基于线粒体 DNA D-loop 全序列的麒麟鸡遗传多样性研究

【目的】从线粒体DNA(mtDNA) D-loop全序列角度评估麒麟鸡的遗传多样性水平,以期阐明麒麟鸡的品种形成。【方法】通过PCR产物直接测序法对麒麟鸡保种群的黄羽、白羽和黑羽3个资源群及8个地方鸡品种进行mtDNA D-loop全序列测定,分析遗传变异,并进行中性检测,构建单倍型中介网络图,探究麒麟鸡的群体历史。【结果】麒麟鸡mtDNA D-loop全序列为1 231～1 232 bp,C+G含量（39.8%）低于T+A含量（60.2%）,总体核苷酸多样性为0.00630±0.00054,明显高于其他8个地方鸡品种。3个资源群黄羽、白羽和黑羽麒麟鸡的单倍型多样性分别为0.777±0.076、0.816±0.060、0.710±0.057,核苷酸多样性分别为0.00699±0.00115、0.00662±0.00090、0.00546±0.00062,遗传多样性水平基本上与群体规模呈正相关。麒麟鸡与8个地方鸡的双参数遗传距离为0.008～0.009,净遗传距离为0.003～0.005,均大于其他地方鸡之间的遗传距离。90份麒麟鸡样本共检测到45个突变位点,定义了17个单倍型,其中独享...     

DNA条形码技术鉴定中国地方鸡品种的重新评估

【目的】探讨COI基因作为标准DNA条形码技术鉴定外形差异较小的地方鸡品种的可行性。【方法】以华南地区9种优质地方鸡（怀乡鸡、清远麻鸡、惠阳胡须鸡、中山沙栏鸡、阳山鸡、杏花鸡、五华三黄鸡、文昌鸡和广西三黄鸡）和国外引进品种隐性白羽鸡为试验材料,测定标准的DNA条形码技术的线粒体细胞色素C 氧化酶亚基I （cytochrome C oxidase subunit I,COI）,同时下载已发表的31条家鸡和原鸡及绿头鸭的COI基因序列,分析品种遗传多样性与遗传距离,构建单倍型中介网络图和系统发生邻接树,界定区分品种特异的单倍型。【结果】除去PCR引物序列,获得了695 bp COI基因片段。根据标准的DNA条形码序列,截取648 bp 线粒体COI基因序列进行分析。10个鸡品种203个个体共检测到110个变异位点,占分析位点的16.98%,其中90个单一位点突变,20个简约信息位点。平均核苷酸多样性为0.00394（0.00349-0.00560）,平均单倍型多样性为0.832（0.763-0.905）,其中五华三黄鸡最高,中山沙栏鸡次之,文昌鸡最低。定义了84种单倍型,单倍型1为9个地方鸡种所共享,出现频率为64次;单倍型9和5为家鸡和隐性白羽鸡共享,出现频率分别为29次和19次;每个鸡品种均有品种特异的单倍型。广西三黄鸡、五华三黄鸡与中山沙栏鸡的单倍型数最多,为13个,隐性白羽鸡与清远麻鸡的最少,为8个。不同品种的单倍型分布差异较大,如杏花鸡的单倍型主要分布在1,清远麻鸡主要分布在1和9,惠阳胡须鸡主要分布在1、5和9,隐性白羽鸡主要分布在9和79。10个鸡种品种间遗传距离范围为0.003-0.006,净遗传距离为0-0.003;鸡品种间的遗传距离一般大于鸡品种内的遗传距离;绿头鸭与鸡品种间的遗传距离大于0.2。中介网络图将84个单倍型分为3条进化枝,呈现出一定的品种特异性,如以单倍型9为起点的进化枝没有广西三黄鸡和文昌鸡分布,但另外两枝未表现出此特征;1为祖先单倍型,由此逐渐衍生出其他单倍型。邻接树显示中国家鸡与红原鸡聚为一簇,与黑尾原鸡、灰原鸡和绿原鸡分开;中国地方鸡聚为同一簇,且存在明显的交叉现象,无显著的品种特异性。【结论】COI基因可作为研究鸡品种遗传多样性的候选分子标记。仅依靠标准的DNA条形码技术无法有效区分差异外形较小的地方鸡种,需要联合多种分子标记如COI基因、细胞色素b、 AFLP指纹技术、微卫星位点LEI0258、基因组SNP和品种特异的外貌特征。     

