3个鸡群体中4个微卫星DNA多态性及其与杂种优势的关系

利用4个微卫星标记（ADL101、MCW020、ADL183、ADL298）对玫瑰冠鸡、新罗曼鸡和安卡红鸡的等位基因频率、群体多态信息含量、有效等位基因数、杂合度和遗传距离进行了遗传检测,并测定了玫瑰冠鸡与安卡红鸡及新罗曼鸡的杂交效果。结果表明,4个微卫星标记在玫瑰冠鸡、安卡红鸡和新罗曼鸡3个群体中存在多态性,可以用于鸡遗传多样性的评估;从不同的群体来看,安卡红肉鸡遗传变异程度最大,而玫瑰冠鸡的遗传变异程度相对较小;玫瑰冠鸡与安卡红鸡的遗传距离大于其与新罗曼鸡的遗传距离,玫瑰冠鸡与安卡红鸡的杂种优势高于与新罗曼鸡的杂种优势,与实际杂种优势测定结果相符。     

基于SSR与AFLP指纹的4个鸡品种及其杂交后代的遗传特征分析

利用20对微卫星引物和6种AFLP引物组合对狄高黄鸡(T1、T2)、安卡红鸡(A)、石岐杂鸡(S)、隐性白羽鸡(D1、D2)4个鸡品种及其F1代、F2代计9个群体进行遗传特征分析,研究4个鸡种亲本间及其与F1代、F2代不同群体间的遗传关系.结果显示20个微卫星座位在9个鸡群体中共检测到126个等位基因,等位基因数最多达9个,最少为4个,获得的平均等位基因数为6.3个.9个群体平均杂合度在0.281～0.695之间,多态信息含量在0.245～0.664之间;亲本4个品种6个群体平均杂合度在0.281～0.391之间,多态信息含量在0.245～0.367之间;F1代与F2代的平均杂合度在0.601～0.695之间,多态信息含量在0.553～0.664之间;4个亲本之间的遗传距离为0.4882～0.6230,亲本与F1代的遗传距离在0.1238～0.1714,亲本与F2代的遗传距离在0.2631～0.3104, F1与F2的遗传距离为0.1322和0.1442;6种AFLP引物组合在9个鸡群体中检测到了数量不等的特异性条带,其中F2最多,为5条,亲本隐性白羽鸡最少,为1条.表明分子遗传检测结果与鸡品种(群体)的选育状况基本一致,为预测品种(系)之间的杂种优势,配套系的培育提供了科学依据,同时为从分子水平鉴定鸡品种奠定了研究基础.     

猪配套系选育方法的研究

利用8个微卫星标记对杜长大三元杂交群体5个种群和斯格配套系8个种群的遗传结构进行了分析,并通过计算等位基因频率、F-统计量分析配套系群体间和群体内的遗传变异情况。结果表明,不同的微卫星位点上有特异的条带,可以作为专门化品系定位的辅助标记,如S0214位点138bp可作为父本父系的选育方向的特有条带,S0003位点162bp可作为母系方向选育的特有条带,S0003位点的155bp可作为母本母系方向选育的特有条带,S0515位点中156bp和161bp是母本父系不具有的条带。固定系数Fst在斯格猪和杜长大纯种上的遗传分化不大,可作为专门化品系选育程度的指标。     

黄羽肉鸡群体遗传变异的微卫星分析及其与体重杂种优势的关系

选用10对微卫星引物分析了黄羽肉鸡A、B、C3个品系的遗传结构和差异,并对微卫星标记所计算的个体间遗传距离与C×B、C×A杂交后代的初生至8周龄体重的杂种优势和杂种优势率进行了相关分析。结果表明,10个微卫星标记中有9个表现出多态性,多态信息含量(PIC)和群体杂合度(Heterozigosity)分别为0·4400和0·6811,各品系、各微卫星基因座上都表现出一定差异。利用9个多态微卫星标记计算得出的亲本个体间的遗传距离与后代杂种优势率间多数没有显著的相关(P>0·05),仅C×B组合中亲本个体间平均遗传距离与第8周龄体重杂种优势和杂种优势率间相关显著(P<0·05)。     

固始鸡不同品系及部分外来鸡种遗传多样性的微卫星分析

利用10个微卫星标记,对固始鸡5个系和4个非固始鸡品系共9个群体的等位基因频率、遗传杂合度、群体间的遗传距离等进行了分析,并根据遗传距离进行了聚类分析。结果表明:星红褐鸡与绿壳蛋鸡被聚为一类,固始鸡慢羽系与快羽系被聚为一类,固始鸡被聚为一大类,罗曼鸡自成一类,艾维茵鸡也自成一类。     

