光照对贵州黄鸡ONECUT1基因在不同产蛋期各组织中表达的影响

【目的】分析光照对蛋鸡不同组织和不同产蛋时期ONECUT1基因的差异表达，探讨该基因对鸡产蛋性能的影响，为深入开展光照对鸡繁殖性能分子机理的研究奠定基础。【方法】选取贵州黄鸡体重相近的10周龄母鸡216只，在半舍饲养殖条件下(舍饲+运动场)随机分为自然光照组和早晚各增光1 h组，140日龄、200日龄、480日龄屠宰各4只，采集垂体、下丘脑、视网膜、输卵管和卵巢等组织，利用qRT-PCR技术检测ONECUT1基因的差异表达。【结果】ONECUT1基因在肌肉组织中表达量最高，输卵管、卵巢次之，肝脏最低。在垂体、下丘脑和卵巢组织中，ONECUT 1基因在产蛋高峰期(200日龄)的表达量显著高于开产日期(140日龄)和产蛋后期(480日龄)。垂体组织中200日龄的增光组显著高于自然光照组，输卵管中140日龄的自然光照组显著低于增光组。【结论】ONECUT1基因的表达具有时空特性，并受光照调节，与鸡产蛋性能有关。     

茶花鸡FSHR基因多态性及其与产蛋性能的相关性研究

[目的]旨在探索FSHR基因多态性与茶花鸡产蛋性能的相关性,以期挖掘出影响茶花鸡产蛋的分子遗传标记。[方法]以茶花鸡为研究对象,采用测序技术来筛选FSHR基因SNPs位点,并与茶花鸡产蛋性能进行相关性分析,通过实时荧光定量PCR(RT-qPCR)技术探究FSHR基因在高、低产组间不同组织中的基因表达情况。[结果]在FSHR基因外显子1中发现了2个SNPs位点(g. 34847A→G和g. 35000C→T),均属于中度多态;关联分析显示:g. 35000C→T位点的TT型个体开产日龄显著高于CT型(P<0.05);CT型个体43周龄产蛋数显著高于CC型和TT型(P<0.05);FSHR基因在高产组卵巢和下丘脑中的表达量显著高于低产组(P<0.05),高产组和低产组中卵巢的表达量都显著高于下丘脑(P<0.05)。[结论]茶花鸡FSHR基因具有一定的多态性和组织表达差异,发现一些影响茶花鸡产蛋性能的潜在分子标记,为地方鸡产蛋性能分子机理及茶花鸡的选育提供了理论基础。     

鸡NCOA1基因发育性表达模式的研究

应用实时荧光定量PCR技术,以不同繁殖性能的母系(S3系)、父系(Y、F、D系)为研究对象,研究了鸡NCOA1基因不同发育时期在下丘脑、垂体、卵巢、肝脏和血液中的相对表达量及表达模式.结果表明,NCOA1基因在鸡性腺轴组织中高水平表达,NCOA1基因在组织中的表达量与鸡性腺发育和产蛋性能呈相似的变化规律.随着生长发育的...     

山麻鸭开产期和产蛋高峰期卵巢组织转录组分析

【目的】探明山麻鸭开产期和产蛋高峰期卵巢组织的转录组差异,丰富蛋鸭转录组数据信息。【方法】选取6份山麻鸭卵巢组织样品（开产期和产蛋高峰期各3份）,利用Illumina HiSeq^TM 2000进行高通量测序,构建山麻鸭开产期和产蛋高峰期卵巢组织转录组文库,并用测序评估、基因功能注释等生物信息学方法进行分析。【结果】经过测序获得质量不低于20的碱基比例（Q20）均高于93%;开产期获得了43 489 798条reads,4 380 847 061 bp数据量;高峰期获得了42 782 676条reads,4 307 499 083 bp数据量;分别有70.92%和72.70%的reads能比对到鸭参考基因组序列上。对开产期与产蛋高峰期转录组进行比较,发现开产期有26 808个表达基因,产蛋高峰期有27 013个表达基因,与开产期为参考,在高峰期卵巢组织中共获得1 929个差异表达基因,其中上调基因989个,下调基因940个;进一步将这些差异基因在Nr数据库进行注释,发现获得注释的基因有1 423个,其中上调基因695个,下调基因728个;COG功能注释分析发现这些差异表达基因共获得663个功能注释,涉及25个功能分类;GO 功能注释分析表明,有1 122个基因获得GO 功能注释,可以分为61个功能分类,这些分类主要涉及到分子绑定、催化活性、细胞过程、生物调节等诸多生理生化过程,其中涉及到发育繁殖生物学过程的相关注释基因有406个;KEGG分析发现共有425个基因注释到160个代谢通路中,其中GnRH信号通路、GPI-anchor生物合成、TGF-β信号通路、核糖体生物合成等通路显著富集。GnRH信号通路和TGF-β信号通路在卵巢的生理生殖活动发挥了重要作用,而GPI-anchor生物合成和核糖体生物合成,这两类代谢通路在卵巢生理生殖活动的作用尚不明确。【结论】利用高通量测序技术对山麻鸭开产期和产蛋高峰期卵巢组织的转录组进行测序和分析,揭示了山麻鸭不同生理状态下卵巢组织差异表达基因的数量,获得了差异表达基因的功能、分类和代谢通路。为丰富蛋鸭卵巢组织转录组信息,为开展蛋鸭产蛋性状相关基因的研究及分子调控机制研究奠定基础。     

