乐昌含笑种群遗传多样性的研究

基于随机扩增多态DNA(RAPD)方法分析了珍稀木兰科植物乐昌含笑6个种群的遗传多样性及分化程度。19条随机引物扩增出111个可分析位点,多态位点百分比为81．98％,经POPGENE分析发现,乐昌含笑的Nei’s基因多样度(Hc)为0．3255,Shannon表型指数(I)为0．4751,与其它植物比较具有较高水平的遗传多样性。6个乐昌含笑群体间基因分化系数(Gst)值为0．2226。群体内的遗传变异大于群体问的遗传变异。按照遗传距离将乐昌含笑6个群体划分为两类：第1类有广西三江、湖南宜章、湖南双牌和湖南资兴的群体,第2类包括江西官山和湖南醴陵的群体;研究表明：第2类种群的遗传多样性指数高于第1类种群的遗传多样性指数。     

湘鄂西地区珙桐天然群体遗传结构的研究

以珙桐叶为材料,对湘西和鄂西两天然珙桐群体的60个样品进行RAPD分析.结果表明,9个随机多态引物,获得24个多态标记位点,平均每个引物产生2.67个多态位点;湘西和鄂西两群体之间的遗传多样性差异不明显,Shannon指数分别为0.427 4和0.448 1;种内平均遗传多样性为0.326 9,群体内平均遗传多样性为0.297 6,群体间的遗传多样性为0.029 3,基因分化系数为0.089 6,基因流为5.079 2.两个天然珙桐群体的遗传相似性非常高,达到0.923 3,遗传距离为0.079 8;湘西群体的多态百分位率略高于鄂西.这表明,湘西和鄂西两群体间存在着非常频繁的基因流.     

不同种源印楝遗传多样性的ISSR分析

利用ISSR分子标记技术对印楝进行遗传多样性分析,用9条引物进行扩增,共检测出81条清晰的位点,其中79条具有多态性,多态位点百分率为97．53％,Nei＇s基因多样性指数为0．3803,Shannon信息指数为0．5537,表明印楝遗传多样性很丰富。种源间遗传分化系数为0．4702,Shannon’s居群分化系数为0．4677,表明印楝种源内的遗传分化大于种源间的分化。聚类分析将13个种源分为2大类,来自缅甸的11个种源聚成一类,来自澳大利亚和印度的种源聚成另外一类。结果表明,ISSR分子标记技术适合于印楝的遗传多样性分析。     

茶藨生柱锈菌寄主遗传多样性研究

运用随机扩增多态DNA (RAPD)标记对分布于我国4省6病区63份茶藨生柱锈菌寄主红松和华山松进行遗传多样性分析.用6个随机引物对寄主松针进行PCR扩增,共得到138个DNA位点,其中多态位点117个,多态位点比率为84.78%,RAPD的Shannon指数遗传多样性为0.315 5,RAPD的Nei指数基因分化系数为0.525 5.不同来源寄主的遗传多态性规律顺序:辽宁清原红松＞云南洱源华山松＞山西沁水华山松＞云南巧家华山松＞四川广元华山松＞云南东川华山松.从RAPD聚类分析树状图可以看出,先将63个松针样品分成2个不同的RAPD组群(红松组群和华山松组群),然后又将不同地理来源的华山松组群按地理区域分成5个亚群,同一采集的华山松亚群中又分成感病组和抗病组.研究表明,种间的遗传多样性是由种的遗传属性所决定的,而地理因素只是影响种内遗传多样性的一个因子.     

黄心夜合的遗传多样性研究

运用随机扩增多态DNA（RAPD）技术,对黄心夜合[Michelia martinii（Levl.）Levl.]自然分布区的6个自然种群遗传多样性进行了研究。从100个随机引物中筛选出能产生清晰、稳定的多态性标记引物18个,共检测出110个位点,其中多态性位点为96个,占87.27%;在物种水平上,有效等位基因数目（Ne）,Nei’s基因多样性系数（He）和Shannon表型多样性指数（I）分别为1.735 2,0.416 3和0.597 1;总的遗传变异量（Ht）为0.339 8,其中居群内遗传变异量（Hs）为0.258 7,各居群间的遗传分化系数（Gst）达到0.323 1.应用UPGMA法对遗传距离进行聚类分析并构建树系图,结果表明：黄心夜合自然种群具有较高的遗传多样性,其种群间的遗传差异与其地理分布有关。     

四川不同地区硬头黄竹RAPD和ISSR分析

以四川不同地区硬头黄为研究对象,通过随机扩增多态性DNA标记（RAPD）和简单序列重复区间（ISSR）标记进行扩增,探讨硬头黄竹的遗传多样性。研究表明,6个RAPD引物扩增出42条条带,多态性高达69．05％;5个ISSR引物扩增出47条条带,多态性为61．70％。利用Popgen32和NTYS软件进行聚类分析,可将不同地区硬头黄竹类型区分开来,其遗传距离分别为0．1823～0．6022和0．0435～0．6721,RAPD和ISSR分子标记为硬头黄竹的遗传改良提供理论依据。     

