GPAT/AIRC基因对白耳鸡群体肌肉肌苷酸含量的遗传效应分析

 以GPAT/AIRC基因为侯选基因,以白耳鸡为试验材料,采用PCR-SSCP方法对GPAT基因外显子2,AIRC基因外显子8进行SNPs检测。结果各发现了一个单核苷酸多态性位点。各种基因型与胸肌IMP含量的方差分析结果表明：GPAT基因外显子2中AA型个体的肌肉肌苷酸含量显著地高于AB型和BB型个体,AB型个体也稍高于BB型,但差异不显著;AIRC基因外显子8中CG型个体的肌肉肌苷酸含量显著地高于GG型和CC型个体,GG型个体的胸肌肌苷酸含量也显著地高于CC型。两个基因的单倍型对IMP含量也有显著的影响：单倍型为AACG的个体比单倍型为BBCC的个体高1.006mg/g,单倍型的遗传效应大于最优秀的单个基因型效应。因此,可以利用该单倍型对鸡的肉质风味性状进行标记辅助选择。     

GPAT／AIRC基因对白耳鸡群体肌肉肌苷酸含量的遗传效应分析

以GPAT/AIRC基因为侯选基因,以白耳鸡为试验材料,采用PCR-SSCP方法对GPAT基因外显子2,AIRC基因外显子8进行SNPs检测.结果各发现了一个单核苷酸多态性位点.各种基因型与胸肌IMP含量的方差分析结果表明:GPAT基因外显子2中AA型个体的肌肉肌苷酸含量显著地高于AB型和BB型个体,AB型个体也稍高于BB型,但差异不显著;AIRC基因外显子8中CG型个体的肌肉肌苷酸含量显著地高于GG型和CC型个体,GG型个体的胸肌肌苷酸含量也显著地高于CC型.两个基因的单倍型对IMP含量也有显著的影响:单倍型为AACG的个体比单倍型为BBCC的个体高1.006mg/g,单倍型的遗传效应大于最优秀的单个基因型效应.因此,可以利用该单倍型对鸡的肉质风味性状进行标记辅助选择.     

铁观音茶树甘油-3-磷酸酰基转移酶(CsGPAT)基因克隆及萎凋过程中的表达分析

【目的】以铁观音茶树鲜叶为试验材料,对参与甘油磷脂代谢途径的茶树甘油-3-磷酸酰基转移酶(Glycerol-3-phosphate acyltransferase, CsGPAT)进行克隆、生物信息学分析以及不同萎凋温度的表达量分析,了解GPAT基因在茶叶萎凋过程中的重要意义,以期为茶叶萎凋过程中温度调控提供理论基础。【方法】基于乌龙茶加工(萎凋)转录组数据,筛选获得茶树GPAT同源序列。利用ExPASy Protparam、 SMART、 SignalP 4.1Server、PSORT、prediction protein等在线软件进行生物信息学分析,利用SWISS-MODEL在线工具编辑GPAT蛋白质三维结构;在NCBI Blastp进行氨基酸序列同源比对。提取铁观音叶片RNA进行qRT-PCR,检测实时表达情况,克隆茶树GPAT基因全长。【结果】克隆得出CsGPAT(IDcsa:CSA000941.1/IDcss:TEA019813.1)基因序列全长1 554 bp,编码497个氨基酸;GPAT蛋白属于稳定疏水性蛋白,不含信号肽,具有磷脂生物合成功能的PlsC域;进化树分析表明CsGPAT基因与油茶的亲缘关系最近。qRT-PCR分析结果显示CsGPAT基因在20℃温度萎凋时表达量最高。【结论】CsGPAT基因在茶叶萎凋受到相对低温胁迫时,表达量上调,表明CsGPAT表达与茶叶萎凋过程中的温度调控密切相关。     

麻疯树质体甘油-3-磷酸酰基转移酶(JcGPAT2)cDNA的克隆及序列分析

甘油-3-磷酸酰基转移酶(GPAT:EC2.3.1.15)是催化脂肪酰基转移到甘油-3-磷酸的Sn-1位上合成1-酰基-Sn-甘油-3-磷酸(溶血磷脂酸)的酶。通过设计兼并引物和RACE引物,克隆得到麻疯树质体JcGPAT2基因(GenBank登录号:FJ952147),其cDNA全长1 516 bp,其中编码区1 389 bp,编码462个氨基酸,与蓖麻等植物GPAT基因高度同源,且含有4个保守功能结构域(Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ)。表达分析表明,JcGPAT2在麻疯树各组织中为组成型表达,在胚中最高而茎中最低;在种子发育过程中,Ⅰ、Ⅱ期表达量较高,Ⅲ期表达量减弱后在IV期又显著增强;在冷处理麻疯树叶片中,其受冷诱导后表达量在处理4 h时显著增加,12 h后又逐渐降低。表明JcGPAT2在种子油脂合成和抗冷性反应中可能起到重要作用。     

