防止PCR检测动物疫病反应体系污染措施

PCR技术是利用DNA聚合酶,在体外大量合成(扩增)DNA片段的分子生物学技术.具有特异性好、灵敏度高、简便快速等特点.即使在10万个细胞中含有一个拷贝的待检核苷酸序列,也可用PCR技术检测出来.     

牛分枝杆菌特异性PCR检测方法的建立及初步应用

根据已发表的牛分枝杆菌的pncA的基因序列，设计和合成了一对可扩增294bp目的片段的引物，建立了特异性检测牛分枝杆菌的PCR方法。对牛分枝杆菌国际参考株和国内分离株成功扩增出294bp的特异性基因片段；对人结核分枝杆菌、副结核分枝杆菌、鸟胞内分枝杆菌和草分枝杆菌DNA的PCR扩增结果均为阴性。本PCR方法检测的敏感度可达到50pg。对10份牛分枝杆菌培养阳性和10份阴性样品的DNA分别进行了PCR检测，结果10份阳性样品中有9份样品为PCR扩增阳性，阳性符合率为90％（9／10）；而10份阴性样品则PCR扩增全部为阴性，阴性符合率为100％（10／10）。本方法可做为牛分枝杆菌的快速检测和流行病学调查的工具。     

鸡减蛋综合征病毒Hexon基因SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR检测方法的建立

用PCR方法扩增出鸡减蛋综合征病毒（EDSV）Hexon基因保守片段,经琼脂糖凝胶电泳及序列测定分析扩增产物的特异性。以构建的阳性重组质粒作为标准品,建立SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR反应的扩增曲线和溶解曲线,并绘制标准曲线。结果表明,建立的EDSV荧光定量PCR标准曲线Ct值与1×10^1～1×10^6拷贝/μL的基因拷贝数呈现良好线性关系,灵敏度可达10拷贝,且特异性及重复性良好;说明本试验建立的SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR检测方法可用于EDSV的诊断及病原的定量分析。     

快速鉴别奶牛乳腺炎细菌或真菌的双重PCR方法

综合多种细菌、真菌DNA模板的提取方法,采用β-巯基乙醇裂解细胞壁,利用蜗牛酶和溶菌酶消化细胞壁,再利用石英砂机械破壁,能彻底破坏细菌、真菌细胞壁,提取高质量的DNA,摸索出一套从奶样中同时提取细菌、真菌核酸的新方法。建立双重PCR方法,同时完成对细菌16SrRNA保守区特异性基因片段和真菌18SrRNA保守区特异性基因片段的扩增,快速诊断奶牛乳房炎是细菌感染还是真菌感染或是混合感染。对采自临床型乳腺炎和隐性乳腺炎病例的共计84个乳样分别用传统细菌学培养法和双重PCR方法对比鉴定。结果表明,双重PCR检测乳样细菌的最小浓度为10^2CFU／mL,检测乳样真菌的最小浓度为10^3CFU／mL。双重PCR方法对细菌的检测与平板培养检测方法比较差异不显著（P〉0．05）,对真菌的检测与平板培养检测方法比较具有更高的检出率（P〈0．01）。     

犬常见传染病诊断基因芯片的研究与应用

根据PCR技术扩增出犬腺病毒（CAV）ORF1（p-Ⅷ）基因、犬细小病毒（CPV）VP2基因、鸡血红蛋白的珠蛋白基因（GLOBc）各保守基因片段；采用RT—PCR扩增出犬冠状病毒（CCV）纤突蛋白（S）基因、犬瘟热病毒（cDV）融合蛋白（F）基因、犬副流感病毒（CPIV）核衣壳结构蛋白（NP）基因、狂犬病病毒（RV）核蛋白（N）基因的各一段保守序列，克隆荻取质粒。通过微量点样技术将这些质粒作为探针点在硝酸纤维素膜上，产生二维DNA探针阵列，制作成诊断基因芯片。对360份待检样品匀浆后提取核酸作为模板，扩增相应保守基因片段。通过生物素标记PCR（RT—PCR）技术，将所获得的扩增产物与诊断基因芯片进行特异性的逆向点杂交，然后用扫描仪对芯片进行扫描分析、判断。结果表明，此方法比病毒分离、HI、PCR或RT—PCR方法灵敏度高、特异性强，平均检出率要高20％以上，并可同时对犬多种疫病进行快速诊断。     

