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为了解美国大灵芝(Ganoderma oregonense)转录组中的简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)位点信息,并为开发灵芝分子标记辅助育种技术奠定基础,将高通量转录组测序获得的美国大灵芝转录组数据通过Trinity软件拼接组装,再利用MISA软件分析其SSR位点信息。随后采用Primer 3根据SSR位点设计特异性鉴别引物,并以灵芝DNA为模板,对其有效性进行验证。共获得65 064条单基因簇(unigene),在其中2 981条unigene中检测到3 380个符合软件参数的SSR位点,发生频率为5.19%,平均分布距离为12.60 kb。美国大灵芝转录组SSR位点总长度为52 168 bp,平均长度为15 bp。单核苷酸、三核苷酸是美国大灵芝转录组SSR的主要重复类型,分别占总SSR的35.33%和38.67%。SSR基元重复次数范围为5~73次,其中5次重复的发生次数最高。SSR重复基元共有98个类型,其中C/G是最常见的重复基元,比例为17.72%,其次是A/T,比例为17.60%。针对3 380个SSR位点设计出2 324对SSR引物,随机选择15对引物对3种灵芝栽培品种进行PCR扩增,10对引物可稳定扩增出条带,其中8对在3个灵芝栽培品种中表现出多态性。说明美国大灵芝转录组SSR位点多态性丰富,对灵芝的功能基因挖掘、分子标记辅助育种开发以及遗传多样性分析等具有重要意义。 相似文献
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不同果树枝条栽培灵芝基质配方研究 总被引:2,自引:1,他引:1
通过利用农业副产物果树枝条进行灵芝栽培基质配方优化研究,筛选出适合果树可持续发展的最佳灵芝栽培配方。本研究利用桃树、梨树和苹果树枝屑,通过不同配方优化设计进行灵芝优良菌株的栽培研究,对灵芝子实体的农艺性状进行差异分析,同时结合其氨基酸和矿质元素含量分析。结果表明:通过对灵芝子实体农艺性状差异分析,苹果-2配方表现最好;通过对氨基酸含量分析,配方组氨基酸含量顺序为桃树组配方>梨树组配方>苹果树组配方;综合9个配方中灵芝子实体内矿质元素含量分析,梨树-1配方表现最佳。以上不同的配方栽培出的灵芝其产量、氨基酸和矿质元素含量各不相同,芝农可根据不同的需要而选择合适的灵芝栽培基质配方。 相似文献
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幽门螺杆菌被世界卫生组织认定为一类致癌因子,其热休克蛋白(HSP)具有较强的免疫原性,存在着发展为疫苗成分的可能性.四川省农科院生物技术核技术研究所构建了幽门螺杆菌热休克蛋白B亚单位基因HspB植物表达载体pYHWHRI并转化进入根癌农杆菌(Agrobacterium tumefaciens,EHA105).本文采用农杆菌介导的叶盘法对烟草(Nicotiana tabacum L.)叶片进行遗传转化.在含有卡那霉素(Kan)的MS筛选分化培养基上筛选,获抗性烟草植株.经PCR分子检测,其中6株已成功导入HspB基因. 相似文献
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采用60Co-γ辐射处理马铃薯单细胞,快速高效获得马铃薯突变体材料,为丰富马铃薯育种材料提供支持。以紫色马铃薯‘黑美人’试管苗和块茎2种外植体为材料,进行愈伤组织诱导和继代培养并建立细胞悬浮培养系。以紫色马铃薯‘黑美人’单细胞为辐射材料,采用5个剂量的60Co-γ射线辐射处理,观察比较不同辐射处理条件下单细胞的再生率。结果表明:经过10 Gy的60Co-γ辐射处理后,有一定数量的再生植株产生,20 Gy的60Co-γ辐射处理后,植株再生慢,再生率低。经过40Gy、60 Gy的60Co-γ辐射处理后无再生植株。细胞核制片观察结果表明:通过30天的再生培养后,细胞核的外形有明显的变化,10 Gy的辐射处理对细胞核的影响仍明显低于20 Gy,说明60Co-γ辐射处理单细胞引起的诱变具有一定的稳定性,有望获得到马铃薯突变体材料。 相似文献
