苏太猪SLA-DQB基因外显子2多态性及其与繁殖性能的关联分析

采用PCR-RFLP法对苏太猪SLA-DQB基因外显子2的PCR产物进行分析,结果显示,SLA-DQB基因外显子2经RsaⅠ酶切后,共分出4种基因型;经HaeⅢ酶切,共分出3种基因型。χ^2适合性检验结果表明,苏太猪SLA-DQB基因外显子2在RsaⅠ和HaeⅢ酶切位点都已经达到了Hardy-Weinberg平衡状态。在RsaⅠ和HaeⅢ酶切后分出的4种组合带型中,组合带型为BBEE的种母猪第3胎总产仔数、产活仔数、初生窝重、断奶仔猪数和断奶窝重均显著高于组合带型为AADD的个体（P〈0.05）,也高于组合带型为ABDE和ACDE的个体,但是差异不显著（P〉0.05）。     

3个江西省地方猪种SLA-DQB基因外显子2多态性分析

采用PCR-RFLP法对3个江西省地方猪种(乐平花猪、修水杭猪和万安花猪)的SLA-DQB基因外显子2的PCR产物进行多态性分析。结果表明:3个猪种SLA-DQB基因外显子2多态性非常丰富,通过限制性内切酶HaeⅢ和RsaⅠ酶切后,均分出3种RFLP带型,共有10种组合带型,其中修水杭猪仅检测到4种,乐平花猪和万安花猪中均检测到6种。2χ适合性检验表明,3个猪种SLA-DQB基因外显子2的2个酶切位点均达到了Hardy-Weinberg平衡状态。     

6个中国小型猪种SLA-DQB基因外显子2多态性分析

采用PCR-RFLP法对甘孜藏猪、合作猪、滇南小耳猪、荷包猪、五指山猪和巴马小型猪SLA-DQB基因外显子2多态性进行分析。结果表明:经RsaⅠ酶切检测到5种等位基因,14种RFLP带型,遗传杂合度(He)在0.538~0.729,多态信息含量(PIC)在0.488~0.728,该位点表现为高度多态;χ~2适合性检验显示,甘孜藏猪、巴马小型猪和五指山猪3个群体处于Hardy-Weinberg平衡状态。经HinfⅠ酶切检测到3种等位基因,6种RFLP带型,He在0.315~0.524,PIC在0.291~0.461,在该位点表现为中度多态。χ~2适合性检验显示,甘孜藏猪、滇南小耳猪、巴马小型猪、荷包猪4个群体处于Hardy-Weinberg平衡状态。因此,6个小型猪种的SLA-DQB基因外显子2多态性丰富且存在明显差异。     

19个猪种SLA-DQB基因外显子2多态性分析

本研究旨在系统分析国内外猪种SLA-DQB基因的多态性,以期为进一步研究猪SLA-DQB与疾病抗性的相关性提供理论依据.采用PCR-RFLP方法,野猪、14个中国地方猪种和4个引进猪种SLA-DQB基因第2外显子经限制性内切酶HaeⅢ酶切后,共检测到5个等位基因,9种基因型.其中野猪中仅存在A、B 2种等位基因;家猪群体中出现了野猪群体中所没有的6种基因型和3种等位基因.中国地方猪种与引进猪种相比,RFLP带型较为丰富,五指山猪和淮猪中具有8种基因型,多态性最为丰富.除野猪群体中A等位基因为优势等位基因外,其它所有家猪群体中均以B和C基因为优势等位基因;临高猪中出现其它猪种所没有的D等位基因,表现出独特的特性.本研究结果提示,生态环境和遗传纯度均可能影响SLA-DQB等位基因的多样性,总体上,引进猪种、培育猪种和地方猪种SLA-DQB基因外显子2的基因型分布并不存在明显的差异,但PCR-RFLP带型在具体的品种之间的差别较大.     

