猪生殖—呼吸道综合征病毒CH—1al株ORF2～7序列测定

新近发现的猪生殖－呼吸道综合征病毒（ＰＲＲＳＶ）是单股ＲＮＡ病毒,属不久前成立的动脉炎病毒科。为了比较从国内分离的ＰＲＲＳＶ与欧美ＰＲＲＳＶ毒株的分子遗传学关系,本文扩增并克隆了ＰＲＲＳＶ ＣＨ－１ａ株ＯＲＦ２￣７,测定了其核苷酸序列。与北美洲型代表株ＶＲ－２３３２遗传距离最近,可能来自同一祖先。     

中国结东地区猪生殖—呼吸道综合征病毒（S1株）ORF5—7基因特？…

本研究对我国华东地区猪生殖和呼吸综合征病毒分离株Ｓ１主要结构蛋白基因进行了ＰＣＲ扩增和ＤＮＡ测序分析。结果表明,长度为１５２０ｂｐ ＤＮＡ序列含有３个阅读框ＯＲＦｓ,即ＯＲＦ５,ＯＲＦ６和ＯＲＦ７,ＯＲＦ５和ＯＲＦ６及ＯＲＦ６和ＯＲＦ７间有部分碱基重叠,且与欧洲一美洲型ＰＲＲＳＶ相似。     

猪生殖-呼吸道综合征病毒CH-1_株N基因的原核表达

将ＰＲＲＳＶＣＨ１ａ株Ｎ基因用ＥｃｏＲＩ和ＰｓｔＩ双酶切从重组质粒ｐＵＣ１８ＯＲＦ７切下后,插入到原核表达载体ｐＢＶ２２０的ＰＲ、ＰＬ启动子下游,得到重组表达质粒ｐＢＶ２２０ＯＲＦ７。转化了ｐＢＶ２２０ＯＲＦ７的大肠杆菌ＪＭ８３经诱导培养后,用ＳＤＳＰＡＧＥ和Ｗｅｓｔｅｒｎｂｌｏｔ检测表达产物。结果表明ＰＲＲＳＶＣＨ１ａ株的Ｎ基因在原核载体上得到高效表达,表达产物占菌体总蛋白的１５３％。表达蛋白可望成为有价值的ＰＲＲＳ诊断抗原。     

猪繁殖与呼吸综合征病毒北京分离株的ORF7克隆与序列分析

将北京地区猪系列与呼吸综合征病毒（ＰＲＲＳＶ）分离ＢＪ－２和ＢＪ０４的ＯＲＦ７及部分３端编码区（ＵＴＲ）的ＲＴ＿ＰＣＲ扩增产物克隆连接于ｐＧＥＭ－Ｔｅａｓｙ质粒载体上,重组质粒经ＥｃｏＲⅠ酶切鉴定后进行了双链测序。测定垢基因序列与欧已知序列比较发现,ＢＪ－２和ＢＪ－４株与美洲ＶＲ－２３３２株非常接近,在其长度为５５５ｂｐ的ｃＤＮＡ序列中,仅与ＶＲ－２３３２株分别相差１和２个核苷酸,其中ＯＲＦ７的核     

中国华东地区猪生殖-呼吸道综合征病毒(S_1株)ORF_(5～7)基因特征研究

本研究对我国华东地区猪生殖和呼吸综合征病毒（ＰＲＲＳＶ）分离株Ｓ１主要结构蛋白基因（ＯＲＦ５～７）进行了ＰＣＲ扩增和ＤＮＡ测序分析。结果表明，长度为１５２０ｂｐＤＮＡ序列含有３个阅读框ＯＲＦｓ，即ＯＲＦ５、ＯＲＦ６和ＯＲＦ７，ＯＲＦ５和ＯＲＦ６及ＯＲＦ６和ＯＲＦ７间有部分碱基重叠，且与欧洲型和美洲型ＰＲＲＳＶ相似。ＯＲＦｓ推导的氨基酸序列与美国ＶＲ２３３２和欧洲ＬＶ毒株同源性分析为９９％～１００％和５９％～７８％。ＯＲＦｓ预测的蛋白质分子量、等电点、糖基化位点、亲水性分布图及跨膜螺旋区与ＶＲ２３３２毒株相似。     

猪生殖一呼吸道综合征病毒的分子生物学研究现状

猪生殖-呼吸道综合征病毒（PRRSV）是近几年发现的一种新病毒，就该病毒的生物学特性、基因组结构、病毒蛋白、病毒的变异及分类以及该病毒病的分子生物学诊断等分子生物学方面知识作一简单综述。     

猪生殖与呼吸综合征病毒广东株ORF3和ORF5基因的克隆与分析

采用RT-PCR方法扩增了猪生殖与呼吸综合征病毒广东株的糖蛋白基因ORF3、ORF5，并对其进行了克隆和序列分析。用Blast分析软件比较分析了其与VR-2332株以及流行的欧洲株之间的同源性，并对其编码氨基酸序列的分子质量、等电点、穿膜区、糖基化位点进行了分析。结果显示，PRRSV广东株ORF3与美洲株的同源性达90％，而与欧洲株只是在318～393bp、502～697bp之间有77％左右的同源性；ORF5与美洲株的同源性为88％，与欧洲株仅在133～209bp区间有77％左右的同源性。     

