反转录-聚合酶链反应检测猪繁殖与呼吸综合征病毒的研究

本研究成功地建立了检测猪繁殖与呼吸综合征病毒（ＰＲＲＳＶ）的反转录－聚合酶链反应（ＲＴ－ＰＣＲ）技术。根据ＰＲＲＳＶ两个标准毒株（美洲ＡＴＣＣ ＶＲ－２３３２株及欧洲ＬＶ株）膜蛋白和核衣壳蛋白的编码序列差异,自行设计合成了各自的引物,对两标准毒株及广州分离株（ＣＤＧ９５１２）进行扩增,获得了预期久为１ｋｂ的扩增片段。酶切鉴定,结果进一步主宰两标准毒株间基因差异显著,分离株与美洲株更为接近,百不同于     

猪繁殖—呼吸道综合征病毒（PRRSV）CH—1a株基因型鉴定

根据猪繁殖－呼吸道综合征病毒（ＰＲＲＳＶ）美洲型毒株和欧洲型毒株的基因组序列设计合成了２对引物,即１００８ＰＳ／１００９ＰＲ和１０１０ＰＬＳ／１０１１ＰＬＲ。我国分离的ＣＨ－１ａ株用这２对引物均能扩增出与预期大小相符的ＲＴ－ＰＣＲ产物,分别与美洲型代表株（ＶＲ－２３３２）的ＲＴ－ＰＣＲ产物大小相当。特异性试验表明,这２对引物均不能扩增其他常见的繁殖障碍相关病毒的ＲＮＡ或ＤＮＡ以及未感染的ＭＡＲＣ－１４５细胞ＲＮＡ。间接免疫荧光试验也证明,ＣＨ－１ａ株与ＰＲＲＳＶ核衣壳蛋白特异性单克隆抗体以及美洲型毒株抗血清均呈阳性反应。因此初步证实ＣＨ－１ａ株为美洲型ＰＲＲＳＶ。     

用反转录—聚合酶链反应检测猪繁殖与呼吸综合征病毒的研究

根据猪繁殖与呼吸综合征病毒美洲型标准毒株的ＯＲＦ６及部分ＯＲＦ７的序列，设计合成了一对引物２６３７４ ＰＳ／２６３７５ＰＲ，用反转录－聚合酶链反应技术对６株ＰＲＲＳＶ北京分离株进行了检测。结果该引物对６株病毒均能扩增出与预期大小相符的ＲＴ－ＰＣＲ产物，并与ＡＴＣＣ ＶＲ－２３３２株扩增产物的大小相当，而欧洲型标准毒株未获扩增片段。     

猪繁殖与呼吸综合征病毒北京分离株的ORF7克隆与序列分析

将北京地区猪系列与呼吸综合征病毒（ＰＲＲＳＶ）分离ＢＪ－２和ＢＪ０４的ＯＲＦ７及部分３端编码区（ＵＴＲ）的ＲＴ＿ＰＣＲ扩增产物克隆连接于ｐＧＥＭ－Ｔｅａｓｙ质粒载体上,重组质粒经ＥｃｏＲⅠ酶切鉴定后进行了双链测序。测定垢基因序列与欧已知序列比较发现,ＢＪ－２和ＢＪ－４株与美洲ＶＲ－２３３２株非常接近,在其长度为５５５ｂｐ的ｃＤＮＡ序列中,仅与ＶＲ－２３３２株分别相差１和２个核苷酸,其中ＯＲＦ７的核     

猪繁殖和呼吸综合征病毒基质膜蛋白和核衣壳蛋白基因的克隆与鉴定

猪繁殖和呼吸综合征病毒（ＰＲＲＳＶ）的基质膜（Ｍ）蛋白和核衣壳（Ｎ）蛋白是２种重要的结构蛋白。本试验根据ＰＲＲＳＶ美洲毒株的基因序列,设计了能够扩增Ｍ和Ｎ蛋白基因的１对引物,并在２个引物的两端分别加入ＥｃｏＲＩ和ＢａｍＨＩ酶切位点,经ＲＴ－ＰＣＲ技术获得了一约９５０ｂｐ的目的基因片段,并将此基因克隆于ＰＢＶ２２０载体,构建了ＭＮ蛋白基因重组质粒ＰＢＶＭＮ,进一步由重组质粒回收ＭＮ基因片段亚克隆于ｐＳＫ＋（ｐＢｌｕｅｓｃｒｉｐｔＳＫ＋）测序载体,构建了重组质粒ＰＢＳＭＮ,经部分序列分析鉴定,重组质粒含ＭＮ蛋白基因。此基因的克隆为进一步研究该病毒ＭＮ蛋白免疫学特性及其分子基础和基因诊断技术奠定了基础。     

