乌骨鸡、珍珠鸡及其杂交后代线粒体DNA序列分析

骡鸡是乌骨鸡和珍珠鸡直接杂交的后代 ,但在遗传学上仍没有被证实。本实验分析了骡鸡、珍珠鸡和乌骨鸡共 5 9个个体的mtDNAD环部分序列 ,发现在同一对引物扩增时存在长度变异 ,乌骨鸡序列为 5 39bp ,珍珠鸡为4 98bp ,而骡鸡或同于珍珠鸡 ,或同于乌骨鸡。序列分析进一步支持骡鸡是乌骨鸡和珍珠鸡的远缘杂交后代     

白毛乌骨鸡ChIFN-β基因克隆与生物信息学分析

为研究白毛乌骨鸡β干扰素的生物学特性,利用RT-PCR技术扩增了白毛乌骨鸡肝脏β干扰素(ChIFN-β)基因,将其连接到pGEM-T Easy载体上进行转化,重组质粒PCR鉴定后进行序列测定,同时利用BLAST、SignalP 4.1 Server、TMHMM Server v.2.0和DNAStar等软件对ChIFN-β进行生物信息学分析。结果表明:ChIFN-β基因编码区长度为612 bp,编码203个氨基酸,分子量为23.686 ku,等电点为10.3;ChIFN-β与已报道的其它鸡的IFN-β氨基酸序列具有较高的同源性;白毛乌骨鸡ChIFN-β氨基酸序列和绿头鸭首先聚类,与其它动物的亲缘关系较远;ChIFN-β存在跨膜结构,为分泌蛋白,前26个氨基酸为信号肽序列;ChIFN-β蛋白具有干扰素αβ的匹配区域,同时含有干扰素αβ受体复合物两个跨膜亚基IFNAR-1和IFNAR-2的结合位点,预测ChIFN-β蛋白属于IFαβ超家族。研究结果为白毛乌骨鸡ChIFN-β基因的结构和功能研究提供了参考。     

12个地方鸡种肌肉脂肪酸相对含量比较及因子分析

试验旨在对12个地方鸡种肌肉脂肪酸相对含量比较及因子分析。文章基于前人研究结果对12个地方鸡种（白耳鸡、狼山鸡、萧山鸡、北京油鸡、乌骨鸡、余干黑鸡、崇仁麻鸡、三黄鸡、康乐鸡、藏鸡、武定鸡、大围山鸡）的营养成及肌肉脂肪酸含量进行分析。结果显示,三黄鸡的系水力、剪切力、pH值均优于萧山鸡、白耳鸡、北京油鸡。藏鸡肉的粗脂肪含量明显高于其他11个鸡种。三黄鸡、白耳鸡及藏鸡氨基酸营养价值较高。乌骨鸡的饱和脂肪酸相对含量最高（44.96%）,藏鸡的饱和脂肪酸相对含量最低（31.67%）。藏鸡的不饱和脂肪酸相对含量最高（68.22%）,狼山鸡和乌骨鸡不饱和脂肪酸相对含量最低（54.34%、54.43%）。主成分分析获得的前6个主成分可以解释全部变异的69.153%,第1、2、3主成分分别解释总变异的27.352%、25.371%、16.431%。基于主成分值的系统聚类图将12个地方鸡种归为4大类,余干黑鸡、三黄鸡、康乐鸡、崇仁麻鸡聚为一类,北京油鸡、藏鸡、武定鸡聚为一类,萧山鸡、大围山鸡、狼山鸡、乌骨鸡聚为一类,白耳鸡为独立分支。研究表明,藏鸡、余干黑鸡、三黄鸡不饱和脂肪酸相对含量明显高于饱和脂肪酸...     

