应用AFLP分子标记对6个家蚕品种的鉴定

利用AFLP分子标记技术对浙江省生产上应用的 6个家蚕品种 (包括正反交 )进行了DNA指纹分析 ,筛选出E AAC/M CTT、E ACA/M CAA、E ACC/M CTT、E AGG/M CAA及E AGG/M CTT 5对引物。这 5对引物在 6个家蚕品种中共扩增出 15 7条带 (平均每对引物扩增 31 4条带 ) ,其中有多态性带 5 4条 (平均每对引物扩增多态性带 10 8条 ) ,多态性比例为 34 4 %。通过这些多态性条带的不同组合 ,可明确将供试的 6个家蚕品种加以区分 ,并作为 6个家蚕品种鉴定的依据。     

波尔山羊和江苏本地山羊的AFLP和RAPD分析

实验山羊共 10 5只 ,其中波尔山羊 6 0只 (公母羊各半 ,采血样 2 0个 ,组织样 4 0个 ) ,徐淮山羊 30只 (公母羊各半 ,每羊采血样 1个 ) ,海门山羊 15只 (公羊 7只 ,母羊 8只 ,每羊采血样 1个 )。分别提取DNA ,按品种构建池DNA。应用 36个选择性引物组合对波尔山羊、徐淮山羊和海门山羊种间AFLP多样性进行研究 ,其中 2 9个引物组合共扩增出 32 5 3个标记 ,包括可变标记 92个 ,平均每个引物组合扩增 3 17个标记 ,多态频率达 2 8%。可变标记数较多的引物组合为 :E0 0 ACG/M0 0 CAC(13个 )、E0 0 ACG/M 0 0 CAG(10个 )、E0 0 AAC/M 0 0 CAC(8个 )和E0 0 AAC/M0 0 ACT(7个 )。从 93个随机引物中筛选出品种间多态性较强、重复性好的引物 2 2个 ,对三个品种池DNA进行随机扩增 ,共扩增出 183个标记 ,其中可变标记 6 0个 ,平均每个引物扩增 2 73个标记 ,多态频率为 32 8%。两种方法得到一致结果 ,即徐淮山羊与海门山羊遗传距离最近 ,...     

泰和丝毛乌骨鸡耐热性AFLP标记鉴别研究

通过热应激试验,将45羽泰和丝毛乌骨鸡分为3个耐热性差异极显著的组(强、中、弱),用25对AFLP(Amplified fragment length polymorphism)引物组合对这3个组的池DNA进行了AFLP分析,结果发现,25对引物组合共检测到1800余条AFLP扩增带。8对引物扩增结果表现为单态,17对引物组合扩增结果有多态现象,其中E32／T32、E32／T38、E32／T49、E42／T32、E45／T32、E45／T486对引物组合检测到了耐热性强鸡群池DNA所特有的多态条带,而E32／T48、E39／T48、E42／T38和E45／T334对引物组合在耐热性差鸡群的池DNA中扩增到其特有的多态条带;这些与耐热性相关的AFLP多态标记在转换为STS后,对于日后定位、分离和鉴别鸡耐热性主效基因,或利用标记辅助选育策略,培育耐热性鸡新品系提供了有利的工作基础。     

新疆6个地方绵羊品种遗传多样性的AFLP分析

本试验旨在从分子水平研究绵羊品种之间的遗传多样性,为科学评价新疆地方绵羊种质资源提供依据。利用筛选出的8对E+3/M+3引物,对6个地方绵羊品种基因组DNA进行AFLP扩增。根据AFLP分析结果,统计了每个引物组合在各品种中检测到的多态性条带和特异性条带,计算了6个绵羊品种的遗传相似系数和遗传距离,并构建了UPGMA聚类关系图。结果表明,8对引物组合共得到334条清晰可辨条带,平均每个引物组合产生41.75条多态性标记,多态性条带为103条,多态位点百分率为30.838%,同时各品种中还检测出特异性条带。通过UPGMA聚类分析,将6个地方绵羊品种种群划分为2类。因此,6个地方绵羊品种均得到较丰富的遗传多样性,其遗传相似系数和聚类结果与各绵羊品种的地理分布及现实状况相吻合。     

