A型猪流感病毒TaqMan探针荧光RT-PCR检测方法的建立

根据A型猪流感病毒(SIV)的基质蛋白(M)编码基因保守序列设计合成一对特异性引物和一条Taq Man探针,建立了一种检测A型SIV的荧光RT-PCR方法。结果显示,该方法对H1N1、H3N2和H9N2亚型SIV均呈特异性扩增,对猪瘟病毒、猪繁殖与呼吸综合征病毒、猪流行性腹泻病毒和猪传染性胃肠炎病毒等猪的其他常见病毒无交叉扩增反应;该方法对M基因RNA对照(SIV-M-RNA)的最适线性检测范围为3.8×10~1~3.8×10~8拷贝数/反应,标准曲线方程为Y=-3.4365X+40.091,相关系数(R~2)为0.999 8,最低检出限为38个拷贝数的SIV-M-RNA。对3个不同浓度(3.8×10~3~3.8×10~5 copies/μL)的SIV-M-RNA进行组间和组内重复试验,每个浓度的Ct值变异系数均小于1.5%,具有良好的重现性。用该方法对860份进口猪的鼻拭子样本和78份国内猪场猪鼻拭子样本进行SIV检测,结果进口猪鼻拭子样本的SIV检测均为阴性,17份国内猪场猪鼻拭子样本SIV检测为阳性。本研究提供了一种快速、敏感和特异的A型猪流感病毒检测方法。     

H1亚型猪流感病毒微滴数字RT-PCR定量检测方法的建立

本研究针对H1亚型猪流感病毒(swine influenza virus,SIV)HA基因保守序列设计引物和探针,通过反应条件优化,建立了一种快速、准确检测H1亚型SIV的微滴数字RT-PCR定量方法。该方法特异性强,除H1亚型SIV外,H3、H5、H7亚型SIV以及猪瘟病毒、猪繁殖与呼吸综合征病毒等检测均为阴性;敏感性高,最低可检测4.7拷贝/μL;重复性好,对5个不同稀释度的H1亚型SIV RNA进行3次重复试验,每个稀释度的变异系数均小于5%。利用该方法对湖南省规模化养殖场收集的30份猪鼻拭子样品进行检测,发现与荧光RT-PCR检测结果一致。试验表明,该方法快速、准确、灵敏,可为H1亚型SIV的快速筛查及流行病学研究提供可靠的技术保障。     

H3亚型猪流感病毒抗原捕捉ELISA检测方法的建立

为快速检测H3亚型猪流感病毒(SIV),本研究将一株H3N2亚型SIV特异性单克隆抗体(MAb)进行纯化,建立了以多抗作为包被抗体,MAb作为检测抗体的H3亚型SIV抗原捕捉ELISA (AC-ELISA)方法.并对该方法的特异性和敏感性进行了分析,其敏感性是血凝试验的4倍,与猪繁殖与综合征病毒、猪圆环病毒、猪瘟病毒、猪细小病毒以及H1、H5、H9亚型SIV均没有明显的交叉性反应,批间和批内重复试验变异系数均小于10％.应用建立的AC-ELISA方法对84份H3亚型SIV实验室感染样品进行检测与鸡胚滴定病毒结果符合率达90.47％.本实验建立的AC-ELISA方法具有良好的特异性和敏感性,可用于H3亚型SIV的临床检测.     

H1亚型猪流感病毒一步法实时荧光定量RT-PCR检测方法的建立及应用

为建立一种快速、简便、准确的方法以诊断和检测H1亚型猪流感病毒(swine influenza virus,SIV),试验根据H1亚型SIV血凝素(hemagglutinin,HA)基因保守序列,分别设计并合成1对特异性引物和1条TaqMan MGB探针,建立检测H1亚型SIV的一步法实时荧光定量RT-PCR技术。结果显示,该方法的敏感性可达10²拷贝/μL,除H1亚型SIV外,对H3N2亚型SIV、H9N1亚型SIV、猪瘟病毒、猪繁殖与呼吸综合征病毒、猪流行性腹泻病毒、猪传染性胃肠炎病毒的检测均为阴性,且应用该方法对疑似猪流感样品进行检测,其结果与SPF鸡胚分离病毒方法结果的符合率为94%。本试验结果表明该方法特异性强、重复性好,有望成为一种特异、敏感、快速、定量检测H1亚型SIV的方法。     

