用基于Gibbs抽样的贝叶斯方法估计大白猪遗传评估中主选性状的遗传参数

用基于Gibbs抽样的贝叶斯方法估计了大白猪遗传评估中主选性状的遗传参数.结果为:达100 kg体重日龄的窝效应c2为0.182,遗传力为0.346,属于中等遗传力;100 kg体重校正背膘厚的窝效应c2为0.059,遗传力为0.479,属于高遗传力,后备猪达100 kg体重日龄的窝效应大于背膘厚的窝效应;达100 kg体重日龄与100 kg体重校正背膘厚的遗传相关系数为-0.249;大白母猪总产仔数的遗传力较低,为0.119.     

大白猪高繁母本新品系生长和繁殖性状的遗传趋势分析

配合混合模型,用多性状非求导约束最大似然法(Multiple traits derivative free restricted maximumlikelihood,MTDFREML)分析估计了大白猪高繁母本新品系生长和繁殖性状的表型与遗传趋势。结果表明,窝产仔数、窝产活仔数和达100 kg体重日龄性状的表型趋势分别为0.170、0.100和-2.072,遗传趋势分别为0.057 7、0.030 4和-0.658 0。说明大白猪品系选择试验的窝产仔数和达100 kg体重日龄2个主选性状的选择是明显有效的,繁殖性能在逐代提高,而且并未对肥育性能造成不利的影响。     

猪体重和体尺性状与繁殖性能间的相关

研究了母猪不同阶段的体重和6月龄体尺性状与繁殖性能间的关系,结果表明:母猪的体重、6月龄体尺性状与各繁殖性状的表型相关很小,只有6月龄体长与断奶头数的表型相关达显著水平。而各体重、体尺性状与繁殖性状间却存在很强的遗传相关,其中70日龄体重、4月龄体重、6月龄体重、6月龄体高、6月龄胸围、6月龄背膘厚与产仔数等繁殖性状呈负遗传相关,而6月龄体长与产仔数等繁殖性状是强的正遗传相关,这表明,腿短体长、体重适宜的母猪产仔多,繁殖性能好,应该留作种用。     

湘白Ⅰ系猪生长及繁殖性状相关选择效果研究

选取湖南省畜牧兽医研究所种猪场湘白Ⅰ系猪核心群1985～1989年度5个世代的数据资料,采用各性状表型值和育种值最小二乘均数对世代数的回归作为评估表型趋势和遗传趋势的方法,分析对生长速度的选择效果,以及对繁殖性状的相关选择反应。结果表明,正向选择湘白Ⅰ系猪断奶时及以后生长速度,其断奶前生长速度亦略有提高,对繁殖性状则基本没有影响.断奶体重和断奶前日增重的表型趋势分别为1.6kg 和27.65g/d,相应遗传趋势分别为0.59kg 和6.91g/d;产仔数、活仔数、初生窝重及断奶窝重的表型趋势分别为0.062头,0.101头,-0.144kg,7.034kg;相应遗传趋势为0.014头,0.016头,-0.02kg,0.492kg。     

用动物模型估计杜洛克猪生长和繁殖性状的遗传力及育种值

运用动物模型DFREML ,估测美系杜洛克猪的生长和繁殖性状的遗传力和育种值,结果表明,生长肥育性状日增重、饲料转化率、体重达10 0kg时日龄和体重10 0kg时背膘厚的遗传力估计值分别为0 .35 ,0 .2 6 ,0 .2 1和0 .38;繁殖性状窝产仔数、窝产活仔数、初生窝重、2 1日龄窝重的遗传力估计值分别为0 .13,0 .11,0 .15 ,0 .16。各性状的育种值均向有利于选择的方向发展。     

科苑荟萃

20050145用动物模型估计杜洛克猪生长和繁殖性状的遗传力及育种值(赵淑娟,王清义,庞有志)杜洛克猪是目前国际上公认的优秀终端父本,在我国猪的遗传改良及商品猪生产中所占据的地位越来越重要。估计育种值是种猪选育的主要依据,而育种值估计的准确性直接影响猪群的遗传进展。作者运用动物模型DFREM L,对美系杜洛克猪的生长肥育和繁殖性状的育种值进行了估计。结果表明,生长肥育性状日增重、饲料转化率、体重达100kg时背膘厚的遗传估计值分别为0.35、0.26、0.21、0.38;繁殖性状窝产仔数、窝产活仔数、初生窝重、21日龄窝重的遗传力估计值分…     

