金华猪回肠、结肠真菌结构及其与体脂沉积的相关性研究

本试验旨在探究不同肥瘦率的金华猪回肠、结肠真菌菌群结构差异及其与体脂沉积的相关性.试验选择270日龄的同批次金华猪35头,测定背膘厚、眼肌面积和瘦肉率,并选择瘦肉率最低(高脂肪组,H组)和最高(低脂肪组,L组)的金华猪各5头,采集回肠、结肠内容物用于真菌测序分析.结果表明:1)不同肥瘦率金华猪的瘦肉率与背膘厚存在显著差...     

金华猪回肠、结肠古菌结构及其与体脂沉积的相关性研究

本实验旨在研究不同瘦肉率金华猪回肠和结肠古菌菌群结构的差异，分析其与宿主体脂沉积的相关性。选取35头270日龄金华猪，测定其背膘厚和瘦肉率，从中选择出8头脂肪率最高（高脂组，H组）和8头脂肪率最低（低脂组，L组）的猪，通过16S rRNA基因测序方法对其回肠和结肠的古菌结构进行分析。结果表明：广古菌门（Euryarchaeota）、泉古菌门（Crenarchaeota）和奇古菌门（Thaumarchaeota）为回肠和结肠优势菌门；回肠优势菌属为Euryarchaeota＿norank、甲烷短杆菌属（Methanobrevibacter）和甲烷粒菌属（Methanocorpusculum），结肠优势菌属为甲烷短杆菌属、Euryarchaeota＿norank和热原体属（Thermoplasma）；对不同瘦肉率猪的古菌进行对比分析发现，H组的菌群多样性高于L组，且不同瘦肉率猪的古菌结构差异显著，主要体现在Nitrosopumilales＿norank、Candidatus Methanomethylophilus、除硫球菌属（Desulfurococcus）、甲烷微球菌属（Methani...     

金华猪PPARGC1A基因克隆、生物信息学分析及组织表达研究

试验旨在研究过氧化物酶体增殖物激活受体γ辅助激活因子1α（PPARGC1A）在金华猪和大白猪中的遗传特征和表达情况，探究PPARGC1A基因在mRNA水平和蛋白质水平的表达模式。以金华猪和大白猪为试验动物，分别提取背脂组织的总RNA，根据GenBank中公布的猪PPARGC1A基因序列（登录号：NM_213963.2）设计编码区和实时定量PCR引物，以猪GAPDH基因和β-actin蛋白作为内参，应用多种生物信息学方法对PPARGC1A基因编码蛋白进行功能分析，并通过实时荧光定量PCR及Western blotting检测其在金华猪背脂中的表达水平。结果表明，金华猪PPARGC1A基因CDS区全长2 361 bp，编码786个氨基酸，该蛋白分子大小90 336.01 u，其中丝氨酸（ser）所占比例最高（13.7%），色氨酸（Trp）所占比例最低（0.8%）。同源性比对结果显示，金华猪PPARGC1A基因与山羊、牛和绵羊的同源性较高，分别为95.0%、94.9%和94.9%，在物种进化中具有较强的保守性；金华猪PPARGC1A蛋白不稳定指数为74.88，属于不稳定亲水蛋白，无跨膜结构，其二级结构由α-螺旋、延伸链、β-转角及无规则卷曲4种结构组成，所占比例分别为26.59%、5.73%、5.73%和61.96%，PPARGC1A蛋白同源建模经折叠、弯曲等一系列复杂的过程获得三级结构模型；实时荧光定量PCR试验和Western blotting试验结果一致，显示PPARGC1A基因在背脂较厚的金华猪中表达量显著低于瘦肉型的大白猪（P<0.05）。本研究为探明PPARGC1A基因对猪脂肪沉积的分子生物学功能提供了理论基础。     

