猪细环病毒的检测及与多种病原混合感染的调查分析

为了解细环病毒(Torque teno virus,TTV)在广西猪群中的感染情况,本研究运用Nest-PCR方法,对2009—2011年采自广西140个规模猪场的156份血液、流产胎儿及肺脏、脾脏、肾脏、肝脏、淋巴结等组织样品进行检测,并对阳性样品的非编码区(UTR)进行克隆测序及遗传进化分析;同时对部分样品进行猪圆环病毒2型(PCV2)、猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)、典型猪瘟病毒(CSFV)、伪狂犬病病毒(PRV)检测及细菌的分离鉴定。结果发现,广西猪群中TTV总感染率达到93.6%,TTV2的感染率(76.9%)不仅明显高于TTV1(16.7%),且毒株间遗传变异较大。TTV多与PCV2和PRRSV混合感染,且以与PRRSV混合感染率更高(64.29%)。猪群中存在2重、3重,甚至4重TTV与其他病毒的混合感染。临床上TTV与细菌的混合感染(或细菌继发感染)以链球菌和副猪嗜血杆菌多见。本研究证实在广西猪群中存在TTV感染,且存在普遍的TTV与PRRSV、PCV2和CSFV混合感染。     

广西猪繁殖与呼吸综合征病毒感染状况调查

采用RT-PCR技术,对2004年1月至2005年4月期间,广西13个市104个疑似猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)感染猪场,无菌采取231头病、死猪的组织病料(肺脏、淋巴结、脾脏)进行了病毒检测。同时,对鉴定为PRRSV阳性的组织病料和猪场进行了猪圆环病毒2型(PCV2)、猪瘟病毒(CSFV)和猪伪狂犬病毒(PRV)的检测,以确定猪群中PRRSV与PCV2、CSFV和PRV混合感染情况。结果从12个市的115份组织病料中检出PRRSV,病料的平均阳性率为49.78%(115/231),猪场的平均阳性率为61.54%(64/104),不同地市有一定的差异。PRRSV与PCV2、CSFV和/或PRV二重或多重混和感染的组织病料总数为53份,猪场总数为39个,混合感染的组织病料和猪场的总阳性率分别为22.94%(53/231)和37.50%(39/104)。混合感染的组织病料占PRRSV阳性组织病料的46.09%(53/115),混合感染的猪场占PRRSV阳性猪场的60.94%(39/64)。其中以PCV2和PRRSV混合感染的组织病料和猪场数最多。由此可见,PRRSV感染在广西猪场已普遍存在,与其他病毒混合感染现象逐渐趋向复杂化。     

猪圆环病毒病快速检测的应用研究与流行病学调查

本研究对2012年4月至2013年3月上海市浦东新区5个规模化养殖场进行了猪圆环病毒（Porcine circovirus,PCV）2型（PCV2）针对性的调查,并对PCV2疑似病例进行病原和其他病原混合感染状况调查.浦东地区发病猪群PCV2阳性率平均为31.5％.研究表明,浦东地区PCV2与猪繁殖与呼吸综合征病毒（Porcine reproductive and respiratory syndrome,PRRSV）的混合感染率为34.8％,混合感染是导致猪群死亡的重要因素,也是当今浦东地区猪群疫病的感染现状及发病模式.     

断乳仔猪多系统衰竭综合征病原检测与分析

应用PCR技术,结合,临床观察、病理解剖对福建省不同地区断乳多系统衰竭综合征（PMws）发病猪群采集的病料进行多重病原检测与分离。结果表明50份病料中猪圆环病毒2型（PCV2）、猪繁殖与呼吸综合征病毒（PRRSV）、猪瘟病毒（CSFV）、猪伪狂犬病病毒（PRV）阳性率分别为40％、26％、4％、0,不同地区各病原检出率差别不大。病毒性混合感染以PCV2和PRRSV为主,感染率为22％;PCV2与CFSV混合感染率为4％;PRRSV与CFSV混合感染率为4％;PCV2、CFSV、PRRSV三种病原混合感染率为4％。研究结果表明福建大部分地区猪群PMWS的发生是PCV2、PRRSV、CSFV等多种病原混合感染的结果,其主要病原为PCV2,该病的发生没有明显地域性。     