鸡lmbr1部分内含子的克隆及其单核苷酸多态性

以丝羽乌骨鸡和白洛克肉鸡的基因组DNA为模板,采用PCR产物直接测序的方法进行鸡lmbr1基因部分内含子的克隆、单核苷酸多态性检测。结果表明,试验克隆了鸡lmbr1基因的10～14及16内含子序列,共计4 610 kb,从丝羽乌骨鸡和白洛克肉鸡中检测到67个单核苷酸多态位点（SNPs）。将提交序列与NCBI上公布的红色原鸡基因组序列比较,在这6个内含子内发现40个变异位点,其中20个为新的SNPs。基因组结构分析表明,鸡lmbr1基因约60 kb,为人类lmbr1基因的28%,内含子外显子的剪接方式符合GT-AG法则。     

天府乌骨鸡与贵州山地乌骨鸡线粒体DNA的序列分析

测定了12只天府乌骨鸡、11只贵州山地乌骨鸡和11只矮小型乌骨鸡共34个个体的控制区(D-环)部分序列(539bp),结果显示线粒体D环部分序列有11种单倍型,分布在4个不同的序列变异类型中,提示其至少有4个不同的母系来源。     

他留乌骨鸡TYR基因多态性与色素性状相关性分析

通过研究鸡酪氨酸酶(TYR)基因多态性与羽色、肤色等色素性状相关性,为他留乌骨鸡色素性状基因纯化及分子标记选择提供科学依据。采用PCR扩增池测序与PCR-RFLP标记技术,研究他留乌骨鸡麻羽、白羽和黑羽3个羽色类群以及乌骨鸡与非乌骨鸡2种类群的TYR基因多态性,计算等位基因频率与基因型频率,并与色素性状进行了关联分析。结果显示,在他留乌骨鸡中共检测到20个SNP位点,其中2个SNP引起氨基酸改变。建立了TYR基因HindⅢ和MseⅠ两个PCR-RFLP分子标记,利用这两个标记对所有受试个体进行基因分型,关联分析提示,他留乌骨鸡TYR基因变异与羽色性状显著相关,但与肤色等乌骨性状相关不显著。TYR基因MseⅠPCR-RFLP标记可能是影响羽色性状变异的一个分子标记。     

鸡lmbr1基因外显子16的SNP检测和单倍型分析

外显子16是鸡lmbr1基因最大的外显子,本研究进行了该外显子在丝羽乌骨鸡和白洛克肉鸡间的SNP检测和单倍型分析。研究表明,鸡lmbr1外显子16的PCR-SSCP基因型在两个品种间的分布存在明显差异,测序从24个个体中检测到4个变异位点,其中T32C变异在两个品种间存在明显差异,丝羽乌骨鸡均含有32T(纯合的TT或杂合的TC),白洛克肉鸡在T32C位点都为纯合的CC;单倍型分析从24个个体中检测到5种单倍型,丝羽乌骨鸡和白洛克肉鸡的单倍型存在明显的差异,hap1和hap2是丝羽乌骨鸡的特异性单倍型,hap5是白洛克肉鸡的特异性单倍型,hap3和hap4主要存在于白洛克肉鸡中,在丝羽乌骨鸡中的比例极少。     

部分鸡品种血浆胆固醇含量比较研究

本试验对乌骨鸡、仙居鸡、萧山鸡、隐性白鸡血浆胆固醇含量进行了测定。结果表明:血浆胆固醇的含量从高到低依次为乌骨鸡,仙居鸡,隐性白鸡,萧山鸡,其中,乌骨鸡与隐性白鸡、萧山鸡,仙居鸡与萧山鸡间差异显著(p<0.05),其它鸡种间差异不显著。血浆胆固醇含量在性别间也存在差异,即公鸡高于母鸡。此外,研究还发现:利用血浆胆固醇含量作为辅助标志从理论上可以用于改进肉品中的胆固醇含量。     

中国地方品种丝羽乌骨鸡白细胞介素2基因的克隆及遗传进化分析

鸡白细胞介素2（ChIL-2)是近年来新发现的一类细胞因子。根据Sundick等发表的鸡IL-2基因序列设计一对特异性引物,从ConA体外激活的脾脏淋巴细胞中提取mRNA,通过RT-PCR方法扩增和克隆了我国地方品种丝羽乌骨鸡IL-2cDNA,丝羽乌骨鸡IL-2基因由734nt组成,编码-由143个氨基酸组成的前体蛋白,基因5’端含有17个核苷酸和3'端含有285个核苷酸组成的非编码区,3'UTR中含有4个重复的“ATTTA”序列。编码蛋白氨基酸与Kestrel,Obese和SC品系的来杭鸡比较,氨基酸的突变主要发生在28-32位,这一区域丝羽乌骨鸡和Kestrel来杭鸡相同,Obese和SC鸡相同,基因系统进化树分析表明丝羽乌骨鸡和Kestrel来杭鸡具有很近的亲缘关系,Lbese和SC鸡具有很近的亲缘关系。中国的药用鸡品种-丝羽乌骨鸡在非常保守的133位发生了氨基酸突变,我们推测这可能与该品种鸡具有很强的抗病能力有关。     