利用微卫星DNA多态性预测半番鸭的杂种优势

为探究微卫星DNA多态性与鸭肉用性能杂种优势的相关关系,选取10对微卫星标记对金定鸭、樱桃谷鸭、F1(樱桃谷鸭×金定鸭)和番鸭进行遗传多样性检测。利用ONEDscan、GENEPOP、Mstools软件对目的基因进行分型,计算遗传多样性参数以及群体间标准遗传距离,并测定半番鸭各杂交组合F1代体重杂种优势。结果表明:在4个鸭群体共检测到52个等位基因,金定鸭、F1(樱桃谷鸭×金定鸭)、樱桃谷鸭与番鸭群体间标准遗传距离分别为0.57678、0.52220、0.46356,樱桃谷鸭与金定鸭遗传距离为0.38949。并根据遗传距离,采用对数曲线模型对半番鸭体重杂种优势进行了预测,χ2检验结果显示,预测结果与实验测定结果无显著性差异,表明本研究建立的根据微卫星DNA多态性预测半番鸭部分生长阶段体重杂种优势是可行的。     

利用微卫星DNA多态性预测引进肉用绵羊品种杂种优势

旨在利用微卫星DNA在不同绵羊群体中的多态性预测引进肉用绵羊品种与地方绵羊品种的杂种优势。利用23个微卫星基因座对4个国外引进肉羊品种及3个地方绵羊品种的群体多态信息含量、有效等位基因数、杂合度和遗传距离进行遗传检测,并测定引进肉羊与地方肉羊品种的杂交效果。结果,23个微卫星座位在7个绵羊群体中均呈现高度多态,共检测到348个等位基因,平均每个座位等位基因数为15个;多态信息含量在0.532 1~0.936 1,有效等位基因数在2.572 8~9.345 8,平均杂合度在0.549 2~0.936 0,品种平均杂合度在0.714 2~0.829 5,可以用于绵羊遗传多样性的评估。从不同品种看,无角陶赛特的遗传变异最大,而小尾寒羊的遗传变异相对较小;经遗传关系分析,在引进的4个肉羊品种中,与小尾寒羊、蒙古羊及滩羊杂交优势由大到小依次为白萨福克、波德代、无角陶赛特、特克赛尔,与实际杂种优势测定结果一致。利用微卫星DNA多态性预测引进肉用绵羊品种与小尾寒羊、蒙古羊及滩羊的杂种优势是可行的,这将对今后绵羊育种具有重要的应用价值和指导意义。     

三个微卫星标记在松辽黑猪中的遗传多样性研究

利用3个微卫星标记ESTMS20、SW2570和S0002对松辽黑猪的等位基因频率、有效等位基因数(Ne)、遗传杂合度(H)和群体多态信息含量(PIC)进行了遗传检测.结果表明,这3个微卫星标记在松辽黑猪中均存在多态性,可以用于松辽黑猪遗传多样性的评估.     

黄羽肉鸡遗传变异的微卫星分析及其与体重杂种优势的关系

本实验选用10对微卫星引物,分析了黄羽肉鸡A、B、C三个品系的遗传结构和差异,并对微卫星标记所计算的个体间遗传距离与C×B、C×A杂交后代的初生重及2、4、6、8周龄体重的杂种优势和杂种优势率进行了相关分析。结果表明,10个微卫星标记中有9个表现出多态性。利用这些微卫星标记计算得出的亲本个体间的遗传距离与后代杂种优势率间多数只有弱的正相关或负相关,仅C×B组合中亲本个体间遗传距离与第8周龄体重杂种优势和杂种优势率间有显著相关关系。     

微卫星标记测定湘西黄牛杂交牛的遗传多样性及其与生产性能的相关性研究

通过6对微卫星DNA标记对湘西黄牛及其与安格斯、夏洛来、利木赞和西门塔尔牛的杂交牛进行了遗传多样性分析,以期了解湘西黄牛及其杂交牛的群体遗传结构和育成情况.通过计算多态信息含量(PIC)、平均杂合度(H),评估湘西黄牛遗传变异和各杂交品种间遗传相关.结果表明,6个微卫星座位共检测到52个等位基因,平均等位基因数为8.67个;6个微卫星座位的多态信息含量在0.6858～0.8576间.表现出较为丰富的信息含量;4个杂交品种与湘西黄牛之间的遗传距离为0.1620～0.2554;杂交牛与湘西黄牛间遗传距离与杂种优势率的相关系数为0.9142,平均基因杂合度与杂种优势率的相关系数为0.8517,呈高度正相关.结果表明,有效微卫星标记的利用能有效的测定湘西黄牛杂交牛的遗传多样性,提高其生产性能.     