云南高峰牛MHC-DQB基因外显子2遗传多态性分析

本研究采用PCR直接测序和PCR-RFLP法研究了云南高峰牛MHC-DQB基因外显子2(DQB.2)的遗传多态性,并利用DNAMAN软件分析了云南高峰牛与部分物种DQB.2相应核苷酸序列的同源性。结果发现,共检测到了17个等位基因,其中Hae Ⅲ酶切位点存在10种基因型,由A、B、C、D和E 5个复等位基因控制;RsaⅠ酶切位点存在22种基因型,由A、B、C、D、E、F、G、H、I、J和K共11个复等位基因控制;TaqⅠ酶切位点只出现了1种基因型。分析发现,云南高峰牛DQB.2基因的12、25、63、96、106、126、152、156、165、204位的碱基表现出了多态性。所分析的物种该基因片段大小相同均为270 bp,云南高峰牛第224位碱基缺失及236位碱基插入现象。云南高峰牛与人、猪、马、绵羊、黄牛×瘤牛的核苷酸序列的同源性分别为81.4%、83.3%、78.1%、87.7%、86.6%。经χ²检验结果表明,Hae Ⅲ和TaqⅠ酶切位点处于Hardy-Weinberg平衡状态(P＞0.05),而RsaⅠ酶切位点则未达到Hardy-Weinberg平衡状态(P＜0.05)。     

中国荷斯坦牛BoLA-DRB3.2基因座的PCR-RFLP多态性分析

主要组织复合体(Major Histocompatibility Complex,MHC)基因在动物机体免疫系统中具有重要作用,并与多种疾病的抗性或易感性存在相关性.利用限制性内切酶HaeⅢ和RsaⅠ通过PCR-RFLP技术分析了112头中国荷斯坦牛BoLA-DRB3.2基因的多态性.结果表明:所检测牛群中BoLA-DRB3.2基因在两个酶切位点均存在多态性,HaeⅢ酶切位点存在4种等位基因,有4种基因型;RsaⅠ酶切位点存在3种等位基因,有4种基因型.经x2适合性检验,所检测牛群中BoLA-DRB3.2基因在两个酶切位点均未达到Hardy-weinberg平衡状态.     

中国荷斯坦牛BoLA-DRB3.2基因座的PCR-RFLP多态性分析

主要组织复合体(Major Histocompatibility Complex,MHC)基因在动物机体免疫系统中具有重要作用,并与多种疾病的抗性或易感性存在相关性。利用限制性内切酶HaeⅢ和RsaⅠ通过FCR-RFLP技术分析了112头中国荷斯坦牛BoLA-DRB3.2基因的多态性。结果表明:所检测牛群中BoLA-DRB3.2基因在两个酶切位点均存在多态性,HaeⅢ酶切位点存在4种等位基因,有4种基因型;RsaⅠ酶切位点存在3种等位基因,有4种基因型。经χ~2适合性检验,所检测牛群中BoLA-DRB3.2基因在两个酶切位点均未达到Hardy-weinberg平衡状态。     

撒坝猪及长撒二元杂猪SLA-DQB基因PCR-RFLP多态性分析

采用限制性内切酶RsaⅠ对云南地方品种撒坝猪及其长撒二元杂猪SLA-DQB基因外显子2的273bp扩增产物进行多态性分析,结果在2种猪中均发现B、C、G3种等位基因,在撒坝猪中发现6种基因型:132bp/84bp/30bp/27bp(BB)、246bp/27bp(CC)、132bp/114bp/27bp(GG)、246bp/132bp/84bp/30bp/27bp(BC)、132bp/114bp/84bp/30bp/27bp(BG)、246bp/132bp/114bp/27bp(CG);长撒二元杂猪中发现5种基因型:BB、CC、BC、BG、CG。经χ2适合性检验,撒坝猪和长撒二元杂猪SLA-DQB基因外显子2在RsaⅠ酶切位点处于Hardy-Weinberg遗传不平衡状态。     

