3-羟基-2,4,6-吡啶三羧酸的原位合成及结构表征

在水热条件下采用硝酸铜和2,4,6-三甲基吡啶为原料合成了两个新的配合物[Cu4（2,4,6-opyta）2（H2O）8]（1）和[Cu4（2,4,6-opyta）2（H2O）6].2H2O（2）,并对配合物的结构进行了X-射线单晶衍射分析.结果表明,两配合物互为超分子异构体,结构中都包含有[Cu2（2,4,6-opyta）2]基本单元,且均结晶于三斜晶系,P-1空间群,其晶胞参数分别为a=7.008 8（9）,b=8.055 0（10）,c=10.979 0（10）,α=73.419（2）°,β=87.934（2）°,γ=85.127（2）°,V=591.86（12）3和a=6.980 2（7）,b=7.067 6（7）,c=13.234 6（14）,α=82.698（2）°,β=76.977（2）°,γ=79.960（2）°,V=623.74（11）3.     

莱姆病螺旋体端粒解离酶的表达纯化及其晶体衍射分析

【目的】对莱姆病螺旋体（Borrelia burgdorferi）端粒解离酶（telomere resolvase，ResT）进行原核可溶性表达纯化，并筛选高衍射度的ResT-DNA复合物晶体，为探究ResT DNA复合物的结构和功能奠定基础。【方法】合成pET28-b-ResT表达质粒，构建原核表达载体pSUMO-ResT，分析ResT可溶性蛋白在BL21(DE3)、BL21(DE3) pLysS、BL21 Gold(DE3) pLysS、BL21 Codon Plus(DE3)、Rosetta(DE3)和Rosetta(DE3) pLysS中的表达量，获得最优的ResT原核表达菌株。基于AlphaFold预测的ResT蛋白模型，利用定点突变及ResT可溶性蛋白表达分析，获得高效可溶性表达ResT突变体。经Ni-NTA亲和层析、HiTrap Heparin HP亲和层析及分子筛层析对ResT突变体 ResT（W94H）进行蛋白纯化。利用EMAS检测ResT（W94H）与DNA的结合能力。使用蛋白晶体接种（seeding）和交叉接种（cross-seeding）方法，利用多种商业化结晶试剂盒筛选并优化ResT-DNA复合物的结晶条件，对复合物晶体进行X射线衍射分析。【结果】BL21 Gold(DE3) pLysS菌株是ResT最佳的高效可溶性表达菌株，W94H突变体比野生型具有更强的可溶性表达。获得了高纯度（95%）且高质量浓度（15 mg/mL）的ResT（W94H），其能够与底物DNA形成稳定的ResT DNA复合物。在18 ℃下，ResT DNA最佳结晶条件是：PEG3350 150 g/L、二甲苯二酸钠0.1 mol/L（pH 6.6）、NaCl 0.15 mol/L，ResT-DNA晶体分辨率最高为3.52 ?，晶体空间群为P4。【结论】得到了高纯度ResT (W94H）蛋白，获得了ResT-DNA复合物晶体。     

典型超微细菌降解邻苯二甲酸二丁酯的途径及水合酶的表达纯化研究

典型超微细菌菌株PAE-UM属于β-变形菌门丛毛单胞菌属(Curvibacter sp.),是革兰氏阴性菌株,可利用DBP作为唯一碳源。利用流式细胞仪检测细菌生长情况,并采用高效液相色谱测定DBP的浓度,结果显示该菌对DBP的降解率为94%,菌株最大生长速率为0.237 2 h-1。已经完成了该菌株的全基因组测序,Gen Bank登录号为LKCX00000000。通过全基因组数据分析及文献对比发现该菌在降解邻苯二甲酸二丁酯的途径中,4-oxalomesaconate水合酶(OMH)是原儿茶酸间位裂解代谢途径中的关键酶,具有催化4-oxalomesaconate(OMA)降解为4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate(CHA)的能力,该酶是降解邻苯二甲酸酯过程中的关键酶之一,也是芳香化合物降解过程中的重要降解酶。利用蛋白结晶技术及分子生物学手段,对关键酶(OMH)进行分子构建,表达、纯化、结晶的筛选,应用X-ray衍射技术对关键酶的晶体进行衍射,获得晶体的衍射数据,进行关键酶的三维结构解析。Curvibacter sp.PAE-UM菌株中的OMH蛋白在大肠杆菌中得到表达,经多种方法纯化后筛选获得了纯度大于95%的蛋白,并经试剂盒筛选获得高质量的蛋白质晶体。在上海光源同步辐射(SSRF)BL~(-1)9U线站收集数据,通过X射线衍射实验收集到分辨率达到2.00的衍射数据,并使用软件HKL2000进行了数据处理与修正,该OMH的结构解析为2.00。后续将通过该关键酶的三维结构的解析进一步阐明该菌降解PAEs的分子机理。     

