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1.
中国荷斯坦牛初产日龄遗传评估及全基因组关联分析 总被引:2,自引:0,他引:2
基于高通量SNPs测序的全基因组关联分析为奶牛繁殖性状相关基因的探索提供了契机。本研究基于课题组前期中国荷斯坦牛基因组测序芯片的结果,通过DMU(v 6.0)采用AI-REML结合EM算法的动物模型对北京地区2001-2011年10年间19 111头中国荷斯坦母牛初产日龄记录进行遗传参数估计,并应用PLINK(v 1.07)将大群估计的2 172头中国荷斯坦母牛初产日龄性状的育种值(EBV)作为表型值,进行基于无关群体设计的全基因组关联分析。通过全基因组水平的Bonferroni校正,共检测到1 700个SNPs与初产日龄显著相关。选取P值达到10-15的43个SNPs进行初步分析,其中12个位于X染色体上。显著SNPs上下游200kb范围内存在KLHL4、TRAM1、TRAM2、ZNF438、MATK等繁殖障碍疾病相关基因。7号染色体1 Mb(20.42~21.52 Mb)区域内多个SNPs位点与初产日龄显著相关。这些基因和区域可以作为影响初产日龄性状的重要候选基因和区域,为揭示奶牛繁殖性状的分子遗传基础积累了素材。 相似文献
2.
3.
本研究基于课题组前期对北京地区中国荷斯坦牛群体产奶性状全基因组关联分析结果,在新的中国荷斯坦牛群中将转运蛋白颗粒复合体9(TRAPPC9)基因作为产奶性状的候选基因进行遗传效应验证。研究利用混池测序寻找SNPs位点,结合前期GWAS结果筛选到的SNPs位点,进而分析这些多态性位点与中国荷斯坦牛产奶性状的相关性。结果发现,SNP1、SNP2位点对乳蛋白率和乳糖率效应均显著(P0.05);SNP3位点对乳脂率和乳蛋白率的效应均极显著(P0.01);SNP4位点对乳脂率有极显著影响(P0.01);SNP5位点对乳脂率和乳糖率的效应显著(P0.05)。同时发现TRAPPC9基因的表达量对产奶性状也有显著影响(P0.05),而TRAPPC9基因启动子区DNA甲基化对产奶性状无直接显著影响。该结果进一步表明,TRAPPC9基因可以考虑作为分子遗传标记应用于中国荷斯坦牛产奶性状的标记辅助选择。 相似文献
5.
中国南方水田环境复杂,不同生长阶段秧苗的形态各异,且田中常出现浮萍及蓝藻,其颜色与秧苗颜色极其相似,因此常用的作物特征提取算法难以应用在水田上。针对这些问题,该文提出一种基于SUSAN角点的秧苗列中心线方法。运用归一化的Ex G(excess green index)提取秧苗的灰度化特征,运用自适应的SUSAN(smallest univalue segment assimilating nucleus)算子提取秧苗特征角点;最后运用扫描窗口近邻法进行聚类,采用基于已知点的Hough变换(known point Hough transform)提取秧苗列中心线。经试验验证,此算法在图像中存在浮萍、蓝藻和秧苗倒影的情况下有较高的鲁棒性。在各种情况下均成功提取秧苗的列中心线,且每幅真彩色图像(分辨率:1280×960)处理时间不超过563 ms,满足视觉导航的实时性要求。 相似文献
6.
克隆了鸡(Gallus gallus)的γ-干扰素cDNA,并用大肠杆菌(Escherichia coli)进行了温度诱导型表达。用PCR方法扩增了鸡γ-干扰素基因组基因,将其克隆到载体pGEM-T上。对重组载体的插入片段进行酶切分析和部分序列测定:证明了基因的正确性;克隆的鸡γ-干扰素基因的编码序列中存在一个点突变(G→A),这一突变导致一个三联体密码子GAA变为AAA,编码的氨基酸由谷氨酸(Glu)变为赖氨酸(Lys)。用鸡γ-干扰素基因组基因构建了真核表达载体pCI-ChIFN。将这一真核表达载体转染兔成纤维细胞的细胞系中进行表达实验:提取转染后细胞裂解物中的RNA,再以此为模板进行RT—PCR,获得了完整的鸡γ-干扰素cDNA基因,同时证明鸡γ-干扰素基因组基因能在兔成纤维细胞系中表达。用鸡γ-干扰素cDNA构建了温度诱导型原核表达载体pBVcDNA,并将其转导到大肠杆菌DH5α中,经细菌发酵和温度诱导,表达了一个18kD的特异蛋白,其表达量占细菌总蛋白的8.75%。 相似文献
7.
8.
目的 观察复合麻醉在无痛分娩中的效果及对母婴的影响,为临床提供另一种有效的、安全的无痛分娩方法.方法 300例拟无痛分娩的产妇随机分为A 、B两组,每组150例,A组予硬膜外阻滞麻醉方法进行镇痛,B组予硬膜外阻滞+静脉注射布托啡诺复合麻醉镇痛.对两组的镇痛有效率、剖宫产率、新生儿Apgar评分,以及全产程产妇舒适度等指标进行统计分析.患结果两组镇痛有效率、剖宫产率、新生儿Apgar评分差异无统计学意义(P均〉0.05),但B组舒适度满意率优于A组(χ2=27.70,P〈0.01).结论 复合麻醉在无痛分娩应用中安全有效,对母婴影响小,值得临床推广应用. 相似文献
9.
10.