鸡成纤维细胞生长因子家族生物信息学特性及表达调控

【目的】探索鸡成纤维细胞生长因子(fibroblast growth factor, FGF)家族的生物学特性及表达调控，为进一步研究FGF家族相关成员的生物学功能奠定基础。【方法】利用在线软件对鸡FGF家族19个成员的生物信息学特性进行系统分析；利用实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)技术对鸡FGF家族成员的组织时空表达特性及雌激素对FGF19和FGF23基因表达的影响进行分析；利用主成分分析对鸡FGF家族基因的遗传变异及其对不同鸡品种形成的贡献进行分析；采用混合线性模型对FGF19基因上的遗传变异与固始鸡不同阶段产蛋量进行关联分析。【结果】鸡FGF家族各成员均有1个相同的保守基序和FGF结构域。鸡FGF家族19个成员聚类在3个分支上。主成分分析显示，鸡FGF家族有助于蛋鸡和肉鸡品种分类。鸡FGF家族各成员在肝脏、肾脏、十二指肠、卵巢和腹脂器官中均有表达。FGF19基因在产蛋高峰期(30周龄)的卢氏鸡肝脏的表达水平显著高于产蛋前期(20周龄),而FGF23基因的表达水平无显著变化。雌激素可显著下调鸡肝脏FGF23基因的表达，显著上...     

鸡白痢沙门氏菌感染对雏鸡脾脏miRNA表达谱的影响

【目的】鉴定感染鸡白痢沙门氏菌后雏鸡脾脏差异表达的miRNA，为阐明miRNA在鸡白痢沙门氏菌感染中的调控机制提供理论基础。【方法】采集感染和未感染鸡白痢沙门氏菌的SPF雏鸡脾脏，提取脾脏RNA，构建6个miRNA文库；利用Illumina Hiseq 2500测序技术和生物信息学分析筛选差异表达miRNA，通过TargetScan和miRanda算法预测差异表达miRNA的靶基因，并进行GO功能富集和KEGG通路富集分析，最后利用RT-qPCR方法验证测序结果。【结果】鉴定到29个差异表达miRNAs，其中15个显著上调、14个显著下调。GO分析表明：脂多糖介导的信号通路正调控以及NIK/NF-κB介导的信号通路负调控等免疫相关生物学过程显著富集；KEGG分析显示：差异表达的miRNA主要参与溶酶体和内吞作用等免疫相关通路。高通量测序结果与RT-qPCR结果一致。【结论】成功鉴定到鸡白痢沙门氏菌感染雏鸡脾脏miRNA表达谱，获得29个鸡白痢沙门氏菌感染潜在相关miRNAs。     

利用数字基因表达谱对鸡卵泡发育相关基因的筛选

为筛选禽类卵泡募集、等级化维持及排卵过程中的关键基因,通过数字基因表达谱检测鸡卵巢内等级前小白卵泡（SWF）和发育到最大期的等级卵泡（F1）中的差异表达基因。结果显示,随着卵泡的成熟,显著上调表达的基因有784个,显著下调的基因有1526个。基因表达差异倍数达到5倍以上的上调基因包括 PTGS1、TEK、VEGF A 、MMP 3、CDK1等;下调基因包括β cate-nin 、ZO 1、Nectin 3、PTPX15、Gadd45等。对差异表达基因进行基因本体（GO）生物学分析和信号通路显著富集分析发现,差异表达的基因所编码的蛋白主要参与生物学催化反应、分子连接、转移酶活性、水解等生物学过程;主要与细胞黏合通路、p53信号通路、蛋白合成通路及细胞周期通路等信号通路有关。对卵泡发育过程中的基质金属蛋白酶家族（MMPs）的 MMP 3与 MMP 9基因表达变化进行测定发现,MMP 3基因表达量在卵泡发育过程中显著升高,排卵后的卵泡中显著下降;MMP 9基因表达量则持续显著升高,在排卵后第2天的卵泡中下降,但下降不明显。     