哈萨克羊、阿勒泰羊、巴什拜羊遗传多样性的AFLP分析

利用11对AFLP引物组合,检测了哈萨克羊、阿勒泰羊、巴什拜羊池DNA遗传变异,构建了各品种的AFLP DNA 指纹图谱,根据AFLP分析结果,统计了每个引物组合在各品种中检测到的多态性条带,计算了3个品种的遗传相似系数,并据此构建了UPGMA聚类关系图,分析了它们的遗传关系.结果表明:11对AFLP引物组合在3个地方绵羊品种中共检测到310条带,平均每个引物组合产生28.18条带,变化范围在25～34条,其中多态性条带32条,占扩增总带教的10.32%,每对引物平均扩增多态性带2.909条.品种间的遗传相似系数以哈萨克绵羊与阿勒泰绵羊的最高(O.699),哈萨克绵羊与巴什拜绵羊最小(0.592),聚类结果与这些羊的育成史、分化及地理分布一致.     

中国台湾学者成功构建首张鸭AFLP指纹连锁图谱

日前,台湾国立中兴大学动物科学系黄章文博士利用多色荧光AFLP标记检测了鸭(褐色菜鸭×北京鸭F2代766个个体)基因组DNA,并成功构建了首张鸭AFLP指纹连锁图谱。该研究利用18组TaqⅠ/EcoRⅠ荧光引物组合扩增鸭基因组DNA,共产生296个多态     

鹿苑鸡微卫星和AFLP指纹分析

利用20个微卫星标记和6对AFLP引物组合对地方鸡种鹿苑鸡进行了遗传检测,结果表明鹿苑鸡在20个微卫星位点上共检测到118个等位基因,基因频率分布在0.0125～0.5500之间,平均每个座位检测到5.9个等位基因.20个微卫星座位的平均杂合度为0.7366,平均多态信息含量为0.6953;6对AFLP引物组合在该鸡种中共检测到245条多态性条带,平均每个引物组合产生40.8条多态性条带;鹿苑鸡群体变异大,具有丰富的遗传多样性.     

大足黑山羊地方类群多胎性AFLP标记研究

利用分子标记技术AFLP标记,从15对引物中选取扩增效果较好的11对引物,对11只极端多胎个体和6只极端非多胎个体DNA进行扩增,共扩增出766个条带,平均多态率5.36%,其中引物E42/T48中1条294bp的条带在极端非多胎个体中均出现,而在极端多胎个体中只在1个个体中扩增出来,表现出极显著的差异。对差异片段回收、克隆、测序,设计4对引物,对基因组扩增后发现,产生差异片段的原因是片段内部有较长序列的插入或丢失,产生310bp和265bp2个等位基因,其中310bp纯合等位基因的初产羔羊数显著高于310bp和265bp杂合等位基因的初产羔羊数,在大足黑山羊地方类群内可能作为多胎性状分子标记。     

湖北省现行家蚕品种原原种AFLP指纹图谱的构建

利用AFLP分子标记技术,构建了湖北省10个优质强健原原种的AFLP指纹图谱,分析了其遗传相似系数及亲缘关系。利用4对AFLP引物,共扩增了584条带,其中有多态性带354条,多态性比例为60.62%,构建了其AFLP指纹图谱,可以在分子水平上对这10个家蚕原原种进行鉴定和检测。     

半番鸭羽色性状RAPD分子标记初探

利用随机扩增多态DNA指纹分析技术(RAPD)，时半番鸭全白羽和全黑羽两种羽色极端个体的基因组DNA指纹进行研究，从40个随机引物中筛选出7个引物对22羽半番鸭个体基因组DNA进行分析。结果：7个引物共获得44个条带，其中有5个条带与白羽性状显著相关，表明应用RAPD技术可用于初步筛选有关性状的分子标记。     