一种食品中猪源性成分的快速检测技术

建立一种基于PCR技术的食品中猪源性成分快速检测技术。根据猪线粒体cytb基因设计引物,进行PCR扩增。该方法对猪DNA检测的灵敏度达到100pg;该方法仅对猪DNA检测呈阳性,与其他物种DNA无交叉反应;同时可用于商业样本及复杂食物样本的检测。本研究的猪源性成分特异PCR检测技术具有快速、准确的特点,且具有较高的特异性和敏感性,可作为肉制品中猪源性成分快速检测的手段。     

PCR技术在鼠金黄色葡萄球菌检测中的初步研究

根据已公布的金黄色葡萄球菌耐热核酸酶nuc基因的序列 ,设计并合成一对特异性的引物 ,利用PCR技术扩增nuc基因片段。对金黄色葡萄球菌和其他非金黄色葡萄球菌菌株抽提的DNA进行扩增。结果金黄色葡萄球菌PCR产物出现 6 6 8bp的特异性DNA扩增片段 ,而其他非金黄色葡萄球菌未出现扩增片段 ,证实了合成的引物对金黄色葡萄球菌具有特异性。将抽提的金黄色葡萄球菌DNA进行系列稀释 ,测定此PCR体系的敏感性。结果显示 ,该PCR体系能检出 3pg金黄色葡萄球菌DNA ,且从抽提DNA到PCR扩增及电泳结束仅需 4h。因此 ,研究所建立的扩增耐热核酸酶nuc基因检测鼠金黄色葡萄球菌的PCR方法 ,具有快速、可靠、敏感和特异的特点 ,可用于临床样品和金黄色葡萄球菌感染时的检测 ,适合应用于实验大小鼠的监测     

PCR技术在畜禽细菌病诊断中的应用

聚合酶链反应（PCR）又称无细胞克隆技术，是一种根据生物体内DNA复制的某些特点而设计的在体外对特定DNA序列进行快速扩增的新技术。近几年来，随着PCR技术的迅速发展及世界各国对畜禽传染病的日益重视，PCR技术在兽医实验室诊断中的应用已屡见不鲜。本文仅概述其在畜禽细菌性疾病诊断和研究中的应用。１沙门氏菌Nguyen根据肠炎沙门氏菌C７具有特异性的序列（２．１kbHingIII片断）设计出１对引物，从２３种沙门氏菌中扩增出２．０kb的产物，其它１９种肠道细菌对照没有扩增产物。李景鹏等根据H１基因序列设计１对引物扩增H１基…     

PCR技术及其在畜牧兽医领域的应用

PCR(polymerase Chain reaction聚合酶链反应),又称DNA或基因体外扩增技术。它是一种模拟天然DNA复制过程,在体外扩增特异性DNA片段的分子生物学新技术。1985年,Saiki首次报道用PCR检测镰刀贫血病;1986年Erlish分离并纯化了适用于PCR的热稳定性Tag DNA聚合酶,并于1988年获专利;1988年,Saiki开始使用耐热     

猪细小病毒SYBR Green I模式实时定量PCR检测方法的建立

根据GenBank猪细小病毒（PPV）的NS1基因序列，设计一对特异性引物，采用SYBRGreenI随机结合渗入法，建立实时定量PCR检测方法，构建了检测PPV的标准DNA模版，循环阈值（Ct）与标准质粒DNA模板在7．8×10^1-7．8×10^8拷贝μl浓度范围内呈良好的线性关系，相关系数为0．997。该方法用于猪细小病毒的检测具有很高的特异性，其敏感性与常规PCR相比可以提高100倍，可以用于猪细小病毒的快速检测。     

