桂林市高致病性猪蓝耳病病毒流行株Nsp2基因片段的遗传变异分析

为了解桂林市高致病性猪蓝耳病病毒流行毒株的遗传变异情况及分子流行病学背景,筛选我市保存的2份PRRSV阳性病料进行Nsp2基因序列的测定与分析。结果表明,该研究中的两个基因片段的核苷酸序列同源性为96.2%,两者间推导的氨基酸序列同源性为95.3%,与14个参考毒株比较,核苷酸同源性达到81.9%~98.1%,推导的氨基酸序列同源性达到76.2%~97.5%。与传统毒株相比较,在第481位和第532~560位不连续缺失30个氨基酸,与国内其他变异毒株的缺失情况一致。从遗传进化方面分析,我市目前流行的高致病性猪蓝耳病毒株与JXA1及TJ等毒株具有相似来源。     

2株高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒分子特征分析

为进一步掌握黔西南州猪繁殖与呼吸综合征病毒（porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV）流行变异趋势,对2株高致病性PRRSV（HR-PRRSV）贵州分离株GZLPS、GZSB进行Nsp2与GP5基因克隆和测序,并分析毒株分子变异特征。结果显示,2株分离株Nsp2基因有90个核苷酸不连续缺失,不同位置的36个核苷酸发生突变;GP5基因存在不同位点置换。同源性比对与系统进化树分析显示,2株分离株Nsp2与GP5基因与HP-PRRSV JXA1株及贵州省2011年以前流行毒株的核苷酸同源性在96%以上,氨基酸同源性在95%以上,但在分子变异上存在差异。结果表明黔西南州PRRSV变异方式已呈多样性。     

2株高致病性蓝耳病病毒的分离鉴定及其非结构蛋白Nsp2基因特性分析

将黑龙江省2个地区的高致病性蓝耳病疑似病料接种Macr-145细胞,分离得到2株病毒,随后对其用RT-PCR方法、间接免疫荧光法进行鉴定,并对其非结构蛋白Nsp2基因的序列进行测定和遗传进化分析。结果表明,分离到的毒株均为PRRSV,分别命名为HLJZD13株和HLJMDJ13株;其Nsp2基因与国内近几年分离的HP-PRRSV毒株JXA1、HuN4的Nsp2基因的氨基酸同源性在95.4%以上,且在相同位置存在30个氨基酸的不连续缺失,提示目前市场上预防HP-PRRSV的疫苗适合在黑龙江省进行高致病性蓝耳病的防控。     

一株Nsp2蛋白部分氨基酸自然缺失的猪繁殖与呼吸综合征病毒的分离和鉴定

将RT-PCR检测为猪繁殖与呼吸综合征病毒(Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)阳性的肺组织碾磨、过滤后接种MARC-145细胞,在细胞上连续传代,上清传至第二代后能产生细胞病变。通过RT-PCR方法可以检测到释放在细胞上清中PRRSV RNA。间接免疫荧光试验也能检测细胞内PRRSV N蛋白的表达,表明该PRRSV毒株成功地在MARC-145细胞中分离,命名为PRRSV NN1396株。对NN1396分离株GP5基因进行克隆测序分析,结果表明该毒株与NCBI登录的PRRSV GP5核苷酸同源性为62.9%~98.2%,与PRRSV原型毒株VR-2332的同源性为87.9%,与高致病性毒株PRRSV JXA1同源性为98.0%,通过GP5的遗传进化分析发现所分离的PRRSV为北美型PRRSV,且与高致病性PRRSV分布在同一个小分支上;对部分nsp2基因的测序、比对结果表明,该部分基因与NCBI登录的参考序列VR-2332氨基酸同源性为73.0%,与JXA1的同源性为94.8%。NN1396分离株Nsp2蛋白含有高致病性PRRSV特异的1+29个氨基酸的缺失,此外,在缺失29个氨基酸区域的上游,含有连续19个氨基酸缺失。该PRRSV毒株的分离和Nsp2蛋白部分序列的缺失鉴定,为下一步研究Nsp2部分氨基酸缺失对病毒生物学特性影响奠定基础。     

