6个玉米人工合成群体的育种潜势分析

 【目的】系统评价6个玉米人工合成群体的育种潜势，为进一步改良利用提供合理方案。【方法】采用群体性状表型鉴定、配合力测定以及SSR标记对群体进行综合分析。【结果】多数性状与季节互作不明显，群体间多数性状差异极显著。多数农艺、经济性状的GCA群体间存在显著或极显著差异，少数经济性状的SCA组合间存在显著或极显著差异。26对SSR引物在供试群体内共扩增出246个等位位点。多态性位点数、多态位点比例、基因杂合度以及遗传距离等分析表明，除群体P1外，各群体遗传重组比较充分，群体内具有较丰富的遗传变异，且群体间遗传距离大于群体内遗传距离。【结论】群体P4、P2和P7除自身遗传变异较为丰富外，主要经济性状GCA较高，优于对照高产组合出现次数较多，育种潜力较大。群体P1、P3和P5 经济性状GCA低，优于对照高产组合出现次数相对较少，需进行必要的改良。     

四川及重庆玉米地方品种遗传多样性的比较分析

利用微卫星(SSR)标记技术对分别来自四川和重庆的各15个玉米地方品种群体进行了遗传多样性分析.42对SSR引物在供试玉米品种中分别检测到多态性位点数256和248个,其位点数平均分别为6.1和5.9个,平均多态信息量分别为0.76和0.73.根据遗传相似系数矩阵作出的树状图,分别将四川和重庆的品种群体划分成4类和3类,四川品种群体间的遗传相似系数低于重庆,表明了前者较高的遗传分化程度.群体内遗传多样性和遗传结构分析结果表明,四川玉米地方品种的遗传多样性高于重庆;四川和重庆玉米地方品种群体的遗传结构均偏离了Hardy-Weinberg平衡;品种群体的遗传变异均以群体内遗传变异为主.SSR分子标记的遗传多样性分析不仅揭示出四川和重庆玉米地方品种丰富的遗传多样性,而且对其保护和利用提供了重要理论依据.     

峨眉蔷薇居群遗传多样性的SSR分析

以收集的11个峨眉蔷薇群体的88份样本为研究对象,利用SSR技术分析其群体水平遗传多样性.88份样本的多态位点百分率、Nei氏基因多样性指数(H)和Shannon信息指数(I)分别为90.48％、0.196 0和0.316 6.比较11个群体的遗传多样性指标,种质间遗传变异44.73％,种质内遗传变异55.27％.东环线的遗传多样性最高(H=0.137 7,I=0.206 8,多态位点百分率为38.78％).聚类分析结果显示,11个群体可聚为4支.群体间遗传分化系数(Gst)和基因流(Nm)分别为0.447 3和0.617 9,表明峨眉蔷薇基因分化明显,各群体间基因交流受阻.     

不同种源蒙古栎遗传变异

分析蒙古栎EST序列和叶绿体全基因组SSR位点信息,开发SSR引物,对蒙古栎群体遗传变异进行分析,为蒙古栎分子标记辅助育种奠定基础。利用est-trimmer、CAP3对蒙古栎EST序列处理,通过perl结合MISA、Primer3和Electronic PCR查找SSR位点,设计引物并筛选验证。EST序列中发现SSR位点163个,主要重复类型为二核苷酸。叶绿体基因组上88个SSR位点以单核苷酸重复为主。7对引物共检测到37对等位基因,平均等位基因数（N_a）=5.286,Shannon’s信息指数（I）=1.291,期望杂合度（H_e）=0.622,多态性信息含量(P_IC)=0.692;群体间遗传分化系数(F_st)=0.147,基因流（N_m）=1.933;AMOVA分析表明,种源间遗传变异占10.216%。蒙古栎种源群体间存在中等水平的遗传分化,其遗传变异主要来源于种源内,且种源间的遗传变异与地理距离无显著相关性。基于EST序列及叶绿体基因组SSR位点信息,有效开发SSR引物,为...     