云南特有濒危植物馨香木兰的遗传多样性研究

为研究云南特有濒危植物馨香木兰的遗传多样性水平,采用随机扩增多态DNA技术（ RAPD）,对云南省馨香木兰4个居群,即文山州广南县、西畴县新街、西畴县亚坪等3个天然居群及昆明树木园1个人工居群,进行遗传多样性分析。随机筛选出重复性好的8条随机引物,对70个样品的基因组DNA进行扩增,建立RAPD分析图谱。扩增结果为,共检测出84个多态位点。遗传多态位点百分率为61.90％（文山广南）、76.19％（西畴新街）、71.43％（昆明树木园）和66.67％（西畴亚坪）。遗传多样性Shannon指数为0.5686,其中30.55％来自种群间,69.45％来自种群内; Nei’s指数为0.3903,种群间的遗传分化系数（GST）为0.2216。文山广南和西畴亚坪之间的遗传距离最大,昆明树木园与西畴亚坪之间的遗传距离最小。结果显示,与木兰科等其他濒危植物相比较,馨香木兰遗传多样性相对较高。根据各种群遗传背景研究结果,提出了该物种迁地保护种群遗传资源管理建议。     

巨桉种源遗传多样性的RAPD分析

用随机扩增多态DNA(RAPD)分子标记方法对巨桉11个种源80个个体进行了遗传变异的比较分析.通过20个10bp随机引物的扩增,共检测到149个位点,其中89个为多态性标记位点,总的多态位点百分率为59.73%.各个种源多态位点百分率较高,为42.86%～55.89%,多态位点最多的是8号种源,最低的是6号种源.Shannon表型多样度估测值的统计表明,遗传多样性主要存在种源内部.遗传变异在种源间占28.74%,在种源个体间占71.26%.Shannon表型多样度估测值在种源间为0.1720～0.2650,平均为0.2373.8号种源的遗传多样性最高,6号种源的遗传多样性最低;种源间的遗传距离为0.0391～0.1344,平均为0.0817.这些遗传变异为巨桉优良种源的早期选择提供了科学依据.     

利用RAPD技术研究6种蜘蛛的遗传多样性

采用RAPD技术对园蛛科6种蜘蛛的遗传多样性进行了研究，从100个10pb寡核苷酸随机引物中筛选出10个扩增结果清晰且重复性好的随机引物对基因组DNA进行了扩增，共记录129条片段，平均每个引物12.9条，种群内多态位点比例在17.05%-45.38%。平均遗传多态度0.3096,Shannon多样性指数0.4732。从统计结果来看，6种蜘蛛没有普遍存在的位点；种间遗传多样性较丰富，种内的遗传多样性较低，外部形态相似的种间遗传距离较近，亲缘关系较近。     

用随机扩增多态DNA (RAPD)技术分析野生与笼养绿孔雀种群的遗传多样性

利用随机扩增多态DNA(RAPD)技术对野生14个和笼养18个绿孔雀(Pavomuticus)个体进行了种群遗传多样性分析。用23个随机引物对野生与笼养绿孔雀基因组DNA扩增,分别获得161和166个扩增片段。计算发现野生与笼养绿孔雀的种群内平均相对遗传距离分别是0.0555和0.1355,两种群间的平均相对遗传距离为0.1635;野生绿孔雀和笼养绿孔雀种群的Shannon多样性指数平均分别是0.4348和1.0163,表明有显著性差异。以上分析都显示野生绿孔雀的遗传多样性很低。利用UPGMA法聚类显示两个种群都是分别来源于两个家系,可据此进行绿孔雀的繁育管理。图1表3参5。     

毛竹居群遗传多样性的RAPD分析

利用RAPD技术,对来自不同地区的18个毛竹居群遗传多样性及居群间的关系进行了研究.从184条10碱基随机引物中筛选到14条能稳定产生多态标记的引物,共扩增出129个位点,主要集中在400～1 400bp之间,其中多态性位点有101个,比率高达78.3%,Shannon多态性指数较高平均为0.377.根据POPGENE32软件分析和聚类分析,计算各居群间的遗传相似性I和遗传距离D,遗传距离的变异范围为0.081～0.503,遗传相似性变异范围为0.605～0.923,表明各居群间的遗传距离和遗传相似性存在着较大的差异.地理上较近的居群多聚在一起,表现出比较明显的地域性,说明各居群的亲缘关系与地理分布有着密切的关系.     