7株猪2型圆环病毒ORF2基因的克隆及其序列分析

为了研究分离的猪圆环病毒2型基因序列,根据GenBank中猪圆环病毒2型(PCV2)ORF2基因序列设计1对引物,通过PCR方法从采自不同地区的7份疑似断奶仔猪多系统衰竭综合征(PM-WS)的仔猪组织病料中分别扩增出PCV2的ORF2基因,并将获得的ORF2基因片段分别克隆入pMD18-T载体,通过筛选获得重组质粒,分别命名为pMD-PCV2-HN01、pMD-PCV2-DY01、pMD-PCV2-HM01、pMD-PCV2-SDqd01、pMD-PCV2-SDqd02、pMD-PCV2-SDqd03、pMD-PCV2-PD01,并进行测序及序列分析。结果表明:HN01株ORF2基因全长为705 bp,另外6株ORF2基因全长均为702 bp;7株分离株的ORF2基因核苷酸序列同源性较高,为94.0%～99.9%,氨基酸序列同源性达93.6%以上;7株分离株与GenBank中登录的德国株和台湾株的核苷酸序列同源性较低,分别为91.7%～93.2%和89.0%～90.5%,而与丹麦、法国、中国株的核苷酸序列同源性较高,达94.0%以上,氨基酸序列同源性均达89.3%以上。     

猪繁殖与呼吸综合征病毒GX1003株全基因序列测定与分析

为了解广西省猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的遗传变异情况,采用RT-PCR对PRRSV广西地方分离株GX1003株全基因组进行分段扩增、测序与分析。结果表明,不包括Poly(A)尾,GX1003株基因组全长为15 320nt。同源性分析表明,GX1003株与比对的国内外PRRSV美洲型毒株全基因核苷酸及其推导氨基酸序列的同源性分别为85.0%～99.4%和82.1%～99.1%,与欧洲型代表株LV株的同源性分别为60.6%和51.3%。序列分析表明,GX1003株的NSP2编码区存在第481位aa和第533～561aa发生30个氨基酸的不连续缺失,具有高致病性PRRSV(HP-PRRSV)的遗传特征;同时,在不同编码区出现与HP-PRRSV代表株JXA1株不同的遗传变异现象。遗传进化分析表明,比对的所有美洲型毒株可以分为4个亚群,GX1003株分布在以JXA1株为代表的亚群4中。表明PRRSV广西地方分离株GX1003株属于HP-PRRSV,但其基因组在不同区域发生了新的遗传变异。     

猪繁殖与呼吸综合征病毒GZZJ201711株全基因组序列分析

为了解贵州省毕节地区猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)基因变异情况,于2017年从贵州毕节地区某疑似感染PRRSV猪群分离到1株PRRSV,将其命名为GZZJ201711毒株。采用RT-PCR分段扩增出PRRSV GZZJ201711株13个基因片段,分别连接到pMD19-T载体上进行测序,拼接后得到PRRSV GZZJ201711株全基因组长15 322 bp (去除polyA尾),包括5’UTR、ORFla-ORF7、3’UTR。序列分析表明,GZZJ201711株与欧洲型Lelystad virus(LV)株核苷酸同源性为60.3%,与美洲型毒株代表株ATCC VR-2332核苷酸同源性为89.2%,与HP-PRRSV(HUN4、JXA1、TJ)等毒株同源性在98.8%~98.9%之间。GZZJ201711株与高致病性毒株JXA1、HUN4、TJ属于同一小分支,其中与XJu-1、GDHY毒株遗传关系最近。GZZJ201711毒株的NSP2基因有30个氨基酸缺失,与JXA1、HUN4、TJ等HP-PRRSV毒株缺失位置一致。     

猪繁殖障碍与呼吸道综合征病毒福州株ORF2-7基因结构分析

用RT-PCR方法分段扩增出猪繁殖障碍与呼吸道综合征病毒（PRRSV） FZ株的5条cDNA片段，分别克隆到pMD-18T载体并进行测序，按顺序将这些序列进行拼接得到FZ株ORF2-7编码框序列，测序结果表明该序列长度为3272bp，与BJ 4株、VR 2332株、CH-1a 株和HB-1株核苷酸同源性分别为99.1%、98.9%、93.2%和93.2%。     

PRRSV河北地方分离株ORF5基因序列分析

为了分析河北秦皇岛和唐山部分地区流行的猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)ORF5基因变异情况,对采集自秦唐部分地区在2009年的临床发病猪肺组织,提取其RNA,通过RT-PCR扩增样本中PRRSV的ORF5全序列,并对其进行生物信息学分析.应用DNA Star软件分析序列,系统进化分析表明,它们与国内2006年-20...     