贵妃鸡MHC-B区域微卫星位点LEI0258遗传多样性研究

为研究贵妃鸡的遗传多样性,试验应用主要组织相容性复合体B区域（MHC-B）复合微卫星位点LEI0258测定了贵妃鸡的等位基因信息,结合已发表的序列,进行等位基因与核苷酸多态性、单倍型中介网络图分析。40份样品中共检测到9个等位基因,长度为193~297 bp,其中5个为贵妃鸡特有。观察杂合度（Ho）、期望杂合度（He）和多态信息含量（PIC）分别为0.625、0.716和0.666。3个等位基因与6种已知MHC血清型相匹配。基于侧翼区变异信息的中介网络图将等位基因分为5个进化枝,贵妃鸡9个等位基因分布于A和B进化枝中,这2个进化枝同样存在于红原鸡中。研究结果表明贵妃鸡保持着中等偏上的遗传多样性水平,可能起源于红原鸡。     

基于线粒体DNA D–loop序列的黄郎鸡遗传多样性与品种起源研究

采用PCR产物直接测序法对黄郎鸡50个个体的线粒体DNA D–loop序列进行分析,统计黄郎鸡周边省份地方鸡的进化支地理分布特征。结果表明,黄郎鸡具有较高的线粒体遗传变异水平,检测到26个变异位点,核苷酸多样性为0.012 54±0.000 94,核苷酸差异均数为6.569,单倍型多态性为0.886±0.035。在定义的23种单倍型中,13种单倍型为首次发现,单倍型落在A、B、C、E共4个进化支,B为优势单倍群。系统进化分析和进化支的地理分布特征表明,黄郎鸡起源于中国北方和西南地区,同时受邻省地方鸡基因交流的影响。     

基于线粒体DNA D-loop 序列的五华三黄鸡遗传多样性及其品种起源研究

通过PCR产物直接测序法对五华三黄鸡保种群120个个体进行线粒体DNA(mt DNA)D-loop序列测定,研究该品种的遗传多样性和系统进化。结果显示,五华三黄鸡保留着较高水平的遗传多样性。mt DNA D-loop的C+G含量(42.5%)低于T+A含量(57.5%),核苷酸多样性和核苷酸差异均数分别为0.01298±0.00051和6.750。共检测到33个突变位点,均为转换突变,包括23个TC转换和10个AG转换,占分析位点的6.35%。定义了32种单倍型,其中独享型单倍型19个,单倍型多样性为0.913±0.012,遗传距离为0.013±0.003。单倍型类群主要分布在进化枝A、B、C和E,其中B为优势单倍型类群。系统进化分析和进化枝地理分布特征表明,五华三黄鸡有4个母系来源,可能受北方家鸡南迁的影响。     

芽孢杆菌在动物养殖中的精准应用

随着国内养殖模式及政策法规的转变,动物益生菌类产品在动物肠道保健及环境改良等方面的应用受到越来越多的关注。《饲料添加剂品种目录（2013）》所列35种微生物中,芽孢杆菌类是养殖与饲料中应用最广泛的动物益生菌活菌制剂。芽孢杆菌菌种及菌株选择、使用剂量及投喂方式、动物品种及生理阶段均会影响其益生效果。本文以国内养殖环境下近10年来发表的试验性文章为主要参考依据,就芽孢杆菌在不同养殖动物的菌种选择、应用效果及剂量效应等方面进行了梳理,以期为芽孢杆菌在不同养殖动物中的精确应用提供理论参考。 [关键词] 芽孢杆菌|猪|家禽|反刍动物|经济动物|污染防治     