半番鸭Agouti基因的克隆与SSCP分析

以半番鸭血液基因组为模板进行PCR扩增,获得了半番鸭Agouti基因部分序列,该序列长为1178bp。序列分析表明该序列由部分第1外显子（92bp）、第1内含子（105bp）、完整的第2外显子（95bp）、完整的第2内含子（851bp）和部分第3外显子（35bp）组成;应用PCR-SSCP技术对扩增序列进一步研究发现位...     

白色羽毛半番鸭选育的研究

从正交，反交，轮交和侧交揭示产生半番鸭白色羽毛起主导作用的是家鸭。不同基因型家鸭产生白羽半番鸭频率是不同的，同一品种母家鸭个体间产生白羽半番鸭亦不同，母爱鸭生产白羽率高的个体，用不同公番鸭交配，其Ｆ１白率仍然是高的，估测ｈ＾２为０．６６３８。经５个世代亲本选择，半番鸭白羽率达９３．４９％，１０周龄活重２７８６克。     

半番鸭POU1F1基因序列的克隆与生物信息学分析

根据GenBank中公布的鸭POU1F1基因序列,设计了6对引物,以半番鸭血液基因组DNA为模板,采用PCR方法扩增出POU1F1基因完整的cDNA序列,全长2209bp。对该序列进行生物信息学分析,结果表明该基因编码335个氨基酸,具有POU-specific(POUs)和Homeobox结构域,与鸡、猪、牛、人和小鼠的POU1F1基因氨基酸序列分别具有96.3%、89.5%、89.2%、90.6%和87.5%的同源性。     

鸭圆环病毒套式PCR检测方法的建立

根据GenBank发布的鸭圆环病毒(duck circovirus,DuCV)序列(AY228555),运用Primer Premier 5.0设计2对引物,建立了适合DuCV快速检测的套式PCR方法,采用该方法对从安徽省望江县采集的发病鸭肝脏、胸腺、法氏囊、肾脏和脾脏等内脏病料进行DuCV检测。结果显示,套式PCR对所有内脏病料均能扩增出340 bp的条带,而正常鸭胚、健康鸭肝脏、鸭瘟病毒、禽流感病毒(H9亚型)、新城疫病毒、传染性法氏囊病病毒、网状内皮组织增生病毒、鸡传染性贫血病毒、鸭源大肠杆菌和鸭疫里氏杆菌的扩增结果均为阴性;该方法第1次扩增的敏感性是1 ng,第2次扩增的敏感性是1 fg,第2次比第1次扩增的敏感性高106倍;表明本试验所建立的套式PCR方法可用于鸭圆环病毒(DuCV)感染的临床诊断和流行病学调查。     

番鸭细小病毒与鸭圆环病毒二重PCR方法的建立

根据基因库中鸭圆环病毒和番鸭细小病毒的基因序列,分别设计了两对特异性引物,通过对二重PCR扩增条件的优化,研究建立了可同时鉴别检测鸭圆环病毒和番鸭细小病毒的二重PCR方法。用该方法对同一样品中鸭圆环病毒和番鸭细小病毒的模板进行PCR扩增,结果均得到了与实验设计相符的351bp（鸭圆环病毒）和474bp（番鸭细小病毒）的扩增条带,而对鸭Ⅰ型肝炎病毒、鹅细小病毒、鸭副黏病毒、鸭瘟病毒和禽流感病毒等病原体的检测全为阴性。敏感性测定结果表明：该二重PCR技术最低能检出100fg的鸭圆环病毒和番鸭细小病毒DNA模板。研究建立的鸭圆环病毒和番鸭细小病毒的二重PCR方法,具有快速、敏感、特异、定量和重复性好等优点,可用于临床上鸭圆环病毒和番鸭细小病毒感染的检测。     