鸡OVR基因PCR-RFLP检测及其与产蛋性能相关性的研究

[目的]提高鸡的产蛋性能和育种效率。[方法]利用一个已知的鸡OVR基因PCR-RFLP位点,对乌骨鸡、土乌鸡、青脚麻鸡3个群体进行鸡OVR基因PCR-RFLP位点多态性检测,并且分析该RFLPS与一定时期内产蛋数和产蛋总重的关系。[结果]结果表明,在上述群体中均存在RFLPS;不同基因型间的产蛋数、产蛋总重差异不明显。[结论]RFLP广泛存在于不同类型鸡的群体中。但该研究样本量小,观察时间短,因此需扩大样本,延长观察时间,进行更进一步的研究。     

鸡let-7b在不同生长时期及不同组织中的表达及其生物信息学分析与靶基因预测

为探究let-7b在鸡不同生长时期和不同组织中的表达规律及生物信息学特点,以苏禽3号肉鸡为试验材料,检测鸡let-7b在不同时期和不同组织中的表达变化,通过生物信息学工具对常见脊椎动物的let-7b序列特点及基因组定位进行分析,构建系统进化树,并对靶基因进行预测。结果表明,在鸡大脑、心、胸肌和腿肌中,let-7b的相对表达量较高,且90日龄相对表达量显著高于3日龄。let-7b位于1号染色体基因间隔区,不同物种let-7b的成熟序列同源性较高,进化树分析结果表明,鸡let-7b与鸟类聚为一类。靶基因预测分析共获得263个靶基因,对获得的靶基因进行基因本体(GO)功能富集分析,发现靶基因主要富集到蛋白质泛素化、miRNA介导的翻译抑制和mRNA 3′-非翻译区(3′-UTR)结合等方面。KEGG通路分析发现,靶基因主要富集到丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)、转化生长因子β(TGF-β)通路和卵母细胞减数分裂等通路。总之,鸡let-7b在组织中广泛表达,物种间较为保守;结合靶基因富集分析结果,推测let-7b可能通过靶向MAPK和TGF-β等信号通路参与调控鸡肌肉生长及细胞增殖分化。     

FoxO3转录因子在鸡卵巢组织中的表达鉴定

[目的]明确FoxO3转录因子在不同日龄鸡卵巢组织中的表达模式及其具体定位情况,为后续开展家禽卵泡激活及发育调控等相关机理研究提供科学依据.[方法]在GenBank中搜索鸡与其他物种(鸭、鹅、老鼠、猪、牛及人类)的FoxO3氨基酸序列,通过LaserGene分析鸡FoxO3氨基酸序列与其他物种FoxO3氨基酸序列间的亲缘关系及同源差异情况;利用RT-PCR鉴定FoxO3基因是否在鸡卵巢组织中表达,再采用实时荧光定量PCR检测不同发育阶段鸡卵巢组织中FoxO3基因的表达水平,最后以免疫荧光检测FoxO3蛋白在鸡卵巢组织中的定位情况.[结果]鸡与鸭和鹅的FoxO3氨基酸序列相似性分别为92.7%和95.3%,基于FoxO3氨基酸序列相似性构建的系统发育进化树也显示鸡与鸭和鹅的亲缘关系较近,说明FoxO3基因的进化相对较保守.在不同发育阶段的鸡卵巢组织中均能检测到FoxO3基因表达,且FoxO3基因在0日龄鸡卵巢组织中的相对表达量最高,显著高于在其他发育阶段的相对表达量(P<0.05).在0日龄鸡卵巢组织中未检测到FoxO3蛋白,但在21日龄和成年鸡的卵巢组织中均能检测到FoxO3蛋白;在21日龄鸡卵巢组织中FoxO3蛋白主要定位在原始卵泡细胞周围,在卵泡内部没有表达;而在成年鸡卵巢组织中FoxO3蛋白仅定位于大卵泡细胞边缘,小卵泡细胞内并未发现FoxO3蛋白.[结论]由于鸡和哺乳动物的FoxO3氨基酸序列高度同源,且FoxO3蛋白在鸡卵巢组织中的定位与在哺乳动物卵巢组织中的定位相似,说明FoxO3在鸡卵巢组织中发挥着与哺乳动物相似的功能,即在卵泡激活与成熟过程中发挥重要作用,因此通过调控FoxO3能有效提高鸡的繁殖性能.     

