玉米甘油-3-磷酸酰基转移酶基因ZmGPAT13生物信息学及表达特性分析 |
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引用本文: | 李鑫,柯珂,任晓晨,刘皓宇,张丙林,刘卫娟,邹华文.玉米甘油-3-磷酸酰基转移酶基因ZmGPAT13生物信息学及表达特性分析[J].福建农业学报,2023(8):901-909. |
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作者姓名: | 李鑫 柯珂 任晓晨 刘皓宇 张丙林 刘卫娟 邹华文 |
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作者单位: | 1. 长江大学农学院;2. 农业农村部长江中游作物绿色高效生产重点实验室(省部共建) |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(32201719、31971839、32171952); |
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摘 要: | 【目的】对玉米(Zea mays L.)甘油-3-磷酸酰基转移酶(Glycerol-3-phosphate acyltransferase,GPAT)家族成员ZmGPAT13进行生物信息学分析和在不同非生物胁迫处理下的基因表达模式变化检测,为进一步研究ZmGPAT13的生物学功能奠定理论基础。【方法】通过TAIR和MaizeGDB数据库获得拟南芥(Arabidopsis thaliana)和玉米中GPAT家族蛋白序列,利用生物信息学方法进行理化性质、蛋白结构、亚细胞定位、保守基序、系统进化、磷酸化位点和启动子顺式作用元件等分析,并采用荧光定量PCR(qRT-PCR)技术对ZmGPAT13在不同组织部位及甘露醇(Mannitol)、NaCl、脱落酸(ABA)、高温(42℃)、低温(4℃)处理下的相对基因表达量进行分析。【结果】ZmGPAT13是一个定位于线粒体的跨膜蛋白,与部分GPAT家族成员含有排序相同的15个保守基序(motif),且与拟南芥中AtGPAT1的亲缘关系最近;预测分析发现ZmGPAT13含有62个磷酸化位点,可能与玉米中多个GPATs存在相互作用关系;ZmGPAT13基...
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关 键 词: | 玉米 甘油-3-磷酸酰基转移酶 ZmGPAT13 生物信息学分析 非生物胁迫 |
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