不同初始基因频率下闭锁群体遗传漂变的模拟

在假定不发生基因突变、群体间无个体迁移的情况下,群体内实行随机留种,随机交配,世代不重叠,且每代参与繁殖的个体数相同.采用计算机模拟方法研究了不同初始基因频率、群体规模和公母比例下闭锁群体内单个双等位基因座位的遗传漂变.模拟试验共进行了50个世代,100次重复.结果表明:群体规模较大,公畜数较多以及初始基因频率处于中等水平时,基因频率在世代问发生随机波动的幅度较小,基因由于随机遗传漂变而发生丢失或固定的概率也较低.群体规模太小、公畜比例过低以及基因的初始频率过低或过高,均会增加基因丢失或固定的风险.     

猪F2代资源家系的群体结构对QTL定位的影响

 【目的】研究猪F2代资源家系的群体结构对数量性状座位(quantitative trait loci,QTL)定位的影响,为QTL定位群体的构建提供参考。【方法】通过模拟的方法,模拟了18种不同的群体结构,研究F0代(亲本)、F1代和F2代群体大小、F0代和F1代公母比例以及祖代QTL基因频率等6种因素对QTL定位的影响。【结果】随着F2代群体的增大,QTL检测的效率明显提高,加性效应的估计值逐渐偏低,95%置信区间显著减小。造成加性效应降低的主要原因是QTL在两亲本群体中没有纯合。随着F0代母畜比例的增加,QTL 95%置信区间也明显降低;随着祖代QTL基因频率差异的增加,QTL检测的效率和准确性都显著提高。【结论】F2代群体大小、F0代母猪比例和祖代QTL基因频率对QTL定位有显著影响,而F1代的群体大小、F0代的群体大小和F1代公母比例对QTL定位的影响不显著。     

数量性状两个候选基因检测效率分析

文章采用Monte Carlo模拟方法分析了各种因素对两对数量性状检测效率的影响。采用回归分析法估计候选基因检测分析统计模型的参数;考虑了群体大小(个体数)、候选基因遗传贡献率和基因频率等3个因素。模拟试验结果表明,个体数对检测效率的影响不如遗传贡献率显著;检测高遗传贡献率的候选基因要比低遗传贡献率需要的群体小;基因频率对候选基因的检测效率几乎没有影响。     

云杉天然群体基因分化与种质资源异地保存抽样策略

采用聚丙烯酰胺垂直板凝胶电泳和水平淀粉凝胶电泳对云杉全分布区10个天然群体的300个个体进行酶电泳分析,研究天然群体的等位基因数量和频率分化,共测定8种酶系统,得到17个清晰酶位点和27个等位基因.10个群体检测到的等位基因数均值为24.7个(变幅为23～27个).据基因频率进行分类,检测到全域基因和广域基因数量分别为19个和7个,分别占总基因的70.37%和25.93%;特有基因只有1个,即铁布群体的Idh-2-C,占总基因的3.7%.10个群体基因频率的均值没有太大差异,相同位点的广域基因频率在群体间均存在差异.通过计算机模拟建立云杉天然群体种质资源保存的群体和群体内个体两个层次的基因捕获曲线.群体的等位基因频率与地理生态因子的相关分析表明:Fdh-2-B基因频率与生态梯度值呈显著负相关(r=-0.661 1*).构建了云杉天然群体核心种质保存的抽样策略,经综合分析,抽取全分布区内铁布、卓尼、阿坝、小金、热务沟、凤县和曲谷7个群体,每个群体保存25个拟式无亲缘关系的个体,可以保护云杉种内95%～99%的基因资源.     

淮南麻黄鸡三个选育群血清转铁蛋白多态性的研究

本试验采用聚丙烯酰胺凝胶垂直板电泳法测定了淮南麻黄鸡三个群体T多态性,统计各群体的基因型频率与基因频率,并计算各群体的纯合系数与群体间的遗传距离。结果表明：三个群体的基因型频率与基因频率各不相同,皆以B基因频率最高,Ⅰ群体中BC型个体最多,C基因频率大地A基因频率;Ⅱ群体中BB型个体最多,Ⅲ群体中AB型个体最多,Ⅱ、Ⅲ群体皆A基因频率大于C基因频,从Tf位点来看,淮南麻黄鸡各群体纯度还有待于进一步选育提高。     

不同适合度下2对基因互作引起的基因频率的演变

研究了随机交配群体中2对基因9种基因型在不同适合度下所占比例的逐代变化。发现只按1对基因统计时,在另1对基因的影响下,所考察基因3种基因型的适合度不再是常数。通过数据模拟可找出基因频率逐代变化的极限,模拟结果可解释生产中很难看到杂种劣势的原因。     

基于动态粗集的农民工群体结构研究

首先基于动态粗集理论对农民工群体进行建模,将农民工群体动态的划分为4个层次,分别是核心农民工群体、现实农民工群体、边缘农民工群体和非农民工群体。其次提出依据农民工个体属性的迁移系数判定他位于农民工群体的层次。此过程不仅充分考虑了农民工个体在社会中的动态表现和各种不确定因素,还避免了主观因素的影响。最后通过一个公司农民工群体结构分析的应用举例验证了研究的实用性。     