高致病性PRRSV河北地方株的分离鉴定及部分Nsp2基因变异分析

从唐山某猪场患高热病病料中分离到1株病毒,该病毒能在Marc-145细胞上增殖,产生细胞病变。经RT-PCR鉴定证明,该病毒为美洲型PRRSV,将其命名为TS02。应用设计的特异性引物扩增TS02株的Nsp2基因,并与国内外PRRSV分离株的Nsp2基因序列进行了比较。结果表明,TS02株Nsp2基因推导的氨基酸序列出现30个不连续的缺失,与PRRSV高致病性毒株JXA1、GD、WUH1、Jiangxi-3的核苷酸序列同源性分别为97.7%、97.7%、96.5%和97.1%。     

一株Nsp2蛋白自然缺失123个氨基酸的PRRSV分离和鉴定

通过RT-PCR方法检测到一份猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)阳性肺组织病料。将该病料研磨、过滤后感染Marc-145细胞,连续传代都能产生明显的细胞病变。为鉴定细胞病变是否由PRRSV引起,抽提细胞总RNA,通过RT-PCR的方法成功的检测到了PRRSV基因。同时用间接免疫荧光方法证实了感染的细胞内有PRRSV N蛋白的表达。将成功分离的毒株命名为GXYL1403株。对分离株的ORF5基因和Nsp2高变区进行扩增、克隆和遗传进化分析,结果发现该毒株Nsp2高变区与NCBI登录的参考序列VR-2332氨基酸同源性为68.6%,JXA1的同源性为90.8%。通过ORF5遗传进化分析该分毒株为北美型PRRSV,且与高致病性PRRSV分布在同一个小分支上。Nsp2序列对比显示该分离株Nsp2蛋白含有高致病性PRRSV特异的1+29个氨基酸的缺失。特别的是,在缺失29个氨基酸区域的上游,含有连续20个氨基酸缺失,在下游更出现了连续73个氨基酸的缺失。该PRRSV毒株的分离和Nsp2蛋白部分序列的缺失鉴定,为下一步研究Nsp2部分氨基酸缺失对病毒生物学特性影响奠定了基础。     

高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒山西分离株的鉴定及部分Nsp2基因序列分析

本研究采集山西省不同地区的发病猪脏器组织与血液样品,采用特异性 RT-PCR方法检测高致病性猪繁殖与呼吸综合征(porcine reproductive and respiratory syndrome,PRRS)样品16份,应用设计的特异性引物扩增出Nsp2基因序列,利用DNAStar生物信息学分析软件,对获得的序列与国外代表毒株VR-2332、国内代表毒株CH-1a、BJ-4、HB-1及PRRSV变异毒株HuN4和JXA1的序列进行了比较,绘制系统发生树。氨基酸序列比较分析发现山西省流行毒株同源性分别在69.8%~71.7%、85.3%~87.9%、68.7%~70.6%、91.7%~94.3%、94.3%~98.5%、95.1%~98.9%。所获得的16株病毒之间的同源性在90.9%~100%之间。研究结果发现所获得的序列同源性与国内近几年流行的PRRSV的变异毒株HuN4和JXA1毒株的序列同源性最高,分别在94.3%~98.5%与95.1%~98.9%之间,Nsp2 基因缺失位置一致,其Nsp2均有2个部位出现了缺失,即Nsp2基因分别为编码1个氨基酸的3个核苷酸的缺失和编码29个氨基酸的连续87个核苷酸的缺失,结果表明,山西省目前流行PRRSV的变异毒株与国内流行株属于同一分支。     

一株猪高致病性蓝耳病病毒的分离鉴定与遗传变异分析

为研究猪蓝耳病病毒(PRRSV)的遗传进化规律,于2018年从新疆某猪场采集的病猪血液中分离了一株PRRSV,命名为XJ-b。对临床样品采用RT-PCR扩增鉴定,将阳性样品过滤处理之后接种在Marc-145细胞系进行培养,将盲传3代之后出现病变(CPE)的Marc-145样品进行间接免疫荧光鉴定。通过噬斑纯化后,利用RT-PCR对分离株的全基因组进行扩增,使用SeqMan软件对测序结果进行拼接,并根据NCBI上已公布的PRRSV全基因组及Nsp2基因核苷酸序列进行遗传进化与同源性比对分析。结果表明,临床病料RT-PCR检测呈PRRSV核酸阳性,处理后的病料接种至Marc-145细胞72 h之后产生CPE,间接免疫荧光鉴定为PRRSV抗原阳性;序列拼接显示分离株全基因组开放阅读框大小为15119 bp;全基因组和Nsp2基因核苷酸序列分析和同源性比对显示该分离毒株属于中国的高致病性PRRSV亚群。研究结果可为近年来新疆地区PRRSV的毒株差异分析提供参考。     