藏猪SLA-DRB基因第2外显子PCR-RFLP多态性分析

采用限制性内切酶RsaⅠ对藏猪SLA-DRB基因外显子2进行多态性分析。结果表明：藏猪SLA-DRB基因外显子2在RsaⅠ-RFLP位点上存在7种基因型，以杂合子BC型居多，基因型频率为0.4419，为优势基因型。χ2适合性检验结果表明，藏猪SLA-DRB基因外显子2 的RsaⅠ酶切位点的χ2值为10.14，高于显著水平（P<0.05），说明藏猪SLA-DRB基因在RsaⅠ酶切位点上没有达到Hardy-Weinberg平衡状态。     

中国美利奴羊MHC-DRB1基因PCR-RFLP多态性分析

应用巢式PCR-RFLP方法,对211只中国美利奴(新疆军垦型)羊的MHC-DRB1外显子2的遗传多态性进行检测,并对基因型频率和等位基因频率进行了统计,结果表明,中国美利奴(新疆军垦型)羊的MHC-DRB1基因外显子2在SacⅠ、Hin1Ⅰ和HaeⅢ的酶切位点存在多态性,这些酶切位点分别受2、2和6个等位基因控制,由于MHC-DRB1为多碱基突变的基因位点,综合3种限制性内切酶的酶切结果,在中国美利奴(新疆军垦型)羊中共发现24种等位基因;χ2适合性检验结果表明,中国美利奴(新疆军垦型)羊的MHC-DRB1外显子2在SacⅠ和Hin1Ⅰ酶切位点均达到Hardy-Weinberg平衡(P＞0.05),但在HaeⅢ酶切位点未达到Hardy-Weinberg平衡(P＜0.01).     

杜滇猪和杜藏猪SLA-DQB、SLA-DRB基因第二外显子杂交优势分析

本实验旨在研究杂交后代杜滇猪、杜藏猪SLA-DQB、SLA-DRB基因第二外显子多态性问题,并与双亲(杜洛克猪、迪庆藏猪、滇南小耳猪)进行比较,分析其杂交优势。采用PCR-RFLP方法对杜滇猪、杜藏猪SLA-DQB、SLA-DRB基因第二外显子进行研究。结果表明:杜藏猪和杜滇猪SLA-DQB基因第二外显子经Hae III酶切,分别表现出4个和3个SNP位点、3个等位基因、5种基因型;杜滇猪和杜藏猪出现双亲都没有的AC基因型,迪庆藏猪拥有EE基因型而杜藏猪没有;杜滇猪SLA-DQB基因第二外显子杂合度和多态信息含量均高于双亲,表现出良好的杂交优势。杜藏猪和杜滇猪SLA-DRB基因第二外显子经过Rsa I酶切,分别表现出4个和3个SNP位点、4个和3个等位基因、8种和5种基因型;杜藏猪出现了双亲都没有的AC、BD基因型,杜滇猪出现双亲都没有的BD、DD基因型。杜藏猪、杜滇猪SLA-DRB基因第二外显子杂合度和多态信息含量均高于双亲,表现出良好的杂交优势。     

多浪羊MHC-DRB1基因多态性与包虫病抗性分析

通过PCR扩增122只包虫病(细粒棘球蚴病)阴性和70只包虫病阳性多浪羊的MHC -DRB1第2外显子,产物经SacⅠ、Hin1Ⅰ和HaeⅢ3种限制性内切酶酶切后进行RFLP多态性分析.结果表明,多浪羊MHC-DRB1基因第2外显子在SacⅠ、Hin1Ⅰ和HaeⅢ酶切位点存在丰富的多态性,分别检测出了2、2和6种等位基因,出现了3、3和18种基因型.将包虫病阴性和阳性多浪羊的等位基因频率和基因型频率分别进行比较分析,发现等位基因HaeⅢ a对包虫病感染具有一定的易感性(P＜0.05),SacⅠab和Hin1Ⅰaa 2个基因型对包虫病具有一定的抗性(P＜0.05), HaeⅢbe和HaeⅢef这2个基因型对包虫病具有较强的易感性(P＜0.01).     