发酵香菇渣对断奶仔猪生长性能、结肠挥发性脂肪酸含量及微生物结构的影响

为研究发酵香菇渣（fermented shiitake residues,FSR）对断奶仔猪生产性能、十二指肠消化酶活性、空肠紧密连接蛋白相关基因表达、结肠挥发性脂肪酸及结肠微生物区系的影响,本研究选用100头健康的壹号土猪断奶仔猪（小耳花猪×杜洛克猪,公母各50头）,随机分为2组,每组5个重复,每个重复10头猪,进行饲养试验。对照组饲喂基础饲粮（NC组）,试验组饲喂基础饲粮+5%发酵香菇渣。试验期33 d。饲养试验结束时,从每个组中选择6头仔猪（公母各半）进行屠宰取样。检测指标包括生长性能、十二指肠黏膜消化酶活性、空肠紧密连接蛋白mRNA相对表达量、结肠挥发性脂肪酸含量和肠道微生物结构。结果显示,与对照组相比,试验组显著提高了断奶仔猪的末重和平均日增重（P<0.05）,显著降低了料重比（P<0.05）;显著提高了十二指肠黏膜胰蛋白酶和β-淀粉酶活性（P<0.05）;显著提高了结肠挥发性脂肪酸丙酸、丁酸、异丁酸和异戊酸水平（P<0.05）;显著增加了结肠纤维杆菌门（Fibrobacteres）和链球菌属（Streptococcus）的相对丰度（P<0.01;P<0.05）,对空肠紧密连接蛋白1（TJP1）和紧密连接蛋白2（TJP2）基因mRNA的表达无显著影响（P>0.05）。综上所述,饲粮中添加5%发酵香菇渣可提高断奶仔猪肠道消化酶活性,增加结肠挥发性脂肪酸含量,调节肠道微生物区系组成,有利于提高断奶仔猪的生长性能。     

甘蔗梢自然青贮过程中的营养成分及细菌多样性变化规律

为研究甘蔗梢在自然青贮条件下营养成分及细菌多样性的变化规律，在甘蔗梢自然青贮条件下的第1、15、30、45、60、90天分别采集甘蔗梢青贮样品，分析其常规营养成分、pH、乳酸、氨态氮、挥发性脂肪酸以及微生物多样性变化。结果显示，与青贮第1天相比，自然青贮条件下的甘蔗梢干物质含量在15 d时最低，显著低于第1天（P<0.05），30 d以后趋于稳定，蛋白质含量随着青贮时间的延长而逐渐降低（P<0.05），中性洗涤纤维（NDF）及酸性洗涤纤维（ADF）含量在15 d以后均显著低于第1天（P<0.05），其中以60 d时最低，总磷含量随着天数的增加而显著增加（P<0.05）；pH随着青贮天数的延长而逐渐降低，15 d时pH即达到4.0以下且趋于稳定；乳酸含量在15 d时即显著高于第1天（P<0.05），第30天时达到最高值（207.17 mmol/kg）；乙酸含量随着青贮时间延长逐渐增加（P<0.05），但丙酸和丁酸含量无显著变化（P>0.05）。在青贮的第1天甘蔗梢中的微生物在目水平上主要以Lactobacillales、Rhizobiales、Bacillales、Micrococcales、Sphingomonadales为主，在第15天时，Lactobacillales迅速占据优势地位，其次是Enterobacteriales，30 d时几乎全为Lactobacillales；在属水平上，第1天时以Lactobacillus、Staphylococcus、Sphingomonas、Methylobacteriu、Rhizobium为主。15 d时以Lactobacillus占据绝对优势，30 d时Lactobacillus趋于稳定。由此可得出，甘蔗梢在自然青贮条件下青贮30 d即可达到良好的青贮效果，Lactobacillales目中的Lactobacillus属细菌在甘蔗梢自然青贮中具有重要作用。     

淮猪的保种繁育与产业化开发

黄淮海黑猪（淮猪），属古老的华北型猪种，是我国新淮猪、沂蒙黑猪等培育猪种的亲本，是培育杂交改良品种的良好育种素材。淮猪被毛黑色，体形紧凑，四肢租；仕，适应性强，耐粗饲，抗病力强，性成熟早，产仔率高，在中国猪系中属多产品系。淮猪生产性能良好。纯繁情况下，6月龄平均体重75kg，背膘厚3cm，屠宰率65％，瘦肉率44．5％。     

