甲型H1N1流感病毒核酸检测能力验证样品制备及其应用效果评价

为考核实验室检测甲型H1N1流感病毒的能力,设计和实施了“CNAS T0459甲型H1N1流感病毒核酸检测能力验证计划”.利用甲型H1N1流感病毒(2009)和经典H1N1猪流感病毒核酸标准物质制备6组能力验证阳性样品,经实验室检测分析,所制备的样品均匀性和稳定性均达到中国合格评定国家认可委员会对能力验证样品的要求.将6组阳性样品和1组阴性样品编号后下发54家参试实验室,共有50家实验室报送了有效数据,其中完全达到能力验证要求的实验室共34家,满意率达68％,其余16家为不满意实验室,包括8家实验室检测经典H1N1猪流感病毒满意,但甲型H1N1流感病毒(2009)特异性检测不满意.本次能力验证为整体提升我国甲型H1N1流感病毒的检测水平和评估各级实验室检测能力具有重要意义.     

甲型H1N1与季节性H1N1流感病毒检测基因芯片的制备与初步应用

建立DNA微列阵技术检测甲型H1N1和季节性H1N1流感病毒的方法,进而探讨该方法用于检测临床标本的可行性。通过生物医学数据库甲型H1N1流感病毒及季节性H1N1亚型流感HA与NA基因进行检索和筛选,应用分子生物学软件,进行序列分析、引物及探针设计,并进行验证。试验所设计的探针可以对甲型H1N1流感与季节性H1N1流感病毒进行区分,用该方法检测了长春市CDC送检的6份疑似甲型H1N1流感病毒临床病例,4份阳性,检测结果同实时荧光定量PCR方法一致。结果表明,利用本研究建立的DNA微列阵技术检测甲型H1N1流感病毒方法,特异性和敏感性强,可作为甲型H1N1流感病毒临床标本检测方法。     

多重RT-PCR方法检测新型甲型H_1N_1流感病毒的研究

为了建立快速检测新型甲型H1N1流感病毒的多重PCR技术,根据GenBank中公布甲型H1N1流感病毒(2009年流行株)的HA和NA基因序列,设计并合成两套特异性引物。使用TaKaRa公司的一步法RT-PCR试剂盒和自行设计合成的引物建立多重RT-PCR反应,按照预期的PCR产物序列合成的DNA作为阳性对照。结果表明,该方法具有良好的特异性,可以将甲型H1N1流感病毒(2009年流行株)与传统甲型H1N1、H3N2、H5N1、H6N2和H9N2亚型流感病毒区分。该方法同时具有较高的灵敏度,最低可以检测到100个拷贝的阳性克隆质粒。在对183份发热病人临床咽拭子样品检测中发现了10份阳性样品,对350份猪鼻腔拭子样品检测全部呈阴性,结果与中国检验检疫科学研究院试剂盒检测结果一致,说明了该多重RT-PCR方法在临床检测新型甲型H1N1流感病毒方面具有广阔的应用前景。     

甲型H1N1流感病毒实验室生物风险评估

根据目前掌握的资料,从生物学特性、流行特点、临床表现以及实验室活动等方面对甲型H1N1流感病毒做了初步的风险评估,以期为从事甲型H1N1病毒有关操作的实验室做好相关的风险评估及生物安全防护工作提供依据。     

甲型H1N1(2009)流感病毒实时荧光RT-PCR检测方法的建立与评价

自甲型H1N1(2009)流感病毒于2009年在世界多个国家暴发流行后,许多国家的猪群中检测到该病毒的存在,因此建立快速准确的甲型H1N1流感病毒的检测方法成为迫切需求。本研究针对甲型H1N1(2009)流感病毒NA基因设计特异性引物和探针,建立甲型H1N1(2009)流感病毒特异性实时荧光RT-PCR快速检测方法。并将该方法与WHO推荐美国CDC建立的检测方法和美国农业部推荐的检测方法进行比较。通过田间试验验证该方法在实际应用中的效果。结果表明:本研究建立的方法对检测甲型H1N1流感病毒裂解疫苗的灵敏度达到10-6,与WHO推荐的A型流感病毒实时荧光PCR检测方法的灵敏度一致,并且高于美国农业部推荐方法的检测灵敏度(10-5);该方法特异性强,与经典型H1N1和其他亚型流感病毒株无任何交叉反应。与香港兽医化验所进行了检测比对,检测灵敏度和特异性完全一致。近3 800份的田间试验表明,所建立的方法准确可靠。本研究所建立检测方法快速灵敏,检测结果准确可靠,适合用于甲型H1N1(2009)流感病毒的分子生物学检测和监测。     