中草药制剂对鸡免疫器官发育及脾脏中免疫因子表达的动态影响

试验旨在探究复方中草药制剂对黄羽肉鸡育雏期间免疫器官指数及脾脏中IL-2、IL-4、IFN-γ因子表达的动态影响。选取1日龄健康黄羽肉鸡450只,随机分成3个处理组(对照组、抗生素组和中草药组),每个处理5个重复,每个重复30只。分别在21、35、49日龄测定鸡免疫器官指数和脾脏细胞中IL-4、IL-2、IFN-γ的动态表达量。结果显示:中草药组的免疫器官指数显著高于对照组(P<0.05),血清中免疫球蛋白IgG含量与对照组相比显著增加(P<0.05);中草药制剂组黄羽肉鸡脾脏中的IL-4 mRNA表达量在35日龄显著高于对照组和抗生素组(P<0.05),IL-2和IFN-γmRNA表达量在试验期呈增加趋势,其表达量在49日龄时中草药组显著高于对照组和抗生素组(P<0.05),说明复方中草药有提高免疫细胞因子mRNA表达量的作用。试验结果表明,基础日粮中添加复方中草药对黄羽肉鸡免疫器官发育和细胞免疫水平有不同程度的促进作用。     

山地放养五华三黄鸡的屠宰性能、肉质性能及血液生化指标测定

随机选择山地放养五华三黄鸡30只为试验材料,对其进行体尺、屠宰性能、肉品质和血液生化指标测定.结果表明:不同性别的五华三黄鸡在体尺上存在差异,公鸡的体尺高于母鸡;公母鸡的屠宰率、胸肌率和腹脂率差异不显著.公母鸡肉色和熟肉率胸肌均显著低于腿肌,但胸肌失水率均显著高于腿肌;公母鸡胸、腿肌粗蛋白与粗脂肪含量均差异显著.公母鸡血液各生化指标差异均不显著.     

日粮中添加柚皮粉对五华三黄鸡生产性能和肉品质的影响

为探讨柚皮粉的饲喂效果,将60只1日龄五华三黄雏鸡随机分成对照组和试验组2组,每组30只。对照组饲喂基础日粮,试验组在基础日粮中添加5%的柚皮粉,连续饲养150 d,研究柚皮粉对1~150日龄五华三黄鸡生长发育、屠宰性能及肉品质的影响。每周测定耗料量、体质量及体尺性状指标,在第151天测定屠宰性能及肉品质。结果表明:与对照组相比,饲料中添加柚皮粉对雏鸡的生长发育和屠宰性能没有明显影响,添加柚皮粉能使肌肉的蛋白质含量提高12.84%(P0.01),提高肌肉的红度、改善肉色,OD值提高23.53%(P0.01),使肌肉的脂肪含量降低46.99%(P0.01),肌肉系水力降低15.94%(P0.01),失水率提高55.22%(P0.01)。综上所述,日粮中添加5%的柚皮粉能显著提高五华三黄鸡的肌肉粗蛋白含量、降低脂肪含量,在改善肉质方面起到一定作用。     

五华三黄鸡MHC-B 区域复合微卫星位点 LEI0258 遗传多样性与进化研究

应用MHC-B区域复合微卫星位点LEI0258研究五华三黄鸡的遗传多样性与进化地位。147份样品共检测到48个等位基因,长度范围为181~495 bp。等位基因251(0.0952)、275(0.0850)和310(0.0816)频率最高。DNA测序鉴定出44个等位基因,其中42个为首次发现。观察杂合度、期望杂合度和多态信息含量分别为0.830、0.927和0.952。9个等位基因与15种已知MHC血清型相匹配。基于侧翼区变异信息的中介网络图将44个等位基因分为7个进化枝,其中3个进化枝存在于红原鸡中,提示五华三黄鸡起源于红原鸡。研究结果表明,微卫星LEI0258适用于鸡群体遗传多样性、血清型鉴定和进化研究。