凡纳滨对虾连续3个世代选育群体的遗传多样性分析

[目的]明确凡纳滨对虾连续3个世代选育群体的遗传变异情况及近亲繁殖对个体生长速度和抗病性的影响,为凡纳滨对虾种质改良提供理论依据.[方法]从GenBank收录的微卫星(SSR)引物序列中筛选11对能有效扩增的SSR引物,对2016—2018年桂海1号凡纳滨对虾连续3个世代选育群体(合计853个样品)进行遗传多样性分析,监测相邻2个世代选育群体间的遗传变异情况.[结果]11对SSR引物在凡纳滨对虾连续3个世代选育群体中共检测到103个等位基因,各SSR位点的等位基因数(Na)平均为9.3636个,有效等位基因数(Ne)平均为3.8355个,观测杂合度(Ho)平均为0.4794,期望杂合度(He)平均为0.7074,多态信息含量(PIC)平均为0.6708;除TUMXLv10.33位点呈中度多态性(0.250.50);对应的平均Na为8.7272、7.3636和8.0000个,平均Ne为3.8676、3.7654和3.8010个,平均Ho为0.3975、0.5224和0.4876,平均He为0.7057、0.7057和0.7029.Hardy-Weinberg平衡检测结果显示,绝大部分SSR位点偏离Hardy-Weinberg平衡.凡纳滨对虾连续3个世代选育群体在11个SSR位点上的遗传分化系数(Fst)均小于0.0500,即凡纳滨对虾群体的遗传分化很小;凡纳滨对虾群体内近交系数(Fis)介于-0.0101~0.8098,平均为0.3543,且除C11654位点为负值外,其余SSR位点均为正值,表明凡纳滨对虾连续3个世代选育群体的近交程度较高.分子方差分析(AMOVA)结果显示,69.78%的遗传变异来源于凡纳滨对虾个体内,而29.96%的变异来源于凡纳滨对虾个体间.[结论]桂海1号凡纳滨对虾各世代选育群体尚具有较丰富的遗传变异,但群体遗传结构处于不稳定状态.因此,今后应通过人工选育方式保留有利突变、淘汰有害突变,同时避免近亲繁殖,或引进优质品种进行杂交以扩充基因库,保护凡纳滨对虾的遗传多样性,防止种质退化.     

广西地方玉米种质和加拿大群体的遗传多样性分析

 【目的】分析45份广西地方玉米品种和15份加拿大改良群体的遗传多样性,为更好地利用地方品种拓宽广西玉米种质的遗传基础提供理论依据。【方法】采用混合取样法（每个群体中随机提取4个混合样本,每个样本包括10个单株）和SSR分子标记技术进行研究。【结果】70对SSR引物在60个群体的240份样本中扩增出245条等位基因,每对引物检测出的等位基因数目为2～6条,平均每个位点3.5条。加拿大的15份群体和广西的45份地方品种分别聚为二大类群。加拿大的15份群体又可以分为硬粒型和马齿型两个亚群。在45份广西地方种质中,同样可以分为硬粒型和马齿型两个亚群;糯玉米没有单独聚类,而是分散在硬粒型类群当中。【结论】广西亚热带种质比温带的加拿大种质具有更大的遗传变异,研究这些材料的遗传多样性可更好地扩增广西玉米种质的遗传基础,对玉米育种中发现潜在突破性种质可能会起到一定的作用。     

玉米温-热种质杂交后代选系遗传结构的SSR标记分析

利用SSR标记技术,对温热种质5003×A19杂交F6、F7后代性状基本稳定的22个选系遗传结构进行了初步研究。从88对SSR引物中,筛选出48对表现多态性丰富、带型清晰明显且稳定的引物,分析了22个选系的遗传多样性及遗传结构,并对其应用前景进行了探讨。根据SSR标记结果,用UPG-MA法进行聚类分析表明,双亲及其杂交后代全部选系与标准测验种478、B73属于同一个杂种优势群-PA群,玉米温热种质杂交后代选系虽然出现了丰富的遗传变异,但在类群划分上仍然保持双亲的基本类群特征。从基于SSR分子标记的各选系遗传组成分析,温带种质(5003)遗传背景明显高于热带种质(A19),在各选系中温带种质5003遗传背景平均含量为64.03%、A19遗传背景平均含量为30.03%、非双亲遗传背景平均含量为5.94%;SSR标记分析显示,在温-热带种质杂交后代的多数选系中均出现新的等位基因,且通过多代选择仍是有效的,说明温热种质杂交群体有广泛的遗传变异基础,是玉米种质扩增、改良的有效途径。     

基于SSR标记构建西南玉米地方品种核心种质的方法

结合地方品种的地理起源和种质特性,以17%的抽样率选取玉米核心品种,用SSR分子标记技术对54个玉米地方品种进行遗传聚类,研究中国西南地区玉米地方品种核心种质的构建方法.结果表明,由9个核心品种构成的核心种质较好地保持了原玉米地方品种群体的遗传变异,42对SSR引物在原玉米地方品种群体和核心种质中分别检测到268、256个等位基因,平均多态信息量分别为0.76和0.73,其评价参数平均数百分率、方差百分率和变异系数可变率分别为10%、10%、83.5%,表明构建的核心种质能较好地代表原种质资源群体.     

