狼山鸡MHC多态性及血型与部分抗性性状关联的研究

为探究血型与抗病性状的关系,本研究利用微卫星标记技术对狼山鸡MHC-Ⅰ和MHC-Ⅳ区遗传多样性及血型进行研究;同时检测了部分抗性性状,并分析不同血型与抗性性状的相关性。结果表明:狼山鸡MHC-I位点期望杂合度为0.4891,多态信息含量平均为0.3695;MHC-IV位点期望杂合度为0.6357,多态信息含量平均为0.5628。狼山鸡中共发现6种常见血型,即纯合型B4、B21、B13及其杂合型B4/B21、B4/B13和B13/B21;免疫性状检测结果发现B21综合抗性指标显著好于其他血型(P<0.05)。实验提示,可利用MHC-Ⅰ和MHC-Ⅳ区进行血型判定,且血型与免疫性状存在关联性。     

基于微卫星标记的香炉山鸡遗传多样性研究

为了解香炉山鸡遗传多样性丰富程度,本研究利用PCR扩增结合聚丙烯酰胺凝胶电泳技术,采用21个微卫星标记对121只香炉山鸡遗传多样性进行分析。结果显示:香炉山鸡共检测出85个等位基因,平均等位基因数为4.047 6,有效等位基因数为2.955 0,Shanon指数为1.170 8,多态信息含量为0.580 7,观察杂合度为0.575 7,期望杂合度为0.637 1。可见,香炉山鸡群体遗传多样性比较丰富,群体内杂合度比较高,还存在一定的选育空间。     

新西兰白兔、福建黄兔遗传多样性分析

利用经筛选多态性较好的18对微卫星引物,对新西兰白兔、福建黄兔进行遗传多样性检测。研究结果表明,2个兔品种在18个微卫星座位上的基因频率存在一定的差异;新西兰白兔群体的基因杂合度和多态信息含量分别为0.593和0.533;福建黄兔群体的基因杂合度和多态信息含量分别为0.613和0.560。福建黄兔群体基因平均杂合度和平均多态信息含量较新西兰白兔高;说明福建黄兔的遗传多样性较新西兰白兔丰富。     

运用微卫星标记分析11个鸭种(群)的亲缘关系

利用9个微卫星标记对11个鸭种（群）的平均基因杂合度、多态信息含量以及群体间的亲缘关系进行分析.结果11个鸭种的平均基因杂合度为0.659 9;平均多态信息含量为0.596 6.其中,黑羽番鸭（白头）平均基因杂合度最高,为0.694 8,荆江麻鸭平均遗传杂合度最低,为0.575 7.平均多态信息含量也出现了类似的结果,说明黑羽番鸭（白头）遗传多样性最丰富.根据遗传距离构建NJ系统发生树,系统发生树分析结果表明：黑羽番鸭（纯黑）、黑羽番鸭（白头）、白羽番鸭聚为第1类群;山麻鸭、金定鸭、高邮鸭聚为第2类群;苏牧白羽鸭、苏牧黑羽鸭、龙白鸭、苏牧麻鸭、荆江麻鸭聚为第3类群.     

巴什拜羊OLA-DRB3基因多态性与绵羊肺炎支原体感染相关性研究

本研究旨在分析巴什拜羊DRB3基因遗传多态性与MO感染的相关性。采用PCR-RFLP方法分析巴什拜羊OLA-DRB3基因第2外显子多态性,并计算基因杂合度、多态信息含量和有效等位基因数等遗传参数;通过分析和差异性检验MO阴性和阳性巴什拜羊OLA-DRB3基因型频率和等位基因频率,初步判定MO的抗性或易感性基因。结果表明:巴什拜羊OLA-DRB3第2外显子在第122、154、168和241碱基处表现出多态性;在Taq I、Pst I位点达到Hardy-Weinberg平衡,根据基因杂合度和多态信息含量,表明巴什拜羊具有较为丰富的遗传多样性。在巴什拜羊的24种基因型中,HaeⅢBC(P0.05)为MO抗性基因,HaeⅢDD(P0.05)为MO易感基因型;Pst I A(P0.01)和Pst I B(P0.01)、HaeⅢC(P0.01)分别是巴什拜羊MO易感和抗性相关等位基因。此结果可为绵羊抗病育种研究提供理论支持。     