养殖密度对育肥大白猪体重校正日龄、体尺与背膘厚的影响

文章旨在比较不同饲养密度对大白猪达100kg体重校正日龄、主要体尺性状与背膘厚的影响。试验按体重相近、公、母比例相同的原则随机分为4组,饲养密度分别为0.6、0.7、0.8、0.9m^(2)/头,试验结束时测定其实际体重、背膘厚、体长、体高、胸围数据,通过遗传评估软件计算其达100kg体重校正日龄。试验结果表明,降低饲养密度会缩短大白猪达100kg体重校正日龄(P<0.01),随着饲养密度的减小,体长、体高数据有逐渐变小趋势,而胸围变化不明显。饲养密度对大白猪背膘厚影响未达到显著水平(P>0.05)。     

基于动物模型BLUP的杜洛克猪生长及繁殖性状选择进展

【目的】揭示基于动物模型最佳线性无偏预测(animal model best linear unbiased prediction,AM-BLUP)的选择指数对杜洛克猪生长及繁殖性状的选育效果。【方法】在采用AM-BLUP方法估计个体目标性状育种值基础上,以达100 kg体质量日龄(相对权重0.7)和100 kg活体背膘厚(相对权重0.3)为主选性状构建选择指数,对1个闭锁的杜洛克猪群开展持续7年(2013—2019年)的选育,系统分析选育期间猪群6个生长及繁殖性状表型值、估计育种值(estimated breeding value,EBV)、选择指数及近交系数的变化。【结果】相较于2013年,2019年猪群达100 kg体质量日龄、100 kg活体背膘厚和30～100 kg料重比分别极显著缩短4.45 d、降低0.52 mm和降低0.05 (P<0.01);初产和经产母猪的总产仔数分别提高0.99头(P<0.05)和1.02头(P>0.05),产活仔数分别提高0.72头和0.49头(P>0.05),21日龄窝重分别降低0.39 kg和提高6.20 kg (P&...     

应用动物模型BLUP方法估计猪个体育种值研究

利用华中农业大学养猪科学研究所的中国瘦肉猪新品系DⅣ系 1986～ 1992年期间测定资料 1747条、繁殖性能资料 5 2 0条和系谱资料 ,对日增重、背膘厚、边膘厚、总产仔数、产活仔数、初生窝重 6个性状进行了详细的遗传统计分析。用非求导的REML方法 (MTDFREML软件 )估计了这些性状的不同遗传模型条件下的遗传力及性状间的遗传相关系数和表型相关系数。用BLUP方法 (PEST软件 )估计这些性状的育种值 ,并计算遗传进展。日增重、背膘厚和边膘厚遗传力分别为 0 .41、0 .47和 0 .42 ,日增重和背膘厚两性状间表型相关和遗传相关分别为 0 .0 2和 - 0 .0 2 ,背膘厚和边膘厚遗传相关为 0 .99。而繁殖性状总产仔数、产活仔数、初生窝重的遗传力分别是 0 .0 9、0 .12和 0 .2 1。日增重、背膘厚、边膘厚、总产仔数、产活仔数、初生窝重遗传进展分别为 3g/d、- 0 .14mm、- 0 .13mm、0 .0 13头、0 .0 2头和 0 .0 3kg。中国瘦肉猪新品系DⅣ系采用群体继代选育法 ,经 6个世代的选育 ,主要性能指标均取得一定遗传进展     

长白猪群体生长性状的遗传参数及进展分析

【目的】对长白猪达 100 kg 体重日龄（DAYS_100）、达 100 kg 体重日增重（ADG_100）、达 100 kg 体重眼肌面积（LMA_100）和达 100 kg 体重背膘厚（BFT_100）4 个性状进行遗传参数估计,分析性状间 的相关性及遗传和表型进展,为目标群体的遗传改良提供依据。【方法】收集广西某种猪场核心育种群长白猪 2002—2020 年的生长性状测定记录,利用 R 软件对影响长白猪生长性状的因素进行固定效应分析,运用 DMU 软件和多性状动物模型估计 4 个性状的群体遗传参数,同时评估这些性状间的遗传相关和表型相关以及遗传进 展和表型进展。【结果】长白猪 DAYS_100、ADG_100、LMA_100 和 BFT_100 的估计遗传力分别为 0.399、0.391、 0.433 和 0.421,均属于中高遗传力。性状 DAYS_100 和 ADG_100 的遗传及表型相关呈极度负相关,相关系数分 别为 -0.997 和 -0.992。DAYS_100 表型趋势总体呈上升趋势,其余 3 个性状呈下降趋势;ADG_100 和 BFT_100 遗传趋势总体呈现上升趋势,DAYS_100 和 LMA_100 的遗传趋势总体呈现下降趋势。【结论】长白猪 4 个生长 性状均为中高遗传力性状,可通过直接选择加快遗传进展。DAYS_100 和 ADG_100 性状间的相关性较强。猪场 的表型测定管理及群体育种目标性状的选择对猪群生长性状的表现有影响。此外,养殖场生产管理水平的提高 和品种品系结构的变化也可能会影响遗传进展。     