2016—2018年广西玉林市部分规模猪场猪繁殖与呼吸综合征病原检测与混合感染分析

为了解广西玉林市规模化猪场猪繁殖与呼吸综合征病毒（PRRSV）感染情况及其与猪瘟病毒（CSFV）、猪圆环病毒2型（PCV2）和猪伪狂犬病病毒（PRV）混合感染情况,采用RT-PCR/PCR方法,对2016—2018年采集自玉林市存栏母猪300头以上规模化猪场的661份临床健康猪血清样本和896份表现呼吸道症状和繁殖障碍发病猪只的组织样本,进行PRRSV病原检测,并对检出的PRRSV病原阳性样本进行CSFV、PCV2、PRV病原检测,并对结果进行统计分析。结果显示：2016—2018年收集的血清样本中,PRRSV病原阳性率分别为6.86%、19.33%和10.17%,场阳性率分别为25.00%、46.67%和40.00%;PRRSV血清阳性样本混合感染率分别为52.38%、65.22%和62.50%,以与PCV2、PRV混合感染为主。2016—2018年收集的病料组织样本中,PRRSV病原检出率分别为46.38%、48.24%和48.81%,场阳性率分别为42.11%、35.37%、37.10%;PRRSV病料阳性样本混合感染率分别为50.00%、52.99%和52.35%,同样以与PCV2、PRV混合感染为主。结果表明,广西玉林市规模猪场中PRRSV流行广泛且呈加重趋势,与PCV2和PRV等病原的混合感染较严重。结果提示,玉林市规模猪场应制定科学的免疫程序,加强这些疫病的综合防控。     

猪木乃伊胎病原体混合感染的多重PCR诊断

2013年11月,贵州省都匀市某猪场发生了一起母猪流产、产死胎为特征的疾病,为确诊该猪场病原诊断类型,试验采用猪繁殖障碍性病毒性疫病六重PCR检测方法对送检木乃伊胎病料进行了猪伪狂犬病毒(PRV)、猪细小病毒(PPV)、猪圆环病毒2型(PCV2)、猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)、猪瘟病毒(CFSV)和乙型脑炎病毒(JEV)的快速检测,结果表明该猪场送检病料存在PCV2和JEV两种病毒的混合感染。     

2016年广西部分地区猪群五种疫病感染情况监测

为探明2016年广西猪群主要疫病的感染情况,从发病猪场和屠宰场共采集猪组织样品340份,应用RT-PCR方法检测猪瘟病毒（CSFV）?猪繁殖与呼吸综合征病毒（PRRSV）、猪流行性腹泻病毒（PEDV）,应用PCR方法检测猪圆环病毒2型（PCV2）和猪伪狂犬病病毒（PRV）?结果显示,发病猪场中的CSFV、PRRSV、PEDV、PCV2和PRV感染率分别为1.97%?16.45%?0.00%?34.21%和3.95%,而屠宰场猪的感染率分别为0.53%?11.17%?0.00%?43.09%和0.00%?对猪群的混合感染情况进行分析发现,PCV2和其它病原的混合感染率最高?其中,发病猪场二重感染率最高的为“CSFV+PCV2”,为3.95%;其次为“PRRSV+PCV2”,为3.29%?屠宰场二重感染率最高的是“PRRSV+PCV2”,为2.66%?结果表明：临床健康屠宰猪群和发病猪群中的PCV2和PRRSV感染率较高,其中PCV2感染率最高,且常与CSFV和PRRSV发生混合感染;PRV和CSFV主要在发病猪中被检出;加强PCV2和PRV的监控,对控制猪群发病具有重要意义;应通过加强生物安全措施来净化PRRSV和PRV?     