甲型H1N1流感病毒及其疫苗研究热点

2009年4月初,北美爆发一种新型甲型(H1N1)流感病毒,并通过各种途径迅速传播,引起了全球极大的恐慌。文章介绍了历史上历次甲型流感大流行,流感的分类与生物学特性,甲型H1N1流感的病原学特点和分子特征,甲型H1N1流感的传染源、传染性、传染途径和传染方式,甲型H1N1流感的临床特征和严重危害。最后指出疫苗是最经济有效的预防流感的手段,国内生产疫苗主要使用鸡胚作为生产基质,筛选出高丰度的流感病毒适应性细胞将成为研究的热点。     

中国流行的2009甲型H1N1猪源流感病毒HA和NA基因的分子和遗传特征

目前流行的甲型H1N1流感病毒是一个复杂的基因重配病毒。对病毒的分子生物学研究,尤其是病毒囊膜蛋白血凝素（haemagglutini,HA）基因和神经氨酸酶（neuraminidase,NA）基因的研究,为控制和预防H1N1流感病毒具有重要的意义。本研究对中国流行的2009甲型H1N1猪源流感病毒的HA和NA基因与疫苗株A/California/07/2009（H1N1）,以及不同国家和地区的病毒株进行核苷酸和氨基酸序列分析。从NCBI的GenBank数据库下载所需要毒株的序列,采用Lasergene 6.0软件包中的EditSeq和MegAlign进行序列分析,进化树分析采用MEGA4.1软件。进化分析表明,中国流行的2009 H1N1流感病毒与疫苗株的核苷酸同源率分别在98.8%~99.7%和98.6%~99.6%之间;裂解位点处为I/VPSIQSR↓G,不具备高致病性流感病毒的特征;有1株NA抗性病毒。尽管与疫苗株相比,中国流行株2009甲型H1N1猪源流感病毒的HA和NA基因有部分突变,但这些突变并不是重要的。本研究首次详细分析了中国流行的2009甲型H1N1猪源流感病毒株与疫苗株的HA和NA基因的分子特征,对实时监测流感病毒HA和NA基因的变化具有重要意义。     

甲型流感病毒H1N1感染猪和其他动物的回顾

甲型流感病毒在哺乳动物和禽类中存在广泛感染谱,通常野生水禽被认为是甲型流感病毒主要的自然贮存宿主。2009年5月2日,首例新甲型H1N1病例确诊于加拿大一个猪场,公共卫生学调查表明病原是由人传播到猪的。随后新甲型H1N1感染火鸡、猫、犬、水貂和一些野生动物相继被报道,病毒从人传播到动物在后续病例得到更多证实。此病毒最初被命名为＂猪流感H1N1＂,虽然后来被正名为新甲型H1N1,但仍导致全球范围内猪肉产品消费锐减,生猪养殖业深受影响。至今,新甲型H1N1已平息,总结新甲型H1N1感染猪及其他动物感染谱,不但对正确认识流感病毒传播特点、为类似突发疫病防控提供经验,而且也使我们更重视流感病毒易感动物监测,避免使猪再次蒙冤,对保护养猪业健康发展有一定的价值。     

