分子生物学新方法在根瘤菌分类中的应用

随着分子生物学技术的发展,一些全新的方法应用于根瘤菌分类,使根瘤菌类的研究得到了迅速发展,从过去的传统分类过渡到以遗传特征和系统发育为主要依据的现代系统分类。研究在参考大量文献的基础上,概述了全细胞可溶性蛋白电泳,多位点酶永金ＤＮＡＧ＋Ｃ摩尔百分含量测定ＤＮＡ－ＤＮＡ杂交,限制性片段长度多态性分析,随机扩增ＤＮＡ片段的多态性,基因外回文重复序列ＰＣＲ扩增技术及１６ＳｒＤＮＡ序列的分析确定根瘤菌系统     

海藻分子生物学技术的应用与发展

分子生物学技术是有目的地利用及定向改造生物体系 (包括组织、细胞及其组分 )的技术。海藻分子生物技术指有目的地利用和定向改造海藻的有关分子生物学技术 ,它包括蛋白质工程、基因工程、以及与藻类天然产物开发有关的分子生物学技术。更广义地讲 ,它应包括应用于海藻学研究领域的所有分子生物学技术。目前的一些分子生物学技术如蛋白质同工酶、基于遗传物质基因组ＤＮＡ的限制片段长度多态性 (ＲＦＬＰ)技术、随机扩增多态性ＤＮＡ(ＲＡＰＤ)技术、扩增片段长度多态性 (ＡＦＬＰ)技术、微卫星ＤＮＡ(ｍｉｃｒｏｓａｔｅｌｌｉｔｅＤＮＡ)…     

海藻分子生物学技术的应用与发展

分子生物学技术是有目的地利用及定向改造生物体系 (包括组织、细胞及其组分 )的技术。海藻分子生物技术指有目的地利用和定向改造海藻的有关分子生物学技术 ,它包括蛋白质工程、基因工程、以及与藻类天然产物开发有关的分子生物学技术。更广义地讲 ,它应包括应用于海藻学研究领域的所有分子生物学技术。目前的一些分子生物学技术如蛋白质同工酶、基于遗传物质基因组ＤＮＡ的限制片段长度多态性 (ＲＦＬＰ)技术、随机扩增多态性ＤＮＡ(ＲＡＰＤ)技术、扩增片段长度多态性 (ＡＦＬＰ)技术、微卫星ＤＮＡ(ｍｉｃｒｏｓａｔｅｌｌｉｔｅＤＮＡ)…     

华癸根瘤菌的系统发育地位

１６ＳｒＲＮＡ序列测定是细菌分类学的基本方法之一，其序列差异是确定细菌属间及属上系统发育关系的主要标准。本文根据国际系统细菌学委员会根瘤菌分委员会的建议，采用聚合酶链的反应扩增了华癸根瘤菌模式菌株１０３的１６ＳｒＲＮＡ基因中约２６０个碱基的一个片段，并对其进行了序列测定。所得序列与其他已知根瘤菌种，属的相应片段进行了比较。结果表明，华癸根瘤菌与豌豆根瘤菌和苜蓿根瘤菌两种及与其他属的碱基差异在６．９     

一种有效抽提蚕、桑DNA的方法

生物技术的发展给实验理论和生产实践带来了新的突破 ,分子生物学技术的广泛应用使蚕桑生产出现了新的突破点与希望 .目前 ,几乎所有的家蚕生理、生化方面的研究都深入到分子生物学 ,对透彻了解和掌握家蚕的生长发育起着举足轻重的作用 .如限制性酶切片段长度多态性 (ＲＦＬＰ) ,随机扩增多态性ＤＮＡ(ＲＡＰＤ) ,串联重复序列 (ＳＳＲ) ,扩增酶切片段长度多态性 (ＡＦＬＰ)等方法 ,除了应用于家蚕外 ,也可广泛应用于桑树的分子生物学研究 .因此 ,在试验与研究过程中 ,探讨摸索一条适用于可同时提纯桑树、家蚕的动植物ＤＮＡ的方法对研究工…     

DNA分子标记技术在红菇分子鉴定中的应用进展

总结了近年来国内外8种主要分子标记技术在红菇分类鉴定、遗传多样性及进化关系等方面的研究进展,介绍了IGS、ITS、LSU区域的标记技术以及限制性长度片段多态性(RFLP)、随机扩增片段多态性分析(RAPD)、扩增片段长度多态性(AFLP)、微卫星序列(SSR)和微卫星间隔序列(ISSR)等分子标记技术的原理和方法.     