姜黄素对育肥期金华猪生长性能、肉品质、脂质代谢及肠道微生物的影响

试验旨在研究饲料中添加姜黄素对育肥金华猪生长性能、肉品质、脂质代谢和肠道微生物的影响。选取日龄相近、体重为（59.2±5.3）kg的健康金华猪24头,随机分为2组,每组12头猪,3个重复,每个重复4头。对照组饲喂玉米-豆粕型基础饲料,姜黄素组在基础饲料中添加300 mg/kg姜黄素,试验预试期7 d,试验期40 d。结果显示：与对照组相比,饲料中添加300 mg/kg姜黄素对育肥期金华猪的生长性能无显著影响,但饲料中添加姜黄素降低了育肥期金华猪的平均日采食量和料耗重增比（P<0.05）;与对照组相比,饲料中添加姜黄素降低了金华猪的背膘厚和背部脂肪脂肪细胞大小（P<0.05）,还提高了肌内粗脂肪含量和眼肌面积（P<0.05）;与对照组相比,饲料中添加姜黄素下调了金华猪背部脂肪中脂肪生成相关基因PPARG、CEBPA的mRNA表达水平（P<0.05）,且提高了背最长肌中PPARG的mRNA表达水平（P<0.05）;饲料中添加姜黄素对育肥期金华猪的肠道微生物多样性无显著影响;与对照组相比,姜黄素组金华猪盲肠中厚壁菌门（Firmicutes）及布劳特氏属（Blau...     

沙乌头猪二元杂种猪活体背膘厚与眼肌面积的研究

为比较沙乌头猪二元杂种猪不同体重阶段背膘厚和眼肌面积,试验通过B超测定两种二元猪80~100 kg活体背膘厚和眼肌面积。结果表明,沙乌头猪二元杂种猪背膘厚和眼肌面积随体重增加而增加。鲁莱黑猪×沙乌头猪(LS)组背膘厚在80~90 kg极显著增加(P<0.01),眼肌面积在80~90 kg缓慢增加(P>0.05)。杜洛克猪×沙乌头猪(DS)组背膘厚在80~100 kg显著增加(P<0.05),眼肌面积在80~90 kg缓慢增加(P>0.05),90 kg后显著增加(P<0.05)。沙乌头猪二元杂种猪背膘厚和眼肌面积因杂交组合方式(地方猪血统比例)不同而异。DS组80~90 kg背膘厚均极显著低于LS组(P<0.01),而其80~90 kg眼肌面积均极显著高于LS组(P<0.01)。相关性分析结果显示,沙乌头猪二元杂种猪活体背膘厚、眼肌面积与体重均呈正相关。综上,在考虑活体背膘厚和眼肌面积方面,DS组优于LS组。研究为沙乌头猪的开发利用提供相关理论及数据支持。     

不同腹脂率番鸭回肠转录组差异分析

【目的】解析番鸭回肠组织中与腹脂沉积相关的主效基因。【方法】从2 000只番鸭中随机选取200只70日龄的番鸭进行屠宰,采集腹脂并称重,计算腹脂率。按腹脂率大小排序,选取腹脂率最高的5只和最低的5只番鸭的回肠组织进行转录组测序分析。利用Illumina NovaSeq 6000高通量RNA-Seq测序技术对2种腹脂率番鸭的回肠进行转录组测序,使用RSEM软件将测序得到的reads序列与Trinity拼接的参考基因组进行序列比对,筛选出差异表达基因,利用GO和KEGG数据库进行功能注释、富集分析和聚类分析,并利用皮尔森相关性分析方法分析了腹脂重和腹脂率与差异表达基因的相关性。【结果】高腹脂率和低腹脂率番鸭的回肠差异表达基因共有602个;与低腹脂率番鸭相比,高腹脂率番鸭回肠中有285个基因上调,317个基因下调。GO和KEGG富集分析显示,有5个与脂肪代谢相关的GO条目(脂质应答、类固醇激素介导的信号通路、类固醇激素应答、类固醇激素刺激的细胞应答和脂质的细胞应答)和4个KEGG通路(PPAR信号通路、初级胆汁酸的生物合成、花生四烯酸代谢和胆汁分泌),并筛选出与脂肪代谢显著相关的6个基因(P＜0.05),包括NR5A2、ACBP、ACOX2、FABP2、FABP4和FABP5,其中,ACOX2和FABP5基因与腹脂重和腹脂率呈显著正相关(P＜0.05),ACBP基因与腹脂重和腹脂率呈极显著正相关(P＜0.01)。【结论】不同腹脂率番鸭回肠转录组存在差异,发现5个GO条目和4个KEGG通路,NR5A2、ACBP、ACOX2、FABP2、FABP4和FABP5等基因与番鸭腹部脂肪沉积相关。     