油料树种千年桐的SSR标记开发、遗传多样性与群体结构分析

  目的  千年桐是大戟科油桐属的一种重要的工业油料树种，较同属的油桐具有更强的抗枯萎病能力，近年来受到了广泛关注。然而，因千年桐栽培历史短及种质管理的不足，目前对其分子遗传方面的研究还非常有限。本研究旨在开发千年桐的基因组SSR标记，进而开展其种质的鉴定、遗传多样性与群体结构分析。  方法  采用RAD测序技术获得千年桐简化基因组以开发SSR标记，基于SSR标记利用分子变异分析（AMOVA）、非加权组平均法（UPGMA）聚类、主坐标（PCoA）与群体结构分析等方法对来自3个不同地理分布的共105份千年桐种质资源进行研究。  结果  17个多态性的三核苷酸基因组SSR标记被开发，并能够很好地鉴别所有收集的105份千年桐种质。在其中62份种质中检测到85个私有等位基因，涉及15个SSR位点。AMOVA分析发现，千年桐群体间呈现出中等程度的遗传分化，但群体内的遗传变异远高于群体间的遗传变异。群体结构分析显示，3个来自不同地理分布的千年桐群体中存在4个不同的基因库，群体间既有进化独立性，又有较高程度的遗传混合，这一结果与UPGMA和PCoA分析的结果基本一致。  结论  新开发的17个SSR标记有效鉴定了105份千年桐种质，揭示了其遗传多样性和群体遗传结构，对千年桐种质保存和育种计划具有非常重要的参考价值。      

利用SSR分子标记分析三峡库区玉米地方品种的遗传关系

利用微卫星(SSR)标记技术和DNA混合取样方法, 检测了来自三峡库区15个玉米地方品种的遗传多样性. 42对SSR引物在15个玉米地方品种群体中共检测到248个多态性条带, 每个位点的等位基因数为2～14个, 平均5.9个; 多态信息量0.28～0.81, 平均为0.73; 根据遗传相似系数矩阵做出的树状图, 将15个玉米地方品种划分成3类, 所有玉米地方品种间的遗传相似系数均在0.42以上. 从15个玉米地方品种中选出5个, 每个品种选取15个单株, 共75个DNA单株样品, 分析玉米地方品种群体的遗传结构. 42对相同的SSR引物在5个玉米地方品种中检测到有效等位基因数Ae=3.40, 平均期望杂合度He=0.67. 遗传结构分析结果表明, 玉米地方品种群体间及群体内的遗传结构均偏离了Hardy-Weinberg平衡; 品种群体内和群体间的遗传变异分别占总变异的92%和8%.     

Structure of Allozymatic Diversity of Ten Temperate and Adapted Exotic Breeding Populations of Maize (Zea mays L.)

Ten temperate and adapted exotic breeding populations of maize were studied with electrophoretic techniques. Three isozyme systems coded by nine allozyme loci were used for evaluating the genetic variability within and among populations.The results revealed that 78.57% of allozyme loci were polymorphic. Low allelic variation with a mean number of 1.84 alleles per locus per population was detected. But, these populations still maintained higher level of heterozygosity;moreover, the exotic populations had greater gene diversity than the temperate populations. All the populations were non-panmictic with negative Wright's fixation indexes (-0.091- -0.424). The tropical BS16 was typified by maximum allelic richness, percent of polymorphic loci and heterozygosity. More than 93% of the gene diversity maintained within populations, and the genetic differentiation among populations was low (0.002-0.191). Multivariate analysis demonstrated that the tropical BS29 diverged from other populations in the reverse direction. The temperate BS9 and tropical BS 16 were divergent each other, and highly differentiated from other temperate and tropical populations, consequently, these two populations would be analogically postulated as potential germplasms to establish new heterotic groups for temperate maize breeding programs.     