鸭新城疫病毒与番鸭细小病毒二重PCR方法的建立

根据GenBank中新城疫病毒(NDV)L基因和番鸭细小病毒(MDPV)Vp3基因的保守序列,采用Primer Premier 5.0软件设计并合成了2对引物。通过优化反应条件及特异性、敏感性评价,建立了能同时检测鸭源NDV和MDPV的二重PCR方法。该方法对鸭源NDV和MDPV的检测敏感性分别为30和16 fg。同时使用该方法对鸭瘟病毒、鸭肝炎病毒、鸭圆环病毒、H9亚型禽流感病毒、鸭黄病毒、沙门氏菌、大肠杆菌和禽多杀性巴氏杆菌进行检测,结果显示全为阴性。本研究建立的鸭源NDV和MDPV的二重PCR检测方法,具有特异、敏感、快速、重复性好等优点,可用于鸭源NDV和MDPV感染的快速鉴别检测。     

基于主成分分析法建立鸭一般抗病力的评估模型

研究对家鸭(金定鸭、樱桃谷鸭、苏牧麻鸭)、番鸭、半番鸭的白蛋白(X1)、球蛋白(X2)、总蛋白(X3)、IgA(X4)、IgM(X5)、IgG(X6)和AI抗体HI效价(X7)等7个免疫指标进行测定,并对这7个免疫指标进行主成分分析。结果表明:选取前2个特征值作为2个主成分(累计贡献率达到90.70%),基本上反映了原所有免疫指标包含的全部信息;通过建立主成分综合评价模型,比较5个群体主成分综合得分,金定鸭得分最高,其次分别为樱桃谷鸭、番鸭,苏牧麻鸭、半番鸭表现较低。     

辽东白嗉鸭种质性能研究报告

辽东白嗉鸭是一个具有独特外貌特征和生产性能的地方鸭种资源类群,对丰富世界鸭种遗传资源的多样性有着重大意义。对该鸭种的种质性能进行测定,结果:从羽色及蹼色可分为3个亚型,即黑羽白嗉、银灰羽白嗉、金掌白嗉;体形、体重有兼用型的特征,成年公鸭屠宰率84.1%,胸肌率17.6%,腿肌率16.4%。银灰羽和黑羽类群公、母鸭的绝对增重峰值期均出现在8~9周龄(28~33g/d),相对增重率的峰值均出现在4周龄(80.43%~85.38%);银灰羽类群公、母鸭的初生重及24周龄体重略高于黑羽类群,但差异不显著(P>0.05);0~6周龄成活率98.6%,7~24周龄成活率97.8%。开产日龄为184d,核心群入舍母鸭年均产蛋量(249±12)个、加权年均产蛋量(285±16)个;普通群入舍母鸭年均产蛋量(174.6±18)个、加权年均产蛋量(186.3±16)个;自然交配公、母比例为1∶9,饲养只日受精率为91.32%。     

鸭新城疫病毒和鸭圆环病毒二重PCR检测方法的建立

本研究根据GenBank中鸭新城疫病毒(NDV)的F基因和鸭圆环病毒(DuCV)的V1/rep基因的保守序列,各设计一对特异性引物,并对二重PCR的扩增条件进行优化,建立了鸭NDV和DuCV的二重PCR检测方法。对混合样品进行扩增,得到2条大小为493bp(鸭NDV)和218bp(DuCV)的特异性条带,与预扩增片段相符。而对番鸭细小病毒、鸭瘟病毒、鸭肝炎病毒、鸭源小鹅瘟病毒、鸭H9亚型流感病毒、鸭疫里氏杆菌、大肠杆菌、禽多杀性巴氏杆菌等病原检测,结果为阴性。该方法的敏感性试验表明,鸭NDV的核酸最小量为40fg,DuCV为20fg。