应用PCR方法对一起疑似感染猪瘟病毒的检测

采用猪繁殖障碍性病毒性疫病六重PCR检测方法对贵州省某猪场送检的疑似感染猪瘟病毒（CFSV）病料进行了猪伪狂犬病毒（PRV）、猪细小病毒（PPV）、猪圆环病毒2型（PCV2）、猪繁殖与呼吸综合征病毒（PRRSV）,CFSV和猪流行性乙型脑炎病毒（JEV）的快速检测,结果表明该猪场送检的仔猪同时感染PCV2和PRRSV两种病毒,CFSV检测呈阴性。     

猪圆环病毒3型的检测及其全基因进化分析

本研究对2016年3月~2017年3月采集于上海市猪场的20份病料进行了病原体检测,并对检测到的圆环病毒3型(Porcine circovirus type 3,PCV3)进行了全基因分析。检测结果显示:猪繁殖与呼吸综合征病毒(Porcine reproductive and respiratory syndrome,PRRSV)阳性病料1份,而猪圆环病毒2型(Porcine circovirus type 2,PCV2)、猪伪狂犬病毒(Pseudorabies virus,PRV)、猪瘟病毒(Classical swine fever virus,CSFV)、猪细小病毒(Porcine parvovirus,PPV)、猪乙脑病毒(Japanese encephalitis virus,JEV)均为阴性;PCV3阳性病料2份,其中1份为PCV3和PRRSV混合感染。对这2株PCV3进行全基因测序和Blast分析,并绘制PCV3全基因、囊膜蛋白基因的遗传进化树,结果显示:与这2株病毒基因同源性最高的毒株为CN/Hubei-618/2016,同源性为99%;在全基因进化树中,这2株毒株和中国来源的PCV3毒株以及美国毒株PCV3/USA/MO2015(Gen Bank登录号:KX778720.1)在同一群中;在囊膜蛋白基因的进化树中,这2株PCV3属于PCV3a。     

断奶仔猪多系统衰竭综合征相关病原混合感染的流行病学调查

为了解中国江苏省及周边地区猪场断奶仔猪多系统衰竭综合征(PMWS)相关病原的流行情况,本研究采用PCR方法,对2014年1月至2015年5月采自江苏、安徽及浙江等地猪场的125份健康猪样品和261份发病猪样品分别进行猪圆环病毒2型(PCV2)、猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)、猪细小病毒(PPV)、输血性传播病毒(TTV)和类猪圆环病毒P1的检测。结果显示,所有样品PCV2、PRRSV、PPV、TTV1、TTV2和P1的阳性率分别为39.38%、21.76%、3.11%、15.80%、16.32%和10.10%,其中混合感染主要存在于PMWS的发病猪群,以PCV2与TTV2 (15.32%)和PCV2与PRRSV (11.87%)的混合感染为主。结果表明,江苏省及周边地区猪场普遍存在PMWS相关病原的混合感染现象,加大了PMWS相关病原的防控难度。     

2018年广西重要猪源病毒性疫病流行病学调查

为了解2018年广西猪群重要疫病流行情况,试验采集广西各地的病死猪组织样品及病猪腹泻拭子,应用多重实时荧光定量RT-PCR检测猪瘟病毒（CSFV）、猪繁殖与呼吸综合征病毒（PRRSV）,应用多重实时荧光定量PCR检测猪伪狂犬病病毒（PRV）、猪圆环病毒1型（PCV1）、猪圆环病毒2型（PCV2）及猪圆环病毒3型（PCV3）,应用多重RT-PCR检测猪流行性腹泻病毒（PEDV）、猪德尔塔冠状病毒（PDCoV）、猪传染性胃肠炎病毒（TGEV）和猪轮状病毒（PRoV）。结果显示,所检测的694份组织样品中,CSFV、PRRSV、HP-PRRSV、PRV、PCV1、PCV2、PCV3的阳性率分别为11.10%、18.88%、7.20%、5.19%、2.45%、67.00%和5.76%;2种病原混合感染率为41.21%,3种病原混合感染率为4.32%,其中PRRSV和PCV2混合感染率最高。所检测的792份肠内容物及拭子腹泻样品中,PEDV、PDCoV、TGEV、PRoV的阳性率分别为9.72%、5.81%、1.77%和6.31%;2种病原混合感染率为5.30%,其中PEDV和PRoV混合感染率最高。结果表明,当前多种重要病毒性疫病仍在广西猪群发生和流行,并且多重感染普遍存在,应进一步加强监测和防控。     

