宁夏地方绵羊品种mtDNAD-loop环序列遗传多样性与起源研究

为了分析宁夏地区主要绵羊品种的遗传多样性及系统发生关系,试验采用PCR扩增,12%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳、Sanguinetti银染法显色的方法,对宁夏地区3个绵羊品种(滩羊、小尾寒羊和蒙古羊)群体遗传多样性进行检测,统计各群体的等位基因组成,利用等位基因频率计算各群体的多态信息含量(PIC)和群体间的遗传距离。结果表明:D-loop环在3个绵羊群体中的PIC达到中度多态,可以作为有效的遗传标记用于各绵羊品种的遗传多样性及系统发生关系的分析。运用遗传距离(D A)将绵羊品种进行分类,滩羊与蒙古羊遗传距离最近,滩羊与小尾寒羊的遗传距离最远,聚为两类。各绵羊品种的分子系统发生关系与其来源、育成史、分化及地理分布基本一致。     

我国农区及农牧交错区绵羊与蒙古羊遗传分化研究

采用中心产区典型群随机抽样方法和多种电泳技术检测小尾寒羊、滩羊编码血液蛋白16个结构基因座上的变异，与蒙古国蒙古羊、我国湖羊和同羊的相同资料进行比较分析，探讨其遗传分化关系。除Alp和X-p，结构基因座的基因遗传分化程度均低于7．3417％，群体间遗传差异占5．3705％。标准遗传距离、模糊聚类分析表明，湖羊、同羊、小尾寒羊和滩羊与蒙古羊亲缘关系逐渐疏远。遗传贴近度是否适合用于受研究群体和已知其始祖的现代群体之间的比较有待进一步验证。从结构基因座方面进一步证实小尾寒羊、滩羊的蒙古羊属性，揭示了5个绵羊群体之间的部分遗传差异。     

我国蒙古羊系统主要地方绵羊品种遗传分化的研究

应用中心产区典型群简单随机抽样的方法,检测控制湖羊、同羊、滩羊、小尾寒羊和洼地羊的血液酶和其他蛋白质变异的5个结构基因座位(Tf、X-p、Ary-Es、Hb-β、Ke)上的遗传变异,引用国内外学者以相同实验方法获得的其他分布于我国周边国家和地区的11个绵羊品种作为分析背景,对16个群体进行遗传距离分析及亲缘关系聚类。结果表明:中亚以东南绵羊群体可以划分为蒙古羊、藏羊和南亚-东南亚羊三大集团,湖羊、同羊、滩羊、小尾寒羊和洼地羊均属于"蒙古羊"系统。     

用主成分分析法研究腹泻仔猪血清生化指标

为了研究腹泻对仔猪血清生化指标的影响,本试验采集了20头腹泻仔猪(7~8日龄)和10头健康仔猪(与腹泻仔猪同日龄、同性别)的粪便和血清。荧光定量PCR法对粪便进行病原学检测,对采集的血清用血生化分析仪进行检测,并利用主成分分析法对其结果进行分析。结果,(1)20头腹泻仔猪粪便的猪流行病腹泻病毒检测结果均为阳性。(2)十二项血清生化指标被转化成了综合性更强的4个主成分,根据这4个主成分进行的聚类分析的结果和临床采集样品的分类结果一致。(3)腹泻仔猪的血清球蛋白、尿素和肌酐水平显著升高(P0.05)。结果表明,由猪流行性腹泻病毒引发的腹泻,可能导致仔猪体内的蛋白质代谢紊乱、肝脏和肾脏的机能受损。     