Structure of AIIozymatic Diversity of Ten Temperate and Adapted Exotic Breeding Populations of Maize （Zea mays L.）

Ten temperate and adapted exotic breeding populations of maize were studied with electrophoretic techniques. Three isozyme systems coded by nine allozyme loci were used for evaluating the genetic variability within and among populations. The results revealed that 78.57% of allozyme loci were polymorphic. Low allelic variation with a mean number of 1.84 alleles per locus per population was detected. But, these populations still maintained higher level of heterozygosity; moreover, the exotic populations had greater gene diversity than the temperate populations. All the populations were non-panmictic with negative Wright＇s fixation indexes （-0.091— -0.424）. The tropical BS 16 was typified by maximum allelic richness, percent of polymorphic loci and heterozygosity. More than 93% of the gene diversity maintained within populations, and the genetic differentiation among populations was low （0.002—0.191）. Multivariate analysis demonstrated that the tropical BS29 diverged from other populations in the reverse direction. The temperate BS9 and tropical BS16 were divergent each other, and highly differentiated from other temperate and tropical populations, consequently, these two populations would be analogically postulated as potential germplasms to establish new heterotic groups for temperate maize breeding programs.     

浙江省柑橘胶孢炭疽菌遗传多样性的ISSR分析

为了解柑橘炭疽病菌的种内遗传多样性,从32条ISSR引物中筛选出多态性好、条带清晰的5条引物,对28株炭疽病菌株进行ISSR-PCR扩增.结果显示:5条引物共扩增出43个条带,多态性条带41个,多态性比例为95.34%,说明柑橘炭疽病菌种内遗传多样性丰富.利用NTSYS软件分析并构建UPGMA聚类图,当相似系数为0.73时,28株菌可以分为5个类群,不同菌株间遗传变异较大,遗传变异与地域来源无显著的相关性.     

中国美国白蛾种群遗传多样性的AFLP分析

利用AFLP分子标记技术分析我国重大外来入侵害虫美国白蛾8个群体的遗传多样性及遗传分化。结果表明:5对AFLP引物共扩增出564个位点,其中多态位点为548个,多态位点百分率（P）为97.16%,Neis遗传多样性指数（h）为0291 0,在物种水平上美国白蛾具较高的遗传多样性;AMOVA显示美国白蛾有较高的遗传分化,群体间变异占31.05%,群体内变异占68.95%,遗传分化指数（Fst）为0.310 5;美国白蛾8个群体平均遗传相似度为0.892 7,平均遗传距离为0.114 7。聚类分析结果表明,沈阳、济南、烟台和寿光群体亲缘关系较近,天津、济宁群体聚为一类,而廊坊、北京群体分别独立分支。进而对美国白蛾遗传多样性与其适应机制和扩散传播模式之间的关系进行了讨论。      

海南岛鸟巢蕨自然种群遗传多样性SRAP分析

为揭示鸟巢蕨（Asplenium nidus）自然种群的遗传多样性和亲缘关系,促进野生鸟巢蕨资源有效保护和利用,本研究以海南岛保护区自然分布的鸟巢蕨为对象,利用SRAP分子标记技术,采用UPGMA 方法对海南岛6个种群96份鸟巢蕨样本进行聚类分析。结果表明:(1)鸟巢蕨10对引物共扩增出184个位点,其中多态位点174个,多态位点百分率为94.57%,各种群间的多态位点百分比（PPB）存在较大差异,SRAP检测到的种群平均多态位点百分比为85.15%。鸟巢蕨种群间遗传变异程度范围较大,各种群均具有较高遗传多样性水平。(2)种群内部遗传分化发生比例为86.94%,而种群间遗传分化发生比例为13.06%,证明种群间存在一定水平遗传分化。(3)鸟巢蕨6个种群平均遗传相似度为0.922 4,平均遗传距离为0.080 9。其中,BW和EXL遗传距离最近,LMS2和LMS3遗传距离最远,分别为0.050 8和0.116 6。鸟巢蕨野外种群遗传距离UPGMA聚类分析结果显示,地理位置较近的BW和EXL聚类在一起,说明两者间基因流动通畅;同一地区LMS1和LMS3聚类在一起;而黎母山地区LMS2与其余种群遗传距离最大,遗传分化最显著,说明SRAP标记在鸟巢蕨种群间具有丰富多态性,该结果对揭示鸟巢蕨亲缘关系具有重要意义,为保护工作提供了指导。由于鸟巢蕨野外生境受到不同程度破坏,建议就地保护为主,在种群遗传多样性较高区域——黎母山区域建立级别更高的自然保护区,即尽快建成热带雨林国家公园,这有利于鸟巢蕨自然生境和种群恢复与扩大,促进热带雨林保育和物种多样性可持续发展。     

木荷种群遗传多样性的ISSR分析

利用ISSR分子标记技术,对木荷种群的遗传多样性和遗传分化进行分析.用12个引物对9个木荷种群共180个个体的样品进行扩增,共测到245个位点,其中多态位点221个,多态位点百分率(P)为90.20%.9个种群的P平均为53.02%.木荷种水平的Shannon信息指数(Ⅰ)为0.4548,Nei指数(h)为0.3016.各种群Ⅰ平均为0.2914,h平均为0.1974.表明木荷物种以及种群水平均具有较高的遗传多样性.AMOVA分子差异分析表明木荷种群的遗传变异34.37%存在于种群间,65.63%存在于种群内,种群间的基因分化系数(Gst)为0.3454.木荷种群间的基因流(Nm)为0.9476.木荷9个种群间的遗传距离平均为0.1547.利用算术加权平均数法(UPGMA)对木荷9个种群进行聚类,结果可分为3大类群.     

