转基因鱼试验湖浮游生物群落DNA指纹与理化因子的关系

对转基因鱼试验湖7个采样点的浮游生物群落进行了PCR-DGGE指纹分析,并进而探讨了DNA指纹与理化因子的关系.结果表明:(1)PCB-DGGE指纹图谱中共含104谱带,其中原核谱带58条,真核谱带46条,其多态性位点分别为87.9%和82.6%.(2)各站点的理化因子中,Ⅰ站的TP含量最高(0.10 mg/L),TN含量在Ⅲ站最高(0.34 mg/L),且各站点波动较大,Ⅴ站的透明度最低(63.00 cm);NO3-N、NH4-N、pH、DO、COD及电导率在各站点变化不大.基于原核生物图谱的相似性聚类分析表明,浮游生物群落Ⅵ和Ⅶ、Ⅳ和Ⅴ、Ⅱ和Ⅲ相似度分别较高,Ⅰ站有别于其它各站,单独为1枝;基于真核生物图谱的聚类分析显示,Ⅰ、Ⅱ站聚为1枝,Ⅳ、Ⅴ、Ⅵ和Ⅶ依次相聚后与Ⅲ站聚为另1大枝,Ⅰ、Ⅱ站与Ⅲ站相距较近;理化因子的主成分分析结果与之基本吻合.因此,浮游生物群落DNA多态性与环境理化因子是密切相关的,这类资料的积累将为在分子水平上建立水质预测预报体系奠定基础,为评价转基因鱼生态安全性提供依据.     

复合池塘循环水养殖系统微生物群落结构分析

于2008年6至10月逐月调查研究了新型复合池塘循环水养殖系统各塘水体理化和微生物分子特征.通过提取水样中细菌总DNA,扩增其16S rDNA基因V3区,再经DGGE分析获得图谱,选择其中主要的13条特征条带进行克隆测序.研究结果表现为,随水流方向(Pl→P5),各循环塘溶氧(DO)和透明度(SD)依次呈明显下降趋势,而NH4~+-N,TP和COD_Mn水平呈明显上升趋势;与对照塘相比,循环塘DO和SD升高,COD_Mn和营养盐水平降低.DGGE图谱分析显示,各养殖塘微生物种类丰富,循环塘与对照塘的群落结构存在明显差异,且差异主要表现在较弱的条带上;13条特征条带的测序结果表明,池塘优势菌群分属4个门:放线菌门(Actinobacteria)、变形菌门(Proteobacteria)、蓝细菌门(Cyanobacteria)和拟杆菌门(Bacteroidetes),其中有2条属于蓝细菌门的条带特定分布于对照塘.典型对应分析(CCA)排序结果显示,DGGE图谱条带分布与理化因子密切相关.与传统池塘养殖相比,该养殖模式有助于改善养殖池塘微生态环境.本研究旨为池塘微生物群落结构及其功能关系研究提供借鉴.     

沿海滩涂异育银鲫养殖池塘真核浮游生物群落DNA指纹结构与理化因子的关系

为研究沿海滩涂异育银鲫养殖池塘浮游生物群落周年变化及其与理化因子的关系,2011年每月采集养殖池塘水样,测定相关理化因子。采用18s rDNA PCR-DGGE技术对真核浮游生物群落多样性进行了分析。运用CCA方法分析了真核浮游生物与理化因子的关系。结果表明:TP含量为0.17~1.12 mg/L,7月出现峰值。PO4-P含量为0.04~0.30 mg/L,7月和8月较高。NO2-N含量为0.02~0.57 mg/L,12月最高。NH+4-N含量为0.20~2.37 mg/L,5月出现峰值。NO3-N含量为0.04~10.47 mg/L,11月出现峰值。DGGE结果显示,1—12月共有73条谱带,平均每月谱带数为24.67。5月、6月、8月和9月份多样性指数较高。谱带匹配后聚类分析表明:除3月、7月和11月份外,真核浮游生物变化具有季节性,其中8月、9月和10月聚为一支,4月、5月和6月聚为一支,1月、2月和12月聚为一支。CCA分析表明,温度、TP和NH+4-N与真核浮游生物群落结构组成显著相关,为养殖生态调控和养殖模式优化提供理论依据。     