猪生殖与呼吸综合征病毒ORF6片段的cDNA克隆及鉴定

根据已发表的ＰＲＲＳＶ基因组序列，设计并合成了１对特异扩增ＡＴＣＣ ＶＲ－２３３２株的ＯＲＦ６的基因的引物，以ＡＴＣＣ ＶＲ－２３３２基因组为模板，通过ＲＴ－ＰＣＲ扩增出５８６ｂｐ的ｃＤＮＡ产物。将该ｃＤＮＡ片段经Ｔ－Ａ连接插入ｐＧＥＭ－Ｔｅａｓｙ载体中，用重组质粒转化大肠埃希氏菌ＪＭ１０９，获得重组质粒转化菌。对重南粒ＤＮＡ进行ＰＣＲ及酶切鉴定，证明插入的ＤＮＡ片段与ＰＣＲ扩增的ＤＮＡ片段大小相     

中国华东地区猪生殖-呼吸道综合征病毒(S_1株)ORF_(5～7)基因特征研究

本研究对我国华东地区猪生殖和呼吸综合征病毒（ＰＲＲＳＶ）分离株Ｓ１主要结构蛋白基因（ＯＲＦ５～７）进行了ＰＣＲ扩增和ＤＮＡ测序分析。结果表明，长度为１５２０ｂｐＤＮＡ序列含有３个阅读框ＯＲＦｓ，即ＯＲＦ５、ＯＲＦ６和ＯＲＦ７，ＯＲＦ５和ＯＲＦ６及ＯＲＦ６和ＯＲＦ７间有部分碱基重叠，且与欧洲型和美洲型ＰＲＲＳＶ相似。ＯＲＦｓ推导的氨基酸序列与美国ＶＲ２３３２和欧洲ＬＶ毒株同源性分析为９９％～１００％和５９％～７８％。ＯＲＦｓ预测的蛋白质分子量、等电点、糖基化位点、亲水性分布图及跨膜螺旋区与ＶＲ２３３２毒株相似。     

猪繁殖与呼吸道综合征RT-PCR诊断方法的建立

根据猪繁殖与呼吸道综合征病毒（ＰＲＲＳＶ）核衣壳蛋白ＯＲＦ７的序列,设计了１套引物,对立了检测ＰＲＲＳＶ核酸的ＲＴ－ＰＣＲ方法。通过对猪繁殖与呼吸道综合征（ＰＲＲＳ）标准毒株的检测,证明该方法不仅能够扩增出特异性的核酸片段。同时可以从基因水平上区分ＰＲＲＳＶ美洲型和欧洲型。使用该方法对国内临床上疑似为ＰＲＲＳ的送检样品进行检测,结果为阳性,并确定基因型均为美洲型。该研究建立的从组织中直接提取细胞总     

禽呼肠孤病毒S1基因的扩增克隆与鉴定

利用反转录－聚合酶链（ＲＴ－ＰＣＲ）技术,扩增出禽呼肠孤病毒（ＡＲＶ）Ｓ１１３３、１７３３长为５４０ｂｐ的Ｓ１基因片段。将扩增到的２个毒株的Ｓ１基因通过粘端连接分别克隆到ｐＢｌｕｅｓｃｒｉｐｔⅡＫＳ＋质粒中,用ＰＣＲ和限制性内切酶分析鉴定,表明获得２种重组质粒ＡＲＶ Ｓ１１３３ Ｓ１－ｐＢｌｕｅｓｃｒｉｐｔ、ＡＰＶ １７３３ Ｓ１－ｐＢｌｕｅｓｃｒｐｔ。     

RT-PCR检测禽传染性支气管炎病毒

用２对已发表的引物和１对自行设计的引物对同一禽传染性支气管炎病毒（ＩＢＶ）Ｈ１２０株进行ＲＴ－ＰＣＲ,分别获得了Ｓ１基因上与引物设计相一致的１７２０、２２８、６０２ｂｐ的扩增片段。用自行设计的引物对７个毒株（Ｈ１２０、Ｈ５２、Ｍ４１、Ｃｏｎｎ、Ｇｒａｙ、Ｔ、Ｈｏｌｔｅ）和５个分离株（宜毒、上毒、云毒、ＨＫ、１１８）的含毒尿囊液或纯化病毒进行ＲＴ－ＰＣＲ,结果除Ｈｏｌｔｅ株和２个分离株（宜毒、云毒）外,其余均成功地扩增出６００ｂｐ的片段。用１．７、０．２、０．６ｋｂ３对引物对６个ＩＢＶ毒株和６个分离株的含毒尿囊液在相同和不同条件下进行ＲＴ－ＰＣＲ,结果３对引物分别扩增出３、５、９株ＩＢＶ,同时可将不同血清型的１２个ＩＢＶ株分成６种基因型。将ＩＢＶ分离株ＨＫ与标准株Ｍ４１经ＰＣＲ扩增、ＨａｅⅢ和Ｈｉｎｄ酶切、ＲＦＬＰ分析,表明属同一马萨诸塞血清型。３株ＩＢＶ（Ｈ１２０,ＨＫ,Ｍ４１）在鸡胚中繁殖,ＰＣＲ最早检出的时间为２０～２４ｈ。ＲＴ－ＰＣＲ提供了直接从尿囊液和感染鸡组织中快速检测病毒的新方法。     