乳猪"高热症"猪繁殖与呼吸综合征病毒的分离与致病性分析

本研究针对疑似高热症疫情的猪场,从分离病原的致病特性及基因特征,对高热症的病因进行了探索。以RT—PCR／PCR从临床病料中检测出猪繁殖与呼吸综合征病毒（PRRSV）、猪圆环病毒2型（PCV2）、猪瘟病毒（CSFV）核酸,利用Marc-145细胞从病料中分离到PRRSV（XS070425毒株）。测序结果显示,XS070425毒株Nsp2基因无高致病性PRRSV Nsp2基因533～561位连续29个氨基酸“RPVTPLSEPIPVPAPRRKFQQVKRLSSAA”的缺失;但遗传进化分析显示,XS070425毒株Nsp2、ORF5基因与近期我国报道的高致病性PRRSV-HuN4和JXA1有较高的同源性,达95％～96％。致病性试验显示,PRRSV-XS070425原始病料悬液和Marc-145细胞分离物接种健康猪后,病毒血症可持续26d,并出现典型的PRRS临床症状和体温升高,但不致死感染猪。这些结果说明,无NSP2蛋白29个氨基酸残基缺失的PRRSV也是猪高热症的重要病原。     

贵州省高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒的分离鉴定及遗传变异分析

利用已建立的猪呼吸和繁殖障碍类病毒性疫病多重PCR检测方法对2017年以来贵州9个不同地区采集的150份病料进行检测,对猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)检测为阳性的病料采用细胞接毒培养技术、病毒的形态结构观察和间接免疫荧光试验等分离鉴定PRRSV,并对其ORF5和Nsp2基因的核苷酸和氨基酸序列进行差异性分析。结果表明:分别接种Marc-145细胞并连传5代,获得5株PRRSV,分别命名为GZ-Fq、GZ-Bj、GZ-Kl、GZ-Hz和GZ-Zy;病毒粒子在电镜下呈球形或卵圆形,直径约30~80nm;5株毒株与近年来国内各地流行的高致病性PRRSV(HP-PRRSV)同源性较高,分别为96.2%~100%和97.1%~98.6%,其中,ORF5基因的第13位氨基酸均为精氨酸(R),第137位氨基酸均为丝氨酸(S),Nsp2基因的氨基酸均存在第481位和532-560位氨基酸2处不连续的缺失位点;其ORF5基因及Nsp2基因均与2008年之后流行的HP-PRRSV亲缘关系较近。研究表明,贵州省PRRSV发生了变异,与近年来国内各个地区的HP-PRRSV序列的变异位点一致,属于美洲型PRRSV的变异株。     

Seroprevalence of antibodies to Encephalitozoon cuniculi and Encephalitozoon intestinalis in humans and animals

The presence of antibodies against Encephalitozoon cuniculi (E. cuniculi) and Encephalitozoon intestinalis (E. intestinalis) was examined in 215 samples from humans and in 488 samples from five different species of domestic and companion animals in Slovakia. The 215 human samples and samples from 90 swine, 123 non-infected cattle (cattle), 24 cattle infected with bovine leukosis virus (BLV-positive cattle), 140 sheep and 111 dogs were examined by the enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA). Samples with serum titres 1:200 or higher were considered as positive. Specific anti-E. cuniculi antibodies were found in humans (0.9%), swine (52%), cattle (2%), sheep (9%) and dogs (15%) except for the BLV-positive cattle at the titre of 1:200. The titre of 1:400 was detected only in humans (0.5%). The presence of specific anti-E. intestinalis antibodies at the titre of 1:200 was confirmed in humans (6%), swine (51%), cattle (11%), BLV-positive cattle (13%) and dogs (6%) but not in sheep. The anti-E. intestinalis antibodies reached the 1:400 in humans (1%), swine (4%) and BLV-positive cattle (17%). The presence of specific anti-E. intestinalis antibodies at the titre of 1:600 was observed only in one swine (1%). Significant differences were observed in animals at titres 1:200 and 1:400 (chi-squared test: p < 0.0001) for both pathogens and in humans only for E. cuniculi at the titre of 1:400 (chi-squared test: p < 0.0075).     