遗传标记及其在园艺植物研究中的应用

评述了形态学标记(morphologicalmarkers)、细胞学标记(cytologicalmarkers)、生化标记(bio鄄chemicalmarkers)、DNA分子标记(DNAmolecularmarkers)等技术的发展现状,着重介绍了近年来DNA指纹图谱技术,即限制性片段长度多态性(RestrictionFragmentLengthPolymorphism,RFLP)、随机扩增片段长度多态性(RandomAmplifiedPolymophismicDNA,RAPD)、简单重复序列(simplesequencere鄄peats,SSR)、扩增片段长度多态性(AmplifiedFragmentLengthPolymorphism,AFLP)、单核苷酸多态性(singlenucleotidepolymorphism,SNP)等标记技术的特点及其在园艺植物品种的分类鉴定、纯度的分析检测及品种间亲缘关系等研究中的应用。     

沙冬青根瘤菌固氮酶基因nifH PCR-RFLP分析

利用固氮基因nifH PCR扩增,nifH PCR-RFLP及扩增产物序列分析方法对分离自宁夏和内蒙古部分地区的沙冬青根瘤菌代表菌株的nifH 进行了遗传多样性和系统发育分析.结果表明,在80%相似水平上42株根瘤菌nifH PCR-RFLP基因图谱中有5个基因型聚类群.对不同基因型代表菌株的nifH PCR产物进行序列测定和系统发育关系分析,测试菌株在系统发育地位上与中慢生根瘤菌和中华根瘤菌相近,测试菌株与温带中慢生根瘤菌(Mesorhizobium temperatum isolate HAMBI 2583)序列相似性范围为95.6%～96.9%,与草木樨中华根瘤菌(Sinorhizobium meliloti strain CCBAU10062)基因序列相似性范围为99.8%～100%,基因序列同源性较高.本研究中nifH基因所揭示的沙冬青根瘤菌遗传多样性和系统发育关系说明沙冬青根瘤菌受染色体基因背景、地理环境以及菌株个体的进化而存在一定的差异.     

华癸根瘤菌的系统发育地位

16S rRNA 序列测定是细菌分类学的基本方法之一,其序列差异是确定细菌属间及属上系统发育关系的主要标准。本文根据国际系统细菌学委员会根瘤菌分委员会的建议,采用聚合酶链反应扩增了华癸根瘤菌(Rhizobium huakuii)模式菌株103的16S rRNA 基因中约260个碱基的一个片段,并对其进行了序列测定。所得序列与其他已知根瘤菌种、属的相应片段进行了比较。结果表明,华癸根瘤菌与豌豆根瘤菌和苜蓿根瘤菌两种及与其他属的碱基差异在6.9%～14.1%(17～35个碱基),相当于根瘤菌科内已知属间的差异。结合表型特征,我们认为该种可能代表了根瘤科的一个新属。     

生物技术在天牛分类中的应用

天牛分类一直以形态特征为依据,近年来生物技术在天牛分类研究中得到应用,此文综述了包括同工酶电泳、RAPD分子标记、PCR、核酸序列分析等技术在天牛近缘种及种下阶元的分类鉴定、种上阶元的系统发育分析、天牛种群的遗传变异与进化、天牛生物地理学研究中的应用,并根据存在的问题对天牛分子生物学研究的前景进行探讨。     

分子生物学新方法在AM真菌生态学研究中的应用

随着分子生物学技术的发展,新的技术和方法应用于AM真菌研究,使AM真菌生态学的研究得到了迅速发展,从过去的物种多样性过渡到了以分子特征为主要依据的遗传多样性。本文综述了聚合酶链式反应(PCR)、限制性片段长度多态性分析(RFLP)、随机扩增DNA片段的多态性(RAPD)、rRNA基因序列分析、核酸分子杂交技术、同功酶分析、荧光染料染色及以技术为基础的rRNA和rDNA分析等分子生物学方法的基本原理以及在AM真菌生态学研究中的应用现状和前景。     

宁夏沙坡头地区根瘤菌特性分析：Ⅱ.多位点酶电泳酶谱分析

本主苦难对分离自宁夏沙直以头地区的１７株根瘤菌手１６株已知参比菌进行了１６种多位点酶电泳分析。将所得数据做聚类分析表明，分离自沙坡头地区的根瘤菌中，有１２株相似性较高，不同于已知参比菌，而独立成群，这与数值分类结果吻其分类地位需进一步研究确定。     

核酸序列直接分析在真菌鉴定方面的应用

综述核酸序列直接分析在真菌分类鉴定方面的基础理论及特点,介绍核酸序列直接分析在真菌鉴定方面的应用及常用的引物,比较真菌分类鉴定中常用的18SrDNA,ITS分子生物学方法。     

番茄基因组DNA不同微量提取方法的比较及适用性分析

为了探究不同基因组DNA提取方法在生物学试验中适用性问题，采用5种方法提取番茄基因组DNA，并通过琼脂糖凝胶电泳、微量紫外分光光度计、聚合酶链式反应（PCR）比较提取的DNA浓度、质量及适用性。结果显示，碱裂解煮沸法成本低、操作简便，但所提取的DNA浓度最低，质量最差，只适合一般PCR检测试验；SDS冰浴法和改良的CTAB法操作步骤多、程序复杂，提取的DNA浓度和质量好，通用性最强，但所用试剂具有毒性；高盐低pH法和PVP-40法操作简单，提取的DNA浓度和质量较好，具有一定的通用性，且所用试剂无毒，建议一般性的生物学试验可优先考虑这两种方法。     