山西白猪的微卫星标记与其体重、体尺性状的关联分析

 采用单变量动物模型分析了21个微卫星标记对山西白猪初生重、断奶重、6月龄体重、体长、体高、胸围和活体背膘厚等7个性状的影响。结果表明，S0227和S0218标记对6月龄活体背膘厚有显著影响（P<0.05）。在S0227座位上，杂合子AB型个体的6月龄背膘厚最薄；在S0218座位上，BB和CC型个体的背膘最薄。S0101标记对6月龄体高有显著影响（P<0.05），对6月龄体重的影响也接近显著水平（P=0.0854）。在S0101座位上， CC型个体的6月龄体重最大，显著高于AB型个体，而与其他类型差异不显著；BC型个体的体高最高，显著高于AB型，而与其他类型差异不显著。     

Relationship of plasma lipid concentrations to fat deposition in pigs

The time course for changes in plasma free fatty acid and triglyceride concentration after removal of feed was established. Genetically obese and lean lines of pigs, two types of crossbred female pigs and a group of male pigs were used to establish the relationship between circulating free fatty acid or triglyceride concentrations and adiposity. Pigs were weighed, ultrasonically probed for backfat thickness, bled in a fed state and again in the fasted state. Plasma was analyzed for free fatty acid and triglyceride concentration. Fasting increased plasma free fatty acid, but only slightly increased triglyceride concentrations. There were several significant correlations between backfat thickness and plasma lipid concentrations; however, the low magnitude and inconsistency of these correlations precludes use of plasma lipid concentrations as indicators of adiposity in swine. Fasted obese pigs had lower plasma fatty acid concentrations than lean pigs at 2, 4 and 6 mo of age. If these plasma levels represent in vivo mobilization of fat, the results probably contrast with previously reported in vitro results wherein adipose tissue from obese pigs had lipolytic rates expressed on a cellular basis that were equal to or greater than those form lean pigs.     

Dietary conjugated linoleic acids increase intramuscular fat deposition and decrease subcutaneous fat deposition in Yellow Breed × Simmental cattle

This study was conducted to estimate the effect of dietary conjugated linoleic acids (CLA) on intramuscular and subcutaneous fat deposition in Yellow Breed × Simmental cattle. The experiment was conducted for 60 days. The results showed that the average backfat thickness, (testicles + kidney + pelvic) fat percentage and subcutaneous fat percentage in dietary CLA were significantly lower than in the control group, while intramuscular the fat percentage was significantly higher. Compared to the control group, the Longissimus muscle enzyme activities of lipoprotein lipase (LPL), fatty acid synthase (FAS) and acetyl‐coenzyme A carboxylase (ACC) in dietary CLA and the subcutaneous fat enzyme activities of LPL, hormone‐sensitive lipase (HSL) and carnitine palmitoyltransferase‐1 (CPT‐1) were significantly increased. Similarly, compared to the control group, the Longissimus muscle sterol regulatory element binding protein 1 (SREBP‐1), FAS, stearoyl‐coenzyme A desaturase (SCD), ACC, peroxisome proliferator‐activated receptor γ (PPARγ), heart fatty‐acid binding protein (H‐FABP) and LPL gene expression in dietary CLA were significant increased, as were the subcutaneous fat of PPARγ, H‐FABP, LPL, CPT‐1 and HSL in dietary CLA. These results indicated that dietary CLA increases IMF deposition mainly by the up‐regulation of lipogenic gene expression, while decreasing subcutaneous fat deposition mainly by the up‐regulation of lipolytic gene expression.     