微卫星标记预测太行鸡与其他高产商品蛋鸡亲本间的杂种优势

为了给太行鸡的杂交改良提供参考依据,试验首先选取10个多态性微卫星标记座位,对太行鸡、海兰灰父系、海兰灰母系、罗曼粉父系、罗曼粉母系、京粉1号父系、京粉1号母系7个群体进行遗传多样性分析,计算群体遗传杂合度(He)、多态性信息含量(PIC)、不同品种的有效等位基因数(E),然后计算群体间的Nei式遗传距离,进行系统聚类分析。结果表明:所选择的微卫星标记座位多态性丰富,10个微卫星标记座位的PIC值在0.584 2～0.657 5之间,有效等位基因数在5.27～5.75个之间,杂合度在0.414 0～0.657 9之间,说明所选的微卫星标记座位可靠;群体间Nei式遗传距离以及系统聚类分析结果得出太行鸡与罗曼粉父系遗传距离最大(0.340 7),其次是海兰灰母系,海兰灰父系与京粉1号父系遗传距离最近(0.056 6),据此推测太行鸡母系与罗曼粉父系、太行鸡父系与海兰灰母系间杂种优势较高。     

闽南黄牛的微卫星多态性研究

：用8个微卫星标记对闽南黄牛的等位基因频率、多态信息含量、杂合度和有效等位基因数等指标进行统计分析，并在此基础上对其进行聚类分析和分类研究。结果：8个微卫星标记在所检测的闽南黄牛群体中都表现出较丰富的多态性，在4个群体8个微卫星座位共有58个等位基因，每个微卫星标记平均检测到7．2个等位基因（3～11）；8个微卫星标记的平均多态信息含量（PIC）为0．6471，各群体的平均多态信息含量（PIC）差并不显著；全部群体平均杂合度为0．2930；各群体平均有效等位基因数为3．37。此表明闽南黄牛在微卫星位点上具有丰富的遗传多样性；根据奈氏标准遗传距离进行UPGMA聚类分析，结果表明4个群体间的遗传变异不大。     

特克塞尔羊和地方绵羊品种微卫星DNA多态性分析及群体间杂种优势预测

文章宗旨是利用5个微卫星标记分析5个绵羊品种的遗传结构变异,了解特克塞尔羊和地方绵羊品种的遗传多样性及亲缘关系,以期为种质资源合理利用和保护提供理论依据.根据5个绵羊品种在5个微卫星位点的等位基因组成及频率进行群体遗传统计分析.5个微卫星座位在5个绵羊品种中共检测到78.0个等位基因,各位点的等位基因数(Na)11.0～19.0个;5个绵羊品种平均多态信息含量(PIG)为0.615 2～0.7373,平均基因杂合度(He)为0.671 1～0.7820.特克塞尔羊与晋中绵羊的标准遗传距离(DS)为最大(1.6668),其余依次为广灵大尾羊(1.3062)、小尾寒羊(1.095 9)、乌珠穆沁羊(0.8308).表明5个微卫星座位均为高度多态位点,可作为有效遗传标记用于绵羊品种的遗传多样性及品种间遗传关系分析;5个绵羊品种在5个微卫星位点遗传变异大、多态性丰富.据DS推测,特克塞尔羊(Texel)与晋中绵羊(Jinzhong sheep)杂交可望获得较大的杂种优势,与广灵大尾羊(Guangling Large-tailed sheep)、小尾寒羊(Small-tailed Han sheep)的杂种优势次之,与乌珠穆沁羊(U jumqin sheep)杂种优势稍小.     

微卫星标记遗传距离与鸡杂种优势的相关分析

试验利用微卫星标记技术测定6个亲本群体及其杂交后代间的遗传距离,并结合鸡主要经济性状的杂种优势率进行了相关性分析。结果表明,亲本间遗传距离与7个性能指标杂种优势率的相关系数绝对值在0.0651～0.9344之间,胸宽、腹脂重、半净膛重、全净膛重、腿肌重与遗传距离呈正相关;初生重、胫长与遗传距离呈负相关,获得了全净膛重等3个可用于预测杂交后代生产性能的指标,提示微卫星标记遗传距离对杂种优势的预测有重要的参考价值。     

肉牛杂交亲本遗传距离与杂种优势的相关性研究

利用11个微卫星标记研究川南山地黄牛、海福特牛、黑安格斯牛、红安格斯牛、利木赞牛、西门塔尔牛、德国黄牛的遗传多样性,分析肉牛亲本间微卫星标记遗传距离与体尺、体重杂种优势间的相关性。结果表明:11个微卫星基因座平均有效等位基因数为4.5422,7个牛种的多态信息含量在0.3434~0.4207,平均杂合度为0.6868~0.8413,7个牛种均具有丰富的多态性。亲本间遗传距离与体尺、体重杂种优势间相关系数偏小(-0.003~0.304),均未达到显著水平,用微卫星标记遗传距离预测肉牛体尺、体重杂种优势还有待进一步探讨。     