不同饲养方式对蛋鸭产蛋性能的影响及其机制

旨在探讨单笼饲养、双笼饲养、散养和网上平养四种养殖模式对蛋鸭（Anas platyrhynchos）产蛋性能的影响及其影响机制。191羽优质蛋鸭品种山麻鸭被分成单笼、双笼、网上平养、散养四组,记录其产蛋率和日耗料量,研究不同饲养模式对产蛋性能的影响。同时,应用real-time PCR技术检测在不同养殖模式下山麻鸭下丘脑、垂体、卵巢、肾上腺等组织中产蛋相关基因的表达,筛选出其中差异表达基因。结果表明,双笼饲养的山麻鸭产蛋性能和饲料转化率最低,单笼饲养的产蛋性能最佳。产蛋相关基因差异表达检测发现,在不同饲养模式下,促肾上腺激素释放激素（corticotropin-releasing hormone, CRH）基因在下丘脑和垂体组织中,阿黑皮素原（proopiomelanocortin, POMC）基因在垂体组织中的表达无显著差异。在双笼饲养模式下,黑素皮质素受体（melanocortin 2 receptor, MC2R）基因在山麻鸭垂体中的表达量最高,催乳素受体（prolactin receptor, PRLR）基因在卵巢中表达量最高,而骨形态发生蛋白4（bone morphogenetic proteins 4,BMP4）基因在卵巢中表达量最低。结果提示,（1）双笼饲养会导致蛋鸭的产蛋性能下降; （2）双笼饲养的蛋鸭可能长期处于应激状态,诱使垂体中MC2R基因高表达,进而调控HPA轴激素分泌,抑制HPG轴的活性,使得卵巢中的PRLR及BMP4等产蛋相关基因异常表达,两个信号通路交互作用,最终影响了蛋鸭的产蛋性能。     

矮小型鸡与三黄胡须鸡配套利用研究初报

利用矮小型基因鸡与三黄胡须鸡进行配套，观测并比较各组合Ｆ１代种鸡的产蛋性能，耗料量，以及Ｆ２代肉鸡的体型外貌，生长速度，屠宰性状等指标，根据Ｆ１、Ｆ２代的综合生产性能，筛选出生产性能和商品价值较高的配套模式，对三黄胡须鸡进行改良利用，另外还对三黄胡须鸡的现状及进一步的配套利用进行了探讨。     

固始鸡与矮脚鸡/瑶鸡的杂交对后代鸡冠发育及性成熟的影响

分析比较了固始鸡(GG:G♂×G♀)及其杂交组合YG:Y♂×G♀、GA:G♂×A♀鸡冠的发育以及产蛋的情况。试验以同日龄、相同饲养条件下的固始鸡及其杂交组合为试验材料,记录鸡冠的发育以及鸡群初期产蛋情况,并在120日龄时称重后进行屠宰,取出卵巢/睾丸进行称重。综合冠高和冠厚,在整个发育过程中鸡冠的发育表现为YGGAGG;GA公鸡的睾丸发育较早,其次YG,而固始鸡大部分公鸡发育都较晚;大多数YG母鸡的卵巢发育较早,GA只有少数发育较早,固始鸡母鸡的发育最晚。另外,YG、GA和GG产第一枚蛋的时间分别为104、108、119日龄,宰前1周的产蛋率也表现为YGGAGG。研究结果表明杂交组合GA和YG的性成熟在一定程度上比固始鸡纯系GG早。     

鸡YAP1基因在不同生长发育时期卵泡中的时空表达分析

为探讨YAP1基因在鸡卵泡生长发育中的调控作用,以150 d海兰褐蛋鸡为供试材料,采用相对定量RT-PCR方法对YAP1基因在鸡卵巢组织不同发育时期卵泡中的mRNA转录水平进行检测分析,并用免疫组织化学方法对YAP1蛋白质分子在鸡前等级卵泡中的时空表达模式进行蛋白定位分析。结果表明:鸡YAP1基因mRNA在卵巢间质、前等级卵泡和不同等级化的卵泡中均有表达,但在不同等级的卵泡中表达差异不显著(P0.05),呈现出组成型表达的特点。鸡YAP1蛋白质分子主要在卵巢间质组织、前等级卵泡卵母细胞和颗粒细胞中有表达,但在膜层细胞中未检测到其表达信号。此结果表明,YAP1分子可能主要以自分泌或旁分泌的方式在前等级卵泡的生长发育过程中发挥着重要调节作用。     