大豆油脂的合成途径及关键酶 GPAT 基因的研究进展

大豆油脂的主要成分为三酰甘油,其合成过程中的关键合成酶基因是甘油三磷酸酰基转移酶(GPAT)基因。如今国内大豆油脂的需求量日渐提高,如何增加大豆油脂的产量将成为油料作物育种的重要目标之一。对大豆油脂、油脂合成途径以及GPAT基因进行了阐述,并介绍了GPAT基因在油脂合成途径中的应用,为进一步筛选可稳定遗传且高效表达的转基因高油脂大豆优良品系奠定基础,对大豆油脂的生产具有重要意义。     

IGFs和MSTN基因表达量与种猪生长性状的相关性研究

【目的】探寻简洁、高效的种猪分子育种方法,检测和分析胰岛素样生长因子基因(IGF-1、IGF-2)和肌生成抑制素基因(MSTN)在大约克公猪、杜洛克公猪和长白公猪耳组织中的相对表达量。【方法】采用荧光定量PCR技术对目的基因在种猪耳组织中的相对表达量进行检测,并运用SPSS软件进行表达量数据分析及其与种猪生长性状的相关性分析。【结果】大约克公猪中IGF-1基因与MSTN基因表达量均显著高于IGF-2基因表达量(P0.05),杜洛克公猪中IGF-1基因与IGF-2基因表达量存在显著相关(P0.05),长白公猪中目的基因表达量两两之间存在显著差异(P0.05);IGF-1基因和MSTN基因在长白猪中相对表达量显著高于大约克猪(P0.05);IGF-1基因在长白公猪耳组织表达量与生长性状(饲料利用率、总耗料、日耗料和生长指数)存在显著相关(P0.05),MSTN基因在耳组织表达量与大约克公猪(体长、胸围、胸深、日增重、总耗料、日耗料和生长指数)、杜洛克公猪(体长、半腿臀围)、长白公猪(生长指数)生长性状呈显著相关(P0.05),联合分析显示目的基因在不同猪种耳组织中表达量与其生长性状均显著相关(P0.05)。【结论】IGF-1、IGF-2和MSTN基因可能在猪生长性状的形成过程中具有协同调控作用,为种猪分子育种提供了理论基础。     

PBI121/GPAT质粒的构建及对非洲菊转化*

 为提高植物抗寒性,本文构建一个植物表达载体,并对非洲菊进行转化。用已克隆的强抗冷植物兵豆的甘油-3-磷酸转酰酶（GPAT）基因构建表达载体,将GPAT插入表达载体pBI121质粒取代该质粒上原有的GUS基因,并用PCR和酶切进行鉴定。用农杆菌介导的方法将该质粒转化到非洲菊中。结果表明该植物表达载体构建成功,同时对非洲菊高效转化体系进行探索,获得卡那霉素抗性苗7苗。     

玉米甘油-3-磷酸酰基转移酶基因ZmGPAT13生物信息学及表达特性分析

【目的】对玉米（Zea mays L.）甘油-3-磷酸酰基转移酶（Glycerol-3-phosphate acyltransferase,GPAT）家族成员ZmGPAT13进行生物信息学分析和在不同非生物胁迫处理下的基因表达模式变化检测，为进一步研究ZmGPAT13的生物学功能奠定理论基础。【方法】通过TAIR和MaizeGDB数据库获得拟南芥（Arabidopsis thaliana）和玉米中GPAT家族蛋白序列，利用生物信息学方法进行理化性质、蛋白结构、亚细胞定位、保守基序、系统进化、磷酸化位点和启动子顺式作用元件等分析，并采用荧光定量PCR(qRT-PCR)技术对ZmGPAT13在不同组织部位及甘露醇（Mannitol）、NaCl、脱落酸（ABA）、高温（42℃）、低温（4℃）处理下的相对基因表达量进行分析。【结果】ZmGPAT13是一个定位于线粒体的跨膜蛋白，与部分GPAT家族成员含有排序相同的15个保守基序（motif），且与拟南芥中AtGPAT1的亲缘关系最近；预测分析发现ZmGPAT13含有62个磷酸化位点，可能与玉米中多个GPATs存在相互作用关系；ZmGPAT13基...     