华东某猪场猪繁殖与呼吸综合征的诊断与防制

华东区某猪场暴发以妊娠母猪繁殖障碍为特征的传染病。在该场采集可疑病例血样 62份进行检测 ,其中 53份血清为猪繁殖与呼吸综合征(PRRS)阳性 ,阳性率高达 85 4 %。结合病毒分离鉴定确诊为PRRS病毒 (PRRSV)感染 ,RT PCR试验证实分离毒属美洲型PRRSV ,且与ATCC VR2 332株属同一基因亚型。确诊后采取隔离、消毒及采用当地病猪肺组织灭活苗紧急接种等措施 ,取得了较满意的效果。跟踪血清学调查显示 ,1年后该场抽检血样PRRS阳性率仍达 80 %     

猪生殖-呼吸道综合征病毒CH-1a株ORF2～7序列测定

新近发现的猪生殖－呼吸道综合征病毒（ＰＲＲＳＶ）是单股ＲＮＡ病毒，属于不久前成立的动脉炎病毒科。为了比较从国内分离的ＰＲＲＳＶ与欧美ＰＲＲＳＶ毒株的分子遗传学关系，本文扩增并克隆了ＰＲＲＳＶＣＨ－１ａ株ＯＲＦ２～７，测定了其核苷酸序列。用序列分析软件进行核苷酸和氨基酸序列比较分析，结果表明ＣＨ－１ａ株与欧洲型代表株ＬＶ的遗传关系较远，与北美洲型代表株ＶＲ－２３３２遗传距离最近，可能来自同一祖先。     

1株NADC30-like重组猪繁殖与呼吸综合征病毒的分离鉴定及遗传变异分析

为研究山东地区猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)流行病毒株的遗传变异情况,本研究从山东省威海市某疑似猪繁殖与呼吸综合征(PRRS)发病猪场采集的猪肺脏组织中分离到1株PRRSV,命名为SDwh,并对其进行了全基因组序列测定、遗传演化分析和重组分析.结果显示:该病毒株在Marc-145细胞上生长良好,可见明显细胞病变;全基因组演化分析和同源性比对分析结果显示,SDwh株与美国病毒株NADC30和中国的NADC30-like位于同一分支;与北美病毒株NADC30的同源性最高,为93.1%;与我国分离的NADC30-like病毒株CHsx1401、JL580的同源性分别为91.1%和88.4%;与北美经典病毒株VR2332、中国HP-PRRSV JXA1和HuN4的同源性均为85.3%;与欧洲型病毒株Lelystad-virus(LV)同源性最低,为60.6%.与VR2332相比,Nsp2氨基酸序列比对结果显示,SDwh株存在NADC30-like病毒株典型的131个不连续氨基酸的缺失,同时在584~585位缺失2个氨基酸;GP5氨基酸序列比对结果显示,SDwh在GP5抗原表位上有氨基酸的突变.全基因组重组分析结果显示,SDwh株是一株重组病毒株,为NADC30与JXA1-P80的重组病毒,潜在的重组位点位于Nsp2中(2066 nt).本研究结果为PRRSV流行株的重组、演化分析和防控提供借鉴意义.     

猪繁殖与呼吸综合征病毒强毒株HUB2株全基因组序列分析

从湖北省暴发猪"高热病"的猪场分离出1株猪繁殖与呼吸综合征病毒(Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV),并命名为HUB2株.根据GenBank上已发表的PRRSV全基因序列设计引物进行RTPCR扩增,获得PRRSV HUB2株全基因组cDNA序列.测序结果表明PRRSV HUB2株基因组全长15 320 bp(不包括PolyA尾).分析结果显示该毒株与PRRSV美洲型标准株(VR-2332)和欧洲型标准株(LV)全基因核苷酸同源性分别为89.6%和50.3%.说明HUB2属于美洲型毒株.与VR-2332相比,HUB2株非结构蛋白(Nsp2)存在2处不连续的缺失(共缺失30个氨基酸),其缺失位点位于推定氨基酸序列的第481位和532～560位.此次新出现的强毒株全基因组序列特性的揭示为科学防治猪高致病性蓝耳病奠定了理论基础.     