鸡卵巢组织SSH cDNA文库构建及差异表达基因筛选与初步鉴定

为分离与鸡产蛋性能密切相关的重要基因或调控因子，利用抑制性消减杂交技术，以高产蛋鸡品种海兰褐商品代蛋鸡和产蛋量相对较低的地方鸡品种大骨鸡20周龄时的卵巢组织为试验材料，构建消减cDNA文库。文库的插入片段集中在500bp左右，挑取720个克隆进行PCR筛选，获得657个阳性克隆，经过点杂交筛选后选择了536个阳性克隆，...     

宫廷黄鸡体尺、屠宰性能及蛋品质分析

本试验旨在揭示宫廷黄鸡体尺与屠宰性能的性别差异性、各项指标间的相关性,以及宫廷黄鸡与其他品种鸡的蛋品质差异性。参照中国家禽体尺、屠宰性能和蛋品质测定标准,随机选择30只300日龄宫廷黄鸡和60个鸡蛋,对其进行体尺、屠宰性能和蛋品质测定与分析。结果表明,宫廷黄鸡体尺与屠宰性能均呈性别显著或极显著差异;宫廷黄鸡体尺与屠宰性能各项指标间存在极显著相关性,且相关系数均比较高;不同品种蛋品质性状间比较发现,宫廷黄鸡在蛋重和蛋壳厚度有一定的优势。     

鸡FSHβ亚基研究进展

产蛋性能是鸡的重要经济性状,而FSHβ基因与鸡的繁殖有密切关系。从基因结构、生物学功能、多态性及其与经济性状的关系方面阐述FSHβ基因的研究进展。     

贵妃鸡的蛋用性能研究

贵妃鸡作为珍禽从欧洲引入我国后,除作为独立珍禽品种外,还参与鸡合成系和配套系的育种。本研究测定了经过4个世代闭锁群选育后笼养贵妃鸡的产蛋性能,统计了19—90周龄存栏母鸡的存活率和产蛋率,检测了36周龄和90周龄的蛋品质,分4批次进行了46—56周龄时的种蛋孵化。结果表明:72周龄入舍鸡产蛋量176.8个,存栏鸡产蛋量187.2个,90周龄入舍鸡产蛋量213.3个,存栏鸡产蛋量228.3个。36周龄贵妃鸡与90周龄相比蛋重差异极显著,蛋壳强度差异极显著,蛋白高度、哈氏单位、蛋壳厚度、蛋黄颜色等差异不显著。50周龄时贵妃鸡种蛋保存10 d的入孵蛋孵化率74.3%,种蛋保存30 d的入孵蛋孵化率63.6%。贵妃鸡笼养性能稳定,具有较强的抗应激能力,产蛋性能、鸡蛋品质和孵化性能有进一步提高的潜能。     

钙结合蛋白d28k基因在鸡子宫中表达变化的研究

[目的]研究鸡子宫中钙结合蛋白d28k基因的变化规律。[方法]采集不同产蛋阶段蛋鸡的子宫组织，利用RT-PCR方法检测钙告合蛋白d28kmRNA在子宫的表达情况。[结果]蛋进入子宫前2、1h检测到钙结合蛋白d28k的表达，随着蛋壳的形成和钙化程度的慨龟。蛋进入子宫后5、15h钙结合蛋白d28k的表达量逐渐增加，在蛋进入子宫后15h达到最高水平，在产蛋后1、2h没有检测到该基因的表达。[结论]钙结合蛋白d28k是影响蛋壳钙化的重要基因。     

四园牧鸡养殖要点

家禽的祖先是红原鸡，它们的自然习性是生活在树林和灌木丛中，利用四园（桑园、茶园、果园、庭园）牧鸡，正是适应了鸡的本能。放牧鸡活动自由，采食营养较全，体质健壮，抗病力强，有利于生产出安全、营养、保健的优质鸡和优质蛋，其鸡肉品质要远远优于舍饲笼养鸡，而且投资少，省力又省工，粪便还可肥田，实现了生态环境和经济效益的双丰收。