加州鲈肌肉生长抑制素(MSTN)cDNA的克隆和序列分析

肌肉生长抑制素是抑制肌肉生长和发育的生长调控因子。对运用RT-PCR和RACE技术从加州鲈成鱼肌肉总RNA中扩增得到的MSTN cDNA全序列进行了序列分析。结果表明,加州鲈MSTN cDNA全长为1626bp,其开放阅读框为1 134bp,共编码377个氨基酸,前面的22个氨基酸为信号肽,中间有四个氨基酸(RARR)为蛋白水解加工位点;该基因总共有13个半胱氨酸残基,后面9个在蛋白水解加工位点之后的C端生物活性区,与其它脊椎动物比较,它们的位置完全一致,对该基因的结构和功能非常重要。与GenBank中已知的条纹狼鲈、金鲷、斑马鱼、虹鳟、斑点叉尾鮰、人、猪、鸡、鸽MSTN的ORF相比较,核苷酸序列同源性为63%~94.4%,氨基酸同源性为61.4%~96%,特别是在C端生物活性区氨基酸同源性为88.1%~100%,高度的保守性反映了该基因受到了高度的进化限制以及功能的重要性。加州鲈MSTN基因的克隆为研究该基因打靶和鱼类肌肉发育调控机理奠定了基础。     

克氏原螯虾病原弗氏柠檬酸杆菌的分离鉴定及其药敏与黏附特性

为了明确安徽省当涂县淡水养殖克氏原螯虾暴发性疾病的病原,取濒临死亡的病虾分离病原。从肝胰腺中分离到一株优势细菌(命名为XLX1分离株),人工感染试验证实其具有较强的致病性;采用形态学检查、生理生化特性测定和细菌16S r RNA基因序列分析,确定XLX1分离株为弗氏柠檬酸杆菌。进一步对XLX1分离株进行药物敏感性、携带黏附素基因情况和细胞黏附性进行检测。结果显示:该分离株对头孢噻肟、庆大霉素、阿米卡星、硫酸新霉素、恩诺沙星、诺氟沙星、替考拉宁和米诺环素敏感或中敏,对其他7种测试药物呈现耐药。该分离株携带黏附素基因cfa和ure基因簇;序列分析发现ure ABC结构基因和ure D关键辅助基因高度保守,在虾源分离株与人源参考株间前者的核苷酸和氨基酸序列同源性分别在93.2%~98.3%和91.7%~97.4%,后者的核苷酸和氨基酸序列同源性分别在90.8%~98.3%和94.7%~98.7%;与人源参考株相比,虾源分离株Ure ABC结构蛋白中第294、600和608位氨基酸,以及Ure D蛋白中的第62和122位氨基酸发生了有意突变。XLX1分离株可以聚集方式黏附于EPC细胞周围,平均黏附菌数为29.8±5.3,但随黏附时间延长,EPC细胞出现病变。上述研究结果可为防控弗氏柠檬酸杆菌引起的水产动物疾病提供理论依据。     

仿刺参超氧化物歧化酶基因cDNA全序列的克隆及其特征分析

以仿刺参Apostichopus japonicus为材料,利用cDNA末端快速扩增(RACE)方法首次得到仿刺参MnSOD的全长cDNA。该全长cDNA大小为955bp,其中5′端非编码区67bp,3′端非编码区216bp,开放阅读框(ORF)672bp,在3′端有多聚腺苷酸信号序列ATTTA,并有polyA加尾,符合有效翻译的基因全长cDNA的特征。MnSOD全长cDNA可编码223个氨基酸的前体蛋白,预测蛋白分子质量为24.64kD,理论等电点是6.66,为亲水性蛋白。该蛋白序列没有信号肽和跨膜结构,仅有一段线粒体导肽。其二级结构主要以α-螺旋为主,无规则卷曲和延伸链构成了蛋白中量最大的结构元件,不含β-折叠。仿刺参SOD的氨基酸序列与目前已报道的其他物种如人、牛、斑马鱼、原鸡、非洲爪蟾、中国对虾、皱纹盘鲍、海湾扇贝、果蝇等的MnSOD氨基酸序列进行序列比对的结果表明,相似性均在61%～69%之间,说明该基因在各物种间具有一定的保守性。该段氨基酸序列无N-糖基化位点,含有3个蛋白激酶C磷酸化位点,1个酪氨酸蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点,5个肉豆蔻酰基化位点,还发现了1个SOD家族的特征肽段DVWEHAYY。对磷...     