鸡白痢沙门氏菌PCR检测技术的建立与应用

为鸡沙门氏菌的临床检测提供了一种更快速、敏感、特异的诊断,参照GeneBank中已公布的的鸡白痢沙门氏菌fliC基因序列,合成出了一对引物,使用PCR法对1株沙门氏标准菌株和其他3株非沙门氏菌标准菌株进行DNA抽提扩增并检测其敏感度。采用上述技术,对12份可疑病料及10份饲料进行PCR检测,同时与传统检测方法进行比较。结果表明1株沙门氏菌PCR产物出现600 bp的特异性DNA扩增带,而非沙门氏菌均未出现扩增条带,证明所设计引物具有沙门氏菌特异性;通过敏感度检测,此PCR体系能检出50 pg以上的细菌DNA,敏感性较高。运用PCR法阳性检出率及敏感性均高于常规检测方法。由此可见,沙门氏菌PCR检测是一种快速、敏感和高度特异的诊断方法。     

猫传染性鼻气管炎PCR检测方法的建立

本文通过设计特异性扩增猫疱疹病毒Ⅰ型gD基因的引物,使用猫三联弱毒苗为模板建立了检测猫疱疹病毒Ⅰ型的PCR诊断方法,并对其灵敏性、特异性进行了评价,并将建立的PCR检测方法对临床样品进行了检测。实验结果证实,本实验建立的猫疱疹病毒Ⅰ型的PCR检测方法,其灵敏度可达到最低可检测10^5拷贝的病毒含量;特异性试验结果仅能扩增出猫三联弱毒苗。     

牛乳中结核分支杆菌复合群的实时荧光PCR检测技术

本研究建立了一种实时荧光PCR检测奶牛乳液中结核分支杆菌复合群的技术，克服了以往牛结核PCR检测样品取样难的缺陷，具有检测灵敏度高、特异性强等优点，可用于奶牛乳房结核的早期诊断以及乳品安全生产检测。以乳液中加卡介苗作为模拟临床检测样本，对DNA提取方法进行改进，利用基于TaqMan技术的实时荧光（real—time）PCR检测。选择分支杆菌编码16sRNA基因和23sRNA基因之间ITS（internal transcribed spacer）序列作为扩增靶序列，研究结果表明卡介苗DNA提取效率提高，实时荧光PCR检测灵敏度达到每毫升乳液检测10个结核分支杆菌。奶牛乳液中结核分支杆菌复合群的检测对兽医系统疫病监测及诊断部门、奶牛养殖业、乳品生产行业有重要应用价值。     

多重PCR对禽分枝杆菌亚种鉴定的初步应用

为了建立禽分枝杆菌多重PCR方法，给禽分枝杆菌亚种鉴定及禽结核病的诊断提供参考。本实验根据国外报道的诊断方法设计4对特异性引物，选用我国禽结核参考菌株（CVCC 68201）基因组DNA为模板，优化了退火温度，测定了DNA最小检测量，并进行了特异性检验。采用优化好的多重PCR体系，对国家兽医微生物菌种保藏中心保存的禽分枝杆菌标准菌株进行检测和分类。实验结果表明，禽结核参考菌株（CVCC 68201）能很好的扩增出577 bp（IS901基因片段）、385 bp（IS1245基因片段）和140 bp（dnaJ基因片段）三条目的条带，基因组DNA的最小检测量为0.38 ng/μL，目的条带在退火温度50 ℃～62 ℃之间均能得到有效扩增。对23株禽分枝杆菌菌株检测，并设立牛分枝杆菌作为阴性对照，最终将禽分枝杆菌菌株分为三大类：禽亚种/森林土壤亚种、副结核亚种、人猪亚种，与国家兽医微生物菌种保藏中心的分类结果相比不仅一致且更加详尽而有临床意义。因此，基于分子生物学方法建立的多重PCR方法可以对禽分枝杆菌亚型进行快速鉴定并对禽结核病的诊断提供参考。     

霍乱弧菌DPO-PCR特异性检测方法的建立与应用

采用一种新型的引物设计方法——双启动寡核苷酸引物（dual-priming oligonucleotide,DPO）,以霍乱弧菌mdh基因为靶序列,建立了霍乱弧菌DPO-PCR特异性检测方法,分析了DPO引物退火温度不敏感性、检测灵敏度及特异性,并对检测方法进行了初步应用。灵敏度结果显示,DPO-PCR方法对霍乱弧菌的最低检出限为1.07×10^2 CFU/mL。退火温度不敏感性试验中,与常规PCR引物相比,DPO引物在45～65℃退火温度均能够高效扩增出靶基因片段。特异性结果显示,DPO-PCR方法的特异性比常规PCR方法强,不产生任何非特异性扩增。利用建立的霍乱弧菌DPO-PCR检测方法对采集的550份样本进行检测,检出43份霍乱弧菌阳性样本,经行业标准法（SN/T2425-2010）复检,检测结果相同,表明所建立的DPO-PCR检测方法具有良好的实用性,为霍乱弧菌的快速准确检测提供了新途径。     