非洲栖热腔菌(Thermosipho africanus)纤维寡糖 磷酸化酶的结晶及衍射分析

为探究非洲栖热腔菌(Thermosipho africanus)纤维寡糖磷酸化酶TaCDP底物宽泛性的结构基础,通过Ni离子亲和层析-阴离子交换层析-凝胶过滤层析3步法纯化TaCDP,采用气相扩散法筛选TaCDP晶体,利用X-射线晶体学方法对TaCDP的晶体结构进行了研究。结果表明,纯化后TaCDP蛋白的纯度高,聚集状态均一,在2. 2 mol·L~(-1)(NH4)2HPO4,0. 1 mol·L~(-1)CHES-NaOH,p H值9. 2,10. 0 g·L~(-1)polyvinylpyrrolidone K15条件下筛选到TaCDP与纤维三糖底物的复合物晶体。该晶体经同步辐射收集衍射数据后分辨率可达0. 28 nm,晶体空间群属于P4122,晶胞参数为a=b=9. 928 nm,c=56. 251 nm,表明1个不对称单位有2个TaCDP分子。     

一维链状镍配合物[Ni(C14H10N2O2)(Mf)]n的合成和晶体结构

合成了含水杨醛缩苯甲酰腙的一维链状镍配合物[Ni(C14H10N2O2)(Mf)]n(Mf=C4H9NO,即吗啡啉),通过元素分析,红外、电子光谱和X-射线单晶衍射进行了表征.晶体属单斜晶系,空间群为P21/c,a=0.9708(4)nm,b=1.4783(7)nm,c=1.2275(4)nm,β=95.728(14)...     

三维超分子配合物Cu(2-mpac)Cl(H_2O)·H_2O的合成与结构

以2-甲基-5-羧基吡嗪为配体合成了1个三维超分子配合物Cu(2-mpac)Cl(H2O).H2O(1)(2-mpac:2-甲基-5-羧基吡嗪),并利用元素分析、IR、X-射线单晶衍射及热重分析等手段对配合物(1)进行了结构表征.结果表明:配合物(1)属于三斜晶系,P-1空间群,P-1,a=3.8306(6),b=11.395 7(18),c=11.5596(18),α=111.321(2)°,β=96.282(2)°,γ=98.667(2)°,V=457.25(12)°3,Z=2,S=1.019,,最终残差因子(I>2σ(I))R1=0.0375,wR2=0.0945,对于全部数据R1=0.0423,wR2=0.0991.     

辣椒疫霉效应分子RxLR22034的表达纯化及晶体生长

辣椒疫霉(Phytophthora capsici)作为一种重要的植物病原卵菌,侵染寄主植物时能够分泌RxLR效应分子,从而激活或抑制植物的防卫反应,引起植物病害的产生。为了深入研究辣椒疫霉效应分子与植物互作的机制及致病机理,本文从辣椒疫霉菌株SD33中克隆得到了RxLR22034效应分子,以大肠杆菌Rosetta(DE3)为宿主,进行了原核表达与纯化,确定了该基因高效表达条件。通过亲和层析及分子筛层析纯化获得高纯度蛋白,借助坐滴法培养优化获得RxLR22034蛋白晶体,X射线衍射获得2.7?的蛋白晶体数据,为后续解析RxLR效应分子蛋白三维结构,从结构生物学角度探知辣椒疫霉RxLR效应分子生理生化功能奠定了基础。     