异育银鲫Toll样受体3的cDNA序列分析与蛋白质高级结构预测

利用RT-PCR、RACE及克隆等方法获得了异育银鲫Toll样受体3(cagTLR3)基因全长cDNA序列.该cDNA全长3170 bp,5'端非编码区181 bp;3'端非编码区283 bp;开放阅读框(ORF)2706 bp,编码901个氨基酸.经序列同源性分析显示,其编码的氨基酸序列与金鱼、斑马鱼、斑点叉尾鲴、虹鳟和红鳍东方鲍有较高的相似性,其相似性分别为92%、88%、79%、75%和72%,说明TLR3在长期的进化中具有较高保守性.TLR3全长序列起始21个氨基酸残基为信号肽;50至695个氨基酸残基间包含15个富含亮氨酸的重复序列(LRR);704至726个氨基酸残基为跨膜区(TM);754至897个氨基酸残基为与白介素-1受体高度同源的区域(TIR).将异育银鲫TLR3与人和斑马鱼胞内TIR结构的氨基酸比对后发现,Phe728、Leu738、Tyr756与Arg736在TLR3的信号转导及胞内定位过程中起到关键作用.异育银鲫TLR3胞外配体结合域的三维结构呈U型,与人TLR3的相应结构十分相似,在N端具有1个二硫键,C端有2个.因LRRs上的插入序列和14个糖基化位点,异育银鲫TLR3胞外配体结合域内表面的大量β-折叠结构呈平坦的平面.     

浒苔中MnSOD和CAT基因克隆和表达分析

实验以大型绿藻浒苔为材料,克隆了其抗氧化系统关键酶锰超氧化物歧化酶(manganese superoxide dismutase,Mn SOD)和过氧化氢酶(catalase,CAT)基因的部分片段,利用荧光定量PCR技术研究了Mn SOD和CAT对温度和水杨酸作用的响应规律。结果获得浒苔318 bp的Mn SOD基因,该Mn SOD推测的氨基酸序列与裂片石莼Mn SOD相似性最高为89%;获得了229 bp的CAT基因,该浒苔CAT编码氨基酸序列与裂片石莼和雨生红球藻CAT序列相似性分别为99%和93%。在利用M n SOD和CAT氨基酸序列构建的系统树中,浒苔均先与裂片石莼聚类,再与其他绿藻聚在一起。不同温度对浒苔Mn SOD和CAT基因表达影响表明,35℃高温培养对浒苔Mn SOD和CAT基因表达影响最显著,其表达量分别为25℃培养的2.18倍和2.05倍;5℃低温培养次之;而15℃与25℃培养对M n SOD和CAT基因表达影响差异不显著(P0.05)。在高温35℃下,添加0.1 mmol/L水杨酸后Mn SOD和CAT基因表达量分别为各自对照的2.08倍和5.30倍,而0.01 mmol/L水杨酸添加后基因表达与对照差异不显著(P0.05)。研究表明,Mn SOD和CAT基因表达的增强不仅是浒苔对高温胁迫的响应,而且也是水杨酸缓解高温对浒苔不利影响的方式之一。     

仿刺参性别相关基因P450c17的克隆与序列分析

本研究克隆了仿刺参(Apostichopus japonicus)P450c17基因的全长cDNA,结果表明其cDNA的5′端UTR为256 bp,3′端UTR为250 bp,ORF为1 530 bp。在3′端有特殊序列ATTTA、终止密码子TAA和polyA加尾。其全长cDNA编码509个氨基酸的前体蛋白,预测蛋白分子量57.6 kD,理论等电点5.5。P450c17的氨基酸序列存在长度为25个氨基酸的信号肽,1个长度为22个氨基酸的跨膜区,1个糖基结合位点NHS,1个P450特有的结构域,其氨基酸序列具有明显的细胞色素P450基因家族的特征。结构域中亚铁血红素结合域中的精氨酸R和发挥活性所必须的半胱氨酸C都是保守的。这些结构组成了血红素结合环、质子传递槽和K螺旋及绝对保守EXXR基序。蛋白前体二级结构中无规则卷曲占41.22%,延伸链占12.77%,α–螺旋占46.01%,不含–折叠。氨基酸序列与其他物种氨基酸序列的同源性在35%～41%之间。系统进化树表明仿刺参与长牡蛎(Crassostrea gigas)及文昌鱼(Branchiostoma belcheri)聚为一支,黄颡鱼(Pelteobagrus fulvidraco)、鲇(Clarias gariepinus)、日本鳗鲡(Anguillajaponica)及白斑角鲨(Squalus acanthias)聚为一支,三刺鱼(Gasterosteus aculeatus)、金眼门齿鲷(Stenotomus chrysops)、斑马鱼(Danio rerio)、鲤(Cyprinus carpio)、虹鳟(Oncorhynchus mykiss)、牙鲆及青鳉(Fundulus heteroclitus)聚为一支。研究结果为进一步探讨仿刺参P450c17在性激素调控性别分化方面的功能提供参考。     