河北省野生大豆天然群体中胰蛋白酶抑制剂蛋白的多态性

 在河北省搜集了东北部山区、东北部平原、白洋淀湖泊区、西南丘陵山区等 18个天然野生大豆群体的 4 6 1份植株种子样本 ,调查其Kunitz型胰蛋白酶抑制剂蛋白 (KTI)的形态及蛋白位点在野生大豆天然个体群体及地理的频率变化。结果显示超过 5 0 %个体群体的KTI位点是多态的 ,18个天然个体群体中 12个群体形态是由Tia和Tib构成的混合群体。这次测定的河北野生大豆中没有发现Tic形态存在。在 12个混合群体中 ,4个群体发现存在Tia/Tib杂合种子 ,约占调查群体的 2 2 % ,在野生大豆总群体中至少有 1%的异交率。河北天然野生大豆Tia基因频率约占 85 % ,Tib约 15 %。地理上 ,东北部山区和平原生态区比南部的白洋淀和西南丘陵山地生态区有较高的Tib频率 ,无论在南部或北部 ,山区生态区Tib频率高于平原生态区 ,同时山区生态区内的个体群体间的基因频率差异变化程度高于平原群体间的变化 ;个体群体的基因频率没有看到与地理距离有相关性。白洋淀湖泊生态区虽然有河北最大的野生群落 ,但是KTI位点是Tia单态的 ,湖内和湖外群体KTI位点是一致的单态性 ,暗示白洋淀区域野生群体间受湖水流动的影响 ,使Tia型种子在群体传播形成一个单态优势型 ,也许这个区域的野生大豆遗传背景较其它地区群体狭窄。在这个研究中 ,我们还首     

水稻DH群体的构建及其特征分析

利用花药培养,构建了武运粳8号×农垦57的加倍单倍体群体（DH群体）,其含有130个稳定株系,对该群体农艺性状的调查结果进行分析表明,多数性状符合正态分布,属于多基因控制的数量性状;利用SSR引物进行双亲多态性筛选,其中60对引物具有多态,多态频率约为12．O％,利用这些多态性的SSR标记对各株系基因型进行检测,发现绝大多数SSR位点符合1：1的分离比例。武运粳8号和农垦57对DH群体的贡献率分别为0．504和0．496,这表明：该DH群体是数量性状遗传分析的理想群体。     

保种群体遗传结构变化的模拟研究

本文运用电子计算机模拟的方法,分析了影响畜禽保种的主要因素,并通过不同参数组合(包括起始基因频率、群体有效含量和世代数等)的模拟试验得出三个主要结论: 1 在有性繁殖的有限群体中,原封不动地保存群体基因库中的每个基因(包括频率很低的基因)是根本不可能的。 2 在完全实行随机交配的情况下,长期保存频率较高的基因也需要相当大的群体才有可能。 3 频率较高基因的保存也不能单纯依靠群体大小,还需借助于选择。只有这样才能在小群体内长期保存频率较高的基因。     

Research on Anti-noise Processing Method of Production Signal Based on Ensemble Empirical Mode Decomposition(EEMD)

The grain production prediction is one of the most important links in precision agriculture. In the process of grain production prediction, mechanical noise caused by the factors of difference in field topography and mechanical vibration will be mixed in the original signal, which undoubtedly will affect the prediction accuracy. Therefore, in order to reduce the influence of vibration noise on the prediction accuracy, an adaptive Ensemble Empirical Mode Decomposition (EEMD) threshold filtering algorithm was applied to the original signal in this paper: the output signal was decomposed into a finite number of Intrinsic Mode Functions (IMF) from high frequency to low frequency by using the Empirical Mode Decomposition (EMD) algorithm which could effectively restrain the mode mixing phenomenon; then the demarcation point of high and low frequency IMF components were determined by Continuous Mean Square Error criterion (CMSE), the high frequency IMF components were denoised by wavelet threshold algorithm, and finally the signal was reconstructed. The algorithm was an improved algorithm based on the commonly used wavelet threshold. The two algorithms were used to denoise the original production signal respectively, the adaptive EEMD threshold filtering algorithm had significant advantages in three denoising performance indexes of signal denoising ratio, root mean square error and smoothness. The five field verification tests showed that the average error of field experiment was 1.994% and the maximum relative error was less than 3%. According to the test results, the relative error of the predicted yield per hectare was 2.97%, which was relative to the actual yield. The test results showed that the algorithm could effectively resist noise and improve the accuracy of prediction.     