瘤胃微生物总DNA提取方法的比较

目前如何获得完整的瘤胃微生物总DNA是对瘤胃微生物在分子水平研究中关键的一步。瘤胃微生物总DNA分子片段很大,大概在15kb￣20kb,因此需要选择一种合适的提取方法来获得完整的总DNA片段。笔者研究采用物理方法如玻璃珠研磨震荡法、反复冻融法、超声波破碎法、液氮研磨法等,化学方法如表面活性剂十二烷基磺酸钠(sodiumdodecylsulfate,SDS)、溴化十六烷三甲基铵(CetyltrimethylAmmoniumBromide,CTAB等),酶解法(溶菌酶、蛋白酶K等)相结合,并对其进行比较,选择最佳的提取方法,使其符合以后PCR扩增要求以及其它后续研究工作。试验结果表明用玻璃珠研磨震荡加CTAB提取液的方法、反复冻融加SDS提取液的方法提取的瘤胃微生物总DNA的效果高于其它方法,并且通过电泳以及PCR检测,所提取的DNA的量适于进一步的分子生物学研究。     

分子生物学在媒介生物研究中的应用

随着分子生物学及其技术迅猛发展,分子生物学已成为现代生物学研究领域的热点之一,在媒介生物研究中也得到了越来越多的应用,为媒介生物的分类鉴定提供了可测量的指标,对媒介生物的分类地位和进化关系有了更准确的定位.就分子生物学在媒介生物研究中应用的一些新进展做了综述,以期为媒介生物资源的检测开发利用、虫媒病毒的检测分析及所传疾病的诊断和防制策略提供理论依据.     

DNA条形码技术在昆虫分类学中的研究进展

DNA 条形编码( DNA Barcoding )是一种快速、准确的生物分类技术,它是分子生物学和生物信息学相结合的产物。昆虫种类繁多,近似物种鉴定困难使该技术在昆虫分类工作中得到了广泛应用。文章简要综述了DNA条形码技术的概念、原理与操作步骤,详细阐述了DNA条形码技术在昆虫分类研究中的具体应用情况,对其在应用过程中相比传统形态分类方法的优势和存在问题予以论述,并探讨了DNA 条形码技术今后在昆虫分类中应用的可行性与发展前景。     

分子生物学技术在鞘翅目昆虫分类研究中的应用

随着生物技术的迅猛发展,分子生物学技术已越来越多地被应用在昆虫的分类学研究中.笔者概述了核酸序列分析、RFLP技术、RAPD技术、分子杂交技术、同工酶电泳技术、SSCP以及DSCP技术在鞘翅目昆虫分类研究中的应用情况,并展望了分子生物学技术在鞘翅目昆虫研究中的广阔前景.     

沙冬青根瘤菌表型特征和16SrDNAPCR-RFLP分析

应用表型数值分类和16S rDNA PCR-RFLP 分析方法,对分离自宁夏和内蒙古部分地区的沙冬青根瘤菌进行表型和遗传多样性研究.通过分离纯化获得44株供试根瘤菌,选取37株未知菌和11株参比菌株进行唯一碳氮源利用、抗生素和染料抗性、耐盐性、初始pH生长、生长温度范围和脲酶共94项生理生化性状测定,以及16S rDNA 基因扩增和扩增产物的限制性酶切分析.结果表明,沙冬青根瘤菌在碳源利用、抗生素敏感性和染料抗性方面存在差异;对15项所选氨基酸氮源均能利用,无明显差异;具有较强的耐盐碱和耐高温能力.经过数值分类和16S rDNA PCR-RFLP比较分析,测试菌株具有丰富的表型和遗传多样性.测试菌株和参比菌株在80%的相似水平上产生2个表观群,表观群I和表观群II在鉴别特征上存在差异.数值分类中聚群的根瘤菌菌株在16S rDNA PCR-RFLP分析中也聚群,2种分析方法有基本的一致性.     

微生物分子生态学技术及其在食品产业中的应用前景

综述了新兴的不依赖于培养的微生物分子生态学技术,包括两类：不基于微生物总基因组DNA的分析方法,主要有单碳源利用图谱法和磷脂脂肪酸图谱法;基于微生物总基因组DNA的分子分析方法,主要有克隆文库分析法、宏基因组文库技术、G＋C含量分析法、总DNA复性动力学分析法、群落水平总基因组DNA交互杂交法、荧光原位杂交技术、DNA微阵列芯片技术、变性/温度梯度凝胶电泳、单链构象多态性分析、限制片段长度多态性/扩增核糖体DNA限制性分析、末端标记限制片段长度多态性、核糖体基因间隔区分析、随机扩增多态性DNA等.并提出了这套技术在食品产业中的应用前景：发现新菌种,生产新型酶制剂,优化改造新工艺,确保食品质量与安全等,为食品产业的继续开发提供新的技术支持.