我国养猪业圆环病毒病的感染情况

<正>我国猪群中猪圆环病毒2型感染十分普遍。刘长明等采用免疫过氧化物酶单层细胞染色的试验(IPMA)方法,对来自黑龙江、吉林、河北、上海、内蒙、云南、江西等地猪场的健康成年猪血清480份,以及发病猪血清424份进行了检测,抗体阳性率分别为91.7%和79.2%,送检样品的12个猪场均为阳性,表明猪圆环病毒2型在我国猪群中感染率非常大对发生高热症猪场送检的病料进行检测发现猪圆环病毒型阳性样品中多数与     

高蛋白配合饲料替代饲喂对拟穴青蟹肠道菌群的影响

为探明蟹公寓养殖模式下,高蛋白配合饲料替代杂鱼饲喂对拟穴青蟹菌群的影响,采用16S rRNA高通量测序技术,比较分析养殖过程中不同饵料组拟穴青蟹的肠道菌群结构。结果显示,各饵料组中优势菌群均为变形菌门、厚壁菌门、梭杆菌门和拟杆菌门,占操作分类单元总数85.84%以上。不同饵料组共有细菌操作分类单元(695个)占总数的18.92%,其序列数占总序列数的95.39%。主坐标分析显示不同饵料组肠道菌群的群落结构未产生显著分化。共现性网络分析显示,随养殖过程推进,微生物互作网络复杂度降低。功能预测分析显示,细菌次生代谢产物的生物合成、转运和分解代谢等功能主要在养殖前期出现显著性差异,而养殖后期饵料组间无显著性差异。试验结果表明,蟹公寓养殖过程中,不同饵料会对拟穴青蟹的肠道菌群造成影响。与杂鱼组相比,高蛋白配合饲料在维持肠道菌群多样性方面有一定优势,同时未显著影响肠道细菌群落结构和功能。     

马氏珠母贝EST微卫星的筛选

构建了马氏珠母贝的血液、足、鳃、胃、肝、心脏、外套膜、珍珠囊和感染多毛虫马氏珠母贝的血液(血感)等9个组织的cDNA文库,测序获得了6979个EST序列,从中查找到了268个重复序列,隶属于243个EST,含微卫星的EST数占EST总数的3.48%.珍珠囊cDNA文库含微卫星的序列所占比例最高,为6.16%,血感的最低,为1.65%.双碱基重复序列130个,占48.5%,(AT/AT)n类型最常见;三碱基类型的83个,占约31%,其中(AAT/ATT)n和(AAG/CTT)n较多;四碱基重复的有30个,占11.2%,(AAAT/ATTT)n占了该类型的约50%.一共能够设计151对微卫星引物,有130对可以扩增,占合成引物总数的86.09%,其中,多态性引物45对.多态性EST-SSR的筛选将为马氏珠母贝的分子遗传学研究、种质鉴定和野生资源保护等提供可靠的工具.     

泥蚶乙二醛酶Ⅰ基因的克隆及时空表达特征分析

为探索贝类乙二醛酶Ⅰ基因的结构及功能特征,实验利用RACE技术首次克隆获得泥蚶乙二醛Ⅰ基因(Tg-GLOI)的cDNA全长序列,并对其氨基酸序列特征及时空表达特征进行了研究。结果发现,Tg-GLOI基因的cDNA全长序列为1 807 bp,开放阅读框为540 bp,编码180个氨基酸,在27~169 aa处具有典型的乙二醛酶系保守序列;成熟的乙二醛酶Ⅰ由2个相同的亚基组成,每个亚基由乙二醛Ⅰ基因编码,其二级结构由18个α-螺旋、20个β-折叠片和36个转角组成,每个亚基各含1个Zn2+;氨基酸序列比对发现,Tg-GLOI氨基酸序列与太平洋牡蛎的同源性达到86.1%,与其他脊椎动物的同源性也都在70%以上,表现出高度保守性。qRT-PCR结果显示,Tg-GLOI基因在泥蚶成贝8个组织中均有表达,在内脏团中的表达量最高,极显著地高于其他组织(P0.01);在各发育时期中,Tg-GLOI表达量随发育进程呈逐渐升高的趋势,在眼点幼虫期达到最高,极显著高于其他时期(P0.01),而在幼虫变态至稚贝时,表达量又极显著地下降(P0.01)。研究表明,Tg-GLOI具有类似于高等动物的分子结构,并在泥蚶不同组织、不同发育时期表达差异显著,这为进一步研究该酶在贝类中的功能和作用机制奠定了重要基础。     