筛选GPAT基因的酵母遗传互补体系的优化

3-磷酸甘油酰基转移酶(glycerol-3-phosphate acyltransferase,GPAT)是甘油脂生物合成途径中催化第1步酰化反应的关键酶,参与生物体的不同代谢途径,发挥着不同的生理功能。本研究对已构建的GPAT基因酵母遗传互补筛选体系进行优化,通过替换酵母表达载体pYES2-Kan-yADH1 v1中ADH1启动子,增强目的基因的表达;同时,在酵母遗传转化后对菌株进行复苏培养,提高遗传转化效率,增加阳性菌落数目。该体系的优化将进一步提高GPAT酶的筛选效率。     

白菜综合风味品质的鉴定及其相关、通径分析

选用12个风味品质不同的鲜食白菜品种为试材,对其综合风味品质、营养品质和农艺学性状进行了相关、回归和通径分析。相关分析表明:综合风味与组成性状中的叶柄味觉、叶片味觉和叶片软硬性呈显著正相关,与营养品质性状中的粗灰分、粗纤维、有机酸、葡萄糖达到了显著负相关,与农艺学性状间的株高、叶宽、叶柄宽和单株重呈显著正相关。多元回归分析和通径分析结果表明,各组成性状对综合风味影响大小依次为叶片味觉、叶柄味觉和叶片软硬度;营养品质对综合风味影响的绝对值大小依次是粗灰分、葡萄糖、有机酸、果糖和粗纤维;农艺学性状对综合风味影响大小依次为叶柄宽、株高、单株重和叶宽,因此,最后提出用叶片味觉、粗灰分和叶柄宽作为白菜品质的简易筛选性状。     

不同品种猪肉质抗氧化性能比较分析

[目的]比较分析不同品种猪肉质抗氧化性能的差异。[方法]对山东省6个地方品种猪和杜长大三元猪的肉质抗氧化性能和肉质风味进行测定和比较分析。[结果]莱芜猪、大蒲莲猪、烟台黑猪、里岔黑猪、五莲黑猪较杜长大宰后肌肉总抗氧化性能高,并且莱芜猪、大蒲莲猪、烟台黑猪、里岔黑猪、沂蒙黑猪猪肉风味占优势。[结论]该研究为进一步加强地方品种猪的保护开发与利用提供基础资料。     

猪ATIC基因SNPs位点分析和表达规律的研究

为了进一步探索氨基咪唑氨甲酰核苷酸转甲酰基酶/次黄嘌呤核苷酸环水解酶ATIC基因与肉质风味性状的关系,寻找猪肉质风味性状相关分子标记,研究采用PCR-SSCP的方法对ATIC基因进行序列扫描,寻找SNP位点并分析不同等位基因在不同品种猪间的分布规律,同时采用荧光定量PCR的方法对ATIC基因在猪子宫、背肌、肠、肺、脾脏...     

Measurement of trimethylamine concentration and evaluation of pig meat natural quality by a spectrophotometric method

Pig meat off-flavor is attributed to trimethylamine (TMA) concentration, and it is considered as the precursor of the fishy off-flavor problems. In this study, TMA concentrations in pig meat were determined, and the interactions with breed and gender effects were discussed. In addition, the TMA threshold for meat off-flavor and pig meat natural quality was measured in relation to meat storage and movement, and the influential factors including the pig breed and storage time were discussed. The results indicated positive effects on the precursor of the fishy off-flavor and the TMA threshold. Native breeds were found to have lower TMA concentrations than European breeds (P<0.01), and females and castrated males had significantly lower TMA concentration than males (P<0.01), The threshold concentration of TMA when meat was classed as off-flavored was 25 μg·g^-1, and this occurred after 35–38 h of storage. The natural qualities, such as appearance, flavor, color and overall acceptable scores declined significantly after 4 days in storage (P<0.01). It is concluded that pig meat off-flavor, breed and gender were essential factors affecting flavor for meat breeding programs, and storage time is important for pig meat natural quality.     