H1、H3亚型猪流感病毒双重实时荧光定量RT-PCR检测方法的建立及应用

为建立一种快速、准确地检测H1和H3亚型猪流感病毒（swine influence virus,SIV）的方法,根据H1和H3亚型SIV血凝素（hemagglutinin,HA）基因保守序列,分别设计2对特异性引物和2条TaqMan探针,建立双重实时荧光定量RT-PCR方法。结果显示,该方法敏感性高,可检测到最低拷贝数为10²拷贝/μL;重复性良好,重复孔Ct值的变异系数均在5%以下;特异性好,除H1和H3亚型SIV外,H4、H5、H7、H9亚型SIV、猪瘟病毒、猪繁殖与呼吸综合征病毒、口蹄疫病毒、伪狂犬病病毒检测均为阴性;在田间样品中成功检出1株H1和1株H3亚型SIV,检出率为1.16%。该方法准确、快速、灵敏、特异,可为H1、H3亚型SIV的快速鉴别检测及流行病学调查提供有效的技术手段。     

H3亚型猪流感病毒SYBR Green Ⅰ实时荧光定量PCR检测方法的建立

为建立一种快捷、可行的检测H3亚型猪流感病毒(SIV)的方法,本研究根据GenBank中登录的H3亚型SIV HA基因的保守序列,设计合成一对特异性引物,建立了一种检测H3亚型SIV的SYBR Green Ⅰ荧光定量检测方法,并进行灵敏度、稳定性和特异性试验,与普通PCR进行比较.研究结果表明,标准曲线的循环阈值与模板浓度呈现良好的线性关系,R2为0.994,CV在0.17％～1.41％之间,具有良好稳定性.除H3亚型SIV外,对H1、H4、H6、H9亚型SIV以及猪瘟病毒、猪繁殖与呼吸综合征病毒、口蹄疫病毒和猪圆环病毒2型的检测均为阴性,与普通PCR相比更灵敏.该方法特异性好,准确率高,适于临床分离鉴别H3亚型SIV.     

贵州省H7亚型禽流感病毒感染的血清学和病原学分析

为了解贵州省近几年H7亚型禽流感病毒感染情况,分别采集鸡血清3 031份、卵黄962份、咽-肛拭子1 607份、环境土壤拭子394份及野鸟粪便122份样本共计6 116份,采用血凝抑制试验(HI)和实时荧光定量RT-PCR方法进行H7亚型禽流感病毒特异性抗体和核酸检测。结果显示,在鸡血清和卵黄样本中,H7亚型禽流感表达特异性抗体的阳性率分别为1.2%(37/3 031)和2.3%(22/962);在2 123份鸡咽-肛拭子、环境样本和野鸟粪便中,均未检测出H7亚型禽流感病毒核酸。这些结果表明贵州省家禽、野鸟和环境土壤中尚未发现H7亚型禽流感病毒感染。     

猪流感病毒H1、H3、N1、N2亚型分型 RT-PCR方法的建立

根据GenBank中H1N1和H3N2亚型猪流感病毒(SIV)血凝素(hemagglutinin,HA)、神经氨酸酶(neuraminidase,NA)和M基因保守序列,分别设计合成了5对特异性引物,利用RT-PCR技术对SIV的型和亚型进行鉴定。结果表明,该方法的型RT-PCR可以检测出10⁴ EID₅₀病毒量所提取的RNA;H1、H3、N1和N2的亚型RT-PCR均可以检测出10⁴ EID₅₀病毒量所提取的RNA。除每对特异性引物所对应的亚型外,对其他亚型及猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)和猪瘟病毒(CSFV)的检测均为阴性,应用该方法对临床样品进行检测,其结果与病毒分离结果符合率为100%。结果表明,该方法特异性好、敏感性高,有望成为SIV的一种特异、敏感、快速的分型检测方法,为猪流感分子流行病学的调查奠定了良好的基础。     

宁夏屠宰场猪流感流行病学调查

为调查宁夏生猪屠宰场猪流感流行情况,采集2009年12月至2011年4月份猪双孔鼻拭子和对应血清,同时收集2010年4月至2011年10月每月送检的猪双孔鼻拭子。采用血凝抑制试验对1600份血清样本进行H1和H3亚型抗体检测;采用RT-PCR方法对2391份鼻拭子进行病原学检测。血清学调查结果显示,SIV隐性感染阳性样品247份,阳性率为15．4％,临床感染阳性样品414份,阳性率25．9％;病原学调查结果表明,对鼻双孔拭子检测SIV阳性率为12．7％,对血清学检测阳性样本616份进行RT-PCR检测,阳性率为70．9％,对血清学检测阴性样品984份进行RT-PCR检测,阳性率为13．3％。调查发现,我区屠宰场SIV隐性感染十分普遍,11—4月份生猪带毒率和发病率较高,制约了宁夏养猪业的发展;生猪长途调运屠宰能加速猪流感病毒的扩散和蔓延;同时由于与其它病原微生物混合感染日趋复杂化,使得对猪病防控的难度也越来越大。     