刺参消化道内含物细菌群落组成的PCR-DGGE分析

利用PCR-DGGE技术研究刺参(Apostichopus japonicus)前肠、中肠和后肠内含物的细菌群落组成。通过软件Bio-rad Quantity one分析DGGE指纹图谱,发现刺参后肠内含物的条带数目显著高于前肠和中肠(P=0.003,P=0.016),表明刺参后肠内含物的细菌多样性最高,其次是中肠;前肠内含物的细菌多样性最低。UPGMA聚类分析发现,不同刺参个体其后肠的细菌群落组成差异最小,前肠的细菌群落差异最大。经DGGE分离、条带切割和序列测定,共获得了13条序列,系统发育分析表明,刺参消化道内含物的细菌群落可主要归属于5大类群,即α-变形菌纲(α-proteobacteria)、γ-变形菌纲(γ-proteobacteria)、δ-变形菌纲(δ-proteobacteria)、拟杆菌纲(Bacteroidetes)和柔膜菌纲(Mollicutes)。刺参前肠、中肠和后肠内含物的优势菌群均为γ-proteobacteria。Blast分析显示,其中12条与之亲缘关系最近的序列来自从海洋环境中获得的细菌克隆,表明刺参消化道的细菌群落可能直接或间接来源于刺参的栖息地环境。     

刺参养殖池塘人工参礁生态效应的研究

研究了采用蓝网、白纱、绿纱、编布、瓦片、石头制成的各种人工参礁对刺参池塘生态系统中底栖藻类种类组成及生物量、底层溶氧和营养盐等生态因子的影响。结果表明,颜色较深的蓝网与绿纱附着底栖藻类的生物量较大;水深小于150cm时附着生物量较大;小型底栖藻类在编布、瓦片上的生物量较大;大型底栖硅藻在蓝网、绿纱、白纱等有孔网片上的生物量较大。NO3--N远远大于NH4+-N并与底栖藻类生物量的相关系数极小;而底层NH4+-N与底栖藻类生物量的相关系数较大,为0.7176;PO43--P与底栖藻类生物量的相关系数介于二者之间。人工参礁的材料、设置方式与水深是刺参池塘养殖生态系统的关键技术和条件,并具有显著的生态效应。     

刺参池塘养殖夏季水质管理技术

<正>入夏后,随着气温的升高和降雨量增加,刺参养殖池塘的水温、盐度、溶氧等理化因子也随之发生较大变化,常超出刺参的适宜范围,而此时大多成参已进入夏眠期,基本停止摄食与生长,免疫力和抗应激能力下降,极易因水环境恶化而诱发疾病甚至死亡。根据多年的科研与生产经验,笔者认为,保证池养刺参安全度夏的关键是要搞好池塘的水质管理。     

池塘养殖仿刺参(Apostichopus japonicus)肠含物、附着基和底泥中的菌群结构及其相关性

2014年10月,利用 PCR-DGGE 技术分析了标准化养殖池塘中仿刺参(Apostichopus japonicus)肠含物及附着基和底泥中细菌的菌群结构及其相关性。结果显示,仿刺参肠含物、附着基、底泥中细菌多样性较高,分别平均获得30.00±1.00、15.33±1.70、21.67±2.62条带,肠含物中细菌种类数显著高于附着基和底泥。聚类分析和戴斯系数表明,不同池塘的仿刺参肠含物样本单独聚为一支,相似性达到0.785,附着基和底泥样品聚为一支,平均相似性达到0.532。不同样品 DGGE 图谱中20条优势条带的切割、克隆、测序,共获得了20条细菌序列,表明肠含物细菌种类以聚球藻属(Synechococcus sp.)、脱硫杆菌属(Desulfobacterium)、脱硫叠球菌属(Desulfosarcina sp.)、极地杆菌属(Polaribacter)、Algibacter sp.为主,附着基中主要以 Robiginitalea sp.和 Silicibacter sp.为主,底泥样品中主要以假单胞菌属(Proteobacterium）、噬胞菌属(Cytophaga）、Desulfosarcina sp.为主,肠含物中细菌特有种类的分离与鉴定为仿刺参养殖潜在益生菌的开发提供基础数据。     