松辽黑猪繁殖性状遗传规律的研究

对松辽黑猪繁殖性状的表型参数和遗传参数进行了分析研究,结果表明:乳头数14.11个,产仔数13.45头,产活仔数12.54头,初生窝重15.79kg,初生个体重1.37kg,断奶仔数10.04头,断奶窝重122.84kg,断奶个体重12.45kg。繁殖性状乳头数、产仔数、产活仔数、初生窝重、初生个体重、断奶仔数、断奶窝重和断奶个体重的遗传力分别为0.528,0.138,0.118,0.427,0.382,0.147,0.243,0.212。繁殖性状间的表型相关介于-0.481～0.901之间,遗传相关在-0.371～0.913之间。断奶窝重与所有繁殖性状间都存在着正的表型相关和遗传相关,因此断奶窝重可以作为松辽黑猪繁殖性状的重要选择指标。     

猪SLA-DQA一个新SNP的发现及其遗传效应的研究

 采用PCR-RFLP方法对新发现的一引起氨基酸改变的SNP位点(读码框第722位碱基)进行了检测，初步探讨了DQA基因作为影响经济性状候选基因的可能性。经在6个中国地方猪种及大白猪中PCR-RFLP检测，发现除小梅山和大白猪外，其它几个猪种均存在多态性,同时对6个地方猪种间的基因型频率的差异进行了χ2检验。在通城猪、长白猪、大白猪及其三元杂种猪长大通和达长通猪中检测了该位点的基因型，并运用GLM进行基因型与生长、胴体性状间关联分析，发现该SNP位点与平均背膘厚、6-7肋间背膘厚存在显著相关(P＜0.05)，与胸腰椎间背膘厚也接近显著性水平(P=0.06)，与内脂率、眼肌高、肌肉失水率亦存在显著相关(P＜0.05),但未发现与生长性状间的相关。     

利用动物模型BLUP对甘肃瘦肉型猪新品系繁殖性能的遗传研究

利用动物模型ＢＬＵＰ对甘肃瘦肉型猪新品系Ａ、Ｂ、Ｃ的繁殖性状的遗传分析,结果表明：３品系遗传力均属于低遗传力范围,各系遗传力已基本稳定。繁殖性状间的表型相关与遗传相关不仅在数值上有差异,有的甚至符号相反,说明表型相关与遗传相关之间存在很大的差异。繁殖性状与近交系数在世代进展中的相关系数由弱负相关向弱正相关转化。利用ＢＬＵＰ法对“八五”期间的产仔数性状作逆向再评定发现,Ａ、Ｂ、Ｃ３品系再在产仔数方面的选育是极其成功的。除Ａ品系活产仔数随世代的进展,遗传变异在加大之外,各系活产仔数和断奶窝重的遗传变异都在下降,性状趋向于稳定,只是在四世代稍有波动。从Ａ、Ｂ、Ｃ的遗传趋势来看,与品系的培育目标一致,从环境趋势来看,变化范围较大。因此,“八五”期间采取的选育措施是有效的,但各性状的遗传、环境走势不稳定,除了与饲养管理条件的控制有关外,选育措施的进一步改进和动物模型ＢＬＵＰ为主的工厂化养猪管理系统的引用是必需的。     

