AFLP技术在林木遗传改良中的应用

AFLP是检测DNA多态性的一种高效的分子标记新技术 .该文对AFLP标记的基本原理进行了介绍 ,并综述了其在林木遗传改良中的应用 :构建无性系指纹图谱及遗传图谱、基因定位及分子标记辅助选择育种等 .     

家蚕RAPD、AFLP和SSR标记的研究及比较分析

 【目的】探讨RAPD、AFLP和SSR标记系统在家蚕遗传学研究中各自适用领域，为其在种质资源研究中选择适合的分子标记系统提供参考。【方法】利用RAPD、AFLP和SSR 3种分子标记方法研究了15个家蚕品种的遗传多样性指数，同时对3种标记系统进行了比较分析。【结果】SSR标记位点的期望异质性（He）最大（0.40），AFLP标记位点的He最小（0.25），但AFLP有最高标记指数（MI，15.60）和最高的多态性检测效率（Ai，74.75）。【结论】SSR比AFLP和RAPD的信息含量高，使得它最适合用于种质资源的遗传多样性分析；AFLP的检测效率高即能够在1次PCR扩增反应中检测到最多的DNA带型，非常适合于种质鉴定与保护和构建连锁遗传图谱。     

RAPD和AFLP在分析尼罗罗非鱼遗传多样性研究中的应用比较

比较了RAPD和AFLP标记技术在尼罗罗非鱼遗传多样性研究中的应用。共筛选20个RAPD引物和7个AFLP引物组合,检测到AFLP标记的有效等位基因数和平均多态信息量稍低于RAPD标记,但AFLP标记的多态性检测效率显著高于RAPD标记。两种分子标记所得遗传相似系数接近。结果表明:AFLP和RAPD适宜于基因组DNA检测,但AFLP优于RAPD。     

AFLP标记及其在园艺植物遗传育种中的应用

AFLP(扩增片段长度多态性)标记是一种新的DNA分子标记技术,对其基本原理、方法及特点做了简要介绍.从遗传多样性和亲缘关系分析、品种鉴定和指纹图谱构建、遗传图谱构建、基因定位与克隆、QTL定位、标记辅助选择育种、基因表达与调控研究等方面概述了AFLP标记在园艺植物上的应用进展,并对其存在的问题和应用前景做了探讨.     

AFLP在食用豆类作物种质资源遗传多样性研究中的应用

特异分子标记匮乏是制约从分子水平上研究食用豆类种质资源的关键因素。AFLP(扩增性片段长度多态性)作为一种物种间通用的DNA分子标记,近年来广泛应用于食用豆类种质资源遗传多样性研究中。对AFLP技术在食用豆类作物种质资源遗传多样性研究中的应用进行了全面总结,并展望了AFLP技术在食用豆类分子标记辅助育种中的应用前景。     

2种方法银染的AFLP片段再扩增效果比较及改进

Bassam银染法和Sanguinetti银染法是AFLP标记最常用的检测方法.本研究比较这2种方法银染的AFLP条带再扩增效果的差异,发现Bassam法银染的AFLP片段再扩增效率达到100%,而用同样的PCR条件,sanguinetti法银染的AFLP片段不能被扩增,限制了Sanguinetti法在AFLP标记分析中的应用.为提高Sanguinetti法银染的AFLP片段再扩增效率,对Sanguinetti法银染的AFLP片段回收和再扩增条件进行了改进.通过增加Sanguinetti法显色后的胶板漂洗次数、延长漂洗时间、改变AFLP条带浸泡溶液、增加浸泡液体积和增加PCR循环次数,成功地将Sanguinetti法银染的AFLP条带的再扩增效率提高到100%,从而解决了San-guinetti银染法应用的限制因素.     

艾纳香遗传多样性的SRAP和AFLP对比分析

[目的]分析艾纳香的遗传多样性,为制定其保护策略提供参考依据.[方法]使用分子标记中常用的SRAP和AFLP分子标记对35份艾纳香资源的遗传多样性进行对比分析与评估.[结果]8对AFLP引物组合和27对SRAP引物组合分别扩增获得1360条AFLP多样性条带(多样性比率为99.48%)和265条SRAP多样性条带(多样性比率为97.78%);SRAP分子标记的有效信息位点指数(PIC)、有效多样性指数(EMR)和标记指数(MI)分别为0.4381、8.1000和4.3141,AFLP分子标记的PIC、EMR和MI分别为0.1773、198.0000和301.1348;基于AFLP多样性条带和SRAP多样性条带的遗传相似度对比分析结果表明,35份艾纳香样品的遗传相似度为0.4450~0.9179,两种分子标记的相关系数r=0.47;基于SRAP分子标记遗传相似系数,35份艾纳香样品可分为五大类群;而基于AELP分子标记遗传相似系数,35份艾纳香样品可分为四大类群.[结论]AFLP和SRAP分子标记均可用于艾纳香的遗传多样性分析,但AFLP分子标记分析的多样性位点多、分子标记特征指数高,更适合用于艾纳香的遗传多样性研究.     