牛IgG2 Fc受体的真核表达、纯化与结晶

【目的】制备牛IgG2 Fc受体(boFcγ2R)蛋白并分析其结构与生物学功能,为进一步研究其免疫学功能奠定基础。【方法】PCR扩增boFcγ2R的胞外区基因片段,将其克隆至真核表达载体pMT/BiP/V5-His A构建重组pMT/BiP-boFcγ2R-His质粒,利用果蝇胚胎Drosophila Schneider 2(S2)细胞表达boFcγ2R胞外区重组蛋白,通过镍柱亲和层析、凝胶过滤层析对目的蛋白进行纯化,利用Dot-blot验证其生物学功能;采用蒸汽扩散坐滴法对目的蛋白进行结晶,对晶体进行X-ray衍射分析;利用去糖基化酶Endo Hf和PNGase F对目的蛋白进行处理,以验证其糖基化修饰与晶体无衍射之间是否存在因果关系。【结果】PCR扩增获得了663 bp的boFcγ2R基因胞外区片段。成功构建了pMT/BiP-boFcγ2R-His载体,将其转染S2细胞后诱导表达出26 ku的boFcγ2R胞外区重组蛋白。SDS-PAGE结果显示,通过镍柱亲和层析、凝胶过滤层析的纯化方法得到了高纯度的boFcγ2R胞外区重组蛋白;Dot-blot结果显示,该蛋白具有较好的生物学功能。蛋白结晶的2个条件是:体积分数15%Tacsimate~(TM)(pH 7.0)、0.1 mol/L HEPES (pH 7.0)、20 g/L PEG 3350和0.1 mol/L HEPES (pH 7.5)、250 g/L PEG 3350。蛋白初筛晶体无衍射,去糖基化试验验证了boFcγ2R胞外区蛋白初筛晶体无衍射可能与其糖基化有关的推测。【结论】得到了高纯度的boFcγ2R胞外区重组蛋白,获得其初筛晶体。     

牛坏死杆菌43K OMP多克隆抗体的制备

为了评价牛坏死杆菌外膜蛋白43K OMP的免疫原性,试验利用大肠杆菌原核表达系统对牛坏死杆菌43K OMP基因进行表达,纯化目的蛋白免疫兔,制备牛坏死杆菌43K OMP多克隆抗体,并对其进行鉴定。对基因序列进行预测分析后,针对大肠杆菌稀有密码子优化合成该基因序列,克隆至pET-32a原核表达载体上,经异丙基硫代-β-D-半乳糖苷(IPTG)诱导表达及镍柱进行纯化,获得重组蛋白大小约为59 ku。重组蛋白经Western blotting鉴定后免疫兔,制备多克隆抗体。Western blot检测牛坏死杆菌43K OMP多克隆抗体与43K OMP重组蛋白具有很好的免疫原性。研究成功制备了牛坏死杆菌43K OMP多克隆抗体,为以43K OMP蛋白为基础的疫苗研究奠定基础。     

牛坏死杆菌43K OMP的截短表达及多克隆抗体的制备

为制备牛坏死杆菌截短43K OMP多克隆抗体,以A25菌株基因组DNA为模板,特异性扩增43K OMP基因的4个相互重叠的截短片段,构建原核表达载体,利用大肠杆菌原核表达系统对截短基因进行表达并纯化蛋白,同时免疫家兔制备多克隆抗体.结果表明:43K OMP基因截短片段经IPTG诱导成功表达,蛋白大小分别为32 kDa、...     

配合物[Pb（2,2’-bipy）（CH3COO）2]n的水热合成与晶体结构

报道了一种新颖的配合物[Pb（2,2’-bipy）（CH3COO）2]n的水热合成和晶体结构.该化合物属于单斜晶系,P2（1）/c空间群,a=1.5361（7）nm,b=0.9505（4）nm,c=0.8198（4）nm,β=92.854（7）°,V=1.1955（9）（3）nm3,Z=1,T=293（2）K,Dc=2.374 mg/m3,μ=14.111 mm^-1,R1=0.1394,wR2=0.2353.     