荷斯坦奶牛BoLA—DRB3基因多态性与乳房炎相关性分析

本研究采用HaeⅢ和EstY Ⅰ内切酶,以PCR-RFLP方法分别检测了新疆地区引进的澳大利亚荷斯坦奶牛BoLA-DRB3基因的多态性及其与乳房炎的相关性.结果共检测到9种基因型5种等位基因.其中基因型HaeⅢAB和Bsty ⅠAA为优势基因型.等位基因HaeⅡA和Bsty Ⅰ A为优势基因;在高于健康牛的分布频率中,基因型HaeⅢAB和Bsty ⅠAB,基因HaeⅢB和BstY Ⅰ A基因频率在感染牛中分布频率最高:在高于感染牛的分布频率中.基因型HaeⅢAA和BstY Ⅰ AA,基因HaeⅢA和BstY Ⅰ A在健康牛中分布频率最高.经X2适合性检验,HaeⅢ酶切位点的碱基突变偏离平衡状态(P<0.01),而BstY Ⅰ酶切位点碱基突变达到平衡状态(P>0.05);HaeⅢ酶切基因型和基因频率在感染牛和健康牛中分布差异均极显著(P<0.01);BstYⅠ酶切基因型和基因频率在感染牛和健康牛中的分布差异均不显著(P>0.05).     

江西地方猪种SLA-DRB基因外显子2的多态性研究

采用PCR-RFLP法对3个江西地方猪种(乐平花猪、修水杭猪和万安花猪)的SLA-DRB基因外显子2的PCR产物进行多态性分析。通过限制型内切酶RsaⅠ酶切后,共产生9种组合带型。通过检测发现:乐平花猪有8种组合带型,即AA、AB、AC、BB、BC、BD、CD和DD;修水杭猪有3种组合带型,即AA、AB和AC;万安花猪有4种组合带型,即AA、AC、BC和CC,且3个猪种中均以A为优势带型,在猪种中频率相差不大。χ2检测表明,乐平花猪和修水杭猪SLA-DRB基因外显子2在RsaⅠ酶切位点达到了Hardy-Weinberg平衡状态,而万安花猪未达到Hardy-Weinberg平衡状态。     

猪Pit-1基因的多态性研究

选取7个中国地方猪种和3个国外引入猪种共473头，应用PCR-SSCP技术在7个中国地方猪种中检测到1个Pit-1基因第4外显子上的突变；应用PCR-RFLP技术在3个国外引入猪种中，扩增长度为1747bp的片段中检测到1个RsaⅠ限制性内切酶的多态酶切位点。遗传多态性分析结果表明：外显子4上的突变，在7个中国地方猪种中是A型等位基因和AA基因型频率占优势。其中沂蒙黑猪和巴马小型猪处于Hardy-Weinberg平衡；北京黑猪、沂蒙黑猪、巴马小型猪、滇南小耳猪和香猪处于中度多态。RsaⅠ酶切多态位点的突变在3个国外引入猪种中也是A型等位基因和AA基因型频率占优势。其中大白猪和杜洛克猪处于Hardy-Weinberg平衡；3个国外引入猪种的多态信息含量均为中度多态。     

云南半细毛羊和杜泊羊MHC-DRB1基因PCR-RFLP多态性分析

试验以云南半细毛羊和杜泊羊为研究对象,采用PCR-RFLP和直接测序的方法分析两个品种的MHC-DRB1基因的遗传多样性及分子系统发育。研究中共检测到云南半细毛羊和杜泊羊MHC-DRB1基因的6个复等位基因。在云南半细毛羊中,SacⅠAA、Hin1ⅠAB和HaeⅢFF为优势基因型;SacⅠA、Hin1ⅠB和HaeⅢF为优势基因。TaqⅠ位点只有AB一种基因型。TaqⅠ限制性酶切位点未达到Hardy-Weinberg平衡状态。在杜泊羊中,HaeⅢAA为优势基因型;HaeⅢA为优势基因。TaqⅠ位点只有AA一种基因型。云南半细毛羊和杜泊羊DRB1基因SacⅠ酶切位点的多态信息含量均为低度多态,HaeⅢ位点为高度多态,其余各位点均为中度多态。     