5份榴莲蜜种质果实品质的主成分分析及综合评价

为评价海南省不同榴莲蜜主栽品种果实品质,建立一套适合榴莲蜜果实品质综合评价体系,通过主成分分析法和聚类分析法对5份榴莲蜜种质果实的13项品质指标进行了系统分析。结果表明,不同种质果实的各项品质指标存在较大差异,各项品质指标均能体现榴莲蜜种质各自的品质特点,具有丰富的遗传多样性,且果实各指标间具有不同程度的相关性。采用主成分分析法从13项品质指标中提取出风味、外观、色泽3个主成分因子,可代表榴莲蜜果实品质的92.690%的信息量。基于主成分分析和聚类分析,可将可溶性固形物、单果苞重和单苞果核重可作为榴莲蜜品质性状评价的主要指标。品质综合评价结果从优到劣依次为：多异3号、多异5号、多异2号、多异1号和多异4号。     

我国主要地方绵羊品种遗传亲缘关系

利用 10种 10碱基的随机引物 ,分析了我国 8个地方绵羊品种计 88只绵羊的随机扩增多态 DNA。结果表明 ,我国地方绵羊品种基因组 DNA多态位点百分率为 81.36 % ,群体平均遗传多样性指数为 1.3370 ,具有丰富的群体遗传多样性。但滩羊、小尾寒羊、藏绵羊和蒙古羊群体遗传多样性程度较低 ,应加强保种措施。群体遗传分化指数为0 .9172 ,说明遗传变异主要存在于群体间。品种间的分子聚类关系基本上反映了品种间的遗传亲缘关系 ,与品种的形成历史及我国地方绵羊的起源进化学说基本一致 ,具有相同来源的蒙古羊、乌珠穆沁羊、小尾寒羊和湖羊的分子聚类关系表明 ,4个地方绵羊品种间已经有了明显的遗传分化 ,小尾寒羊、乌珠穆沁羊间遗传分化较低 ,湖羊与蒙古羊之间相对较高 ,而小尾寒羊和乌珠穆沁羊与湖羊和蒙古羊之间的遗传分化最高     

11个鸡品种产蛋性能与产区生态的聚类分析

 利用主成分分析和聚类分析对我国11个地方鸡品种的产蛋性能和生态特征的资料进行了多元统计分析。单独对4项产蛋性能指标进行聚类分析表明,我国11个地方鸡种大致可以分为大型鸡和小型鸡两类;多元统计分析10项指标的结果表明,主成分分析选取前3个特征值作为3个主成分（占总信息量的94.99%）。根据各品种的前3个主成分值计算相似系数,并用最短距离法进行聚类分析,表明11个地方鸡品种可划分为高海拔型和低海拔型两类,这说明了生态因子亦是品种分类中的一个重要依据。     

犊牛腹泻血液生化指标与主成分分析研究

为考察由不同病原引起的腹泻对犊牛血液生化指标的影响,采集39例犊牛的粪便和血清,利用细菌鉴别培养、RT-PCR病毒检测试剂盒、胶体金多重病原检测试剂盒等对病原进行检测,采集的血清用全自动血液生化分析仪进行测定。检测结果表明,选择的39例12-14日龄的腹泻犊牛粪便中检测到单纯由细菌、或病毒、或寄生虫感染分别为17份、10份、7份,另外3份为混合感染,还有2份样品中未检测到病原;采用主成分分析法将12项血清生化指标转化为综合性更强的4种主成分,结果显示4种主成分的聚类结果与病原检测结果一致;对不同病原所致腹泻犊牛各项血清生化指标进行方差分析,发现病毒性腹泻的总胆红素CT-BIL、总胆固醇(CT)水平与其他病原所致的腹泻有显著性差异(P0.01)。     

血液生化指标在肉羊杂种优势利用中的研究

血液蛋白质及酶多态性作为一种遗传标记,已被广泛应用于探讨品种起源、进化、品种亲缘关系.20世纪60年代以来,为了探讨利用血液蛋白质多态性作为遗传标记进行早期选种的可能性,一些学者研究了血清蛋白质及酶多态性与经济性状的关系,并取得了相应的结果,但利用血清蛋白质及酶多态性计算品种间遗传距离预测肉羊杂种优势还未见报道.现将以宁夏地区普遍饲养的5个品种肉用羊为研究对象,对其血清脂酶、转铁蛋白、后白蛋白及血红蛋白多态性进行了遗传检测,并据其基因频率计算出品种间的遗传距离.依据品种间遗传距离的大小组合不同的杂交组合,并对各杂交组合后代及其纯种的生产性能和各组合的杂种优势进行统计计算,从而为杂种亲本的选择提供简捷、可靠的理论依据.     