黄山松群体酶基因遗传变异的研究

应用等位酶分析法,分析了１８个林分群体（小群体）２８０多株黄山松种子胚乳的ＥＳＴ和ＭＤＨ酶的酶基因。结果表明：ＥＳＴ酶受３个基因位点调控,其中２个位占 有等位基因５个、４个,平均为３．５８个;ＭＤＨ酶受４个基因位点调控,其中３个位点各有等位基因３个、５个、５个,平均为２．８１个。基因位点均是多态的。等位基因在群体中的分布不同。ＥＳＴ酶基因位点的平均期望杂合度为０．５６２,ＭＤＨ酶基因位点的平均期望     

河北太行鸡不同群体含黄素单氧化酶3基因多态性检测

为了研究含黄素单氧化酶3(FMO3)基因T329S突变位点在河北太行鸡不同群体中的等位基因及基因型频率分布情况,采用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性分析方法(PCRRFLP)和DNA测序技术分别对赞皇、平山、唐县地区3个河北太行鸡群体FMO3基因及基因型频率进行检测。结果显示,平山地区太行鸡群体中未检测到SS型个体,而平山、唐县地区太行鸡群体中均有FMO3基因SS型个体;赞皇、平山、唐县3个太行鸡群体中T等位基因的频率分别为0.129 8、0.075 0、0.084 2,其频率均远低于等位基因A的频率。独立性卡方检验结果显示,不同群体间基因型频率分布差异不显著;经适合性卡方检验,赞皇、平山、唐县3个太行鸡群体卡方值分别为1.173 0(P0.05)、0.035 1(P0.05)、0.188 5(P0.05),说明该基因位点A→T碱基突变在3个群体中均处于Hardy-Weinberg平衡状态;通过分析3个不同群体遗传变异参数发现,3个太行鸡群体在该基因位点上均处于低度多态(PIC0.25)。以上结果表明,河北太行鸡群体中FMO3基因型频率较低,可以通过PCR-RFLP的方法予以剔除。     

小麦抗赤霉病基因库建拓研究——抗源库群体改良效果初报

从小麦抗赤霉病的抗源库中,表型转回选择选出RC0、RC1、RC2、RC3等群体,进行两年研究。结果表明:群体抗病性因轮回选择而显著提高。发病穗数和发病率逐轮降低,发病株中发病小穗数也显著减少,平均海轮减少20%左右。群体中抗病植株的频率有增大趋势。穗长、结实小穗数、穗粒数和穗粒重等农艺性状也得到显著改良。千粒重有所降低。群体遗传变异得到较好保持。从基因库中选出抗性增强、农艺性状改善的优良单株机率明显增大。在进一步的轮回选择中,可对抗性改良的同时,对其他农艺性状进行选择,以期改良群体的综合性状。     

农村人口城镇化速度影响中国总人口的定量分析

建立了农村人口城镇化速度影响中国总人口的数学模型,测算了城镇化速度对中国总人口的影响,得到了总人口和老龄人口加速增长的预测结果。     

群体及个体大小对加拿大一枝黄花生长和生殖的影响

[目的]了解群体和个体大小对加拿大一枝黄花生长和生殖的影响。[方法]于加拿大一枝黄花的果实成熟期,分别从选定的9个群体中随机选取10个生殖分株,齐地面剪下,带回实验室测定各形态和数量指标。[结果]群体大小对加拿大一枝黄花的营养生长和茎、叶生物量分配有显著的影响,随着群体的增大,生物量更多地投资到茎上,叶生物量分配则显著减少;群体大小对加拿大一枝黄花生殖性状的影响不明显,在不同大小群体中生殖分株具有稳定的生殖产出;生殖分株个体越大,生殖投入越高,生殖分配越低。[结论]不管在何种大小的群体下,加拿大一枝黄花生殖分株都具有稳定的生殖特性和生殖产出,且都能获得适量的传粉者为其进行异花传粉。     

Kin selection: its components

Change in gene frequency under kin selection is the sum of two components, namely, [See equation in the PDF file], a change in gene frequency caused by individual selection, and [See equation in the PDF file], a change caused by group selection. For the evolution of altruistic traits by kin selection, [See equation in the PDF file] is always negative-that is, individual selection operates against altruism-and [See equation in the PDF file] is always positive, so that selection between groups favors altruism. Hamilton's rule specifies the conditions under which [See equation in the PDF file]-that is, the conditions necessary for intergroup selection to override individual selection.     

间接地下滴灌水盐运移影响因素研究

为研究不同灌溉要素对间接地下滴灌土壤水盐运移的影响规律,通过小区试验,分析流量、灌水量及导水装置直径对间接地下滴灌条件下枣树根区水盐分布的影响。结果表明：增大流量或减小导水装置直径会使土壤表层的含水率提高;大灌水量、小流量会加大水分向下运移的深度;灌水量的增加显著增大主要根区含水率;流量、导水装置直径对水分的横向运移影响比灌水量更显著。     

21世纪头十年徐州市鸟类种群变化

对徐州市1999年和2012年间鸟的种类和数量变化进行了分析.两次调查结果表明,总的种数变化不大,但种的组成变化较大,两次调查中均出现的种仅占总种数的50％左右.