猪繁殖与呼吸综合征病毒GP5、M蛋白基因的克隆及其基因疫苗构建

参照GenBank中猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)美洲型代表株VR2332 GP5和M蛋白基因序列,设计并合成2对引物,用RT-PCR方法分别扩增出PRRSV野毒株GP5和M蛋白基因603,525bp片段,并将其分别克隆到pMD18-T载体。测序正确后,将GP5和M蛋白基因分别克隆到真核表达载体pEGFP-C1上,成功构建基因疫苗表达载体pEGP5-C1和pEM-C1。小鼠免疫试验证实,这些基因疫苗质粒可以诱导小鼠产生特异性抗体,并在二免后1周开始检测到特异性淋巴细胞增殖反应。     

2006—2012年鲁豫冀地区15株猪繁殖与呼吸综合征病毒的分离鉴定及ORF5/Nsp2基因的遗传变异分析

为研究鲁豫冀地区猪繁殖与呼吸综合征病毒(porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)的遗传变异情况,对2006—2012年来自3省区发病猪场的42份样品进行PRRSV分离鉴定,并进行了生物学特性研究和PCR鉴定,结果显示先后分离到15株PRRSV。分别采用RT-PCR扩增其ORF5基因和部分Nsp2基因并测序,与GenBank中68个ORF5序列和40个Nsp2序列的推导氨基酸序列进行比对,遗传变异分析结果表明,15株分离株均属于美洲型毒株,其中13个毒株Nsp2基因推导的氨基酸序列均存在氨基酸的不连续缺失,其ORF5基因推导的氨基酸序列与JXA1株有较高的同源性(95.5%~97.5%);SDDY2007株与疫苗株RespPRRS MLV和VR2332株亲缘关系相近,处于同一个亚群中;而HN25-2009分离株Nsp2基因推导的氨基酸序列有30个氨基酸的特征性缺失,其ORF5基因推导的氨基酸序列的遗传进化分析结果显示该分离株处于VR2332所在亚群(氨基酸同源性97.5%),具有一定特殊性。本试验结果表明,2006—2012年高致病性PRRSV是鲁豫冀地区的优势流行毒株,且存在疫苗毒株,3省区流行毒株间有一定遗传差异,但无明显地域特征。     

猪繁殖与呼吸综合征病毒辽宁分离株ORF5基因的克隆与序列分析

本试验以辽宁地区某猪场猪繁殖与呼吸综合征(porcine reproductive and respiratory syndrome,PRRS)发病猪病料为材料,采用RT-PCR方法特异性扩增编码猪繁殖与呼吸综合征病毒(porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)GP5蛋白的ORF5基因全长cDNA,结果该分离株ORF5基因编码区长603bp,可编码200个氨基酸。与美洲型代表株VR2332、欧洲型代表株LV进行同源性比较,氨基酸同源性分别为89.5%和55.7%。推测该辽宁分离株属于美洲型。     

The primary GP5 neutralization epitope of North American isolates of porcine reproductive and respiratory syndrome virus

I have used indirect ELISA with overlapping synthetic peptides representing the GP5 ectodomain to study the generation and specificity of peptide-binding Abs in pigs that were infected in utero with porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRSV) strain VR2332 and in North American field sera submitted for PRRSV infection diagnosis. Peptide-binding Abs appeared in sera of the VR2332-infected pigs within about 30 days post-farrowing (dpf), reaching maximum titers 100-200 dpf and then decreasing slowly to about half of maximum titer by about 400 dpf. The formation of peptide-binding Abs and of virus neutralizing Abs correlated and their initial appearance coincided with disappearance of virus from the circulation. The Abs were specific for VR2332-specific peptides. In contrast, anti-N-protein Abs as measured by HerdCheck ELISA appeared within 7 dpf, reached maximum levels at about 100 dpf and had decreased below detectable levels by about 200 dpf. Twenty-seven field serum samples with virus neutralizing activity all possessed high levels of peptide binding Abs, but the Abs bound about equally to VR2332 and strain Lelystad virus (LV)-specific peptides. The indirect ELISA results using various large peptides and competition ELISA using small peptides (8 or 9 amino acids long) confirmed that the epitope recognized by the Abs is located in the GP5 ectodomain sequence 37SHLQLIYNL of VR2332. Use of mutated peptides in the competition ELISA showed that 42I to T and 38HL to TY substitutions blocked Ab recognition, whereas deletion of 41L had no effect. In addition, 26 serum samples submitted by two farms for diagnostic tests were found to possess low levels of Abs that bound to GP5 ectodomain peptides, even though the sera were sero-negative in the HerdChek ELISA and lacked neutralizing activity. Competition ELISA showed that the Abs recognized one or more epitopes located downstream of the PRRSV neutralization epitope. An epitope(s) located in the same area was recognized by Abs generated in mice by immunization with a GP5 ectodomain peptide conjugated to BSA. These Abs also lacked neutralizing activity.