宁夏滩羊mtDNA Cyt b基因遗传多样性分析

为了分析宁夏滩羊线粒体DNA(mtDNA)细胞色素b脱复辅基酶(Cytb)基因的遗传多样性,试验采用PCR扩增和基因测序的方法对线粒体Cyt b基因在宁夏地区3个绵羊品种(滩羊、小尾寒羊和蒙古羊)群体的遗传多样性进行检测,分析其碱基组成及序列间碱基的变异。结果表明:滩羊线粒体Cyt b基因部分序列长度为363 bp,A、C、G、T的平均含量分别为39.11%、19.84%、19.26%、21.79%,碱基组成的百分比显示,G相对缺乏,A+T平均含量(60.90%)比G+C(39.10%)平均含量高。在滩羊与蒙古羊、小尾寒羊品种间存在1个变异位点,在47位点处发生了A/G的转换,可以作为候选基因用于辅助检测。     

云南地方猪种肉质NIR指纹主成分分析和聚类分析研究

试验旨在探讨近红外（near-infrared,NIR）光谱技术应用于云南地方猪种肉质特性分析的可行性。在云南省8个县采集7个云南地方猪种腰背最长肌共计102份样品,利用近红外光谱分析技术,对各猪种近红外指纹图谱进行主成分分析和聚类分析。结果表明,7个猪种肉质的近红外光谱具有共性和差异性,其主成分空间分布位于不同的区域,大河乌猪与大河猪光谱欧氏距离最近,迪庆藏猪肉质特异性明显。利用近红外光谱技术可以准确、快速地对地方猪种进行肉质特性分析,揭示出地方猪种肉质方面的特色资源。     

四川5个山(绵)羊品种随机扩增多态DNA分析

本研究参阅文献挑选 80个随机引物 ,从中筛选出 3 0个重复性好的引物 ,对四川黑山羊、南江黄羊、北川白山羊、成都麻羊 4个山羊品种和藏绵羊进行RAPD分析 ,并进一步对 1 3只南江黄羊个体 ,1 8只黑山羊个体的基因组DNA进行PCR扩增。用Nei氏公式计算品种间的遗传距离 ,用UPGMA法构建树状聚类图。结果表明 :黑山羊与南江黄羊的遗传距离最小 ,亲缘关系较近 ;藏绵羊与各品种间的遗传距离都很大 ,亲缘关系远 ;RAPD技术可作为一种有效的分子标记用于山羊品种之间遗传亲缘关系的分析     

4个地方绵羊品种系统发生关系的微卫星分析

试验旨在研究地方绵羊品种的遗传变异,为种质资源评价、保护和利用提供理论数据。利用5个微卫星标记分析4个地方绵羊品种的遗传多样性,根据等位基因组成及频率进行群体遗传统计分析;基于品种间标准遗传距离(Ds)和Nei氏遗传距离,分别构建UPGMA系统发生树。4个地方绵羊品种共检测到70个等位基因,各位点等位基因数(Na)在10~18之间;4个地方绵羊品种平均有效等位基因数(Ne)为3.81~5.68个,平均多态信息含量(PIC)为0.6152~0.7373,平均遗传杂合度(H)为0.6711~0.7820;4个地方绵羊品种间遗传分化系数为0.0847,标准遗传距离(Ds)和Nei氏遗传距离晋中绵羊与乌珠穆沁羊为最大(0.5775、0.6126),小尾寒羊与乌珠穆沁羊为最小(0.1542、0.1955),首先小尾寒羊与乌珠穆沁羊聚为一类,晋中绵羊与广灵大尾羊聚为另一类,然后两类聚在一起形成一大类。结果表明,4个地方绵羊品种遗传变异大、多样性丰富;品种间遗传分化小,但小尾寒羊和乌珠穆沁羊与晋中绵羊和广灵大尾羊间已有明显分化。选择的5个微卫星座位均为高度多态位点,可作为有效遗传标记用于绵羊品种遗传多样性和系统发生关系分析。各地方绵羊品种分子聚类关系与其形成史、分化及地理分布基本一致。     

