五指山猪H—FABP基因不对称PCR—SSCP研究

以海南五指山猪为试验材料,采用不对称PCR-SSCP和测序相结合技术,对海南五指山猪心脏脂肪酸结合蛋白(H-FABP)基因第3内含子(intron 3)进行多态检测,并分析其与生长性状(体重、体高、体长、胸围)的相关性.结果表明:在五指山猪H-FABP基因intron 3中发现了3种基因型,分别命名为AA、AB、BB,对其中的纯合子AA、BB进行测序,发现intron 3的第335位点处发生了突变,都是由碱基A→G的转换造成.AA、AB、BB三种基因型频率分别为63.5%,18.2%,18.2%,A、B等位基因频率分别为73%和27%.不同基因型个体各生长性状的方差分析表明,不同基因型之间的生产性状无显著差异.     

钙蛋白酶3(CAPN3)基因多态性与牛胴体性状的关联分析

为了探讨钙蛋白酶3(Calpain3,CAPN3)基因作为影响牛肉质性状候选基因的可能性,寻找与牛肉质性状相关的分子标记,对CAPN3基因的5′端区域进行SNPs检测,分析不同基因型在不同品种或者组合群体间的分布规律。利用测序和PCR-RFLP的方法进行SNPs检测和基因型分析,计算等位基因频率、各位点多态信息含量。结果发现,2546位处发生点突变C→T。各位点的3种基因型与牛生产性状的最小二乘分析结果表明,AB与BB基因型个体在胴体质量指标上存在显著差异(P0.05)。初步推断CAPN3基因可能是影响牛肉质性状潜在的主效基因或与主效基因连锁,并且这个位点具有成为分子标记的潜在可能。     

雷州山羊和隆林山羊遗传多样性的微卫星分析

为了调查中国热带、亚热带主要山羊品种的遗传资源现状,应用14对微卫星引物,检测了隆林山羊和雷州山羊不同分布地区的群体遗传多样性水平。隆林山羊(柳州)、隆林山羊(百棚)、雷州山羊(徐闻)、雷州山羊(海南)各群体平均多态信息含量(PIC)分别为0.645、0.600、0.483、0.518;平均杂合度(H)分别为0.281、0.421、0.121、0.157;平均等位基因数(k)分别为5.17、4.93、4.64、4.5,3组数据综合说明两个山羊品种遗传多样性相对匮乏,群体遗传变异较低;NJ法聚类显示,隆林山羊两个群体聚为一类,再与雷州山羊(徐闻)聚在一起,最后为雷州山羊(海南),这与两个品种的来源及地理分布基本一致。研究结果为中国热带、亚热带山羊品种资源开发利用提供了基础资料和科学数据。     

五指山猪小群体遗传学检测

本研究利用26个微卫星基因座对中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所保种场的五指山猪小群体58个样本进行了遗传学检测,用非变性(中性)聚丙烯酰胺凝胶电泳检测微卫星的PCR扩增产物,统计了群体平均基因纯合率、等位基因数,利用等位基因频率计算出各群体的平均遗传杂合度(H)、多态信息含量(PIC)。统计结果:全群平均基因纯合率为66.5%;平均多态信息含量、平均观测杂合度为、平均期望杂合度分别为0.807、0.338、0.835;每个位点平均等位基因数为11.92,此结果说明该群体虽然近交程度较高,但仍具有丰富的遗传多样性,遗传变异较大。     

日粮营养水平对海南黑山羊肥育羔羊血液指标的影响

试验旨在研究不同营养水平精料补饲对海南黑山羊肥育羔羊血液生理生化指标的影响.采用2×3析因设计,将24只3月龄、体重相近[( 10.56±1.28) kg]的海南黑山羊随机分成6个处理组,每个处理组4只羊,每只羊为1个重复.采用2个蛋白质水平(15％和17％)和3个消化能水平(11.72、12.55、13.39 MJ/kg DM),设计6种精料补充料,自由采食,试验期90 d.结果表明:精料中蛋白质水平和消化能水平对第90 d末黑山羊血液中丙氨酸转氨酶和天冬氨酸转氨酶活性无显著影响(P＞0.05).含17％蛋白质、12.55 MJ/kg消化能精料组黑山羊血液中尿素氮含量最高(P＜0.05).第90d末黑山羊血液中葡萄糖含量随着精料中消化能水平的提高而显著提高(P＜0.05).第90 d末含17％蛋白质精料组黑山羊血液中胆固醇、总蛋白和血红蛋白含量显著高于含15％蛋白质精料组(P＜0.05).精料中蛋白质水平对黑山羊血液中红细胞和白细胞含量影响不显著(P＞0.05).精料中消化能水平对黑山羊血液中总蛋白、白蛋白、球蛋白、血红蛋白、红细胞和白细胞含量影响均不显著(P＞0.05).结果提示,日粮蛋白质水平对试验第90 d海南黑山羊血液中尿素氮、总胆固醇、甘油三酯、总蛋白和血红蛋白含量影响显著(P＜0.05),日粮能量水平对试验第90 d黑山羊血液中葡萄糖含量影响显著(P＜0.05),蛋白质水平和能量水平以及二者交互作用对试验第90 d黑山羊血液中丙氨酸转氨酶、天冬氨酸转氨酶、红细胞和白细胞含量均无显著影响(P＞0.05).     