焦磷酸测序技术在确证猪甲型H1N1流感病毒中的应用

目的本研究旨在通过对猪甲型H1N1流感病毒进行序列信息分析的基础上,利用焦磷酸测序技术建立一种快速、简单地确证猪甲型H1N1流感病毒的方法。方法通过序列信息比对,设计H1HA和N1NA基因保守区段的扩增引物及测序引物。从感染猪甲型H1N1病毒的鸡胚尿囊液中提取病毒RNA,RT-PCR扩增目的基因片段,采用焦磷酸测序技术(PSQ)针对HA基因和NA基因进行保守核苷酸区段的测序分析。利用扩增引物与其他猪源病毒进行特异性试验,利用测序引物进行重复性试验。将该方法与病毒分离和荧光定量RT-PCR方法做临床样品的平行检测,并比较结果。结果通过序列信息比对寻找到表征H1N1亚型的核苷酸保守区段,经焦磷酸测序后能进一步确证毒株的序列信息为猪甲型H1N1流感病毒。特异性试验表明,不与其他猪源病毒发生交叉反应;重复性试验表明,重现性为100%。对221份临床样品检测表明,病毒分离鉴定与焦磷酸测序方法结果符合率为96.8%,与TaqMan荧光定量方法检测结果符合率90.3%。经统计学分析,焦磷酸测序确证与病毒分离鉴定在检测临床样品上,两者差异不显著。结论基于序列分析的焦磷酸测序技术可以作为进一步确证方法使用。     

猪场如何防控甲型H1N1流感

正在全球范围内发生蔓延的甲型H1N1流感疫情,是由一株新型流感病毒引起的具有公共卫生意义的重大疫病.已证实该病毒的核酸包含人流感病毒、北美禽流感病毒和北美、欧洲、亚洲三类猪流感病毒的多个基因.显然,甲型H1N1流感的发生,是人与动物流感病毒在某种特定条件下交互作用、重组变异的结果.该病自公布和报道以来,引起了世界范围内空前而广泛关注,截止2009年5月12日,世界上已有30个国家和地区确诊人感染该病,目前该病在传播方面的显著特征是人际间传播,且人感染甲型H1N1流感病毒后可以传染给猪,从而导致甲型H1N1流感的发生和流行.我国内地和香港已确诊2例人感染甲型H1N1流感的输入病例.     

Experimental infection with H1N1 European swine influenza virus protects pigs from an infection with the 2009 pandemic H1N1 human influenza virus

The recent pandemic caused by human influenza virus A(H1N1) 2009 contains ancestral gene segments from North American and Eurasian swine lineages as well as from avian and human influenza lineages. The emergence of this A(H1N1) 2009 poses a potential global threat for human health and the fact that it can infect other species, like pigs, favours a possible encounter with other influenza viruses circulating in swine herds. In Europe, H1N1, H1N2 and H3N2 subtypes of swine influenza virus currently have a high prevalence in commercial farms. To better assess the risk posed by the A(H1N1) 2009 in the actual situation of swine farms, we sought to analyze whether a previous infection with a circulating European avian-like swine A/Swine/Spain/53207/2004 (H1N1) influenza virus (hereafter referred to as SwH1N1) generated or not cross-protective immunity against a subsequent infection with the new human pandemic A/Catalonia/63/2009 (H1N1) influenza virus (hereafter referred to as pH1N1) 21 days apart. Pigs infected only with pH1N1 had mild to moderate pathological findings, consisting on broncho-interstitial pneumonia. However, pigs inoculated with SwH1N1 virus and subsequently infected with pH1N1 had very mild lung lesions, apparently attributed to the remaining lesions caused by SwH1N1 infection. These later pigs also exhibited boosted levels of specific antibodies. Finally, animals firstly infected with SwH1N1 virus and latter infected with pH1N1 exhibited undetectable viral RNA load in nasal swabs and lungs after challenge with pH1N1, indicating a cross-protective effect between both strains.     