云南5个地方绵羊品种遗传多样性研究

本研究利用微卫星标记技术从分子水平对云南5个地方绵羊品种（腾冲绵羊（TC）、昭通绵羊（ZS）、迪庆绵羊（DQ）、宁蒗黑绵羊（NL）、乌骨绵羊（WG））进行了分析,通过计算平均杂合度、多态信息含量等对它们之间的亲缘关系及群体间、群体内的遗传变异进行了探讨。结果发现,各品种内杂合度较低,在0.2894~0.3349之间,说明各群体内遗传变异较小;PIC值均大于0.5,呈现高度多态,说明5个绵羊品种具有较丰富的遗传多样性。5个绵羊品种之间的基因流分析结果发现,除与乌骨绵羊之间的基因交流较小外,其他4个绵羊品种之间的基因交流都较大。应用UPGMA法进行系统发生关系分析,乌骨绵羊同其余品种亲缘关系较远,最近的是迪庆绵羊和宁蒗黑绵羊。     

Multivariate characterisation of the phenotypic traits of Djallonke and Sahel sheep in Northern Ghana

The characterisation of the small ruminant populations in developing countries will play a major role in the maintenance of the genetic resources as the basis for future improvement in livestock production. The present study aimed at morphological characterisation of the two main breeds of sheep in Ghana by assessing variation within and between breed populations using principal component and discriminant analyses. The two breeds were the Sahel and the Djallonke sheep of both sexes and of two groups namely, young (1 year old, consisting of 74 animals) and mature sheep (≥2 years old, comprising 219 animals). The analysis of variance revealed significant (P?<?0.05) differences in the morphological traits of the Sahel and the Djallonke sheep breeds with higher values recorded for the former. Sexual dimorphism was in favour of male animals in all the morphological traits examined. Mature animals also had comparative advantage over the young. Two principal components were extracted to discern the structure of the two genetic groups. The most discriminating traits between the two sheep breeds were rump height, height at withers, neck girth and pin-bone width. Mahalanobis distance between the two genetic groups was 5.723 (P?<?0.0001). The developed discriminant functions clearly discriminated and classified the Sahel and the Djallonke sheep into their breeds of origin, thus yielding 100, 93.4 and 90.4 % accurate classification for the rams, ewes and the overall sheep population, respectively. The present approach would greatly help in establishing management and conservation policies for the sustainable production of the two Ghanaian sheep breeds.     

The biodiversity and genetic structure of Balearic sheep breeds

The Balearic sheep breeds, Mallorquina, Menorquina, Roja Mallorquina, Ibicenca and one possible new genetic group, Formentera, constitute a unique genetic resource in the Mediterranean farming landscape, displaying high genetic diversity levels and being well differentiated among themselves and with respect to the continental sheep breeds. We used a microsatellite panel of markers to study genetic diversity and relationships with other Spanish breeds. The results reported in this study have important implications for the use, conservation and breeding of Balearic sheep stocks. A mean number of 7.59 alleles was found among the Balearic sheep breeds for the microsatellites scored. The whole mean value of observed heterozygosity amounted to 0.62, whereas the expected heterozygosity value was 0.69, suggesting the presence of a great degree of genetic variability, although a significant deficit of heterozygotes was detected for some markers. Genetic distance estimates showed that Balearic sheep are differentiated from the other Spanish breeds and in particular, from the Merino type. The Ibicenca breed showed the highest distance value from other breeds. The neighbour‐net method of analysis clustered the Roja Mallorquina, Menorquina and Mallorquina breeds. The Structure results clearly demonstrated the genetic differentiation among the four Balearic sheep breeds, with the Ibicenca and Formentera races joined, with slight migration among them. Few external genetic influences from the Spanish mainland breeds were detected.     