利用微卫星标记分析天山雪鹅肉用品系遗传结构

本试验利用7个微卫星位点分析天山雪鹅肉用品系群体的等位基因频率、有效等位基因数、平均基因杂合度、平均多态信息含量,用以评估品系的选育强度和纯度。结果显示,天山雪鹅肉用品系7个微卫星座位的平均多态信息含量为0.4979,基因组DNA呈中度多态性;平均群体杂合度为0.5367,表明该群体的遗传基础一致性较高,说明天山雪鹅肉用品系经过5个世代的群体继代选育,遗传性能趋于稳定,基因纯度已达一定的水平,但仍需根据选育目标进行进一步选育。本试验选出的CKW11、CKW14、CKW43 3个高度多态性位点,为后期进行微卫星标记与天山雪鹅生产性能的相关性分析奠定了基础。     

香炉山鸡隐性白羽鉴定分析

为淘汰香炉山鸡群体中的白羽基因杂合子个体,建立白羽基因纯合群体,本研究自行设计多重PCR扩增引物,采用PCR扩增结合琼脂糖凝胶电泳技术对120只香炉山鸡的基因型进行鉴定。结果显示:香炉山鸡隐性白羽CC型为56个,占总群体46.67%;Cc型为4个,占3.33%;cc为60个,占50%。经Popgene2.1软件统计分析发现隐性白羽基因位点平均等位基因数为2,有效等位基因数为1.9978,Shannon指数为0.6926,多态信息含量为0.3747,属于中度多态,说明该群体还具有一定的选育空间。本研究为香炉山鸡提供一种分子标记辅助选育方法,为该品种进一步的保护、开发与利用提供技术支撑,为其他鸡群选育研究提供参考。     

滩羊肌肉抑制素(MSTN)基因的多态性研究

为了分析宁夏滩羊肌肉抑制素(MSTN)基因的遗传多样性及其与生长性状的相关性,试验对滩羊群体的98个个体的MSTN基因进行PCR-RFLP分析。结果表明:MSTN基因引物1在所选群体中处于Hardy-Weinberg平衡状态,多态信息含量为0.301 5,属于中度多态,2个等位基因分别为:A、a,3种基因型分别为:AA、Aa、aa,有效等位基因数为1.586 9,杂合度为0.369 8。MSTN基因引物2也处于Hardy-Weinberg平衡状态,多态信息含量为0.366 4,属于中度多态,2个等位基因分别为:A、B,3种基因型分别为:AA、AB、BB,有效等位基因数为1.934 7,杂合度为0.483 1。     

利用微卫星对小香羊群体遗传结构的研究

为了阐明小香羊的遗传特点,试验利用7对微卫星引物对小香羊的等位基因频率、基因杂合度和多态信息含量进行了遗传检测。结果表明:7对微卫星引物共扩增出47个等位基因,基因频率分布在0.034～0.379之间;7个微卫星位点的平均杂合度为0.802,平均多态信息含量为0.790。说明小香羊群体遗传多样性较为丰富。     

五指山猪小群体遗传学检测

本研究利用26个微卫星基因座对中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所保种场的五指山猪小群体58个样本进行了遗传学检测,用非变性(中性)聚丙烯酰胺凝胶电泳检测微卫星的PCR扩增产物,统计了群体平均基因纯合率、等位基因数,利用等位基因频率计算出各群体的平均遗传杂合度(H)、多态信息含量(PIC)。统计结果:全群平均基因纯合率为66.5%;平均多态信息含量、平均观测杂合度为、平均期望杂合度分别为0.807、0.338、0.835;每个位点平均等位基因数为11.92,此结果说明该群体虽然近交程度较高,但仍具有丰富的遗传多样性,遗传变异较大。     

五指山猪小群体遗传学检测

本研究利用26个微卫星基因座对中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所保种场的五指山猪小群体58个样本进行了遗传学检测,用非变性(中性)聚丙烯酰胺凝胶电泳检测微卫星的PCR扩增产物,统计了群体平均基因纯合率、等位基因数,利用等位基因频率计算出各群体的平均遗传杂合度(H)、多态信息含量(PIC).统计结果:全群平均基因纯合率为66.5%;平均多态信息含量、平均观测杂合度为、平均期望杂合度分别为0.807、0.338、0.835;每个位点平均等位基因数为11.92,此结果说明该群体虽然近交程度较高,但仍具有丰富的遗传多样性,遗传变异较大.     