宁夏牧区主要绵羊品种遗传多样性分析及群体间杂种优势预测

利用7个微卫星标记对宁夏牧区陶赛特、得克赛尔、萨福克、滩羊、小尾寒羊、滩寒杂种羊6个绵羊群体进行遗传多样性检测,并根据遗传距离对群体间杂种优势进行预测,结果显示：6个绵羊群体共检测到108个等位基因,每个座位在每个群体都检测到5个以上等位基因,7个微卫星座位在6个群体中呈高度多态性,期望杂合度远大于观测杂合度,群体问表型分化系数（Fst）较低,为5．8％,与Gst结果基本一致,总群体近交系数（Fit）为56．90％,群体内近交系数（Fis）为54．36％。根据DC遗传距离和DA遗传距离,预测群体间杂种优势,杂交母本品种以滩寒杂种羊效果最好,滩羊次之,小尾寒羊最差;杂交父本的选择顺序为得克赛尔、萨福克、陶赛特。     

利用微卫星分析中国家兔的遗传多样性

利用10个微卫星DNA标记对七个家兔品种进行了遗传检测.利用变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测微卫星的PCR扩增产物,计算了七个家兔品种(9个家兔群体)样本在10个微卫星基因座上的等位基因频率、微卫星的多态信息含量(PIC)、各群体遗传杂合度、群体间的遗传距离、并根据遗传距离对这几个群体进行了聚类分析.结果表明:所选择的10个微卫星位点在所检测群体中均表现了较好的多态性,平均多态信息含量为0.569905.平均杂合度范围在0.5885～0.6826.表明所研究的家兔品种的遗传多样性较丰富,还可以做进一步的选择利用.根据遗传距离所做的聚类分析图表明吉戎-Ⅰ系和吉戎-Ⅱ系、哈尔滨大白兔、塞北兔的亲缘关系依次较近,与它们的培育历史相吻合.     

皖江麻鸡三个选育品系微卫星遗传多样性分析

皖江麻鸡是我国新近培育出的优质肉鸡品种,早期生长快,饲料报酬高,抗逆性强,肉质好.本研究利用10个微卫星标记分析了3个母本品系的多态性,并利用遗传距离预测了杂种优势,为进一步更新配套系提供参考.     

结构基因座和微卫星标记应用于绵(山)羊群体遗传分化的比较研究

对湖羊、同羊及长江三角洲白山羊的随机样本分别进行14个结构基因座和7个微卫星标记的遗传检测,比较由两种遗传标记获得的群体基因平均杂合度(H)、多态信息含量(PIC)及群体有效等位基因数(Ne);分别根据两种类型的基因频率资料,计算3个群体间的标准遗传距离并加以比较。结果表明:由微卫星等位基因频率获得的群体基因平均杂合度、多态信息含量及有效等位基因数显著大于结构基因座获得的,但在三群体中变化趋势是一致的;由结构基因座资料计算的3个群体间标准遗传距离为0 0268～0 2487,微卫星标记资料计算的3个群体间标准遗传距离为:0 2321～1 2313,绵山羊间显著大于绵羊群体之间。提示:结构基因座和微卫星标记一致揭示3群体内的遗传变异;同羊>湖羊>长江三角洲白山羊;微卫星标记较结构基因座标记更能表达近缘种间进化趋异水平,可将FCB11、MAF33、AE101、FCB128及FCB304位点作为研究绵山羊近缘种间遗传分化的标志性位点。     

甘肃高山细毛羊优质毛品系15个微卫星位点的遗传多样性分析

研究对甘肃高山细毛羊优质毛品系的15个微卫星位点进行了遗传多样性检测.计算了各位点的等位基因频率(P)、杂合度(H)、多态信息含量(PIC)和有效等位基因数(Ne).结果表明:15个微卫星位点中有1个未检测到多态,其余14个均表现出高度多态性.多态性标记在该群体中的平均等位基因数为10个,平均多态信息含量PIC=0.83,平均杂舍度H=0.85,平均有效等位基因数Ne=7.1.说明甘肃高山细毛羊优质毛品系的遗传多样性丰富,遗传变异程度较高,基因一致度较差,变异性较大,具有较大的选择潜力.这14个位点可以作为有效的遗传标记,用于甘肃高山细毛羊优质毛品系遗传多样性分析及其与各生产性状的相关性研究.