猪捷申病毒Swine/CH/IMH/03分离株细胞适应性和致病性研究

为确定猪捷申病毒(PTV)Swine/CH/IMH/03株的易感细胞系及其致病性,本实验将该病毒接种不同细胞,通过细胞病变、电子显微镜观察和PCR技术进行鉴定。并进一步将该病毒回归本动物鉴定其致病性。试验结果表明,PTV Swine/CH/IMH/03对IB-RS-2和PK-15细胞系敏感,能够在IB-RS-2和PK-15细胞系中增殖。致病性试验结果显示,Swine/CH/IMH/03分离株能够导致实验猪出现神经症状,剖检可见脑、肾、脾、肠道发生出血,病理组织学检查可见脑实质内胶质细胞浸润、肾脏间质小血管淤血、脾淋巴细胞减少、小肠伴有出血及淋巴细胞浸润等病理变化,对仔猪具有强致病性。     

禽流感病毒A／Turkey／Canada／63毒株HA和NA基因的克隆及序列分析

用SPF鸡胚增殖禽流感病毒（AIV）A／Turkey／Canada／63毒株，提取病毒基因组总RNA，应用RT-PCR技术分别扩增该病毒分离株的HA和NA基因全片段，并克隆到pMD18-T载体上。测序结果表明，该毒株的HA基因全长为1745bp，含有完整的阅读框架，编码566个氨基酸；NA基因全长1467bp，编码469个氨基酸。BLAST序列比较结果显示，该毒株HA基因属于H6亚型，NA基因属于N2亚型。将获得的HA和NA基因与AIV数据库中H6和N2基因进行遗传演化分析，表明该毒株HA基因与其他H6基因核苷酸的同源性为80．5％～87．3％，氨基酸的同源性为88．0％～93．1％；NA基因与其他N2基因核苷酸的同源性为86．0％～93．5％，氨基酸的同源性为90．6％～96．3％。     

Synergistic and antagonistic hemolytic activities of bacteria of genus Arcanobacterium and CAMP-like hemolysis of Arcanobacterium phocae and Arcanobacterium haemolyticum with Psychrobacter phenylpyruvicus

A total of 57 bacteria representing eight species of genus Arcanobacterium (A.) were investigated for hemolytic properties on blood agar containing sheep and rabbit blood and for CAMP-like reactions. An enhanced hemolysis on blood agar containing rabbit blood compared to sheep blood could be observed for A. haemolyticum, less pronounced for A. hippocoleae and A. pluranimalium.A synergistic hemolytic reaction with staphylococcal β-hemolysin appeared to be constantly visible for A. hippocoleae, A. pluranimalium and A. pyogenes, with Streptococcus agalactiae for A. phocae and A. haemolyticum, with Rhodococcus equi for A. phocae, A. haemolyticum, A. pluranimalium and A. pyogenes and with A. haemolyticum for A. hippocoleae, A. pluranimalium and A. pyogenes, respectively. A reverse CAMP-reaction in the zone of staphylococcal β-hemolysin could be observed for A. phocae and A. haemolyticum. In addition, a novel CAMP-like reaction could be noted between Psychrobacter phenylpyruvicus, identified by 16S rDNA sequencing, and A. phocae and A. haemolyticum. These synergistic or antagonistic hemolytic properties could possibly be used as additional criteria for identification of bacteria of genus Arcanobacterium.     

Pharmacodynamics of amoxicillin against Mannheimia haemolytica and Pasteurella multocida and pharmacokinetic/pharmacodynamic (PK/PD) correlation in sheep

Silicone-made tissue cages were implanted in sheep. Blood serum (SBS) and tissue cage fluid (TCF) samples were collected after amoxicillin intravenous and intramuscular administrations, at the dose of 15 mg/kg. Amoxicillin pharmacodynamics were studied in an artificial culture medium, SBS and TCF with use of a Mannheimia haemolytica and a Pasteurella multocida strain. A concentration-independent antimicrobial activity of amoxicillin was confirmed for levels higher than 0.79–1.75 × MIC. This result favored the use of the percentage of the 24 h dosing interval during which drug levels remain above MIC as the appropriate pharmacokinetic/pharmacodynamic index. The subsequent correlation revealed that intravenous administration could be considered effective against “deep” infections caused by bacteria with MICs < 1 μg/mL or “shallow” infections caused by bacteria with MICs < 0.1 μg/mL. Intramuscular administration could be safely considered effective against both “deep” and “shallow” infections when the MICs of the targeted pathogens are lower than 1 μg/mL.     