6个中国固有绵羊品种的群体遗传学分析

从 3 0个随机引物中筛选出 5条 ,对哈萨克羊、蒙古羊、兰州大尾羊、同羊、大尾寒羊、小尾寒羊共 6个绵羊品种的基因组进行扩增分析 ,然后用 6种聚类方法 (欧氏距离、夹角余弦、皮尔逊相关、车贝雪夫距离、街区距离、明考夫斯基 )进行聚类。结果表明 ,分布在我国西北部的绵羊品种以及大尾寒羊在大多数情况下总是先聚在一起 ,相对分布于中原地带的同羊、小尾寒羊总是和西北部的品种间距离较远。同羊和小尾寒羊之间距离也很远 ,较接近品种志中的记载。6种聚类方法均可     

Sheep genetic diversity in Bhutan using microsatellite markers

Genotype data from eight microsatellite markers were used to assess genetic diversity and relationships among five indigenous Bhutanese sheep populations, Sakten, Jakar, Sarpang, Sipsu and Tsirang. Estimates of mean observed and expected heterozygosities, mean number of alleles per locus/population were obtained. The highest observed heterozygosities were found in Jakar (0.657) and Sakten (0.647), while the lowest one was found in Tsirang (0.539). Genetic distances, pairwise proportion of different alleles, UPGMA tree, and principal component analysis indicate close relationship among Tsirang, Sipsu and Sarpang populations, while Jakar and Sakten populations are located in one cluster. These two clusters are separated geographically, and show distinct phenotypic as well as molecular characters. We therefore recommend that the Bhutanese native sheep populations be classified into at least two distinct breeds, Jakar‐Sakten sheep and Sipsu sheep. Since Jakar and Sakten sheep have different morphological phenotypes, further analyses will be required to understand the genetic differences between these two sheep populations.     

我国部分地方鸭种的亲缘关系及起源分析

为揭示我国部分地方鸭种的亲缘关系及其起源,选取12对荧光标记微卫星引物,对12个地方鸭种及2个野鸭品种进行遗传多样性检测。利用Microsatellite-Toolkit软件将数据结果导入FSTAT和Dispan软件计算标准遗传距离DS、DA遗传距离,并对12个地方鸭群体与2个野鸭品种之间的遗传距离进行方差分析,最后基于标准遗传距离DS与DA遗传距离对14个鸭品种通过构建UPGMA系统发生树进行聚类分析。结果表明:该12个地方鸭种与绿头野鸭、斑嘴鸭之间的DA遗传距离(配对试验均数差异t检验)差异极显著(P<0.01),基于DS与DA遗传距离构建的UPGMA系统发生树都将14个品种聚为3类,并且斑嘴鸭单独聚为一类;可初步判定这12个地方鸭种起源于绿头野鸭,而与斑嘴鸭的遗传距离相对较远。     

微卫星分子标记分析四川绵羊群体遗传多样性

为探究四川省6个绵羊群体的遗传多样性,实验应用12个微卫星标记计算基因频率、有效等位基因数、杂合度及多态信息含量来评估群体内遗传多样度,通过遗传距离聚类图、群体结构推测图、主成分分析及群体间分子方差分析来评估群体间遗传关系。结果表明:6个绵羊群体在12个微卫星位点的平均有效等位基因数为3.006~3.176,平均多态信息含量变化为0.559~0.612,平均期望遗传杂合度为0.610~0.670;6个绵羊群体间的遗传关系与地理分布情况及育成史实不完全一致,但遗传距离聚类图、群体结构推测图和主成分分析结果均显示,6个绵羊群体中布拖黑绵羊类群与贾洛绵羊类群遗传关系更近;6个绵羊群体间方差组分F统计量结果为0.112 39,处于中度分化水平。