紫胶虫主要生产种的RAPD分子标记分析

用RAPD技术研究了紫胶虫7种主要生产种12个群体之间的亲缘关系,研究中每个群体使用了24个标本,共有288个个体用于研究.在试用的45种随机引物中,筛选出9种引物用于随机引物扩增,共得到121个清晰稳定的位点,其中118个为多态性位点,多态百分率为97.52%,每条引物检测到的位点数为11～16个,长度为150～3 000 bp.根据扩增结果,用UPGMA法对Nei's遗传距离进行聚类分析,构建分子系统树.7种紫胶虫聚类结果显示:紫胶虫各群体间的遗传距离为0.044 3～0.791 7,其中,种间的遗传平均距离为0.443 0,种内的遗传平均距离为0.170 7.根据聚类分析,讨论了紫胶虫主要生产种的亲缘关系.     

七子花种群遗传多样性的RAPD分析

按胸径将浙江省天台山天然七子花划分为大树、中树、小树和幼树 4个大小级种群 ,利用RAPD分子标记技术对 4个大小级种群共 4 5株个体的遗传多样性及遗传分化进行了比较分析 ,结果表明 :通过 12种随机引物扩增共检测到 6 4个可重复的位点 ,4个大小级种群的多态位点百分率高低为大树 >中树 >小树 >幼树。Shannon信息指数估计七子花 4个大小级种群的遗传多样性高低为大树 >中树 >小树 >幼树 ,大小级种群内的遗传变异占总变异的 5 4 4 1% ,大小级种群间的遗传变异占总变异的 4 5 5 9% ,表明不同大小级种群内、大小级种群间个体均存在一定的遗传分化 ,但大小级种群内的遗传分化比大小级种群间高。Nei指数估计的七子花不同大小级种群的基因多样性的高低与Shannon指数估计的一致 ,大小级种群内的遗传分化高于大小级种群间 ,大小级种群间的基因分化系数为 0 3939。不同大小级种群间的遗传相似度以大树与中树最高 ,大树与幼树最低。聚类分析显示大树与中树先聚成一组 ,小树与幼树再聚成一组 ,最后 2组聚在一起     

地理隔离对西南藏区山杨居群遗传结构影响的SRAP分析

采用SRAP分子标记技术,对分布于我国西南3个藏族地区山杨9个居群130个个体进行了遗传结构分析。结果表明,筛选出的7对引物组合共检测到多态性条带(AP)99条,多态性条带百分比(PPB)为59.28%。采用POPGENE软件分析,山杨9个居群平均多态位点百分率(PPB)为33.80%,Nei’s基因多样性指数(H)和Shannon’s信息指数(I)分别为0.130 9和0.213 7,较东北地区山杨具有偏低的遗传多样性。遗传分化系数Gst=0.325 5,表明遗传变异主要存在于居群内个体间。地理距离与遗传距离之间具有弱相关关系(r=0.349,P=94.5%),山脉阻隔效应是导致西南藏族地区山杨居群间遗传分化的主要因素。UPGMA聚类表明,甘孜地区4个居群与迪庆地区的维西居群具有较近的亲缘关系,迪庆地区的德钦、香格里拉居群和昌都地区2个居群的遗传相似度较高。基于西南藏族地区山杨遗传结构分析,建议实施就地保护的同时,建立山杨种质资源库,促进不同居群间的基因交流。     

不同盐度梯度下一年蓬的遗传多样性和遗传分化

利用RAPD技术对3个不同盐度梯度下入侵杂草一年蓬的遗传多样性和遗传分化进行了研究。结果表明,12个随机引物在90株个体中共检测到187个可重复位点,其中多态位点158个,总多态位点百分率为84.49%,3个种群平均多态位点百分率为70.77%。采用Shannon信息指数计算的3个种群总的遗传多样性为0.4522,平均为0.4027;采用Nei指数计算的3个种群总的基因多样性为0.3042,平均为0.2746。3个种群的多态位点百分率、Shannon信息指数、Nei指数大小顺序均为P2>P1>P3。AMOVA分子变异显示,88.54%变异来源于种群内,11.46%变异来源于种群间。一年蓬高的遗传多样性与低的遗传分化与其生物学特性有关,是其广泛入侵的重要原因。     

Genetic diversity of natural Hepatacodium miconioides populations in Zhejiang Province