Efficient surveillance of pig populations using oral fluids

Currently virus surveillance in swine herds is constrained by the cost-effectiveness and efficiency of sampling methods. The objective of this study was to assess the value of using oral fluids collected by barn personnel as a method of surveillance based on PCR testing. Approximately 12,150 pigs in 10 wean-to-finish barns on 10 farms were monitored for the presence of porcine circovirus type 2 (PCV2), porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRSV), influenza A virus (IAV), and Torque teno virus genogroups 1 (TTV1) and 2 (TTV2) by sampling oral fluid specimens. Oral fluid samples were collected from 6 pens at each site starting at the time of pig placement (～3 weeks of age) and continuing thereafter at 2-week intervals for a period of 18 weeks. Data were analyzed both on a pen basis and barn basis. Overall, 508 (85%) samples were positive for PCV2, 73 (12%) for PRRSV, 46 (8%) for IAV, 483 (81%) for TTV2, and 155 (26%) for TTV1 during the study period. The estimated arithmetic means of the quantitative PCR-positive oral fluids for PCV2, PRRSV, and IAV were 1×10(4.62), 1×10(4.97), and 1×10(5.49)per ml. With a single exception, all barns were positive for PCV2 and TTV2 at every sampling point in the study. Virus detection varied among barns, particularly for IAV and PRRSV. The pen level, cumulative distribution of agent combinations between all 10 barns were statistically different. The most commonly observed patterns were PCV2+TTV2 (239 pen samples, 40%), PCV2+TTV1+TTV2 (88 pen samples, 15%), and PCV2 alone (66 pen samples, 11%). This "proof-of-concept" project showed that a variety of viruses could be detected either intermittently or continuously in pig populations and demonstrated that barn herd virus status is highly variable, even among barns in the same production system. Oral fluid sampling is a promising approach for increasing the efficiency and cost effectiveness of virus surveillance in swine herds.     

PCV2、PRV和PRRSV多重PCR方法的建立及其应用

根据GenBank登录的猪伪狂犬病毒（PRV）、猪圆环病毒2型（PCV2）和猪繁殖与呼吸综合征病毒（PRRSV）的参考基因序列,设计3对引物分别用于扩增PCV2的ORF2基因、PRV的gE基因、PRRSV的N基因的目的片段,通过优化反应中各个影响因素,建立了PRV、PCV2、PRRSV的多重PCR（mPCR）检测方法。敏感性和特异性的结果表明,该方法对这3种病毒的最低核酸检出量分别为32.5（PRV）、25.2（PCV2）、35.9pg（PRRSV）。该方法对猪流感病毒（SIV）、猪圆环病毒1型（PCV1）、大肠杆菌、猪瘟病毒（CSFV）、猪流行性腹泻病毒（TGE）等病毒的检测结果均为阴性。200份临床样品的多重PCR结果表明,PCV2感染率为80%（160/200）,PRV感染率为21%（42/200）,PRRSV的感染率为78%（156/200）。200份临床样品主要为PCV2和PRRSV混合感染,阳性率达56.0%（112/200）。该方法的建立对这3种病毒病的早期快速检测和指导临床实践具有十分重要的意义。     