新疆天山马鹿血液蛋白多态的研究

采用垂直板聚丙烯酰胺凝胶电泳技术,分析了40头新疆天山马鹿的血清白蛋白(Alb),前白蛋白(Pro),转铁蛋白(Tf),前转铁蛋白(Prt),血红蛋白(Hb)5个蛋白座位的基因型频率、基因频率和群体遗传变异指标,以便为天山马鹿选种选配繁育工作提供理论依据。结果表明,Alb座位呈单态为AA型,其余各蛋白座位均呈多态。Pro有1种基因型AB,受A、B 2个等位基因控制;Hb有2种基因型AB、BB,受A、B 2个等位基因所控制;Prt有5种基因型AA、AB、BB、AC、BC,受A、B、C 3个等位基因控制;Tf有4种基因型AB、BB、AC、BC,受A、B、C 3个等位基因控制。群体遗传变异分析结果表明,Prt、Tf、Alb、Pro、Hb的杂合度分别为0.667,0.610,0,0.513,0.431。基因多态信息含量分别为0.575,0.528,0,0.375,0.332。平均杂合度为0.4442,平均多态信息含量为0.362,表明天山马鹿的遗传多样性丰富,具有较大的遗传潜力。     

3个绵羊种群MHC微卫星标记的遗传多样性

利用微卫星技术对小尾寒羊、道赛特羊、特克赛尔羊3个绵羊种群共218只绵羊的主要组织相容性复合体（MHC）ClassⅡ区DRB1、DRB2、DYMS、MB026基因座的微卫星多态性进行了研究。统计了3个种群的等位基因组成,并计算了微卫星基因座的等位基因频率、杂合度和多态信息含量。结果显示,4个基因座在3个种群中的平均等位基因数分别为14、10.33、12.67、5.33个;平均多态信息含量分别为0.8315、0.8037、0.7946、0.3992;平均杂合度分别为0.8473、0.8229、0.8165、0.4202。研究结果说明,DRB1、DRB2、DYMS基因座为高度多态基因座,MB026基因座为中度多态基因座,在这4个微卫星基因座上,小尾寒羊、道赛特羊及特克赛尔羊均具有丰富的遗传多态性,可作为有效的遗传标记用于各绵羊品种的遗传多样性和系统发生关系分析。     

岷县黑裘皮羊微卫星遗传多样性分析

试验旨在分析岷县黑裘皮羊群体内遗传多样性,筛选出理想的遗传标记,为岷县黑裘皮羊的选育保种提供理论依据。选取144只岷县黑裘皮羊,颈静脉采血并提取DNA,对24对微卫星引物进行PCR扩增,用毛细管电泳技术进行基因分型,计算其等位基因数、等位基因大小及频率、有效等位基因数、杂合度和多态信息含量。结果显示,24个位点共检测到210个等位基因,平均等位基因数为8.75;群体等位基因频率为0.0104~0.7396,等位基因片段大小为97~285 bp;有效等位基因数为1.7581~8.2433个;群体平均观测杂合度为0.4839;平均期望杂合度为0.6959;平均多态信息含量为0.6527。其中MAF70位点等位基因数、有效等位基因数、期望杂合度和多态信息含量最高;OarFCB128位点观测杂合度最高;OarAE129位点等位基因数最少,SRCRSP9位点期望杂合度、多态信息含量最低;OarFCB304位点观测杂合度最低。Hardy-Weinberg平衡分析结果表明,所选位点中有19个处于非平衡状态。结果表明,岷县黑裘皮羊的遗传背景复杂,群体内遗传多样性丰富,可为其遗传资源的评估和选育保种工作提供理论依据。     

岷县黑裘皮羊微卫星遗传多样性分析

试验旨在分析岷县黑裘皮羊群体内遗传多样性,筛选出理想的遗传标记,为岷县黑裘皮羊的选育保种提供理论依据。选取144只岷县黑裘皮羊,颈静脉采血并提取DNA,对24对微卫星引物进行PCR扩增,用毛细管电泳技术进行基因分型,计算其等位基因数、等位基因大小及频率、有效等位基因数、杂合度和多态信息含量。结果显示,24个位点共检测到210个等位基因,平均等位基因数为8.75;群体等位基因频率为0.0104～0.7396,等位基因片段大小为97～285 bp;有效等位基因数为1.7581～8.2433个;群体平均观测杂合度为0.4839;平均期望杂合度为0.6959;平均多态信息含量为0.6527。其中MAF70位点等位基因数、有效等位基因数、期望杂合度和多态信息含量最高;OarFCB128位点观测杂合度最高;OarAE129位点等位基因数最少,SRCRSP9位点期望杂合度、多态信息含量最低;OarFCB304位点观测杂合度最低。Hardy-Weinberg平衡分析结果表明,所选位点中有19个处于非平衡状态。结果表明,岷县黑裘皮羊的遗传背景复杂,群体内遗传多样性丰富,可为其遗传资源的评估和选育保种工作提供理论依据。     