北京地区大白猪基因组联合育种研究

【目的】 利用基因组选择技术,进行北京地区大白猪基因组联合遗传评估,并实施基因组选择分子育种,预测刚出生的小公猪基因组估计育种值,提高选种准确性。【方法】 利用北京地区3家核心育种场英、美系大白猪2007-2017年场内性能测定记录,筛选4020头个体构建基因组选择混合参考群,性状包括达100kg体重日龄、100kg活体背膘厚和总产仔数,参考群个体和候选公猪个体基因型信息主要采用Illumina 80K SNP芯片进行测定。基因组育种值采用同时利用系谱信息和基因组信息的一步法（SSGBLUP）方法,对3家核心场猪只进行基因组联合遗传评估,分别在公猪去势前和性能测定结束时预测大白公猪生长性状和繁殖性状基因组估计育种值（GEBV）,并进行相应选种。3个场之间的场间遗传联系用关联率衡量。【结果】 场间关联率计算结果表明,由于遗传背景差异,北京地区3家核心场场间遗传联系偏低,无法开展传统联合遗传评估,但基于基因组信息的G矩阵亲缘关系结果显示,不同群体间个体存在亲缘关系,说明通过基因组选择可以实现3个育种场间的基因组联合遗传评估。基因组选择实施后,累计基因组预测大白公猪1789头。与传统育种方式相比,基因组选择准确性大幅提高。实施第一次基因组选择或早期选择时（公猪去势前）,达100 kg体重日龄、100 kg活体背膘厚和总产仔数系谱指数的准确性分别为0.55,0.56和0.41,而3个性状GEBV的准确性分别为0.65,0.70和0.60,提高了10、14和19个百分点。终选（性能测定结束）时,3个性状的传统育种值（EBV）准确性为0.70、0.72和0.41,GEBV准确性进一步提高至0.78、0.84和0.60,提高了8、12和19个百分点。低遗传力的总产仔数准确性提高幅度最大。公猪去势前初选时基因组选择准确性与常规性能测定结束时的常规育种值选择准确性几乎一致,表明基因组选择早期选种效果与常规育种相当,节省了育种时间和成本。338头完成性能测定的候选公猪两次基因组选择准确性表明,第二次基因组选择由于加入了候选公猪的测定信息,达100kg体重日龄和100kg活体背膘厚的GEBV准确性由第一次的0.55和0.62分别提高到0.72和0.84,提高了17和22个百分点。无偏性系数在0.82-1.00之间,两性状GEBV的无偏性由第一次基因组选择的0.82、0.96 分别提高到0.91、1.00,说明第二次估计的偏差更小,结果可信度更高,能更准确选出优秀的种公猪。【结论】 基因组选择可以建立场间遗传联系,实现常规育种不能进行的联合遗传评估,能够进行更大范围的联合育种。基因组选择的准确性高于传统的系谱指数和育种值选种,且低遗传力性状提高幅度最大。基因组选择能够实现早期选择,提高育种效益。     

Associations of Two Polymorphic Loci: A HinfⅠLocus of the Porcine Subunit C of Succinate Dehydrogenase Complex (SDHC) Gene and A MspⅠLocus of the Porcine Rod cGMP-Phosphodiesterase γ-Subunit (PDE6G) Gene

A Hinf I locus of the porcine subunit C of succinate dehydrogenase complex (SDHC) gene and a Msp I locus of the porcine rod cGMP-phosphodiesterase γ-subunit (PDE6G) gene had been reported before, but the association analysis between the different genotypes and the traits had not been done. 300 Large White × Meishan F2 pigs were used as experimental materials to performe the PCR-RFLP analysis and association analysis for the two loci, results revealed that the polymorphism of the porcine subunit C of succinate dehydrogenase complex (SDHC) gene was significantly associated with the traits which included the carcass length, the estimated lean meat percentage, the estimated backfat thickness at last rib, the estimated backfat thickness at last 3-4th rib, the fat meat weight, the fat meat percentage, the lean meat weight,the lean meat percentage, the ratio of lean meat to fat meat, the leaf fat weight, the backfat thickness at shoulder, the backfat thickness at thorax-Waist, the backfat thickness at 6-7th thorax and the average daily gain. Seven other traits, the meat color value (Biceps femoris, BF), the meat marbling (Biceps femoris, BF), the water moisture (Longissimus dorsi, LD),the bone weight, the bone percentage, the loin eye width and the loin eye area, were found to be significantly correlated with the polymorphism of the porcine rod cGMP-phosphodiesterase γ-subunit (PDE6G) gene. Based on these results, it is necessary to apply the two genes as candidate genes to marker assistant selection (MAS) in pig breeding.     

长期选择的杜洛克猪群体经济性状遗传参数及遗传进展分析

目的 对受长期选择的实际杜洛克猪育种群体3个重要经济性状进行遗传参数估计,分析各性状取得的遗传进展,并探讨实际育种群体中长期选择等因素对群体遗传参数的影响。方法 收集广西某种猪场核心育种群杜洛克猪2003—2018年共计15 760条生长性能测定记录。运用DMU软件的DMUAI模块和DMU4模块,利用多性状动物模型估计3个重要经济性状的群体遗传参数和个体育种值。并通过估计该群体的年度累计群体遗传参数以评估该群体在长期选择过程中遗传参数的变化情况。结果 杜洛克猪3个重要经济性状(达100 kg体质量日龄、背膘厚和眼肌面积)的估计遗传力分别为0.354、0.477和0.479,均属中高遗传力性状。3个性状间的遗传相关范围为-0.110~0.039,表型相关范围为-0.076~0.082,均属于弱相关。性状达100 kg体质量日龄在长期选择中取得了较大的遗传进展,而性状达100 kg体质量背膘厚和达100 kg体质量眼肌面积取得的遗传进展较小。分析年度累积群体估计的遗传参数发现,3个经济性状的加性遗传方差出现了不同程度的变化。结论 杜洛克猪群体3个重要经济性状均为中高遗传力性状且性状间相关性较弱。在实际育种群体中,长期选择及引种等因素会导致群体遗传参数发生变化,育种实践中应及时开展遗传参数估计,以获得准确的遗传评估结果,加速群体遗传改良。     