基于16SrDNA比较研究混养三角帆蚌和鲢鳙对池塘养殖水体微生物群落结构的影响

为了研究混养三角帆蚌(Hyriopsis cumingii)和鲢(Hypophthalmichthys molitrix)鳙(Aristichthys nobilis)对池塘养殖水体微生物群落结构的影响,分别在浙江海盐、江西九江、上海浦东开展了罗氏沼虾-三角帆蚌混养、草鱼—三角帆蚌混养、罗氏沼虾-三角帆蚌-鲢鳙鱼混养三组系列实验。利用DGGE技术对养殖水体的16S r DNA进行指纹图谱分析。三组实验共鉴定出57条不同条带,每组实验中混养三角帆蚌或鲢鳙实验组的平均条带数均高于单养水体水样平均条带数。Shannon多样性指数分析结果显示,各养殖水体混养三角帆蚌、鲢鳙后,多样性指数均有所增加。PCA分析和DGGE聚类结果显示,在无鲢鳙的情况下,蚌与主养物种(罗氏沼虾、草鱼)混养实验组的16S r DNA图谱聚为一类,显示出蚌对于微生物群落结构影响的贡献;在同时引入鲢鳙和蚌的情况下,16S r DNA指纹图谱则是按照有无鲢鳙聚为两类,提示在本实验中鲢鳙对于水体微生物的影响要大于蚌。对DGGE图谱其中20条显著条带进行回收、测序和系统发育分析,结果表明,所获序列主要分属于放线菌门(Actinobacteria,25%)、蓝藻门(Cyanobacteria,25%)、α-变形菌亚门(Alphaproteobacteria,15%)、β-变形菌亚门(Betaproteobacteria,15%)、γ-变形菌亚门(Gammaproteobacteria,10%)、ε-变形菌亚门(Epsilonproteobacteria,5%)、裸藻叶绿体(Euglenales,5%)。     

应用稳定同位素分析辽东湾池塘仿刺参的食性

为分析辽东湾海水生态养殖池塘仿刺参的食性特征,分别于2016年3月、5月、7月、9月、12月采集池塘中的浮游植物、浮游动物、颗粒有机物、底栖硅藻、表层底泥和仿刺参,并检测所有样品的δ~(13)C和δ~(15)N值。运用IsoSource线性混合模型计算出浮游植物、浮游动物、颗粒有机物、底栖硅藻、表层底泥对仿刺参的饵料贡献率。试验结果显示,底栖硅藻对仿刺参的平均饵料贡献率周年变化为78.5%～85.7%,颗粒有机物、浮游植物、浮游动物和表层底泥对仿刺参的贡献率分别为2.1%～5.1%、2.2%～5.6%、2.3%～7.7%、3.6%～7.9%。底栖硅藻对消化管内含物δ~(13)C值的贡献率为25.8%～74.5%、颗粒有机物、浮游植物、浮游动物和表层底泥对消化管内含物δ~(13)C值的贡献率分别为3.9%～15.3%、4.0%～18.3%、4.2%～19.4%、5.6%～22.2%。试验结果表明,在不投饵、缺乏底栖大型藻类的生态养殖池塘中,底栖硅藻是仿刺参主要的食物来源,仿刺参也摄食表层底泥、沉降后颗粒有机物和浮游动植物。研究结果可为海水池塘仿刺参的生态健康养殖提供基础数据。     