bta-miR-34b/c和bta-miR-449a/b/c靶基因预测及生物信息学分析

【目的】试验旨在对bta-miR-34b/c和bta-miR-449a/b/c的序列保守性、转录因子和靶基因进行生物信息学预测和分析,探究其影响精子发生的作用机制,为研究其生物学功能及作用机制提供指导和思路。【方法】利用miRBase数据库获取不同物种的bta-miR-34b/c和bta-miR-449a/b/c序列并进行相似性分析;通过TargetScan、miRWalk、miRDB等方法预测bta-miR-34b/c和bta-miR-449a/b/c的靶基因,对获得的靶基因集合分别进行GO功能和KEGG通路富集分析;通过AnimalTFDB获取共同调控bta-miR-34b/c和bta-miR-449a/b/c的转录因子,并构建TF-miRNA-mRNA作用网络。【结果】bta-miR-34b/c和bta-miR-449a/b/c在不同物种间高度保守。预测得到2个转录因子和49个候选靶基因,这些靶基因主要富集在精子发生、钙离子依赖性胞吐的调节、胰岛素分泌的调节等GO条目,以及HIF-1信号通路、甲状腺激素信号通路、Wnt信号通路等KEGG通路。bta-miR-34b/c、bta-miR-449a/b/c与上游转录因子NR2C2和HIC1,下游靶基因AXL、E2F3、DAAM1等共同构成的作用网络通过调控减数分裂、细胞周期、细胞凋亡、精子细胞能量代谢等生物过程影响精子发生。【结论】bta-miR-34b/c、bta-miR-449a/b/c通过上游转录因子和下游靶基因组成的分子调控网络共同调节精子发生过程。     

JS/1/97/Go株GPMV NP基因的克隆、序列分析

根据GenBank中发表的GPMV SF02株的NP基因的核苷酸序列设计合成一对引物,采用RT-PCR扩增出与预期设计的1470bp大小相符的片断,将此扩增产物克隆入PMD18-T载体,进行序列测定和分析.结果表明:所扩增的NP基因的核苷酸长为1 470bp,共编码490个氨基酸.同源性分析表明:JS/1/97/Go与国内的SF02株的NP基因核苷酸同源性为98.6%,氨基酸同源性为99.6%.由此可见,鹅副粘病毒JS/1/97/Go分离株与SF02株的亲缘关系较近,同属于新城疫Ⅶ型基因.而其与LaSota株的核苷酸同源性为85.2%,氨基酸同源性为90.8%.说明该毒株相对于经典的NDV在NP基因上已发生了较大的变异.     

猪流感病毒A/Swine/Inner Mongolia/547/01分离株神经氨酸酶基因的克隆及真核表达

根据GenBank中登录的猪流感病毒参照序列设计了扩增神经氨酸酶(NA)基因的特异性引物.从猪流感病毒A/Swine/Inner Mongolia/547/01(H3N2)株感染的鸡胚液中直接提取病毒RNA,经RT-PCR扩增后将其克隆到pMD18-T载体上,进行序列测定和拼接.用HindⅢ酶切后,亚克隆到杆状病毒转移载体pMelBacB上,得到重组转移载体pMelBacNA,然后与线性化杆状病毒DNA(Bac-N-BlueTMDNA)共转染于sf9昆虫细胞.经3轮噬斑纯化,提取其DNA经PCR鉴定,获得重组杆状病毒株.SDS-PAGE结果显示,目的基因已获得表达,Western blot和神经氨酸酶活性检测结果显示表达产物具有良好的免疫原性和神经氨酸酶活性,为SIV亚单位疫苗和NA基因的深入研究奠定了基础.     

Medetomidine/tiletamine/zolazepam and xylazine/tiletamine/zolazepam combinations for immobilization of fallow deer (Cervus dama).

Eleven adult fallow deer (Cervus dama) were anesthetized using a mixture of xylazine/tiletamine/zolazepam, and 10 were anesthetized with a mixture of medetomidine/tiletamine/zolazepam. Anesthesia was adequate for capture in all instances, and minor surgical procedures were possible in seven of the animals treated with xylazine/tiletamine/zolazepam and in all of the animals treated with medetomidine/tiletamine/zolazepam. Blood gas, hematologic, serum biochemical, and cardiorespiratory parameters were measured during all immobilizations. The deer immobilized with xylazine/tiletamine/zolazepam had significantly higher lactate and cortisol values than the deer immobilized with the medetomidine combination. Although both methods were adequate for fallow deer, the medetomidine/tiletamine/zolazepam combination produced superior results.