Hepatacodium miconioides is the Class II protected plant species in China. This paper studies the genetic diversity and differentiation of its nine natural populations in Zhejiang Province by using random amplified polymorphic DNA (RAPD) technique. Twelve random primers were selected in the amplification, and 164 repetitive loci were produced. The percentage of polymorphic loci in each H. miconioides population ranged from 14.60% to 27.44%, with an average of 20.73%. Among the test populations, Kuochangshan had the highest percentage of polymorphic loci, Simingshan took the second place, and Guanyinping had the lowest percentage. As estimated by Shannon index, the genetic diversity within H. miconioides populations accounted for 27.28% of the total genetic diversity, while that among H. miconioides populations accounted for 72.72%. The genetic differentiation among H. miconioides populations as estimated by Nei index was 0.715,7. This figure was generally consistent with that estimated by Shannon index, i.e., the genetic differentiation among populations was relatively high, but that within populations was relatively low. The gene flow among H. miconioides populations was relatively low (0.198,7), and the genetic similarity ranged from 0.655,7 to 0.811,9, with an average of 0.730,6. The highest genetic distance among populations was 0.422,9, while the lowest was 0.208,3. All the results showed that there was a distinct genetic differentiation among H. miconioides populations. The genetic distance matrix of nine test populations was calculated using this method, and the clustering analysis was made using the unweighted pair group method with arithmetic mean (UPGMA). The cluster analysis suggested that the nine populations of H. miconioides in Zhejiang Province could be divided into two groups, the eastern Zhejiang group and the western Zhejiang group. __________ Translated from Chinese Journal of Applied Ecology, 2005, 16(5): 795–800 [译自: 应用生态学报, 2005, 16(5): 795–800]     

白皮松天然群体遗传多样性的EST-SSR分析

为探讨白皮松群体间遗传变异规律,使用7对EST-SSR引物对分布区内21个白皮松天然群体的遗传多样性及遗传分化水平进行了研究。结果表明:7对引物在21个白皮松天然群体的663个单株中共检测到14个多态性位点。各群体间有效等位基因数(Ne)、Shannon’s信息指数(I)、观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、Nei’s期望杂合度(Nei’s)分别为1.156 5 1.601 9、0.133 5 0.492 5、0.138 4 0.397 3、0.0860 0.342 8、0.084 6 0.337 4。白皮松群体间遗传分化系数(Fst)平均为0.215 2,基因流(Nm)值平均为0.911 9,群体间基因交流总体较少,遗传分化较大。白皮松多样性水平在分布区内呈规律性变化,多样性分布的中心区域主要在西部、南部,具有从西向东,从南向北依次减少的趋势。     

美国山核桃群体遗传多样性的RAPD分析

运用随机扩增多态性DNA（RAPD）标记技术，采用Operon公司的10种随机引物，以采自美国东南部、北部、西部和我国江苏、浙江、湖北、湖南、云南等地的9个美国山核桃栽培群体45个单株的种子为材料，检测出多态位点42个。以这些多态位点为依据，计算了估测了多态性位点百分比、Shannon表型多样度指数、Virk群体内遗传距离和Nei氏群体间遗传距离，并用它们作为参数进行群体遗传多样性的RAPD分析。结果表明，参试的美国山核桃品种群体遗传变异明显，且群体间差异大于群体内差异，我国引种的群体遗传差异大于原产地美国的群体遗传差异。     

Small-scale genetic diversity in oneseed hawthorn (<Emphasis Type="Italic">Crataegus monogyna</Emphasis> Jacq.)

We have examined the pattern of random amplified polymorphic DNA (RAPD) variation among six populations of Crataegus monogyna from northern Italy, extending over an area of about 20,000 km². The aim was to evaluate local differentiation in relation to geographical distance. Of the 73 loci analysed, 65 were polymorphic, and there were no bands at complete fixation at the population level. The mean genetic diversity was 0.291, with the values for individual populations ranging between 0.252 and 0.333. According to the analysis of molecular variance most of the genetic variation was found within populations (about 80%), with a significant proportion being attributable to genetic differences between populations. No evidence for isolation by distance was found in the set of populations sampled. The efficacy of RAPD markers in analysing genetic variation, and the contribution of the results in terms of the preservation of biodiversity and defining the most appropriate strategies for collecting forest reproductive material, are discussed.     

天然蒙古栎群体遗传多样性的RAPD分析

蒙古栎 (ＱｕｅｒｃｕｓｍｏｎｇｏｌｉｃａＦｉｓｃｈ)为壳斗科、栎属植物 ,主要分布区包括中国的华北、东北、内蒙古东部 ,朝鲜半岛 ,俄罗斯远东和蒙古的连续分布区及日本桦太、北海道的间断分布区 (吴晓春 ,1 993)。蒙古栎是我国东北的典型植被类型———红松阔叶林的主要伴生树种之一 ,同时在红松林被干扰破坏后是形成次生阔叶林面积较大的主要树种 ,也是分布区超过北纬 45°的唯一栎属植物。近年来 ,蒙古栎的分布区和群体数量呈扩张趋势 ,其原因除人为干扰外 ,可能涉及气候变化、物种特性、种内遗传多样性、种间互作等等。对蒙古栎群体…