高密度杂交鳢养殖围隔沉积物微生物群落结构垂直变化规律及其与理化因子的关系

为研究高密度养殖系统沉积物微生物群落结构垂直变化规律以及与其对应深度的环境因子的关系,实验选取了华南地区高密度养殖的典型模式——杂交鳢养殖模式,使用PCR-DGGE技术分析了养殖围隔不同深度(0~50 cm)沉积物中的微生物群落结构,同时使用透析装置采集对应沉积物的原位间隙水,并使用微量分光光度法测定间隙水中理化指标,从而探讨高密度养殖系统微生物群落结构垂直变化规律及其与沉积物间隙水理化因子的关系。结果显示,①不同深度的养殖围隔沉积物微生物群落结构通过聚类分析可分3个差异显著的类群:上层(0~6 cm)、中层(7~38 cm)和深层(39~50 cm),其中中层微生物多样性最为丰富。②DGGE电泳共获得46个条带,其中中层条带最多,深层沉积物条带最少。主要微生物类群归属于拟杆菌门、变形菌门、厚壁菌门、疣微菌门和浮霉菌门。③测定的沉积物间隙水中离子,NO_3~--N、SO_4~(2-)-S和Fe~(2+)在沉积物中垂直分布均匀,无明显梯度变化;而NH_4~+-N、NO_2~--N和PO_4~(3-)-P浓度变化较大。NH_4~+-N浓度随深度增加而逐渐增加,在15~18 cm后趋于稳定,为10.98~77.87 mg/L,PO_4~(3-)-P浓度随深度增加而减少,在9~10 cm后趋于稳定,为0.01~0.14 mg/L。④微生物群落结构与理化因子的相关性分析结果表明,NH_4~+-N和PO_4~(3-)-P为影响微生物群落结构垂直分布最大的理化因子组合,其中NH_4~+-N对微生物群落结构垂直分布的影响稍大于PO_4~(3-)-P。NH_4~+-N、PO_4~(3-)-P为影响微生物群落结构的主要理化因子,是杂交鳢养殖系统环境调控的主要控制指标。     

Straying and population genetic structure

The differentiation process in a set of idealized populations is simulated by computer programs. Absolute and relative effects of genetic drift, gene flow (through straying) and natural selection on the genetic population structure are explored. The effect of increased gene flow in an equilibrium situation is studied for both neutral and selected traits.     

硒化岩藻聚糖的理化性质和分子结构

运用多种方法和仪器对本实验室制备的硒化岩藻聚糖的理化性质进行了测定 ,结果表明 :硒化岩藻聚糖可溶于水 ,溶解度随温度升高而增加 ,但在有机溶剂中基本不溶 ;室温干燥放置 1年 ,硒含量保持稳定 ;硒化岩藻聚糖的平均分子量为 1.75× 10 4 ;特性粘度为 16 ;在 (2 0± 1)℃时的旋光度为 - 50 .16°。通过紫外光谱、红外光谱、氢谱 (1H -NMR)和碳谱 (13C -NMR)的测定分析确定 ,亚硒酸根取代了岩藻聚糖分子中C2位或C3位的硫酸根而连接在C2 位或C3位     

Social organisation, shoal structure and information transfer

Recent work suggests that the social structure of fish shoals is nonrandom with strong tendencies for self‐sorting by phenotype in individuals of several species. The frequency of shoal encounters is high in most freshwater species but lower in pelagic fishes where intershoal distances tend to be greater. Detailed knowledge of the encounter rates between shoals and the exchange rates of individuals between shoals during encounters makes it possible to predict the transmission of learned behaviours through a population.     

