基于线粒体DNA D-loop 序列的五华三黄鸡遗传多样性及其品种起源研究 |
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引用本文: | 黄勋和,余哲琪,翁茁先,温金星,李威娜,钟 鸣,唐亚东,钟福生.基于线粒体DNA D-loop 序列的五华三黄鸡遗传多样性及其品种起源研究[J].广东农业科学,2017,44(9):106-113. |
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作者姓名: | 黄勋和 余哲琪 翁茁先 温金星 李威娜 钟 鸣 唐亚东 钟福生 |
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作者单位: | 1. 嘉应学院生命科学学院,广东 梅州 514015;2. 广东省五华三黄鸡科技创新中心,广东 梅州 514015;
3. 湖南农业大学动物科学技术学院,湖南 长沙 410128;4. 五华县田家炳中学,广东 梅州 514400;
5. 广东客家黄畜牧有限公司,广东 兴宁 514571 |
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基金项目: | 广东省自然科学基金(2014A030307018);广东省公益研究与能力建设项目(2015A020208020,
2016A030303068);嘉应学院省市共建重点建设项目(嘉院[2017]27 号) |
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摘 要: | 通过PCR产物直接测序法对五华三黄鸡保种群120个个体进行线粒体DNA(mt DNA)D-loop序列测定,研究该品种的遗传多样性和系统进化。结果显示,五华三黄鸡保留着较高水平的遗传多样性。mt DNA D-loop的C+G含量(42.5%)低于T+A含量(57.5%),核苷酸多样性和核苷酸差异均数分别为0.01298±0.00051和6.750。共检测到33个突变位点,均为转换突变,包括23个TC转换和10个AG转换,占分析位点的6.35%。定义了32种单倍型,其中独享型单倍型19个,单倍型多样性为0.913±0.012,遗传距离为0.013±0.003。单倍型类群主要分布在进化枝A、B、C和E,其中B为优势单倍型类群。系统进化分析和进化枝地理分布特征表明,五华三黄鸡有4个母系来源,可能受北方家鸡南迁的影响。
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关 键 词: | 五华三黄鸡 线粒体DNA D-loop 遗传多样性 系统进化 |
Genetic diversity and breed origin of Wuhua Yellow chicken inferred from mitochondrial DNA D-loop
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Abstract: | |
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