茶花鸡2号IFN-α基因克隆及生物信息学分析

本研究旨在克隆茶花鸡2号α干扰素基因（IFN-α）CDS区序列并进行生物信息学分析,为后续研究IFN-α基因对茶花鸡2号免疫功能的影响提供参考。以茶花鸡2号为实验对象设计IFN-α引物,提取总RNA,反转录PCR扩增并克隆其编码区序列,进行生物信息学分析。结果显示茶花鸡2号IFN-α基因CDS序列全长582 bp,IFN-α蛋白等电点5.05,平均疏水指数-0.514,为酸性亲水蛋白,且存在信号肽和1个跨膜区,主要定位于细胞核。IFN-α蛋白被4个N糖基化位点、5个O糖基化位点和20个磷酸化位点修饰,主要由α-螺旋与无规卷曲构成。茶花鸡2号与固始鸡、海兰鸡、惠阳胡须鸡、罗曼鸡和乌骨鸡的氨基酸同源性分别为95.9%、97.9%、97.9%、97.9%和95.9%。IFN-α蛋白与IRF7、IFNAR1、IFNAR2和IFNK等蛋白存在互作关系。本研究结果可为进一步探讨IFN-α基因在茶花鸡2号病毒疾病防治中的作用提供理论依据。     

应用微卫星标记对12个中国地方乌骨鸡品种遗传多样性的研究

利用27个微卫星DNA标记对12个地方乌骨鸡品种进行遗传多样性分析，通过计算等位基因频率、多态信息含量、杂合度、有效等位基因数和遗传距离，评估各品种内遗传变异和各品种间遗传相关，并根据遗传距离对12个鸡品种进行了聚类分析。结果表明，各乌骨鸡群体的遗传多样性较为丰富，并具有较高的选择潜力。平均杂合度最高的是竹乡鸡，为0．670；最低的是江山乌骨鸡，为0．581。27个微卫星标记中4个为中度多态座位，1个低度多态座位，22个为高度多态座位；LEI0234与LEI0192分别检测到了10．3与12．2个等位基因。以标准遗传距离为准，遗传距离最近的为沐川乌骨鸡与略阳鸡，为0．1002，而乌蒙乌骨鸡与略阳鸡最远，为0．2546。通过UPG—MA法聚类后，略阳鸡、沐川乌骨鸡、兴文乌骨鸡、盐津乌骨鸡、竹乡鸡首先聚为1类，江山乌骨鸡、郧阳白羽乌鸡、余干乌骨鸡聚为1类；金湖乌凤鸡、丝绒乌骨鸡和丝毛乌骨鸡聚为第3类；乌蒙乌骨鸡独为一类。     

利用微卫星标记分析贵州地方鸡种的遗传多样性及亲缘关系

利用7个微卫星标记对12个贵州地方鸡种及1个引入鸡种的遗传多样性进行了检测，分析了各标记座位上的等位基因及频率、基因杂合度、平均基因杂合度、多态信息含量、平均多态信息含量及群体间的亲缘关系。结果表明：13个种群在7个标记座位上的等位基因及频率等均存在一定差异。其中，瑶山鸡的平均基因杂合度最高，引入鸡种隐性白洛克的平均基因杂合度最低，其余鸡种介于其间。平均多态信息含量的分析结果与此类似，说明瑶山鸡的遗传多样性最为丰富。模糊聚类的结果表明，13个鸡种分为2大类群，隐性白洛克独自为1个类群，12个贵州地方鸡种构成1个类群。12个贵州地方鸡种又可进一步分为2个小类群：其中1个小类群由兴义土鸡、矮脚鸡首先聚在一起，然后依次聚上黔东南小香鸡、黔东南小香乌骨鸡构成；高脚鸡、瑶山鸡、威宁鸡、竹乡鸡、竹乡乌骨鸡、黑羽乌蒙乌骨鸡、乌蒙鸡、麻羽乌蒙乌骨鸡则构成另一个小类群。     

