用微卫星标记分析贵州地方鸡种的遗传多样性及亲缘关系

利用20个微卫星座位对贵州12个地方鸡种和隐性白洛克进行遗传分析,得到各品种的等位基因频率、平均杂合度、多态信息含量及品种间的Nei氏标准遗传距离,并进行了聚类分析。结果表明:13个鸡种在各微卫星座位上的遗传杂合度均有差异,平均遗传杂合度为0.6885(贵州地方鸡种为0.6915);平均多态信息含量为0.6297(贵州地方鸡种为0.6326),说明贵州地方鸡种遗传多样性较隐性白洛克丰富。UPGMA聚类分析结果显示,13个鸡种分为2大类群,隐性白洛克独自构成一个类群,12个贵州地方鸡种为另一个类群,12个贵州地方鸡种进一步可分为4个小类群。研究结果对贵州地方鸡种资源的评估、保存和利用具有一定的指导意义。     

应用微卫星标记对12个中国地方乌骨鸡品种遗传多样性的研究

利用27个微卫星DNA标记对12个地方乌骨鸡品种进行遗传多样性分析，通过计算等位基因频率、多态信息含量、杂合度、有效等位基因数和遗传距离，评估各品种内遗传变异和各品种间遗传相关，并根据遗传距离对12个鸡品种进行了聚类分析。结果表明，各乌骨鸡群体的遗传多样性较为丰富，并具有较高的选择潜力。平均杂合度最高的是竹乡鸡，为0．670；最低的是江山乌骨鸡，为0．581。27个微卫星标记中4个为中度多态座位，1个低度多态座位，22个为高度多态座位；LEI0234与LEI0192分别检测到了10．3与12．2个等位基因。以标准遗传距离为准，遗传距离最近的为沐川乌骨鸡与略阳鸡，为0．1002，而乌蒙乌骨鸡与略阳鸡最远，为0．2546。通过UPG—MA法聚类后，略阳鸡、沐川乌骨鸡、兴文乌骨鸡、盐津乌骨鸡、竹乡鸡首先聚为1类，江山乌骨鸡、郧阳白羽乌鸡、余干乌骨鸡聚为1类；金湖乌凤鸡、丝绒乌骨鸡和丝毛乌骨鸡聚为第3类；乌蒙乌骨鸡独为一类。     

利用微卫星标记分析贵州5个地方鸡品种遗传多样性

通过选用30个多态性较好的微卫星标记,检测了贵州省5个地方鸡品种:竹乡鸡、威宁鸡、黔东南小香鸡、高脚鸡、乌蒙乌骨鸡的遗传多样性。计算了各群体的平均遗传杂合度(H)、多态信息含量(PIC)和群体间的DA遗传距离。结果表明:在5个品种中,杂合度最低的是高脚鸡,为0.501,杂合度最高的是竹乡鸡,为0.673,因此贵州各地方鸡品种的杂合度相差较大,据分析可能是由于交通闭塞,形成了家禽品种的多种多型,而且杂合度的高低与PIC值的大小体现了较高的一致性;用UPGMA法进行聚类分析,结果6个鸡品种被聚为3类:竹乡鸡、黔东南小香鸡和威宁鸡聚为一类,乌蒙乌骨鸡自聚为一类;高脚鸡独自聚为一类。这与几个鸡品种的来源、分化、选育历史及地理分布是一致的。     

贵州地方鸡种与隐性白洛克鸡遗传多样性对比研究

本研究运用微卫星DNA标记技术对贵州12个地方鸡种(类群)和引进鸡种-隐性白洛克的等位基因、平均杂合度和多态信息含量等指标进行了对比分析研究,结果表明,贵州地方鸡种的遗传多样性较隐性白洛克高,遗传基础更为丰富,更适宜培育不同的新品种(类型),满足多样化的市场需求。     

利用微卫星PCR分析普安乌骨鸡的遗传结构

为了判断普安县牛角山乌骨鸡群体遗传结构和濒危状况,试验选用10个微卫星标记,通过等位基因频率、有效等位基因数、基因杂合度、多态信息含量的计算以及瓶颈效应分析等方法检测群体遗传结构。结果表明:10个微卫星座位有9个具有多态性,9个微卫星座位的多态信息含量在0.566~0.752之间。群体平均多态信息含量和平均杂合度分别为0.666,0.731。瓶颈效应分析结果表明,牛角山乌骨鸡群体9个微卫星座位均具有极显著的杂合度过剩,无座位具有杂合度不足,推断近几十年其有效群体大小在明显下降。     