Susceptibility of strains of Aeromonas salmonicida to killing by cell-free generated superoxide anion

Abstract. Superoxide anion was generated in a cell-free system using photoreduced riboflavin and methionine. This allowed the susceptibility to killing by superoxide of 11 strains of Aeromonas salmonicida to be investigated. A good correlation was found between susceptibility and 'virulence factors' of the different strains. In the presence of an inhibitor of superoxide dismutase (sodium nitroprusside), the bactericidal effect of superoxide was increased, particularly in the more resistant strains, suggesting that these strains possess superoxide dismutase (SOD). The use of levels of detoxifying enzymes within bacteria such as SOD as an indicator of virulence is discussed.     

海洋SOD抗疲劳作用动物实验方法初探

超氧化物歧化酶(SOD)具有防止细胞过度氧化的生理功能,从海洋生物中提取的SOD,可用于清除运动产生的自由基,起到抗疲劳作用.本文探讨了SOD抗疲劳作用的动物实验方法,为验证SOD抗疲劳效果建立技术平台.     

点带石斑鱼与褐点石斑鱼4种同工酶的比较研究

采用聚丙烯酰胺凝胶垂直梯度凝胶电泳法,对点带石斑鱼与褐点石斑鱼7种组织中的4种同工酶(EST、LDH、MDH、SOD)的组织特异性进行比较研究。试验结果表明:2种石斑鱼的4种同工酶均具有明显的组织特异性。2种石斑鱼同一组织间MDH酶谱没有差别;LDH酶谱相似,只在迁移率上略有差异;EST、SOD酶谱间存在不同程度的种间差异,可作为鉴定点带石斑鱼与褐点石斑鱼的遗传标记。     

Carotenoids and retinal levels in captive and wild shrimp, Litopenaeus vannamei

In farm‐raised marine organisms, the interactions and functions of carotenoid and retinoid micronutrients as free radical scavengers during specific physiological processes, such as gonadic maturation, are not known. Captive and wild female white shrimp, Litopenaeus vannamei, were sampled at two maturation stages: II and IV. Total carotenoids, a carotenoid profile, and vitamin A from the digestive gland and ovary were determined. Superoxide dismutase (SOD) activity was determined in hemolymph. The carotenoid concentration and range of activity were significantly higher (P < 0.05) in wild than in captive shrimp, particularly at maturation stage IV. Activity of SOD in hemolymph of captive shrimp at both stages of maturation was significantly greater (P < 0.05) than that of wild organisms. In sexually exhausted, level IV captive shrimp, low carotenoid concentrations, mainly in digestive gland and ovary, reflected scavenger action insufficient to neutralize oxidative stress processes, as suggested by SOD activity. Carotenoids are important nutrients associated with the reproductive capacity of shrimp.     

盐藻超氧化物歧化酶分子类型鉴定

对盐藻细胞反复冻融和超声波破碎获得超氧化物歧化酶粗酶液,再经丙酮沉淀、70℃热处理、DEAE-52柱层析获得纯化超氧化物歧化酶,经SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳,检测出1条超氧化物歧化酶谱带。该纯化超氧化物歧化酶在紫外光区的吸收峰波长259 nm和可见光区的吸收峰波长671 nm与报道的Cu/Zn-SOD基本一致,并且它对H2O2和KCN均敏感,说明盐藻中的超氧化物歧化酶为Cu/Zn-SOD类型。     

双齿围沙蚕过氧化歧化酶活性对复合污染的不确定性响应

内在底栖生物用于环境监测、生物修复时,为判断过氧化物歧化酶(SOD)活性用作生物指示物反映环境状况的适宜性,以海沙模拟生态毒理学模式生物双齿围沙蚕(Perinereis aibuhitensis)的生境,设计均匀试验并将双齿围沙蚕暴露于不同污染水平的重金属-营养盐-石油烃复合污染15 d,研究其SOD活性在有沉积物时的变化特征。结果显示,各个处理间双齿围沙蚕的SOD活性差异不显著;重金属、营养盐和石油烃均不能显著影响双齿围沙蚕的SOD活性;双齿围沙蚕的SOD活性和污染物之间不存在显著的剂量-毒性效应关系;双齿围沙蚕的SOD活性服从Logistic分布,SOD活性对复合污染的响应不确定。因此,SOD活性能否用于反映环境条件值得商榷;内在底栖生物用作生物监测/生物修复种时,应慎重使用SOD活性反映环境状况。     