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《四川农业大学学报》2016,(1):73-77
【目的】提高紫甘薯贮藏后的商品价值。【方法】采用"果蜡"、"果蜡+柠檬酸"、"果蜡+氯化钙"等3种配方对紫甘薯块根涂膜,测定贮藏期间块根腐烂率、失重率、淀粉、可溶性糖、花青素含量等指标。【结果】结果表明:3种配方均能降低甘薯的腐烂率和失重率,以"果蜡+柠檬酸"处理效果最好,贮藏180d时分别比对照降低24.1%和12.9%;贮藏180d时,"果蜡+柠檬酸"处理薯块淀粉和可溶性糖含量分别较对照提高32.48%和28.85%;涂膜处理明显延缓了紫甘薯块根花青素含量的下降;另外,"果蜡+氯化钙"处理综合口感评价最高。【结论】在实际紫甘薯商品薯贮藏中以营养品质为目标时,可采用"果蜡+柠檬酸"配方;以综合口感评价为目标时,可采用"果蜡+氯化钙"配方。 相似文献
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提取甘薯“川薯34”总DNA,设计引物,通过高保真PCR扩增获得了长为1 144bp的甘薯储藏蛋白(Sporamin)基因启动子SpoA-p.PLACE在线分析表明:Sporamin启动子具有基本的启动子元件CAAT-box,并包含大量与储藏蛋白表达相关、抗逆相关及蔗糖表达相关的功能组件.构建植物表达载体pBI-SpoA-p::GUS、农杆菌工程菌株EHA105:pBI-SpoA-p::GUS后导入烟草及甘薯,分别得到15株烟草和10株甘薯的阳性转基因植株,GUS染色分析表明烟草各部位中只在根中有基因表达,甘薯根、茎和叶各部位未检测到活性.5%蔗糖诱导处理24 h后,在烟草根、茎及叶均观察到GUS活性;在甘薯中只有根有GUS活性.因此,可以看出此启动子为甘薯根部特异的表达启动子,并受蔗糖诱导而表达. 相似文献
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四川省稻曲病菌的群体遗传结构 总被引:3,自引:0,他引:3
采用AFLP(Amplified fragmentlength polymorphism)技术分析了来自四川14个不同水稻种植区和50个不同籼型杂交稻稻曲病菌(Ustilaginoidea virens)的遗传多样性.20对选择性扩增EcoR Ⅰ和Mse Ⅰ引物组合稻曲病菌株可产生40 ~56条DNA带,75个菌株共产生192条清晰可见的DNA带型,其中多态性121条,占总数的63.02%.结果表明:不同地理来源稻曲病菌可能具有相同的遗传群体结构,也显示特异性的群体遗传特征;稻曲病菌遗传结构与寄主品种关系不大,没有表现明显的专化性互作;稻曲病菌不同的遗传群体之间菌株的致病性存在很大差异,即使同一遗传群的不同亚群或同一亚群的不同次亚群之间的菌株致病性也显著不同. 相似文献
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根据GenBank中家蚕核多角体病毒T3株中p10基因的保守序列,克隆得到了8个不同地区的家蚕核多角体病毒的p10基因,并分别与GenBank中的NPVp10基因进行比对.结果发现p10基因都含有1个213 bp的开放阅读框(ORF)共编码70个氨基酸,8株P10蛋白间氨基酸序列相似性为95%~100%,相似性高.与GenBank中Ac-MNPV和BmNPV的P10蛋白相比,8株BmNPV P10蛋白都缺失了3个保守结构域中的C-端结构域,只含有2个保守结构域,即N-端卷曲螺旋和Pro丰富区. 相似文献