5种蔷薇遗传多态性的AFLP分析

[目的]研究AFLP标记在蔷薇遗传多态性方面的应用和5种不同蔷薇品种的遗传背景。[方法]应用10条人工设计的与接头序列相识别的AFLP选择性引物,用PstⅠ酶切,对5种蔷薇基因组DNA进行AFLP反应,分析不同蔷薇间的遗传相似系数和遗传距离。[结果]获得了108个AFLP标记,单引物获得的标记数在4～16,5种蔷薇的遗传相似系数为0.824(0.732～0.947),遗传距离为0.053～0.268。[结论]该研究为评价蔷薇的遗传稳定性提供了相关的参数。     

山西瘦肉型猪(SD-Ⅲ系)基因组DNA的AFLP和RAPD检测研究

用AFLP和RAPD两种分子标记对山西瘦肉型猪(SD Ⅲ系)进行纯度检测,旨在为评价该猪种的遗传稳定性提供相关参数,并对这两种方法应用于遗传距离、相似系数的估测进行了比较。AFLP实验用8条引物,对SD Ⅲ系14头猪进行了基因组DNA分析,共获得101个AFLP标记,单引物获得的标记数在3～15之间,群体相似系数为0 928(0 892～0 978);遗传距离为0 072(0 108～0 022)。RAPD实验用14条随机引物,共获得124个RAPD标记,单引物获得的标记数在4～11之间,群体相似系数为0 944(0 901～0 987);遗传距离为0 056(0 099～0 013)。结果表明:1AFLP和RAPD适宜于基因组DNA检测,但AFLP优于RAPD,2SD Ⅲ系猪纯度较高。     

利用RAPD及AFLP标记分析部分小茴香品种的遗传多样性

采用RAPD和AFLP 2种方法对7份不同地域来源的小茴香材料进行聚类分析,RAPD标记平均每个引物检测到6.0个位点,多态性比率为80.8％；AFLP标记平均每对引物检测位点数为39.4,多态性比率为34.3％；2种标记方法均将参试材料分为3类.结果表明,小茴香的亲缘关系与其地域来源存在相关性,同时小茴香的亲缘关系不...     

核桃AFLP银染技术体系的建立

为了建立准确、高效、实用的核桃AFLP体系,应用于核桃品种鉴别、优异基因的分子标记,本试验针对核桃叶片中多糖、酚类等次生代谢物比较多的特点,采用改良CTAB法,通过添加抗氧化物质,得到了适合核桃AFLP分析的基因组DNA提取方法;在此基础上进行了AFLP体系中主要参数的优化研究,比较了两种银染方法的效果,并从64对选择性扩增引物中筛选出了18对适合核桃AFLP分析的引物,建立了能得到清晰指纹分析图像的核桃AFLP技术体系。     

茶树AFLP--银染技术体系与品种指纹图谱的建立

通过对影响茶树AFLP—银染技术体系的关键因素作对比研究，建立了一套优化的茶树AFLP分子标记体系．应用该体系研究不同茶树品种的AFLP指纹，结果同一引物对不同品种扩增及不同引物对同一品种扩增都呈现出十分丰富的多态性，图谱清晰，分辨率高。     

长豇豆AFLP技术体系的构建与优化

通过对影响长豇豆AFLP分析技术体系的若干关键因素,如DNA的提取方法、酶切与连接时间、预扩增和选择性扩增以及电泳和染色条件等的研究,建立一套经优化的长豇豆AFLP分析技术体系。应用该体系进行长豇豆AFLP分析,能够得到清晰的分子标记图谱,且结果稳定,重复性好。     

