的分布存在明显的差异。     

河北太行鸡不同群体含黄素单氧化酶3基因多态性检测

为了研究含黄素单氧化酶3(FMO3)基因T329S突变位点在河北太行鸡不同群体中的等位基因及基因型频率分布情况,采用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性分析方法(PCRRFLP)和DNA测序技术分别对赞皇、平山、唐县地区3个河北太行鸡群体FMO3基因及基因型频率进行检测。结果显示,平山地区太行鸡群体中未检测到SS型个体,而平山、唐县地区太行鸡群体中均有FMO3基因SS型个体;赞皇、平山、唐县3个太行鸡群体中T等位基因的频率分别为0.129 8、0.075 0、0.084 2,其频率均远低于等位基因A的频率。独立性卡方检验结果显示,不同群体间基因型频率分布差异不显著;经适合性卡方检验,赞皇、平山、唐县3个太行鸡群体卡方值分别为1.173 0(P0.05)、0.035 1(P0.05)、0.188 5(P0.05),说明该基因位点A→T碱基突变在3个群体中均处于Hardy-Weinberg平衡状态;通过分析3个不同群体遗传变异参数发现,3个太行鸡群体在该基因位点上均处于低度多态(PIC0.25)。以上结果表明,河北太行鸡群体中FMO3基因型频率较低,可以通过PCR-RFLP的方法予以剔除。     

贵州地方白羽鸡种MSTN基因SNP位点快速筛查及其蛋白功能预测

[目的]明确贵州地方白羽鸡种肌肉生长抑制素(MSTN)基因的多态性,筛选出改良白羽鸡肉质品质的分子遗传标记,为选择培育优良肉质鸡种提供参考依据.[方法]以兴义矮脚鸡白羽品系、罗曼蛋鸡及兴义矮脚鸡白羽品系与罗曼蛋鸡杂交的自交后代(F2)为研究对象,提取3个鸡种的血液基因组DNA构建DNA混合池,PCR扩增MSTN基因全部外显子序列,直接测序筛选SNP位点并进行生物信息学分析,探究SNP位点突变对MSTN基因mRNA二级结构及编码蛋白结构和功能的影响.[结果]在鸡MSTN基因第1外显子(Exon-1)筛查到6个SNPs位点,分别为G51A、A60G、G195C、A234G、C297T和C324T,且6个SNPs位点均为同义突变.在A234G位点处检测到兴义矮脚鸡白羽系和F2代存在多态性,但罗曼蛋鸡未发生变异;在C297T位点处检测到罗曼蛋鸡存在多态性,以C为优势等位基因,而兴义矮脚鸡白羽品系和F2代均未发生变异;G51A、G60A、G159C和C324T等4个SNPs位点在3个鸡种中均存在多态性.A234G位点突变对鸡MSTN基因mRNA二级结构稳定性无影响,G51A位点突变致使MSTN基因mRNA二级结构最小自由能降低但未改变其构象,A60G、G195C、C297T和C324T等4个SNPs位点突变均引起MSTN基因mRNA二级结构和最小自由能的改变.鸡MSTN基因编码蛋白为不稳定的脂溶性蛋白,存在信号肽,但不存在跨膜区域,其二级结构由无规则卷曲、β-折叠和α-螺旋组成,且以无规则卷曲占比最高.[结论]MSTN基因在贵州地方白羽鸡种中的多态性较丰富,其中A60G、G195C、C297T和C324T等4个SNPs位点突变会导致基因mRNA二级结构的构象发生改变,可作为改良白羽鸡肉质品质的分子遗传标记进一步研究.     

草原型柴鸡"坝上长尾鸡"

坝上长尾鸡属草原柴鸡类型,主产于河北省北部的坝上地区,主要分布在海拔1500￣1700米之间的河北省承德市丰宁县、围场县以及张家口坝上地区的张北、沽源、康保等县。该品种鸡是在当地自然和社会条件下经过长期选育形成的蛋用为主的蛋肉兼用型品种。坝上长尾鸡的突出特征是尾羽较长,公鸡有2￣3根大翘尾羽,长45厘米以上,最长者可达60厘米,母鸡尾羽上翘,主尾羽长约20￣25厘米,分两侧呈八字形,每侧8根。公鸡的尾羽为黑绿色,颈羽、肩羽、鞍羽为红色或金黄色,其他部分为黑色或杂色。也有的全身羽毛为芦花色。母鸡羽毛颜色可分为麻色、黑色、白色和…     

坝上长尾鸡的品种资源保护与开发利用途径

畜禽品种遗传资源是生物多样化的重要组成部分,也是经过长期进化而形成的宝贵资源财富,保护和利用好现有的畜禽品种遗传资源对现在和未来畜牧业的发展将带来新的生机和活力。坝上长尾鸡的品种资源现状坝上长尾鸡属于草原柴鸡的一个类群,主产于河北省北部的承德、张家口两市的坝上地区,承德市重点分布在丰宁县的万胜永草原、骆驼沟、鱼儿山,围场县的御道口、老窝铺、燕格柏等乡镇。张家口市主要分布在张北、沽源、康保等县。坝上长尾鸡是在当地自然环境和社会条件下经过劳动人民长期选育形成的蛋用为主蛋肉兼用型品种。目前,仅丰宁、围场两县…     

黑素皮质素受体4(MC4R)基因在5个地方鸡种中的遗传多态性分析

本试验采用PCR-SSCP和PCR-RFLP方法分析了黑素皮质素受体4(MC4R)基因在5个地方鸡种中的遗传多态性,结果在5个供试鸡群体中检测到两个突变位点。在NC_006089.4:g.54 CG位点中,CC基因型在莱芜黑鸡和琅琊鸡中均没有检测到,CG杂合型在汶上芦花鸡中表现为优势基因型,突变型GG基因型在其余4个群体中表现为优势基因型,等位基因G在所有供试群体中表现为优势等位基因。在NC_006089.4:g.315位点中,GT杂合型在汶上芦花鸡中表现为优势基因型,GG野生型在其余4个群体中表现为优势基因型,等位基因G在除汶上芦花鸡以外的4个群体中表现为优势等位基因。