猪伪狂犬病病毒及猪细小病毒二联PCR检测方法的建立

根据猪伪狂犬病病毒（PRV）和猪细小病毒（PPV）2种病原体的基因保守序列，分别设计并合成了与PRv的gp50基因序列和PPV的VP2基因互补的两对引物，进行单相PCR，分别扩增出预期的217bp片段及158bp片段；同时，用这两对引物对混合的样品中的PRV和PPV的DNA模板进行二联PCP扩增及二联PCR反应条件的优化，结果得到2争与试验设计相符的217bp（PRV）和158bp（PPV）特异性务带：敏感性检测结果表明，对PRv的检测可以达到10^6.11／20μL TCID50对PPV的检测可以达到0．008HA单位的核酸模板。本文建立的PCR方法，可以在24h内对样品进行快速检测，可作为PRV、PPV感染和临床样品检测的可靠手段。     

云南黑山羊性别决定基因体外扩增研究

对云南黑山羊 (10♂ ,2♀ )的基因组DNA性别决定基因 (SRY)进行了体外PCR扩增的研究 ,结果表明适当引物可特异性扩增出雄性个体的性别决定基因片段 (大小约为 185bp) ,而对雌性个体则不能扩增出任何片段 ;研究还利用已筛选出的性别决定基因特异性引物对少量的胚胎细胞进行了特异性扩增 ,检测了 2 0枚云南黑山羊的胚胎 ,其中有 5枚胚胎可扩增出约为 185bp的特异性片段。以上结果为山羊胚胎早期性别鉴定奠定了技术基础。     

美洲型猪繁殖与呼吸综合征病毒TaqMan荧光RT-PCR检测方法的建立

根据猪繁殖与呼吸综合征病毒（PRRSV）美洲株的基因序列,设计U1和U6两套PCR引物和荧光探针,建立了扩增U1和U6基因的荧光RT-PCR用于检测美洲型PRRSV。用10倍倍比稀释的质粒DNA、cDNA、RNA进行扩增以检测其灵敏度,同时对猪瘟（HCV）、猪伪狂犬（PRV）等7种病毒进行特异性检测。结果显示建立的扩增U1和U6基因的荧光RT-PCR可用于检测PRRSV,其灵敏度为10个拷贝的质粒DNA,而与HCV等非PRRSV无交叉反应。本研究所建立的荧光RT-PCR具有快速、灵敏、准确、低污染等优点,可用于PRRSV样品的检测。     

环介导等温扩增技术在动物病原检测中的应用

环介导等温扩增技术（LAMP）是一种依赖于自动循环的链置换技术,在等温条件下,不到1h就能扩增出10^9-10^10靶序列拷贝。该技术快速准确、操作简单、特异性强、灵敏度高,已经被用于动物病原微生物的快速检测。本文就LAMP法的反应原理、技术特点及其在动物病原快速检测中的应用作一综述。     

用地高辛标记的核酸探针检测猪伪狂犬病毒野毒感染的研究

利用PCR技术从带有伪狂犬病毒（PRV）gE基因的重组质粒pMD18-T-gE中扩增回收约304bp大小的片段,并制备出地高辛标记的gE基因核酸探针。特异性检测结果表明,该探针能与重组质粒DNA发生特异性杂交,而与对照的PRVBartha-k61株疫苗毒DNA、猪细小病毒（PPV）DNA、猪圆环病毒（PCV）DNA、猪繁殖与呼吸综合征病毒（PRRsV）cDNA、猪瘟病毒（CSFV）cDNA的杂交反应均为阴性;敏感性检测结果表明,该探针对PRV野毒的最低检出量为4pg。应用该探针对11份繁殖障碍病料进行了杂交检测,共检出4份阳性病料,该结果与PCR检测结果一致,表明该核酸探针可用于猪伪狂犬病野毒感染的临床诊断。