药用价值地方鸡种动态保种的研究

通过资源调查摸清我国10个药用价值地方鸡种的保存现状,发现金阳丝毛鸡已经濒临灭绝.其他9个药用价值地方鸡种均处于正常保种状态.通过筛选的27个多态性较好的微卫星标记,检测了我国9个药用价值地方鸡种的遗传多样性.利用等位基因频率计算了各群体的遗传参数、构建了聚类图,并进行了系统发生分析.根据调查结果及遗传多样性检测数据,分析的9个药用价值地方鸡种保存状态,并提出保护建议.     

鸡Mx基因2032位点单核苷酸多态性研究

研究采用错配PCR-RFLP的方法对15个品种鸡的Mx基因进行筛查,旨在探索不同鸡品种MxcDNA第2032位点抗病基因A与易感等位基因G的多态性,为生产转基因鸡的可行性提供理论基础。结果表明:15个鸡品种Mx基因的2032位点存在A、G2个等位基因,AA、AG、GG3种基因型,其中鹿苑鸡、狼山鸡、斗鸡未发现AA型个体,茶花鸡、红色原鸡未发现GG个体;携带Mx抗性基因A和易感基因G的比例分别是0.350、0.650;抗性等位基因A的检测比例为0.034~0.984。红色原鸡的抗性等位基因A基因频率(0.984)高于地方鸡种的抗性等位基因A的基因频率(0.321);地方鸡种中的观赏型、蛋肉兼用型、肉用型、蛋用型鸡种的抗性等位基因A的基因频率分别为0.221、0.297、0.425、0.462。χ2适合性检验表明,15个品种的鸡群均处于Hardy-Weinberg平衡状态。     

Comparative observations on the growth changes of the histochemical property and collagen architecture of the Musculus pectoralis from Silky, layer-type and meat-type cockerels

Growth‐related changes in the histochemical properties and collagen architecture of the Musculus pectoralis were compared among Silky, layer‐type and meat‐type cockerels. Histochemical and immunohistochemical methods were used and collagen architecture was studied using scanning electron microscopy. The total amount of collagen present was also measured. The diameter of type IIB myofibers was similar or rather larger in the layer‐type birds compared with the meat‐type. The collagen content was generally low for 5–10 weeks across the breeds and then increased in the other breeds except for Silky. In the perimysium, the collagen bundles gradually increased in size and the density of the fibrils also increased during growth. At 30 weeks of age, the layer‐type birds showed compact collagen bundles while the meat‐type had loose bundles. The endomysial collagen network appeared relatively denser in the meat‐type chicks compared to the others at week 1. At 30 weeks of age, compact and felt‐like structure of endomysium was shown by Silky and layer‐type chickens, while the meat‐type showed a relatively loose arrangement of tissue in the endomysial collagen. From these results, it appears that the meat‐type chicken can produce a large M. pectoralis with many, relatively thinner myofibers and a relatively undeveloped form of intramuscular collagen structure.     