德昌水牛Bola-DRB3基因第二外显子的PCR-RFLP多态性研究

本研究应用PCR-RFLP方法,对德昌水牛MHCⅡ类基因座位的Bola-DRB3基因第2外显子进行了遗传多态性研究.结果表明:HaeⅢ酶切出现7种基因型,即AA、AB、AD、BC、AC、BF和BB,共有A、B、C、D、F 5个复等位基因控制;AA型的频率最高,为优势基因型,A基因为优势基因.RsaⅠ酶切结果出现3种基因型,即GH、GG、HH,共有G、H 2个基因控制;GG的频率最高,为优势基因型,G基因为优势基因.这表明德昌水牛在Bola-DRB3基因第2外显子上具有丰富的多态性.在RsaⅠ酶切位点上,德昌水牛未达到Hardy-Weiberg平衡状态,显示在群体中有选择、基因突变、近交、遗传漂变等因素的一定影响,这是对保种极为不利的,应引起畜牧工作者的关注.在德昌水牛遗传资源的开发利用和保存中,作者认为应严格划定杂交改良和保种区的范围;在杂交改良区内可以进行选育、品种间杂交,充分利用杂种优势,提高其生产性能;而在保种区或群中不进行杂交,同时减少选育;使德昌水牛遗传资源的有效保存和充分利用有机的结合起来.     

多浪羊MHC-DRB1基因巢式PCR-RFLP多态性分析

应用巢式PCR-RFLP方法,对200只多浪羊的MHC-DRB1外显子2的遗传多态性进行检测,并对基因型频率和等位基因频率进行统计。结果表明:多浪羊的MHC-DRB1基因外显子2在SacII和MvaⅠ的酶切位点存在多态性,分别检测出了2、2种等位基因,出现了3、3种基因型。由于MHC-DRB 1为多碱基突变的基因位点,综合2种限制性内切酶的酶切结果,在多浪羊中共发现6种基因型;平均杂合度和多态信息含量处于中等多态程度,χ2适合性检验结果表明,多浪羊的MHC-DRB 1外显子2在MvaⅠ酶切位点达到Hardy-Weinberg平衡(P0.05),但Sac II酶切位点未达到Hardy-Weinberg平衡(P0.01)。     

撒坝猪及长撒二元杂交猪SLA-DQA基因PCR-RFLP多态性分析

根据SLA-DQA基因cDNA序列和已报道的引物序列,在猪中成功扩增了一个731bp的片段,该片段包括猪SLA-DQA基因的大部分第2外显子、完整第2内含子和少部分第3外显子.采用限制性内切酶EcoR1对撒坝猪和长撒二元杂猪SLA-DQA基因的扩增产物进行多态性分析,结果2个猪种在酶切后出现2个等位基因,3种基因型:654 bp/77 bp(AA)、731 bp(BB)和731 bp/654 bp/77 bp (AB).分析发现,A等位基因在群体中占优势,经X2适合性检验,撒坝猪和长撒二元杂交猪SLA-DQA基因在EcoR1酶切位点处于Hardy-Weinberg遗传平衡状态.     

小尾寒羊MHC-DRB3基因外显子2的多态性分析

采用PCR-RFLP方法对小尾寒羊MHC-DRB 3基因第二外显子285 bp的扩增产物进行多态性分析,结果共检测到内切酶P stⅠ的3种基因型,由2个等位基因控制,通过酶切图谱分析结果表明:小尾寒羊的MHC-DRB 3基因第二外显子的第241位的碱基表现出多态性,等位基因B的基因频率为0.81879。x2适合性检验结果表明:小尾寒的MHC-DRB 3基因的第2外显子的P stⅠ酶切位点达到了H ardy-W e inberg平衡状态。