应用体外产气法研究3种农业废弃物对黑山羊的饲用价值

为了测定甘蔗尾叶、香蕉茎秆、菠萝叶3种热带农业废弃物对海南黑山羊的饲用价值,采用体外产气法测定3种热带农业废弃物的体外干物质消化率和产气量,并测定其营养成分和单宁含量.结果表明:甘蔗尾叶、香蕉茎秆、菠萝叶的体外于物质消化率(IVDMD)依次为49.68％、61.86％和79.56％,饲料相对值(RFV)依次为62.65％、77.23％和139.81％.总产气量(GP)、IVDMD与粗蛋白质(CP)、酸性洗涤纤维(ADF)、中性洗涤纤维(NDF)均呈负相关,RFV与CP和总能量(GE)呈不显著正相关,而与ADF和NDF呈显著负相关(p＜0.05).综上所述,甘蔗尾叶、香蕉茎秆、菠萝叶对于海南黑山羊均具有一定的饲用价值,可作为黑山羊的粗饲料;在3种废弃物中,菠萝叶的饲用价值最高.     

不同营养水平日粮对海南黑山羊肥育羔羊生长性能和器官指数的影响

试验旨在研究不同营养水平日粮对海南黑山羊肥育羔羊生长性能和器官指数的影响。采用2×3析因设计,将24只3月龄、体重为(10.56±1.28)kg海南黑山羊随机分成6个处理组,每个处理组4只羊(公、母各半),每只羊为1个重复。6个不同营养水平精饲料处理组分别为:试验1组粗蛋白质(CP)水平为15%、消化能(DE)水平为11.72 MJ/kg,试验2组CP 15%、DE 12.55 MJ/kg,试验3组CP 15%、DE 13.39 MJ/kg,试验4组CP 17%、DE 11.72 MJ/kg,试验5组CP 17%、DE 12.55 MJ/kg,试验6组CP 17%、DE 13.39 MJ/kg,试验期90 d。结果表明,精饲料粗蛋白质水平对试验羊平均日增重影响显著(P<0.05),17% CP日粮组试验羊有较高的平均日增重(P<0.05)和较低的料重比(P<0.05);日粮精饲料蛋白质和能量水平对心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、胃的脏器指数影响均不显著(P>0.05),随着精饲料消化能水平的增加,肠道的脏器指数逐渐减小(P<0.05)。结果提示,补饲不同营养水平精饲料对3月龄海南黑山羊育肥期羔羊平均日增重和料重比均有显著影响(P<0.05),对黑山羊肠道重量及肠道器官指数影响显著(P<0.05),而对其他内脏器官指数无显著影响(P>0.05)。     

五指山猪H-FABP基因与生长性状的关联分析

以五指山猪为试验材料,采用PCR-SSCP和测序技术相结合,对五指山猪心脏脂肪酸结合蛋白(H-FABP)基因进行多态检测,并分析其与生长性状(体质量、体高、体长、胸围)的相关性.在五指山猪H-FABP基因Exon2中发现了3种基因型,分别命名为AA、AB、BB,对其中的纯合子AA、BB进行测序,发现Exon2的第30、120位点处发生了突变,都是由碱基C→T的转换造成的,并且导致脯氨酸突变为亮氨酸,苏氨酸突变为异亮氨酸.AA、AB、BB三种基因型频率分别为15.2%、66.7%、18.1%,A、B等位基因频率分别为48.6%和51.4%.不同基因型与生长性状的方差分析表明,8月龄体质量、体长和10月龄胸围AB与AA、BB基因型差异显著(P<0.05),其余分析无显著差异(P>0.05).     

海南黑山羊生长激素（GH）基因单核苷酸多态性分析

利用PCR-SSCP与测序相结合,分析海南黑山羊GH基因第2外显子exon2的多态性,SSCP结果出现3种基因型,分别定义为AA、AB、BB;3种基因型频率分别为28．3％、63．0％、8．7％,A、B等位基因频率分别为59．8％和40．2％,以A等位基因为优势基因,经Hardy-Weinberg平衡卡方适合性检验结果表明,exon2在此群体中处于Hardy-Weinberg不平衡状态（X2=0．000,P〈0．01）,该位点群体遗传结构及多态指标分析结果显示,该位点表现为中度多态。AA和BB基因型进行测序结果发现,exon2第11位点发生G→C突变,将核苷酸序列翻译成氨基酸序列进行同源性比较,结果exon2第11位G→C突变位点引起编码的氨基酸改变,所编码的氨基酸由原来的精氨酸变为脯氨酸。     

云南绵羊mtDNA D—LOOP序列多态性研究

采用 PCR-SSCP 技术与 mtDNA D-Loop 序列分析相结合的方法,对我国云南昭通绵羊、腾冲绵羊、宁蒗绵羊 3 个地方绵羊品种共 134 个个体进行 mtDNA 序列多态性及起源进化研究.PCR-SSCP 分析显示,在云南的 3个绵羊群体中检测到线粒体编码区的 Cytb 和 ND2 基因的 2 种单倍型 A 和 B.根据不同的单倍型从 3 个绵羊群体中共筛选出 23 个样品进行了 mtDNA D-Loop 区克隆测序,系统发育分析揭示,云南绵羊 mtDNA D-Loop 序列单倍型分为支系 A 和支系 B 两大类.基于 PCR-SSCP 和 D-Loop 区序列的分析结果一致提示云南绵羊存在支系 A 和支系B两大母系起源,对云南绵羊进行 mtDNA D-Loop 序列多态性分析,结果发现线粒体 D-Loop 区系列单倍型多样度删为 87.5%～100%;核苷酸多样度只为 0.21～0.26;平均核苷酸差异数 K 为 22.9%～36.8%.此结果揭示云南绵羊遗传多样性相对贫乏.对云南绵羊 mtDNA D-Loop 进行 Mismatch 分析和 Tajima's 值中性检验,结果显示,云南绵羊群体核昔酸差异数表现出完整的 2 个峰形,且经过中性检验不显著,由此推断云南绵羊在过去没有出现群体扩张,群体大小保持稳定.