大兴安岭北段天然樟子松林遗传多样性与主要生态因子的相关性研究

该文利用ISSR技术分析了大兴安岭北段4个不同海拔梯度、3个不同群落及3个纬度梯度的樟子松天然林群体的遗传多样性及遗传分化.16个筛选出的随机引物在3组共240株个体中,分别检测出162、156和169个多态位点,总多态位点的百分率分别达到85.26%、82.11%和88.95%,樟子松天然林群体具有较高的遗传多样性.在海拔、群落和纬度等不同的尺度上,樟子松天然林群体间的遗传变异较低,遗传变异多来自群体内部.海拔及纬度因子显著影响樟子松天然林群体的遗传多样性水平,不同群落类型对群体的遗传多样性影响不大.      

甘肃不同地理种群桃蚜的遗传相似性

【目的】探讨甘肃不同地理种群桃蚜Myzus persicae的遗传相似性和遗传差异,遗传距离与地理距离、海拔之间的关系,以期得到桃蚜种群遗传分化和迁飞的分子证据。【方法】利用7对SSR引物对13个桃蚜地理种群进行遗传相似性和聚类分析。【结果】7对SSR引物共检测到43个多态性位点,多态性条带百分率PPB为95.56%。13个桃蚜地理种群观测等位基因数Na为1.3333,有效等位基因数Ne为1.2293,Nei′s基因多样性指数为0.1311,Shannon信息指数I为0.1898,多态位点百分率P为33.33%。临洮、临夏、岷县、兰州种群的遗传多样性较高,天水、酒泉、漳县种群相对较低。种群聚类分析结果显示,桃蚜分为河西和河东两大类群,AMOVA分析结果表明,类群间遗传变异占总变异的1.76%,种群间变异占17.21%,种群内占81.03%。Mentel检测表明,遗传分化与地理距离、海拔无显著相关性。【结论】甘肃省桃蚜种群具有非常丰富的遗传多样性,遗传变异主要来自种群内部,种群间的基因交流较少,容易发生遗传漂变;陕北、陇东、陇南是陇中桃蚜虫源地,应加强对上述地区桃蚜的监测和治理。     

沙地云杉与近缘种红皮云杉和白扦遗传多样性的RAPD分析

应用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术对内蒙古沙地云杉8个居群及其近缘种红皮云杉10个居群、白扦10个居群的遗传多样性进行了研究,所用的16个随机引物在28个居群中共检测到172个位点,平均每个引物扩增带数为10.75条,其中多态位点119个,占69.19％,表现出丰富的RAPD多态性。运用Neis多样性指数(h)和Shannons多样性指数(i)估算出28个居群的遗传多样性水平,且反映出遗传变异主要存在于居群内。根据遗传距离和聚类分析,3种云杉聚为三大类,沙地云杉与白扦的亲缘关系较与红皮云杉近,表明经过漫长的进化,沙地云杉产生了较大的遗传变异,因此支持将沙地云杉划分为独立种。     

中国鲎3个地理群体遗传多样性的等位酶分析

应用等位酶技术对漳浦、连江和温州3个地理群体的中国鲎遗传多态性进行分析.实验结果发现：6个酶系统的10个位点中有6个为多态性位点,共获得21个等位基因;大部分位点在3个群体中偏离Hardy-Weinberg平衡;在物种水平上,有效等位基因数为1.635,观察杂合度为0.456,期望杂合度为0.306,香侬指数为0.486,表明中国鲎的遗传多样性较高;F-统计量（FST）平均为0.0475,表明中国鲎遗传差异主要存在于群体内;遗传一致度平均为0.969,遗传距离平均为0.0315,表明中国鲎群体间遗传分化较低;基因流平均为5.0120,显示群体间存在较大的基因交流.由此认为3个群体属于同一个繁殖群体.在进行鲎物种保护的同时,要加强对其遗传多样性的保护.