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| 圆斑星蝶MHC ⅡB基因结构、多态性及组织表达分析 | |
| 引用本文： | 李宏俊,王娟,高祥刚,苏浩,刑坤,傅立元,赫崇波.圆斑星蝶MHC ⅡB基因结构、多态性及组织表达分析[J].中国水产科学,2011,18(2). |
| 作者姓名： | 李宏俊 王娟 高祥刚 苏浩 刑坤 傅立元 赫崇波 |
| 作者单位： | 1. 辽宁省海洋水产科学研究院,辽宁省海洋水产分子生物学重点实验室,辽宁,大连,116023 2. 辽宁省海洋水产科学研究院,辽宁省海洋水产分子生物学重点实验室,辽宁,大连,116023;辽宁师范大学,生命科学学院,辽宁,大连,116029 3. 大连海洋大学,海洋工程学院,辽宁,大连,116023 |
| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目，国家鲆鲽类产业技术体系计划项目，国家海洋经济规划实施的科技推进平台与运行项目( |
| 摘 要： | 通过表达序列标签法和cDNA末端快速扩增(RACE)技术,分离和克隆了圆斑星鲽(Verasper variegatus)主要组织相容性复合体(MHC)IIB的全长cDNA序列,该cDNA全长为1 144 bp,5'UTR(untranslated region)为7 bp,3'UTR为450 bp,开放阅读框(ORF)长度为687 bp,可编码228个氨基酸,包含信号肽、抗原结合域(β1),IGC区(β2),跨膜区和胞质区5个结构域.同源分析表明,圆斑星鲽MHC IIB氨基酸序列与其他硬骨鱼具有49%-79%的同源性,与鼠、人、红原鸡和护士鳖的相似性较低,分别为34%,33%,31%和30%.圆斑星鲽MHC IIB基因含有5个内含子,与其他硬骨鱼不同,其β2结构域编码区内存在I个109 bp的内含子.根据获得的MHC IIB基因组序列设计特异性引物,在10尾野生圆斑星鲽中扩增了包括完整内含子1和外显子2的长度约388 bp的DNA片段,PCR产物直接测序后发现在270 bp的抗原结合域中共有23个位点发生变异,密码子第1位和第2位的变异明显高于第3位.利用荧光定量PCR分析组织表达发现,MHC IIB基因在健康圆斑星鲽9种组织中均有表达,但表达量存在差异,肾的表达量最高,肌肉的表达量最低,肾、心、脾脏和鳃的表达量显著高于肝、皮肤、脑、血和肌肉.本研究旨在为MHC基因家族的遗传进化分析、结构与功能的解析提供基础,同时为圆斑星鲽的分子免疫学和标记辅助育种研究提供参考依据. |
| 关 键 词： | 圆斑星鲽 MHC ⅡB 基因结构 多态性 组织特性表达 |
Genomic structure of MHC IIB from spotted halibut Verasper variegates:genomic structure,polymorphism and tissue expression analysis |
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| LI Hongjun,WANG Juan,GAO Xianggang,SU Hao,XING Kun,FU Liyuan,HE Chongbo.Genomic structure of MHC IIB from spotted halibut Verasper variegates:genomic structure,polymorphism and tissue expression analysis[J].Journal of Fishery Sciences of China,2011,18(2). | |
| Authors: | LI Hongjun WANG Juan GAO Xianggang SU Hao XING Kun FU Liyuan HE Chongbo |
| Abstract: | |
| Keywords: | cDNA |
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