4种竹材微纤丝角变异及其对抗弯性质的影响

采用X线衍射技术研究4种常见经济型竹种撑篙竹、粉单竹、吊丝竹、青皮竹的微纤丝角变异以及撑篙竹材质生成过程中微纤丝角（MFA）在纵向和径向位置的变化趋势，并探讨微纤丝角对竹材抗弯强度（MOR）和抗弯弹性模量（MOE）影响。4种3年生竹材的平均微纤丝角由大到小顺序为粉单竹＞吊丝竹＞撑篙竹＞青皮竹，分别为10.46°、9.73°、9.66°和9.52°，竹种间的微纤丝角差异甚微，变化范围在0.53°～1.48°；在径向上，撑篙竹与其他3种竹材微纤丝角从内侧到外侧到竹黄均呈增加趋势。方差分析表明，径向部位对微纤丝角有显著性影响。撑篙竹微纤丝角受竹龄影响不显著，随竹龄的增加呈现先增加后降低的趋势；在纵向上，不同竹龄的微纤丝角沿竹秆高度方向变化趋势不尽相同，受纵向部位影响显著。微纤丝角对4种竹材的抗弯性质都有一定程度的影响，只有粉单竹的抗弯强度和抗弯弹性模量与微纤丝角的相关性比较显著。研究结果以期为竹林培育和竹材合理加工利用提供理论依据。     

盐酸硫胺的主客体作用研究：[CuCl4]（thiamH）的合成、结构及其SOD活性

在甲醇体系中合成了化合物[CuCl4]（thiamH）（thiamH为盐酸硫胺阳离子）,并通过元素分析、红外光谱对其进行了表征,同时还进行了X—ray单晶结构测定．晶体属于单斜晶系,P21／n空间群,晶胞参数a=0．948（2）nm,b=1．685（3）nm,c=1．203（2）nm,β=107．25（3）°,V=1．835（6）nm^3,Z=4,μ=1．893mm^-1,Dc=1．707g·cm^-3,F（000）=956,R1=0．0249,ωR2=0．0655．此外,用邻苯三酚自氧化法测定了标题化合物对超氧阴离子O2^-的催化作用．结果表明,化合物具有良好的超氧化歧化酶（SOD）活性,其IC50为12．46μg·mL^-1．     

Keggin型钼氧酸盐化合物{PMo7^ⅥMo4^ⅤV^ⅤO40（V^ⅣO）2[Co（bipy）2（H2O）]2}[Co（bipy）3]2{PMo7^ⅥMo4^ⅤV^ⅤO40（V^ⅣO）2}·6H2O的合成、结构及性质表征

合成了一种新颖的修饰型的Keggin结构多金属氧酸盐超分子化合物,并用单晶衍射仪测定了其晶体结构,元素分析及红外光谱等进一步佐证了化合物的结构.配合物为三斜晶系,P-1空间群,晶胞参数为a=12.969 4（11）,b=14.025 0（11）,c=24.518 0（19）,α=86.511 0（10）°,β=83.033 0（10）°,γ=62.777 0（10）°,V=3 936.4（5）3,Z=1.配合物是一种特殊的双帽双支撑型的多金属氧酸盐,它是由双帽假Keggin[PMo7ⅥMo5ⅤO40（VⅣO）2]^4-单元,{Co（2,2′-bipy）2（H2O）}和[Co（bipy）3]^2＋部分组成.其中,两个金属有机阳离子{Co（2,2′-bipy）2（H2O）}和两个盖帽的钒原子上的末端氧原子通过共价连接在[PMo7^ⅥMo4^ⅤV^ⅤO40（V^ⅣO）2]上,并通过氢键作用形成三维层状结构.     

Synthesis and Equation of State of (Mg,Fe) SiO3 Perovskite to Over 100 Gigapascals

Silicate perovskite of composition (Mg(0.88)Fe(0.12)) SiO(3) has been synthesized in a laser-heated diamond-anvil cell to a pressure of 127 gigapascals at temperatures exceeding 2000 K. The perovskite phase was identified and its unit-cell dimensions measured by in situ x-ray diffraction at elevated pressure and room temperature. An analysis of these data yields the first high-precision equation of state for this mineral, with values of the zero-pressure isothermal bulk modulus and its pressure derivative being K(0T) = 266 +/- 6 gigapascals and K'(0T) = 3.9 +/- 0.4. In addition, the orthorhombic distortion of the silicate-perovskite structure away from ideal cubic symmetry remains constant with pressure: the lattice parameter ratios are b/a = 1.032 +/- 0.002 and c/a = 1.444 +/- 0.006. These results, which prove that silicate perovskite is stable to ultrahigh pressures, demonstrate that perovskite can exist throughout the pressure range of the lower mantle and that it is therefore likely to be the most abundant mineral in Earth.     