猪背膘中NADPH生成酶的活性与瘦肉率关系的初步研究

试验选择湖北白猪断奶仔猪48头,测定150和180日龄的活体背膘厚及背膘脂肪组织中NADPH生成酶的活性。180日龄随机屠宰36头。对背膘中4种NADPH生成酶的活性与活体背膘厚及胴体性状进行相关分析,结果表明:150和180日龄4种酶的总活性与活体背膘厚、胴体背膘厚及肥肉率呈正相关;与胴体瘦肉率呈负相关。说明4种NADPH生成酶的活性高时,猪的活体背膘厚、胴体肥肉率提高,瘦肉率降低。文中还给出了用酶活性估测瘦肉率的回归方程。研究结果表明猪背膘中4种NADPH生成酶的活性可以作为选择瘦肉型猪瘦肉率性状的辅助指标。     

猪苹果酸酶1基因5′调控区的多态性、遗传效应及功能分析

苹果酸酶1（malic enzyme 1,简称ME1）是机体内源性脂肪酸合成的关键酶,与生物体脂肪酸合成效率之间存在密切相关,猪的脂肪沉积能力与ME1的表达水平有关。为了研究该基因在转录水平上的表达调控,本试验分别用PCR、实时荧光定量RT-PCR（qPCR）和定点突变等方法,克隆了猪ME1基因5′调控区,分析了其多态性与猪背膘厚及脂肪组织中ME1mRNA表达水平的关系,还通过构建不同删除载体分析了该基因5′调控区的功能。结果表明,在猪ME1基因5′调控区的-486位点和-1 068位点分别有一个由C到T和由G到A突变产生的SNP,后者与商品猪的背膘厚关联显著（P〈0.05）。qPCR检测结果显示,在-1 068位点,等位基因G有增加ME1mRNA表达的趋势,接近显著水平（P=0.051 8）。删除试验结果显示,该基因的5′调控区614～717bp和263～405bp区段分别有增强和抑制猪ME1基因表达的顺式元件。     

SH2B1基因及miR-276-3p对猪背部脂肪沉积的影响

本试验旨在研究SH2B衔接因子蛋白1（SH2B adaptor protein 1，SH2B1）基因在猪不同组织和生长发育各阶段背部脂肪中的表达情况，预测调控该基因的miR-276-3p对猪背部脂肪表达的影响。应用实时荧光定量PCR技术检测SH2B1基因在猪脂肪、下丘脑等6种组织，以及在30、60、90、120和180 d猪背部脂肪组织中的相对表达量。靶标预测SH2B1基因的调控miRNA，并通过实时荧光定量PCR检测miR-276-3p对该基因的调控作用。结果显示，SH2B1基因在猪的6种组织中均有表达，且在脂肪组织中表达量最高，在肌肉组织中表达量最低。在猪生长发育各阶段背部脂肪中SH2B1基因均有表达，在前期（30和60 d）表达量较低，在中、后期（90、120和180 d）持续高表达，且显著高于前期表达量（P<0.05）。高、低背膘厚组背部脂肪中miR-276-3p与SH2B1基因均呈差异表达，且两者表达呈相反趋势，miR-276-3p在高背膘厚组中的表达量显著低于低背膘厚组（P<0.05），而SH2B1基因在高背膘厚组中的表达量却显著高于低背膘厚组（P<0.05）。miR-276-3p可通过靶向负调控SH2B1基因，影响猪背部脂肪的沉积。本试验结果为进一步深入研究猪背部脂肪沉积和背膘厚差异的分子机制提供参考。     

Effects of dietary energy level on lipid metabolism‐related gene expression in subcutaneous adipose tissue of Yellow breed × Simmental cattle