A genome-wide association study of five meat quality traits in Yorkshire pigs

Meat quality is an important trait in the pig industry. To identify genomic regions and haplotype blocks responsible for meat quality traits in pigs, a genome-wide association study was conducted for five traits including intramuscular fat content, pH at 45 min and 24 h, drip loss within 24 h and water-holding capacity in 231 Yorkshire barrows using illumina porcine 60k SNP chips. The results showed that a total of 344 single nucleotide polymorphisms (SNP) were significantly associated with five meat quality traits (P<1×10^-4). Moreover, 323 SNPs were within the reported QTL regions, of which 21 were novel. Also, 158 SNPs fell into the proximal region of meat quality related genes. In addition, 25 haplotype blocks based on 116 SNPs were revealed with SNP combination patterns for five traits. Our study added new SNP information for identification of meat quality traits in pigs and will help elucidate the mechanisms of meat quality in pigs.     

引进猪种与我国地方猪种生产效率及肉质特性比较

随着我国人们生活水平的日益提高,对食品的品质要求也越来越高。对进口猪种与地方猪种从生产效率、肉质特性等进行详细的分析比较。结果表明,目前由于过分追求猪的生长速度和瘦肉率,使肉质风味严重下降,应该将地方猪肉肉质优良的得天独厚资源进行更好地保存和利用,才能生产出优质的肉品,为人民和社会造福。     

猪肉品质候选基因研究进展

肉品质性状改良是当今遗传育种界的研究热点之一。利用候选基因策略寻找影响肉质性状的主效基因,从而应用于猪的肉质改良,从分子遗传学角度来说是可行的。综述了与猪肉品质有关的基因:氟烷敏感基因(Hal)、猪酸肉基因(RN)、心脏脂肪酸结合蛋白基因(H-FABP)、激素敏感脂肪酶基因(HSL)和脂蛋白脂肪酶基因(LPL)的研究进展。     

猪MB基因外显子3的多态性分析

以MB基因作为影响猪肉肉色的候选基因,利用PCRS-SSCP技术,以野猪、野家杂种猪、民猪、大白猪、长白猪5个猪种为研究对象.根据GenBank上猪的MB序列设计了3对引物,对此基因的3个外显子进行SNPs检测.基因型检测结果表明:MB基因在第1、第2外显子上没有发现多态,在第3外显子上检测到了多态.在第3外显子上的第437 bp处存在一个T→C的碱基突变,该突变未导致氨基酸的改变,属沉默突变.经计算各基因型频率、基因频率和试验统计表明:随野猪、野家杂种猪、民猪、长白猪、大白猪肉色的变浅,等位基因N的基因频率也呈下降趋势.     

贵州省纳雍县糯谷猪屠宰性能测定

[目的]为糯谷猪的育种提供科学依据。[方法]从贵州省纳雍县随机选取20头糯谷猪进行屠宰性能的测定,将其与其他国内外猪种进行比较。[结果]纳雍糯谷猪的屠宰率较高(达74.46%),瘦肉率适中(45.30%)。糯谷猪的平均背膘厚为3.49 cm,在我国地方猪种中处于中等水平。糯谷猪的眼肌面积和瘦肉率均远低于国外猪种,脂肪含量适中,皮较厚,富含胶原蛋白。由于糯谷猪主要饲喂天然草料,皮和肉均可安全食用,带有香糯的风味,符合目前人们对猪肉品质的要求,具有较好的市场前景。[结论]为更好地保护糯谷猪这个优良猪种,应尽快建立保护区。     

野猪、家猪及野家杂种猪CAPN1基因3′UTR区的SNPs检测及PCR-RFLP分析

μ-钙蛋白酶(μ-calpain,CAPN1)是动物体内肌原纤维蛋白降解的主要酶,为了揭示其基因变异与瘦肉率和嫩度的关系,文章以野猪、家猪及野家杂种猪为研究对象,通过测序和PCR-RFLP方法对CAPN1基因3′UTR进行了SNPs检测和多态性分析。结果表明,共发现7个SNPs,分别是C114T,G220C,C344T,T380C,G501A,T543C,T610C;对G220C/T380C两处突变建立了基于限制性内切酶HinfⅠ/AlwNⅠ的PCR-RFLP检测技术;群体遗传学分析表明,在这两个位点不同基因型在不同品种(品系)猪中的分布都存在着极显著的差异(P<0.01),野猪和民猪之间的差异都不显著(P>0.05),并且HinfⅠ位点的B等位基因频率具有随着品种瘦肉率的增加而增多的趋势。该结果为寻找高瘦肉率的分子标记提供了基础。