猪繁殖与呼吸综合征病毒BJ-4株糖蛋白基因ORFs2～4的克隆与分析

采用 RT- PCR扩增了猪繁殖与呼吸综合征病毒 BJ- 4株糖蛋白基因 ORFs2～ 4,并对其进行了克隆和序列测定。用序列分析软件分析了其编码产物的分子量、信号肽、糖基化位点、穿膜区、抗原表位、等电点及疏水性等分子特征 ,为体外高效表达基因 ORFs2～ 4编码产物 GP2 、GP3 、GP4和进一步探讨其功能与作用奠定了基础     

猪繁殖与呼吸综合征病毒FS株Nsp9基因的克隆与序列分析

为了对猪繁殖与呼吸综合征病毒（PRRSV）Nsp9基因的功能进行预测,利用RT-PCR法从细胞毒中扩增PRRSV FS株的Nsp9基因,并将其克隆至pMD18-T载体上,测序得到Nsp9基因序列,利用多种生物信息学软件分析Nsp9序列生物学信息。结果显示,Nsp9基因全长1 929 bp,目的基因的蛋白分子质量为70.5 ku,pI为7.78,表明该蛋白不稳定;抗原性分析显示,Nsp9基因存在多个抗原位点,柔韧性较好,多处位点的亲水性较强,适合作为单抗制备的表位;同种亚型不同毒株的Nsp9基因氨基酸同源性为96.9%～98.9%,这表明Nsp9基因高度保守,可进一步作为检测靶蛋白用于猪繁殖与呼吸综合征（PRRS）的诊断与疫苗免疫;亚细胞定位预测该基因可能定位于细胞质中,而不是细胞核内;同源建模预测三级结构结果显示,三维结构呈右手型,具有3个亚结构域,没有信号肽。此外,亲本株Nsp9基因与疫苗株Nsp9基因存在多个氨基酸的突变,这些氨基酸的插入与缺失是否与病毒的聚合酶活性和毒力有关还需要进一步试验验证。     

高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒BJSD株和BJPG株序列分析

本研究旨在预测与分析高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒BJSD株和BJPG株序列特点,为其下一步研究作准备。利用分子生物学软件及服务器,对BJSD株和BJPG株全序列及各结构蛋白的生化特性、溶解性和核定位信号等进行了分析,结果显示BJSD株和BJPG株至少有12个非结构蛋白和6个结构蛋白;同源性比较结果显示GP3和GP5蛋白变异性高,M和N蛋白保守。GP3、GP5和M蛋白糖基化位点与参考株相比有变化,GP2、GP4和N蛋白糖基化位点与所有参考株一致。服务器预测BJSD株 和BJPG株GP2、M和N蛋白生化特性显示各项数据完全一致,其中N蛋白的碱性氨基酸比例明显高于其他蛋白,总平均亲水值明显低于其他蛋白;GP2、GP3和GP4蛋白不稳定,GP5、M和N蛋白稳定。BJSD株和BJPG株可溶性只有GP3和GP5略有差别,其余蛋白数据一致,6个结构蛋白预测不溶性概率均在66%以上,GP3不溶性概率最高。BJSD株和BJPG株结构蛋白核定位结果显示,两株仅GP3和GP5有差异,其余蛋白分布情况完全一致。可以利用以上一些不同于以往各代表株的特点,对PRRS的诊断和防制做进一步的研究。     

Cloning and Sequence Analysis of Nsp9 Gene of Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome Virus FS Strain

In order to evaluate the function of Nsp9 gene,the target gene of porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRSV) FS strain was amplificated and sequenced after being cloned into the pMD18-T vector.The physical and chemical properties,homology,hydrophilicity,surface probability plot,antigenic index,secondary structure and subcellular localization were predicted by various softwares.The results showed that the length of Nsp9 was 1 929 bp,its predicted molecular weight was 70.5 ku and pI was 7.78,and it was unstable protein.There were many antigen sites,and the flexibility and hydrophilicity of Nsp9 were ideal.The study showed that Nsp9 possessed potential antigenicity,and it fits for preparation of monoclonal antibodies.The results of subcellular location showed that it might exist in the cytoplasm.Nsp9 of FS strain shared 96.9% to 98.9% amino acid homology with other strains of the some hypotype.Some amino acid mutations were found between the parent strains and vaccine strains,and insertions and deletions could be found among the European strains and the American strains.Whether these insertions and deletions correlate with the virulence and polymerase needed further research.     

猪繁殖与呼吸综合征病毒TS株结构蛋白基因的克隆与变异分析

从河北唐山分离到一株疑似猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV),接种Marc-145细胞,经2代盲传后出现细胞病变,经鉴定为PRRSV,命名为TS株。利用RT-PCR扩增出TS株各基因的cDNA片段,然后克隆入pMD19-T载体并测序。应用DNAStar软件,结合其它河北毒株与多株GenBank中已发表的PRRSV毒株相应基因进行序列比较。结果表明:PRRSV TS株与VR-2332同源性为88.9%-94.7%,与河北省2007年以来发现的8个毒株同源性很强,为98.0%-99.7%;与LV株的亲缘关系较远,同源性为61.2%-69.0%,属于美洲型。遗传进化树表明国内美洲型分离株明显分为2个亚群,所有河北省流行毒株属于同一亚群,且TS株与高致病性代表毒株JXA1关系非常近。本研究将为河北省预防和控制PRRS提供重要的理论数据。