鹿苑鸡微卫星和AFLP指纹分析

利用20个微卫星标记和6对AFLP引物组合对地方鸡种鹿苑鸡进行了遗传检测,结果表明鹿苑鸡在20个微卫星位点上共检测到118个等位基因,基因频率分布在0.0125～0.5500之间,平均每个座位检测到5.9个等位基因.20个微卫星座位的平均杂合度为0.7366,平均多态信息含量为0.6953;6对AFLP引物组合在该鸡种中共检测到245条多态性条带,平均每个引物组合产生40.8条多态性条带;鹿苑鸡群体变异大,具有丰富的遗传多样性.     

长江三角洲白山羊群体遗传结构研究

应用结构基因座和微卫星DNA两种遗传标记探讨长江三角洲白山羊群体遗传结构。结果表明，检测的9个结构基因座位上7个存在多态性，座位的基因平均杂合度、多态信息含量及有效等位基因数分别为0．1767、0．1457和1．2837；7个微卫星位点上共检测到110个等位基因，位点的基因平均杂合度、多态信息含量及有效等位基因数分别为0．8867、0．8774和11．2907。群体内的遗传变异程度相对较高，反映出丰富的遗传多样性，而且微卫星DNA标记揭示的遗传变异高于结构基因座。     

安徽省3个地方鸡品种的遗传多样性分析

运用微卫星标记对淮南麻黄鸡、皖南三黄鸡和五华鸡3个地方品种遗传多样性进行了分析.在5个座位中,共检测到23个等位基因数,平均有效等位基因数为1.5396,杂合度为0.2920,多态信息含量为0.4156.3个地方品种中,淮南麻黄鸡遗传多样性最低,五华鸡遗传多样性最高.根据5个微卫星座位等位基因频率计算群体遗传一致度和标...     

部分地方鸡种微卫星DNA指纹分析

利用20个微卫星标记对我国19个地方鸡种保种群进行了遗传检测,计算各群体的等位基因频率、平均基因杂合度、平均多态信息含量及各群体间的遗传距离,并用类平均法进行聚类分析。研究结果表明:20个微卫星标记在19个地方鸡种保种群共检测到184个等位基因,平均为9.2个,基因频率分布在0.013-0.838之间。19个地方鸡种平均杂合度在0.5824-0.7432之间。其中藏鸡最高,白耳鸡最低。平均多态信息含量在0.5238-0.7023之间,均大于0.5,表现为高度多态性;19个鸡种聚为6类。各鸡种的遗传距离及聚类结果与所保存的地方鸡种的地理分布、现实状况是相吻合的,从而表明用该方法分析品种间的亲缘关系是可行的。     

长江三角洲白山羊群体遗传结构研究

应用结构基因座和微卫星DNA两种遗传标记探讨长江三角洲白山羊群体遗传结构。结果表明,检测的9个结构基因座位上7个存在多态性,座位的基因平均杂合度、多态信息含量及有效等位基因数分别为0.1767、0.1457和1.2837;7个微卫星位点上共检测到110个等位基因,位点的基因平均杂合度、多态信息含量及有效等位基因数分别为0.8867、0.8774和11.2907。群体内的遗传变异程度相对较高,反映出丰富的遗传多样性,而且微卫星DNA标记揭示的遗传变异高于结构基因座。     

贵州部分地方鸡品种的血浆碱性磷酸酶多态性研究

采用水平板聚烯酰胺凝胶电泳法,对贵州及河南、广东、江西部分地方鸡品种及有关外来鸡种共１３个种群、１２２５只个体血浆碱性磷酸酶（Ａｋｐ－１及Ａｋｐ－２）的多态性进行了检测分析。结果在Ａｋｐ－１位点出现了Ｆ和Ｓ两种表型,Ａｋｐ－２位点均为无带类型。Ａｋｐ－１位点两种表型（Ｆ和Ｓ）的分布频率,除黑羽乌蒙乌骨鸡表现为与艾维茵肉鸡和白洛克鸡一样,以Ｆ型高于Ｓ型外,其余地方鸡种及引进的伊利莎鸡,均以Ｓ型高于Ｆ     