贵州省部分地区H7亚型禽流感监测与分析

为了解贵州省H7亚型禽流感感染情况,采用HI试验对全省9个地区家禽血清样本进行血清抗体检测,PT-PCR方法对家禽咽-肛拭子、养禽场环境样本和野鸟粪便进行病原核酸检测。结果显示:在1570份家禽血清样本中,H7亚型禽流感血清抗体阳性率为0.45%(7/1570);在350份家禽咽-肛拭子和310份养殖场环境样本中,均未检测出H7亚型禽流感病毒核酸;在160份野鸟粪便中,有1份为H7亚型禽流感病毒核酸阳性,阳性率为0.63%(1/160)。试验提示,在贵州省养禽场中不存在H7亚型禽流感感染,但迁徙野禽中可能存在H7亚型禽流感隐性感染,应当引起重视。     

禽流感病毒H5HA、H7HA、H9HA亚型夹心ELISA方法的建立

将禽流感病毒(AIV)H5、H7、H9血凝素亚型标准血清中的IgG作为包被抗体,H5、H7、H9血凝素亚型单克隆抗体作为第二抗体,建立了双抗体夹心ELISA(AC-ELISA)方法,并优化了反应条件.结果表明:单抗和标准血清最适工作质量浓度分别为5、10 mg/L,标准阳性血清于4℃包被12 h,二抗作用条件为37℃作用1 h,封闭条件为37℃作用1 h,酶标抗体工作条件为1∶5 000稀释后,37℃作用1 h,底物作用条件为37℃作用10 min.阴阳性抗原临界值为0.274～0.332.本方法具有很高的特异性和敏感性.     

Serologic surveillance of swine H1 and H3 and avian H5 and H9 influenza A virus infections in swine population in Korea

Influenza A is a respiratory disease common in the swine industry. Three subtypes, H1N1, H1N2 and H3N2 influenza A viruses, are currently co-circulating in swine populations in Korea. An outbreak of the highly pathogenic avian influenza H5N1 virus occurred in domestic bird farms in Korea during the winter season of 2003. Pigs can serve as hosts for avian influenza viruses, enabling passage of the virus to other mammals and recombination of mammalian and avian influenza viruses, which are more readily transmissible to humans. This study reports the current seroprevalence of swine H1 and H3 influenza in swine populations in Korea by hemagglutination inhibition (HI) assay. We also investigated whether avian H5 and H9 influenza transmission occurred in pigs from Korea using both the HI and neutralization (NT) tests. 51.2% (380/742) of serum samples tested were positive against the swine H1 virus and 43.7% (324/742) were positive against the swine H3 virus by HI assay. The incidence of seropositivity against both the swine H1 virus and the swine H3 virus was 25.3% (188/742). On the other hand, none of the samples tested showed seropositivity against either the avian H5 virus or the avian H9 virus by the HI and NT tests. Therefore, we report the high current seroprevalence and co-infectivity of swine H1 and H3 influenza viruses in swine populations and the lack of seroepidemiological evidence of avian H5 and H9 influenza transmission to Korean pigs.     

禽流感H5、H7和H9亚型多重PCR方法的建立

为了建立能够同时检测禽流感H5、H7和H9亚型的多重PCR检测方法,本文分别针对各病毒亚型的HA基因高度保守序列设计了3对特异性引物。通过对反应条件的优化,成功建立了在一个反应中同时检测禽流感H5、H7和H9亚型的多重PCR诊断方法。根据其敏感性的结果可知,该方法对这3种亚型病毒的最低核酸检测量均为1×10~4拷贝/μL,且该方法特异性良好,具有灵敏、快速、成本低等优点,对禽流感病毒的流行病学调查具有指导意义。     