苦瓜AFLP和SRAP的PCR反应体系优化及应用比较

【目的】优化苦瓜AFLP和SRAP的PCR反应体系,比较这两种分子标记在苦瓜应用中的优劣,为苦瓜突变体筛选提供参考。【方法】以8份苦瓜种质为材料,对AFLP和SRAP反应体系中各反应因素浓度进行筛选优化;分别选取5对条带清晰、重复性好的AFLP和SRAP引物对8份苦瓜材料进行扩增,比较其多态性。【结果】在AFLP反应体系中,在0-10倍稀释范围内,以连接产物稀释5倍时反应效果较好;将预扩产物稀释30倍进行选择性扩增为宜。在SRAP反应体系中,Mg^2＋浓度为2．5mmol／L、dNTP浓度为0．2mmol／L时,反应效果较好。多态性分析结果显示,5对AFLP引物共扩增出145条带,多态性条带有18条,多态性比率为12．41％;5对SRAP引物扩增条带数为109条,其中多态性条带数有9条,多态性比率为8．25％。【结论】AFLP和SRAP两种分子标记技术均可以很好反映苦瓜种质资源的遗传多样性,但AFLP扩增产物的平均多态性高于SRAP,能够比较稳定地筛选出差异条带。     

AFLP技术原理及其在植物研究中的应用

AFLP是检测DNA多态性的一种分子标记技术,对其原理、方法与特点进行了介绍,并综述其在植物遗传多态性、基因定位及遗传图谱构建和分子育种等方面的现状和应用前景。     

辣椒AFLP技术体系的建立与优化

以辣椒细胞质雄性不育系21A及其相应的保持系21B为材料,通过对影响辣椒AFLP技术体系的若干关键因素,如提取DNA的方法、酶切与连接、预扩增和选择性扩增以及电泳和染色条件等的研究,建立了经优化的适合于辣椒的AFLP分子标记技术体系。采用该体系,对辣椒进行AFLP分析,能够得到清晰稳定的分子标记图谱,为今后利用AFLP技术进行辣椒细胞质雄性不育基因的定位奠定了技术基础。     

野生天麻·栽培天麻的RAPD和AFLP标记遗传多态性分析

[目的]用RAPD和AFLP技术对采自主产区不同地域的2份野生天麻和7份栽培天麻进行多态性和聚类分析,研究天麻的遗传多样性及其原因。[方法]用酚-氯仿法提取的基因组DNA,经RAPD及AFLP程序扩增后分别用琼脂糖凝胶和PAGE电泳检测,使用NTSYSpc-2.10s软件的UPGMA方法对检测结果进行聚类。[结果]用RAPD和AFLP数据得到的聚类图相似,来自不同地方和不同海拔高度的样品在聚类图上得以区分。天麻与蜜环菌之间没有共同条带。[结论]包括海拔在内的地域隔阂,而非人工种植可能是产生天麻种内遗传多样性的重要原因;虽然天麻靠消化侵入其皮层内部的蜜环菌菌丝提供营养而进行发育,但是它们之间没有DNA的相互作用。     

川牛膝(Cyathula officinalis Kuan.)RAPD和AFLP标记的多态性聚类分析

[目的]用RAPD和AFLP技术对采自主产区不同地域的川牛膝Cyathula officinalis Kuan.、头花杯苋Cyathula capitata(Wall) Moq及它们的杂交品种杂交牛膝Hybrid accsssion进行多态性和聚类分析研究。[方法]用酚-氯仿法提取的基因组DNA,经RAPD及AFLP程序扩增后分别用琼脂糖凝胶和PAGE电泳检测,使用NTSYSpc-2.10s软件用UPGMA方法对检测结果进行聚类。[结果]RAPD和AFLP技术在分析遗传多样性和品种鉴定方面各有优缺点;采自同一地方的川牛膝具有最近的亲缘关系,头花杯苋、杂交牛膝与其他采自各地的川牛膝品种之间的遗传差异较大。[结论]在川牛膝中,DNA的差异与地域性有较大关系,说明药材确有地道性的特征,从而在DNA水平上证明了药用植物上的地道性观点。     

番茄大花萼突变体MC基因的AFLP分子标记及种质资源筛选

采用AFLP分子标记方法,在DNA水平上研究番茄大花萼基因.以番茄大花萼突变体品种08085和正常番茄品种08086为亲本材料,分析鉴定了08086×08085以及其有性杂交F1、F2代分离群体的田间表现.结果表明,番茄花萼突变体MC基因所控制的性状是单显性遗传性状.研究用488对引物筛选出3个与番茄MC基因紧密连锁的...