利用微卫星标记分析江苏三个地方鸡品种的遗传多样性

利用30个微卫星DNA标记对3个江苏地方鸡品种进行遗传多样性分析，通过计算等位基因频率、多态信息含量、平均杂合度、有效等位基因数和遗传距离，评估各品种内遗传变异和各品种间遗传相关。结果表明：江苏的3个品种在30个微卫星上共发现196个等位基因，其中96个等位基因为三个品种共有，47个等位基因为各品种所特有；3个地方鸡品种的平均杂合度：狼山鸡为0．655，鹿苑鸡为0．681，溧阳鸡为0．687；狼山鸡与溧阳鸡的遗传距离较小，而两鸡与鹿苑鸡的遗传距离较远。     

贵州部分地方鸡品种的血浆酯酶多态性研究

采用水平板聚丙烯酰胺凝胶电泳法,对贵州及河南,广东,江西部分地方鸡品种及有关外来鸡种类共１３个种群、１２２５只个体血浆酯酶－１（Ｅｓ－１）的多态性进行检测。结果：Ｅｓ－１位点存在Ａ、Ｂ和Ｃ３种谱带及ＡＡ、ＡＢ、ＢＢ、ＡＣ、ＢＣ、ＣＣ６种表型（基因型）。各鸡种的表型分布具有明显的地域性特点,同时还可见基因频率与各鸡种的经济用途之间具有一定的关系。Ｘ＾２检验表明,有９个鸡种的表型分布比例极显著偏离了Ｈ     

利用微卫星标记研究贵州矮马和伊犁马的遗传多样性

试验通过9个微卫星座位对贵州矮马和伊犁马2个品种共84匹马进行了遗传多样性检测,以8%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分离PCR扩增产物,并用银染法显色,计算各微卫星位点的等位基因频率、有效等位基因数(Ne)、杂合度(H)和多态信息含量(PIC)。结果表明,9个微卫星座位中COR059检出的变异最大,AHT040的变异最小;伊犁马的Ne、H和PIC的平均值高于贵州矮马;2个群体的平均遗传分化系数为0.041。说明2个品种都有丰富的遗传多样性,贵州矮马的基因较伊犁马更为纯合。     

华东27个地方鸡品种(品系)的遗传变异

应用30个微卫星标记对华东27个地方鸡品种（品系）进行了遗传多样性分析，计算了多态信息含量、平均杂合度和遗传距离等遗传参数，并用类平均法进行了聚类分析。结果表明：平均杂合度最高的是河田鸡，为0．6870，最低的是狼山鸡，为0．6170；27个地方鸡品种（品系）的杂合度都较高，反映了这些品种的多种多型；各品种的平均遗传距离反映了各品种分化时间的长短；UPGMA的聚类分析将27个品种（品系）聚为10类：丝绒乌骨鸡、济宁百日鸡、河田鸡、安义瓦灰鸡、仙居鸡、江山乌骨鸡、溧阳鸡、金湖乌风鸡、灵昆鸡、余干乌骨鸡、康乐鸡、萧山鸡、琅讶鸡、淮北麻鸡、淮南三黄鸡为第1类，白耳鸡为第2类，浦东鸡为第3类，崇仁麻鸡与丝羽乌骨鸡为第4类，狼山鸡与寿光鸡为第5类，鹿苑鸡、东乡绿壳蛋鸡、汶上芦花鸡各独自聚为第6、7、8类，鲁西斗鸡与宁都三黄鸡聚为第9类，漳州斗鸡独自聚为第10类。通过微卫星标记对华东27个地方鸡品种（品系）遗传变异的分析说明这些地方品种的遗传多样性极其丰富，各具特色，应促进资源优势向经济优势转化。     

利用微卫星标记对7个山羊品种的遗传多样性研究

为了研究小香羊与相邻产区山羊品种之间的亲缘关系,利用7个微卫星位点,以波尔山羊为对照,对中国6个山羊群体进行了遗传检测,计算了各品种群体的等位基因频率、平均杂合度(He)、平均多态信息含量(PIC)和平均有效等位基因数(Ne),同时分析了各品种群体内和群体间的遗传变异,并根据遗传距离进行了NJ聚类。结果表明,各群体的He、PIC、Ne分别为0.778~0.823、0.766~0.809、4.707~5.767;川东黑山羊和川东白山羊聚为一类,乌羊和南江黄羊聚为一类,其次是马头山羊、小香羊,最后是波尔山羊。微卫星标记分析结果与它们的地理分布及品种形成相一致。