道观河水库浮游植物的群落结构和现存量

通过周年 6次采样观测到道观河水库浮游植物有 7门 89种 ,平均密度为 2 5 1 75× 10 4ind ./L ,平均生物量为 5 6 7mg/L ,优势种为肘状针杆藻Synedraulna、小胶鞘藻Phormidiumtenue、水华微囊藻Microcystisflos-aquae、颗粒直链藻Melosiragranulata、啮蚀隐藻Cryptomonaserosa、小环藻Cyclotellasp 和小型色球藻Chroococcusminor。现存量水平变化为Ⅱ站 >Ⅲ站 >Ⅰ站 >Ⅳ站 ;垂直分布以 1/ 2倍透明度 (1/ 2SD)和 1倍透明度 (1SD)处最多 ;月间变化为 7月最高、 9月和 11月次之、 1月最低 ,5月和 7月针杆藻和胶鞘藻大量繁殖。从浮游植物种类组成、现存量看 ,该库为中富营养类型 ,并已向富营养化方向发展。建议加强滤食性鱼类的放养以控制浮游植物。     

关于安徽省渔业结构调整的实践与思考

安徽省是农业大省，也是渔业大省，水产资源十分丰富。全省淡水总面积1581万亩，居全国第六位，其中可养水面居全国第二位，互998年已养面积805万亩，水产品产量居全国淡水产品的第四位，为全国重点淡水鱼产区之一。一、渔业结构调整现状1．渔业经济增产、增效显著，占大农业比重上升。1998年全省水产品产量146．2万吨，渔业总产值78百亿元，均比1993年增长3倍，渔业产值占农业总产值的比例为11．2啪，比19％年提高8．2个百分点，渔业对农民人均收入贡献由36元增至匕4元，全省水产特产税收入1．6亿元，分别是1993年的4．2倍和53倍。2．提高…     

贝壳的结构与应用的研究现状

我国的贝壳资源十分丰富,但囿于技术等问题,利用率一直较为低下。为此,对贝壳的成分、结构进行了介绍,并由此引申出其相关特性,同时,综合相关研究,列举了贝壳在作为吸附剂、杀菌剂、催化剂和用于功能材料等方面的应用,对贝壳的资源化利用提出建议。     

圆斑星蝶MHC ⅡB基因结构、多态性及组织表达分析

通过表达序列标签法和cDNA末端快速扩增(RACE)技术,分离和克隆了圆斑星鲽(Verasper variegatus)主要组织相容性复合体(MHC)IIB的全长cDNA序列,该cDNA全长为1 144 bp,5'UTR(untranslated region)为7 bp,3'UTR为450 bp,开放阅读框(ORF)长度为687 bp,可编码228个氨基酸,包含信号肽、抗原结合域(β1),IGC区(β2),跨膜区和胞质区5个结构域.同源分析表明,圆斑星鲽MHC IIB氨基酸序列与其他硬骨鱼具有49%-79%的同源性,与鼠、人、红原鸡和护士鳖的相似性较低,分别为34%,33%,31%和30%.圆斑星鲽MHC IIB基因含有5个内含子,与其他硬骨鱼不同,其β2结构域编码区内存在I个109 bp的内含子.根据获得的MHC IIB基因组序列设计特异性引物,在10尾野生圆斑星鲽中扩增了包括完整内含子1和外显子2的长度约388 bp的DNA片段,PCR产物直接测序后发现在270 bp的抗原结合域中共有23个位点发生变异,密码子第1位和第2位的变异明显高于第3位.利用荧光定量PCR分析组织表达发现,MHC IIB基因在健康圆斑星鲽9种组织中均有表达,但表达量存在差异,肾的表达量最高,肌肉的表达量最低,肾、心、脾脏和鳃的表达量显著高于肝、皮肤、脑、血和肌肉.本研究旨在为MHC基因家族的遗传进化分析、结构与功能的解析提供基础,同时为圆斑星鲽的分子免疫学和标记辅助育种研究提供参考依据.     