新型间硝基苯甲酸稀土配位聚合物[Nd2（C7H4O4N）7H2O]n的水热合成和晶体结构

采用水热方法合成出一种新型的间硝基苯甲酸稀土配位聚合物[Nd2（C7H4O4N）7H2O]n,并通过元素分析、红外光谱、X射线单晶结构分析对该配位聚合物进行了表征.标题配位聚合物的晶体属于三斜晶系,P1空间群,晶胞参数a=0.984 8（2）nm,b=1.131 4（2）nm,c=1.366 3（3）nm,α=69.22（3）,°β=82.48（3）°,γ=82.21（3）°,V=1.404 5（5）nm3,Dc=1.806 g/cm3,Z=1.结构分析表明：标题化合物是由稀土金属Nd（Ⅲ）和间硝基苯甲酸组成的配位聚合物,此聚合物通过Ln—O—C—O—Ln形成无限一维链状结构,进一步又通过分子间氢键连接形成复杂的三维氢键网络结构.     

甘氨酸亚铁的合成和晶体结构研究

以甘氨酸和七水硫酸亚铁为原料合成了甘氨酸亚铁。采用溶剂挥发法得到了晶体,并通过红外谱图和X-射线单晶衍射确定了晶体的结构。化合物属于三斜晶系,空间群P-1,晶胞参数:a=0.59949(3)nm,b=0.67626(4)nm,c=1.33192(6)nm,α=85.453(4)°,β=82.914(4)°,γ=83.115(5)°,V=0.53085(5)nm3,C4H30N2O22Fe2S2,Mr=634.12,Z=1,R1=0.0219,wR2=0.0640[I>2σ(I)],S=1.005。化合物中铁(Ⅱ)配位数为6,配位多面体为变形的八面方体构型。结构式为 。     

韩国平菇菇床上流行的木霉分离物的形态学和分子生物学分析

自韩国平菇生产地分离到26株木霉(Trichoderma),基于培养特性和菌落形态,这些菌株分为4组,鉴定为Trichoderma sp．K1、Trichoderma sp．K2、T．harizianum,和T．atroviride,其中优势种为Trichoderma sp．K2,其次是Trichoderma sp．K1和T．atroviride。K1和K2不仅在形态上与其它的组有区别,而且相互在生长温度(35℃),菌落形态,分生孢子的形态,分生孢子小梗及其分枝类型,分生孢子的形态等方面有显著差异。对这些菌的ITS、EF-1(和RPB2的序列比较显示出这2个待鉴定的种(K1和K2)不仅与早期报道的木霉种有差异,而且相互间也显著不同。同时发现,EF-1(和RPB2序列比ITS序列在木霉的系统分类上更加客观可靠。基于以上研究结果,我们认为K1和K2是木霉属中的新种,即将给予它们新的名称。     

Atmospheric Lifetime of CHF2Br, a Proposed Substitute for Halons

The rate coefficients, k(1), for the reaction of OH with CHF(2)Br have been measured using pulsed photolysis and discharge flow techniques at temperatures (T) between 233 and 432 K to be k(1), = (7.4 +/- 1.6) x 10(-13) exp[-(1300 +/- 100)/T] cubic centimeters per molecule per second. The ultraviolet absorption cross sections, sigma, of this molecule between 190 and 280 nanometers were measured at 296 K. The k(1), and sigma values were used in a one-dimensional model to obtain an atmospheric lifetime of approximately 7 years for CHF(2)Br. This lifetime is shorter by approximately factors of 10 and 2 than those for CF(3)Br and CF(2)ClBr, respectively. The ozone depletion potentials of the three compounds will reflect these lifetimes.