Changes of enzyme activity and hematopoiesis in Chinese prawn Fenneropenaeus chinensis (Osbeck) induced by white spot syndrome virus and zymosan A

White spot syndrome virus and zymosan A were used to stimulate the Chinese prawn Fenneropenaeus chinensis (Osbeck), and enzyme activities in organs involved in immune defence e.g., lymphoid organ, hepatopancreas and gill, total haemocyte count and mitotic index of haematopoietic tissue (HPT) were measured. The results showed that activities of phenoloxidase (PO), superoxide dismutase (SOD), alkaline phosphatase (ALP) and acid phosphatase (ACP) were higher in lymphoid organ than in gill. The hepatopancreas had no PO activity, its SOD activity was similar to the lymphoid organ, and its ALP and ACP activities were higher than lymphoid organ and gill. Phenoloxidase activity in lymphoid organ was higher than that of the control group at 2 h after injection and lower than control after 24 h. Superoxide dismutase activity in all organs showed an increase. Alkaline phosphatase activity in lymphoid organ and gill was higher than that of the control group at 2 and 24 h after injection respectively. The difference in ACP activity was not significant. After injection with zymosan A, the mitotic index of HPT increased by 1.5‐fold compared with the control, and returned to control level after 48 h.     

微生态制剂对泥鳅生长性能、体成分和免疫活性的影响

以泥鳅为试验材料,将芽孢杆菌、光合细菌、EM菌比例分别为1∶2∶2和2∶1∶2的两种微生态制剂加入养殖水体,饲养大鳞副泥鳅(Misgurnus anguillicaudatus)32 d,定期测量泥鳅的生长,鱼体成分及血清溶菌酶活力和超氧化物歧化酶(SOD)活力。结果表明,试验组泥鳅的末重、增重率、日增重和饲料转化率均高于对照组;试验组泥鳅体成分粗蛋白含量高于对照组,粗脂肪含量低于对照组;在血清酶活力方面,试验组泥鳅溶菌酶活力和SOD活力高于对照组。使用微生态制剂能显著提高泥鳅养殖生长性能、改善鱼体成分、提高泥鳅血清溶菌酶活力和SOD活力。     

点带石斑鱼不同组织同工酶的研究

运用聚丙烯酰胺垂直梯度凝胶电泳法对点带石斑鱼7种组织（眼睛、肌肉、心脏、肝脏、肾脏、尾鳍、脾脏）的4种同工酶（EST、SOD、LDH、MDH）进行了初步研究，并对4种同工酶的同工酶位点及其酶谱表型进行了分析。结果表明，点带石斑鱼的4种同工酶都具有不同程度的组织特异性：EST由4个基因位点编码，具有多态现象；肌肉SOD与其它组织SOD的差异最明显；眼睛LDH与其他组织LDH的差异最明显；MDH具有线粒体型（m-MDH）和上清液型（s-MDH）两种类型。     

Bioaccumulation of cadmium and its biochemical effect on selected tissues of the catfish (<Emphasis Type="Italic">Clarias gariepinus</Emphasis>)

The present study examines the pattern of accumulation of cadmium (Cd) and its biochemical effects on selected tissues of a variety of African catfish (Clarias gariepinus), after exposure to various doses of Cd. The results obtained indicate that at the end of 21 days of exposure, the total tissue organ cadmium concentration followed the pattern kidney > gill > liver > muscle for each of the exposure concentrations. The levels of Cd in these organs were higher than those in ambient water. Moreover, while the rate of uptake of Cd increased with time in the kidney, liver and muscle, it decreased in the gill. Superoxide dismutase (SOD) was significantly elevated only in the kidney of catfish treated with 0.2 and 0.4 ppm of Cd for 7 days compared with the control. Conversely, gill SOD was significantly decreased in the same concentrations of Cd-treated catfish relative to the control. Statistically similar levels of SOD were observed in the liver, brain and muscle with all the treatments after the same duration of treatment. In the fish exposed for 21 days, SOD activity was significantly decreased in the kidney with a corresponding increase in lipid peroxidation (LPO), but it manifested only with the 0.2- and 0.4-ppm Cd treatment relative to the control. In the liver, however, Cd exposure significantly increased SOD in the 0.2- and 0.4-ppm treatments of the same duration. In conclusion, the present study indicates that the accumulation of Cd and its effect on SOD and LPO in C. gariepinus is dependent on concentration, tissue and time