山东聊城地区规模化养猪场中重要病毒性传染病的流行情况调查与分析

为了解在非洲猪瘟背景下山东聊城附近规模化养猪场猪繁殖与呼吸综合征（PRRS）、猪流行性腹泻（PED）、猪瘟（CSF）、猪圆环病毒Ⅱ型（PCV-2）感染和猪伪狂犬病（PR）等重要疫病感染情况及其免疫抗体保护状况,采用酶联免疫吸附试验对聊城附近的6个规模化养猪场的血液样品进行检测和分析。结果发现,PCV-2、PRRSV、CSFV、PRV-gB、PRV-gE的总体抗体阳性率分别为69.64%、87.76%、74.17%、87.10%、77.04%。由该试验结果可以得出,PCV-2、PRRSV、CSFV、PRV-gB的抗体阳性率与往年相比有上升的趋势,说明猪场已经开始重视疫苗防疫。但PRV-gE阳性率达到70%以上,PRV野毒感染仍存在较大隐患,需要引起重视。     

猪全血中多种病原流行病学监测的初步研究

本文利用PCR或RT-PCR技术连续两年对规模猪场采集的猪全血分别进行猪瘟病毒（CSFV）、猪繁殖障碍综合征病毒（PRRSV）、猪伪狂犬病病毒（PRV）、猪圆环病毒2型（PCV2）、牛病毒性腹泻病毒（BVDV）和日本乙型脑炎病毒（JEV）的检测,结果发现2008年猪全血中CSFV、PRRSV、PRV、PCV2的感染率为30.0%、50.0%、4.0%和30.0%,2009年猪全血中CSFV、PRRSV、PRV、PCV2、BVDV和JEV的感染率分别为19.8%、13.7%、1.1%、31.9%、0.7%和2.7%,这表明用猪的全血可进行猪瘟等6种疫病的监测和流行,为更深入研究疫病的流行病学奠定了基础。     

2017-2020年浙江省猪主要病毒性传染病的流行病学调查与分析

为了解浙江省猪主要病毒性传染病的流行情况及变化规律,本试验对2017-2020年浙江省不同地区规模化猪场送检的血清和病料样品进行猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)、猪瘟病毒(CSFV)、猪圆环病毒2型(PCV2)和猪伪狂犬病病毒(PRV)4种疫病痛原和抗体检测.抗体检测结果显示:PRRSV、CSFV、PCV2、PRV...     

猪源TTV Taqman实时荧光定量PCR检测方法的建立和应用

根据TTV1和TTV2的非编码区（UTR）的保守序列分别设计并合成两套特异性引物和Taqman探针,建立了鉴别TTV1和TTV2的Taqman实时荧光定量PCR方法。通过常规PCR方法分别克隆TTV1和TTV2的非编码区（UTR）的保守序列并将其连入pMD18-T载体,制备阳性标准品,优化反应条件,以10倍系列稀释的标准品分别绘制标准曲线,TTV1标准曲线的相关系数为0.984,TTV2标准曲线的相关系数为0.994。检测结果显示,两种方法的灵敏度均可达10 copies/μL,除猪源TTV外,对猪繁殖与呼吸综合征病毒、猪瘟病毒、猪2型圆环病毒、猪流感病毒检测结果均为阴性。该方法重复性好,批内和批间变异系数均小于3%。检测采集自广西和内蒙古的44份病料,TTV1的阳性率为47.73%,TTV2阳性率为70.45%,TTV1和TTV2混合感染的阳性率为31.82%。猪源TTV检测方法的建立为该病毒的流行病学调查和定量提供了有效的手段。     

广东省部分猪场细环病毒感染状况

细环病毒（TTV）目前在全世界的猪群中广泛存在。为了调查其在广东省猪群流行情况,我们运用PCR方法对广东省不同地方猪场和散养户送检的445份血清进行了检测。结果表明：TTV总的阳性率为68.1%（303/445）,其中TTV1阳性率为43.1%（192/445）,TTV2阳性率为24.9%（111/445）。TTV1的阳性率高于TTV2的阳性率,且猪场送检样品阳性率高于散养户。TTV1和TTV2存在混合感染,猪场样品混合阳性率为23.1%（88/381）,散养户样品混合阳性率为1.6%（1/64）。几份阳性样品测序和进化分析显示,它们分别属于TTV1和TTV2。调查结果表明TTV在广东猪群中已经广泛存在。