Development of vaccine strains of H5 and H7 influenza viruses

To establish vaccine strains of H5 and H7 influenza viruses, A/duck/Hokkaido/Vac-1/04 (H5N1) [Vac-1/04 (H5N1)], A/duck/Hokkaido/Vac-3/07 (H5N1) [Vac-3/07 (H5N1)], and A/duck/Hokkaido/ Vac-2/04 (H7N7) [Vac-2/04 (H7N7)] were generated from non-pathogenic avian influenza viruses isolated from migratory ducks. Vac-1/04 (H5N1) and Vac-3/07 (H5N1) were generated by genetic reassortment between H5N2 or H5N3 virus as an HA gene provider and H7N1 or H6N1 viruses as an NA gene provider. Vac-2/04 (H7N7) was a genetic reassortant obtained using H7N7 and H9 N2 viruses to give high growth character of the H9N2 virus in chicken embryonated eggs. The results of sequence analyses and experimental infections revealed that these H5N1 and H7N7 reassortant viruses were non-pathogenic in chickens and embryos, and had good growth potential in embryonated eggs. These viruses should be useful to develop vaccines against H5 and H7 highly pathogenic avian influenza viruses.     

H1、H3、H9亚型禽流感病毒多联RT-PCR检测方法的建立

根据GenBank中登录的H1、H3、H9亚型禽流感病毒(AIV)血凝素(HA)基因序列,通过多序列对比,在保守区域内设计了3对特异性引物,对PCR反应体系的各组分进行试验调整,建立了一种H1、H3、H9亚型AIV多联RT-PCR检测方法,在2h内即可判断待检样品中是否有这3种亚型AIV的存在。经灵敏性及特异性试验以及临床样品检测结果证明,该方法灵敏度高、特异性好、结果准确,能够作为H1、H3、H9亚型AIV的快速检测方法。     

禽流感病毒H5、H7和H9亚型一步法多重RT-PCR检测方法的建立

为了建立能同时检测H5、H7和H9亚型禽流感病毒(AIV)的方法,参考GenBank中H5、H7和H9亚型AIV的HA基因序列的保守区域,利用Primer 5.0软件设计3对分别针对AIV H5、H7和H9亚型的特异性引物,预期特异扩增H5AIV片段大小为380bp、H7AIV为501bp、H9AIV为732bp。经过反应条件的优化,建立了同时检测H5、H7和H9亚型AIV的一步法多重RT-PCR方法。该方法特异性强,对其他亚型AIV和禽呼吸道病原体检测结果为阴性;敏感性高,H5、H7和H9亚型AIV RNA的最低检出量分别为10-4、10-4、10-2拷贝/μL。初步建立了快速、敏感、特异地鉴别检测H5、H7和H9亚型禽流感病毒的分子生物学诊断方法。     

Seroepidemiological evidence of avian H4, H5, and H9 influenza A virus transmission to pigs in southeastern China

Pig serum samples collected in southeastern China were examined for antibodies to influenza A viruses. Since the hemagglutination inhibition (HI) test does not accurately detect antibodies to the hemagglutinins (HAs) of "avian" influenza viruses, we utilized the neutralization (NT) test to detect subtype-specific antibodies to the HA of avian viruses in pig sera. Neutralizing antibodies to H1, H3, H4, and H5 influenza viruses were detected in the serum samples collected in 1977-1982 and 1998, suggesting that pigs in China have been sporadically infected with avian H4 and H5 viruses in addition to swine and human H1 and H3 viruses. Antibodies to H9 virus, on the other hand, were found only in the sera collected in 1998, not in those collected in 1977-1982, correlating with the recent spread in poultry and subsequent isolation of H9N2 viruses from pigs and humans in 1998. The present results indicate that avian influenza viruses have been transmitted to pig populations in southeastern China.     

H5、H7和H9亚型禽流感病毒四重荧光RT-PCR检测方法的建立与应用

旨在提高对禽流感病毒（avian influenza virus，AIV）检测效率，及时发现疫病。本研究通过分析M基因以及H5、H7和H9亚型的HA基因序列保守区域，设计并合成了相关探针和引物，建立了禽流感病毒（AIV）四重荧光RT-PCR检测方法，该方法可在检测禽流感病毒（AIV）的同时，确定病原是否为H5、H7和H9亚型。结果显示，该检测方法耗时短、特异性好、检测下限达到10^-5 ng·μL^-1。采用该方法检测临床采集的13个活禽交易市场的384份禽咽喉和泄殖腔双拭子样品，经检测，其中有60份样品为流感病毒阳性，且全部是H9亚型，该结果与行业标准方法（NY/T 772—2013）检测结果一致，κ值为1（P<0.001）。本方法能实现对禽流感病毒及H5、H7和H9亚型的高通量快速检测，将在AIV快速检测中发挥重要作用。