一株人源H1N1亚型猪流感病毒的进化分析与生物学特性研究

为了解猪流感病毒(SIV)的变异情况,我们2009年11月从河北某养殖场采集呈流感症状的猪鼻拭子40份,接种10日龄SPF鸡胚,分离到一株猪流感病毒,通过RT-PCR和血凝抑制试验鉴定为H1N1亚型,命名为A/swine/Hebei/15/2009(H1N1),其全基因序列测定及同源性分析发现,8个基因片段均与2000年左右H1N1人流感病毒有较高的同源性。系统遗传演化显示,该病毒分离株是由2000年人源H1N1流感病毒A/Dunedin/2/2000(H1N1)进化而来。抗原性分析显示该株与甲型H1N1流感病毒和经典H1N1病毒株抗原性差异较大。对小鼠致病性试验表明该病毒株可以直接感染小鼠并导致小鼠轻微临床症状和组织病理学变化,但不致死小鼠,表现为低致病性。     

上海地区猪群中H1N1甲型流感抗体检测

对2009年H1N1甲型流感流行前后的上海地区养殖场户410份猪血清样品,分别采用血凝抑制试验（hemagglutination inhibition,HI）和酶联免疫吸附试验（enzyme-linked immunosorbent assay,ELISA）进行检测H1N1甲型流感病毒和猪流感病毒（Swine in？uenza virus,SIV）。检测结果表明,除2007年外,2008~2010年猪血清中均存在不同水平的HI抗体,阳性率呈显著上升趋势,且抗体水平与猪群饲养周期及饲养密度正相关,而与猪流感病毒的流行无相关性。     

Reassortant H1N1 influenza virus vaccines protect pigs against pandemic H1N1 influenza virus and H1N2 swine influenza virus challenge

Influenza A (H1N1) virus has caused human influenza outbreaks in a worldwide pandemic since April 2009. Pigs have been found to be susceptible to this influenza virus under experimental and natural conditions, raising concern about their potential role in the pandemic spread of the virus. In this study, we generated a high-growth reassortant virus (SC/PR8) that contains the hemagglutinin (HA) and neuraminidase (NA) genes from a novel H1N1 isolate, A/Sichuan/1/2009 (SC/09), and six internal genes from A/Puerto Rico/8/34 (PR8) virus, by genetic reassortment. The immunogenicity and protective efficacy of this reassortant virus were evaluated at different doses in a challenge model using a homologous SC/09 or heterologous A/Swine/Guangdong/1/06(H1N2) virus (GD/06). Two doses of SC/PR8 virus vaccine elicited high-titer serum hemagglutination inhibiting (HI) antibodies specific for the 2009 H1N1 virus and conferred complete protection against challenge with either SC/09 or GD/06 virus, with reduced lung lesions and viral shedding in vaccine-inoculated animals compared with non-vaccinated control animals. These results indicated for the first time that a high-growth SC/PR8 reassortant H1N1 virus exhibits properties that are desirable to be a promising vaccine candidate for use in swine in the event of a pandemic H1N1 influenza.     

中国类禽型H1N1亚型猪流感病毒的发现和遗传分析

采用禽流感病毒通用引物,对2006年发现的1株H1N1亚型的类禽型猪流感病毒的全基因组进行了测序,并进行了遗传学分析。序列分析表明它的8个片段与欧洲的类禽型猪流感病毒A/swine/Ile et Vilaine/1455/99(H1N1)病毒和A/swine/Cotes d'Armor/1488/99(H1N1)病毒的相应基因具有高度的同源性,同源性可达97%~99%,表明类禽型猪流感病毒已在中国出现。其血凝素基因的190E→D和225G→E的突变使得其结合NeuAc-a2,6Gal受体的能力高于NeuAca2,3Gal受体。欧洲的类禽型猪流感病毒可以直接感染人,并且可导致人的肺炎和死亡。中国类禽型猪流感病毒的发现及其的NeuAca2,6Gal受体结合特性使其成为一个潜在可感染人的病毒。     

甲型H1N1流感研究进展

2009年3月墨西哥与美国先后出现甲型H1N1型流感,并在很短时间内席卷全球,世界卫生组织(WHO)将此次全球流感大流行的预警级别提高到5级。目前研究表明甲型H1N1流感病毒是人流感病毒、北美州禽流感病毒,以及北美洲、欧洲和亚洲猪流感病毒的混合体,其易感人群的年龄段主要在20~45岁,且人群间传染性强。临床表面除一般流感症状外,表现出特异的呼吸道和消化道疾病症状,病死率高于一般流感。本文对甲型H1N1流感的临床表现、病毒特征及其相互关系等做一综述。