星突江鲽的形态特征及内部结构研究

通过观察、测量、解剖、数据的整理和分析，对120尾全长11-43cm，体质量0．02～2．49kg的养殖星突江鲽（Platichthys stellatus Pallas）外部形态、可量可比性状、可数性状和内部结构进行了研究。外部形态包括口、鼻、眼、鳍条、侧线和鳞片的特征；可量可比性状包括全长／体长（T1/S1）、体长／体高（S1/Bd）、体长／头长（S1/M1）、头长／吻长（H1/P1）、尾柄长／尾柄高（C1/Cd）、体长／尾柄长（S1/C1）、头长／眼间距（H1/Ei）、头长／眼径（H1/Ed）比值及其相关方程；可数性状包括背鳍鳍条、尾鳍鳍条、臀鳍鳍条、腹鳍鳍条、胸鳍鳍条、侧线鳞、侧线上鳞、侧线下鳞、牙齿、幽门盲囊、上鳃耙、脊椎骨；内部结构主要包括消化系统的组成和解剖位置。结果表明：（1）外部形态的明显特征在于：背鳍、臀鳍、尾鳍有黑色和黄色相间的条纹；多角星状鳞片，有刺状突起。（2）全长／体长变动范围最小，雌雄差异最小，其线性相关性最好，全长与体长相关方程为S1=0．8771 T1-0．1589（R^2=0．9822）；头长／吻长、头长／眼径不仅变动最大，而且其线性相关性最差，雌雄的差异也最大；星突江鲽体长与体质量关系为：W=0．0168S1^3.199，R^2=0．9797：雄性：W=0．0274S1^2.9721，R^2=0．993；雌性：W=0．0134S1^4.3008，R^2=0．9822（W代表体质量，kg：S1代表体长，cm）。（3）星突江鲽腹鳍鳍条与幽门盲囊最稳定；侧线鳞和牙齿变动最大。（4）牙尖锐，圆锥形；胃大，呈“I”型，肠粗短；1-2枚幽门盲囊。通过比较发现：星突江鲽的外部形态、可量可比性状和内部结构特征均与石鲽相近：星突江鲽与6种比目鱼相比，可数性状指标的数目多较少。     

张氏的年龄结构及生长特性

以鳞片作为年龄鉴定材料,对长江上游特有鱼类张氏(Hemiculter tchangi Fang)种群的年龄结构和生长特性进行了研究。结果表明:张氏鳞片的年轮结构呈疏密切割型,2~3月是年轮形成最多的月份。其渔获物由1~4龄组成,其中857尾为1~2龄,占总数的83.84%;雌∶雄性比为1.07∶1,符合1∶1理论比值(X2=0.754,P>0.05,n=1001),随着年龄的增长呈雌鱼多于雄鱼的趋势。体长主要分布在81~180 mm(94.9%),体重主要分布在2.9~50.0 g(67.69%)。体长和鳞径呈直线关系,体长和体重呈幂函数关系且幂指数接近3,属于匀速生长类型,生长方程为Lt=196.05(1-e-0.36(t+1.26));Wt=97.195(1-e-0.36(t+1.26))3.145,拐点年龄为1.92龄,相应的体长体重分别为133.5 mm、29.13 g。     

西江鱼类群落结构和环境影响分析

2016-2018年,于珠江干流西江桂平至肇庆6个站点开展了季节性渔获物采集和环境监测,共采集鱼类12目29科99种,单次采集10~45种,香浓威纳指数(H’)为0.90~2.93,均匀度指数(J’)为0.30~0.89,物种组成为季节和空间的周转格局。相对重要性指数表明,鲮(Cirrhinus molitorella)、广东鲂(Megalobrama terminalis)和赤眼鳟(Squaliobarbus curriculus)为主要优势种。置换多因素方差分析表明鱼类群落时空差异显著,夏-冬季间群落结构差异主要源于鲤(Cyprinus carpio)、鲮、广东鲂和赤眼鳟质量百分比(W%)差异;桂平与梧州、肇庆的显著差异主要源于鲮、广东鲂和银(Squalidus argentatus)的数量百分比(N%)差异,以及鲮、广东鲂、鲤、鲢(Hypophthalmichthys molitrix)和尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)的W%差异。冗余分析分别解释了鱼类N%和W%变异的49.92%和49.61%,主要影响因子为距河口距离、水温、透明度和径流量,且鲮分布在低透明度的高温水域,广东鲂和鲢分布在下游江段,赤眼鳟分布在中上游江段,鲤分布在高透明度的低温水域。