利用微卫星标记分析长顺绿壳蛋鸡的遗传多样性

利用8对微卫星引物对长顺绿壳蛋鸡遗传多样性进行检测。结果表明,该群体的平均有效等位基因数为3.585 6个,平均多态信息含量为0.659 7,平均期望杂合度为0.713 1,平均基因杂合度为0.710 2,表明长顺绿壳蛋鸡群体遗传变异较大,遗传多样性较为丰富。研究结果为长顺绿壳蛋鸡品种资源合理保护与开发利用提供了科学依据。     

东北黑熊养殖群体6个微卫星基因座遗传多态性研究

利用微卫星标记研究东北黑熊养殖群体的遗传多态性,及时掌握养殖群体的相关遗传信息,为今后黑熊的人工繁殖及育种、保种工作奠定基础。本研究选取了黑熊的6个微卫星基因座(MSUT2、MSUT4、UT3、UT35、UT36、UT38)对115头东北黑熊进行了遗传检测,利用非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳进行DNA分型以及ABI 3730遗传分析仪进行基因大小的判读,计算了6个微卫星位点的等位基因频率、多态信息含量(PIC)、杂合度等值。结果表明:东北黑熊养殖群体的6个微卫星座位共检测到51个等位基因,平均为8.5个;6个微卫星基因座的平均多态信息含量为0.641 9,其中5个微卫星基因座的PIC>0.5,6个微卫星基因座的平均观察杂合度、平均期望杂合度分别为0.529 9、0.641 7。数据证明,6个微卫星标记均具有高度多态性,可用于东北黑熊的遗传多样性分析。     

利用微卫星标记分析贵州地方鸡种的遗传多样性及亲缘关系

利用7个微卫星标记对12个贵州地方鸡种及1个引入鸡种的遗传多样性进行了检测，分析了各标记座位上的等位基因及频率、基因杂合度、平均基因杂合度、多态信息含量、平均多态信息含量及群体间的亲缘关系。结果表明：13个种群在7个标记座位上的等位基因及频率等均存在一定差异。其中，瑶山鸡的平均基因杂合度最高，引入鸡种隐性白洛克的平均基因杂合度最低，其余鸡种介于其间。平均多态信息含量的分析结果与此类似，说明瑶山鸡的遗传多样性最为丰富。模糊聚类的结果表明，13个鸡种分为2大类群，隐性白洛克独自为1个类群，12个贵州地方鸡种构成1个类群。12个贵州地方鸡种又可进一步分为2个小类群：其中1个小类群由兴义土鸡、矮脚鸡首先聚在一起，然后依次聚上黔东南小香鸡、黔东南小香乌骨鸡构成；高脚鸡、瑶山鸡、威宁鸡、竹乡鸡、竹乡乌骨鸡、黑羽乌蒙乌骨鸡、乌蒙鸡、麻羽乌蒙乌骨鸡则构成另一个小类群。     

多浪羊MHC-DRB1基因巢式PCR-RFLP多态性分析

应用巢式PCR-RFLP方法,对200只多浪羊的MHC-DRB1外显子2的遗传多态性进行检测,并对基因型频率和等位基因频率进行统计。结果表明:多浪羊的MHC-DRB1基因外显子2在SacII和MvaⅠ的酶切位点存在多态性,分别检测出了2、2种等位基因,出现了3、3种基因型。由于MHC-DRB 1为多碱基突变的基因位点,综合2种限制性内切酶的酶切结果,在多浪羊中共发现6种基因型;平均杂合度和多态信息含量处于中等多态程度,χ2适合性检验结果表明,多浪羊的MHC-DRB 1外显子2在MvaⅠ酶切位点达到Hardy-Weinberg平衡(P0.05),但Sac II酶切位点未达到Hardy-Weinberg平衡(P0.01)。     

牦牛10个STR基因座遗传多态性研究

利用PCR技术和全自动毛细血管电泳法技术检测牦牛BM1818、BM1824、CSSM66、TGLA53、ETH10、TGLA126、INRA037、ILSTS006、ILST0013、ETH225等10个STR基因座的多态性分布,并计算该10个基因座的基因频率(Pi)、杂合度(H)和多态信息含量(PIC)等值。结果显示:68只牦牛的10个微卫星座位共检测到102个等位基因,平均为10.2;牦牛中10个STR基因座的平均多态信息含量为0.685,10个基因座的平均多态信息含量大于0.5。其中10个基因座的平均观望杂合度和平均期望杂合度分别为0.7995、0.6154。属于高度杂合标记,遗传变异丰富。筛选出的10个STR基因座可用于牦牛遗传多样性、遗传结构分析及遗传图谱的构建等工作。