大白猪主要生长性状的遗传参数估计及育种中存在问题的探讨

【目的】分析温氏某育种场大白猪主要生长性状遗传参数,并探讨不同背膘测定方法的变化(从A超到B超)以及终测体质量的变化(从达100 kg体质量日龄到达115 kg体质量日龄)对育种的影响。【方法】利用DMU软件和单/多性状动物模型计算了达100 kg体质量日龄(AGE)和100 kg体质量背膘厚(BF)的加性方差和窝效应方差,计算各性状遗传力,并分别评估了在只有终测体质量100 kg左右(AGE-100)或只有B超(BF-B)情况下,2016年新测定个体估计育种值(EBV)与正常遗传评估EBV的泊松相关和秩相关。【结果】AGE和BF遗传力分别为0.21和0.41,窝效应分别为0.27和0.15,单/多性状模型基本保持一致;此外,在去除终测体质量115~130 kg内数据或A超测定数据的情况下,新终测个体EBV与正常情况计算EBV的泊松相关分别为0.96和0.94,秩相关分别为0.96和0.92,单/多性状模型基本保持一致。【结论】调整背膘测定方法比调整终测体质量对选种影响小,应该重新选择校正公式。     

妊娠期长短对大约克母猪繁殖性能的影响

对江西省某种猪场 2 0 0 0年 814窝大约克母猪随机抽取 2 0 0窝 ,应用了DPS数据处理系统软件 ,按妊娠期≤ 112d、113～ 115d、116～ 118d、≥ 119d分析大约克母猪的总产仔数、活产仔数、初生个体重、初生窝重、断奶个体数和断奶窝重等性状。结果表明 :随着妊娠期的延长总产仔数、活产仔数逐渐减少 (P >0 .0 5 ) ;初生个体重、初生窝重、断奶个体数、断奶个体重、断奶窝重呈增长的趋势。经相关分析 ,妊娠期与总产仔数、活产仔数呈弱的负相关 ,与初生窝重、断奶窝重、断奶个体数呈弱的正相关。     

RAPD标记遗传距离与猪杂种优势相关性的研究

【目的】探讨利用RAPD分子标记技术预测杂种优势的可能性。【方法】利用RAPD技术测定6个亲本群体间的遗传距离，对亲本群体间遗传距离与10个经济性状的杂种优势率进行相关性分析。【结果】亲本间遗传距离与日增重、料重比、屠宰率和平均背膘厚的杂种优势率呈正相关，与瘦肉率、瘦肥肉比、皮率、眼肌面积的杂种优势率呈负相关。并且遗传距离与料重比和眼肌面积杂种优势率的相关系数达到显著程度（P＜0.05），而与肥肉率、内脂率等性状杂种优势率的相关系数则非常小。【结论】亲本间的遗传距离与杂种优势的相关程度随不同性状而异。     

山西瘦肉型猪SD-Ⅱ系繁殖性状的表型和遗传参数估测

本文对山西瘦肉型猪SD—Ⅱ系繁殖性状的表型参数和遗传参数进行了研究 ,结果如下 :(1)繁殖性状存在负的母体效应 ,表型变化不稳定 (呈亲代高子代低 ,亲代低子代高的趋势 ) ,不适宜用表型选择进行选择 ;(2 )总产仔数、活产仔数、初生窝重、初生个体平均重、泌乳力、断奶窝重、断奶个体平均重、断奶头数、总乳头数的遗传力分别为 0 2 30、 0 2 42、 0 2 19、 0 2 5 7、 0 184、 0 12 8、 0 40 8、 0 419、 0 5 0 2 ,与国内文献报道结果相近 ,而高于国外文献报道结果。 (3)繁殖性状间的遗传相关都比较强 ,断奶头数与大多数繁殖性状的遗传相关呈显著或极显著的正相关 ,因此应作为繁殖性状的主选性状之一