This study was conducted to estimate the effect of dietary energy level on lipid metabolism‐related gene expression of subcutaneous adipose tissue in Yellow breed × Simmental cattle. The experiment was conducted for 60 days. The results showed that final weight, average daily gain, average backfat thickness, (testicles + kidney + pelvic) fat percentage and subcutaneous fat percentage in the high and medium energy groups were significantly higher than in the low‐energy group but that the feed conversion ratio was significantly lower. The glucose, triglycerides, cholesterol, high‐density lipoprotein and low‐density lipoprotein in the high‐energy group were significantly higher than in the low‐energy group. With dietary energy increasing the activities of lipoprotein lipase (LPL), fatty acid synthase (FAS) and acetyl‐CoA carboxylase (ACC) significantly increased, whereas hormone‐sensitive lipase (HSL) and carnitine palmitoyltransferase‐1 (CPT‐1) significantly diminished. Peroxisome proliferator‐activated receptor γ (PPARγ), LPL, FAS, sterol regulatory element binding protein 1 (SREBP‐1), ACC, stearoyl‐CoA desaturase (SCD) and adipocyte‐fatty acid binding proteins (A‐FABP) gene expression were significantly increased by dietary energy increasing, and HSL and CPT‐1 gene expression were significantly decreased. These results indicated that with dietary energy increasing, the subcutaneous fat accumulation mainly increased due to adipose tissue lipogenic gene expression and decreased lipolytic gene expression.     

藏猪和大约克猪ACADM基因表达量与脂肪沉积性状的相关性分析

为探究中链酰基辅酶A脱氢酶(ACADM)基因在不同品种猪组织中的表达水平,并分析其与猪脂肪沉积性状的相关性,采用Sanger测序法对藏猪(58头)和大约克猪(60头)ACADM基因起始密码子上游1 kb区域进行了单核苷酸多态性(SNPs)筛选与基因分型,选取180日龄藏猪和大约克猪各10头屠宰后分别采集肝脏、背脂、心脏和背最长肌组织,利用RT-qPCR技术检测了ACADM基因的表达水平,同时测定其背膘厚和背最长肌组织中肌内脂肪含量。结果显示:在ACADM基因起始密码子上游1 kb区域,存在C-101G和C-569G这2个突变位点,藏猪与大约克猪等位基因频率呈极显著差异(P<0.01);在藏猪与大约克猪的肝脏、背脂、背最长肌和心脏组织中ACADM基因表达趋势完全一致,藏猪极显著高于大约克猪(P<0.01);经ACADM基因表达量与背膘厚、肌内脂肪含量相关性分析发现,ACADM基因mRNA相对表达量与背膘厚和肌内脂肪含量呈显著正相关(P<0.05)。通过以上结果推测这2个突变位点可能是调控ACADM基因表达的重要功能位点,从而导致猪脂肪沉积性状的差异。本研究为进一步开展ACADM基因对猪脂肪沉积的调控机制研究提供了重要支撑。     

Effects of growth rate on carcass and meat quality traits and their association with metabolism-related gene expression in finishing pigs

The objective of this study was to evaluate the effect of different growth rates on carcass characteristics and meat quality and their relationship with myogenesis and lipogenesis in finishing pigs. Pigs were slaughtered at the same age and were assigned to high (HGR) or low (LGR) growth rates with 120 kg or 110 kg final body weights at slaughter. The results indicated that pigs with HGR had heavier (P < 0.05) final body weight, carcass weight, dressing percentage, backfat thickness, higher (P < 0.05) concentrations of fat in the muscle and higher (P < 0.05) total RNA concentration in muscle than pigs with LGR. The messenger RNA (mRNA) expression of lipoprotein lipase, fatty acid synthase, malic enzyme, peroxisome proliferator-activated receptor γ, and sterol regulatory element binding protein-1 in fat were higher (P < 0.05) in pigs with HGR. Additionally, the mRNA expression of glycogen synthase in muscle was lower (P < 0.05) in pigs with HGR. These results indicate differences in postmortem myogenesis and lipogenesis traits of pigs with different growth rates; these differences in turn might have affected carcass characteristics and meat quality.