华东27个地方鸡品种(品系)的遗传变异

应用30个微卫星标记对华东27个地方鸡品种（品系）进行了遗传多样性分析，计算了多态信息含量、平均杂合度和遗传距离等遗传参数，并用类平均法进行了聚类分析。结果表明：平均杂合度最高的是河田鸡，为0．6870，最低的是狼山鸡，为0．6170；27个地方鸡品种（品系）的杂合度都较高，反映了这些品种的多种多型；各品种的平均遗传距离反映了各品种分化时间的长短；UPGMA的聚类分析将27个品种（品系）聚为10类：丝绒乌骨鸡、济宁百日鸡、河田鸡、安义瓦灰鸡、仙居鸡、江山乌骨鸡、溧阳鸡、金湖乌风鸡、灵昆鸡、余干乌骨鸡、康乐鸡、萧山鸡、琅讶鸡、淮北麻鸡、淮南三黄鸡为第1类，白耳鸡为第2类，浦东鸡为第3类，崇仁麻鸡与丝羽乌骨鸡为第4类，狼山鸡与寿光鸡为第5类，鹿苑鸡、东乡绿壳蛋鸡、汶上芦花鸡各独自聚为第6、7、8类，鲁西斗鸡与宁都三黄鸡聚为第9类，漳州斗鸡独自聚为第10类。通过微卫星标记对华东27个地方鸡品种（品系）遗传变异的分析说明这些地方品种的遗传多样性极其丰富，各具特色，应促进资源优势向经济优势转化。     

12个地方品种鸡TLR4基因多态性分析

为了探究我国地方鸡种TLR4基因的多态性和群体遗传特性,本研究采用PCR-SSCP及DNA测序方法,对我国12个地方品种鸡TLR4基因部分序列的单核苷酸多态性进行分析.结果显示,在所有鸡种TLR4基因的第二内含子上均发现了G1894C的突变.除了固始鸡极显著偏离Hardy-Weinberg平衡(P＜0.01)外,其他品种均处于Hardy-Weinberg平衡(P＞0.05).12个鸡品种该位点的多态信息含量均属于高度多态,其中皖南三黄鸡该位点的多态信息含量和杂合度最高,北京油鸡次之,文昌鸡最低;12个品种间的基因型分布存在极显著差异(P＜0.01).本研究表明,中国地方鸡种TLR4基因G1894C位点多态丰富,为深入开展鸡TLR4基因抗病育种的研究提供了一定的理论基础.     

气候因子对中国地方品种鸡的繁殖性状的影响

对中国107个地方品种鸡的4个繁殖性状和4个气候因子间的关系进行了典型相关分析,探讨气候因子对107个地方品种鸡的繁殖性状的影响。典型相关分析结果表明,两组性状间的第1个典型相关系数为0．56584（P〈0．01）,贡献率82．19％。研究结果为家禽遗传育种与繁殖提供科学参考。     

藏鸡、茶花鸡染色体核型分析

运用改进的鸡外周血淋巴细胞培养-空气干燥法,分析了藏鸡、茶花鸡染色体核型.研究结果表明:藏鸡和茶花鸡的染色体形态十分相近,染色体2n众数均为78,但No.4、No.6染色体的形态存在一定的差别,即藏鸡分别为sm和m型,而茶花鸡分别为st和sm型.同时收集丝羽乌骨鸡、鹿苑鸡、狼山鸡、萧山鸡、北京油鸡的核型资料进行分析,发现鸟类核型进化可能是由不对称向对称发展的,着丝粒以及着丝粒周边区域的染色体重排可能是地方鸡种分化和形成的重要内在因素.     

Comparative observations of the growth changes of the histochemical properties and collagen architecture of the iliotibialis lateralis muscle from Silky, layer and meat type cockerels

Growth‐related changes in the histochemical property and collagen architecture of the iliotibialis lateralis muscle were compared among Silky, layer and meat cockerels. Histochemical and immunohistochemical methods were employed to observe the collagen architecture. The total intramuscular collagen was also determined. The muscle consisted of type IIA, IIB and IIC myofibers, of which type IIB occurred at the highest frequency. The diameter of type IIB myofibers in each week was largest in the layer, followed by the meat, and was smallest in the Silky. The total amount of collagen reached 3.38 mg/g in the meat bird, 3.03 mg/g in the layer and 2.71 mg/g in the Silky by 30 weeks of age, respectively. In the perimysium, the collagen bundles increased in size and density of fibrils with growth. At 30 weeks of age the layer had compact collagen platelets while the Silky had loose collagen bundles. In the meat bird, the collagen bundles were moderately compact. The endomysial collagen network had a large mesh size at 1 week and thereafter accumulated many collagen fibrils to form a felt‐like fabric of fibrils at 30 weeks of age. From these results it appears that growth‐related changes in the iliotibialis lateralis muscle are not necessarily causally affected by the different growth rates of chicken breeds.