永登七山羊全基因组选择信号检测分析

旨在检测永登七山羊群体基因组选择信号,挖掘永登七山羊有价值的种质特性基因。本研究以4个绵羊群体(永登七山羊、岷县黑裘皮羊、兰州大尾羊和滩羊)共40个个体为研究对象,利用简化基因组测序(specific-locus amplified fragment sequencing, SLAF-seq)技术检测全基因组范围内的单核苷酸多态性位点(SNPs)。基于SNPs数据集,通过elgensoft软件进行主成分分析;运用Treemix软件分析基因流事件;利用群体遗传分化指数(Fst)和核苷酸多样性比值(πratio)进行全基因组选择性清除分析,取top 5%Fst和πratio的交集以确定基因组受选择区域,并对候选基因进行GO和KEGG富集分析。结果共得到1 658 596个群体SNPs;主成分分析(PCA)发现永登七山羊能够独立分群,基因流表明永登七山羊和兰州大尾羊存在较弱的基因交流。以永登七山羊为试验群体,岷县黑裘皮羊、兰州大尾羊和滩羊为参考群体进行选择清除分析,3个比较组的受选择区域分别检测出424、294、301个候选基因;GO和KEGG分析结果表明,候选基因分别显著富集在65、79、...     

基于全基因组填充重测序关联分析鉴别影响苏山猪初生体尺与乳头数性状的遗传位点

旨在鉴别影响苏山猪初生体尺和乳头数性状的遗传位点,开发可用于辅助育种的分子标记,为苏山猪生长和繁殖性能的持续选育提供理论基础。本试验对269头苏山猪初生仔猪(出生后24 h内)的体尺和乳头数表型进行测定,并采集耳组织样品。基于全基因组重测序及基因型填充策略,利用全基因组关联分析(genome-wide association study, GWAS)和群体分化指数(fixation index,Fst)的方法挖掘与目的性状强关联位点,并对位置功能候选基因开展GO和KEGG分析,确定最有可能的主效基因。本研究共鉴别到4个候选位点,分布在13、14和X染色体上,其中与初生体尺性状显著关联的位点有2个,与乳头数性状显著关联的位点有2个。本研究筛选出1个与体长性状相关的候选基因ACTA2;1个与胸围性状相关的候选基因COL4A6;3个与乳头数性状相关的候选基因ACTA2、CRTAP和SEPTIN6,为苏山猪初生体尺性状和乳头数性状的遗传改良提供了重要的分子标记。     

不同饲料企业产品粗蛋白质水平分析

为了解饲料企业产品粗蛋白质添加水平,对采集的134份配合饲料样品进行分析。饲料样品按照《饲料中粗蛋白的测定凯氏定氮法》（GB/T6432-2018）进行含量检测。结果显示,仔猪配合饲料（体重为10～25kg）粗蛋白质平均含量为16.3%,标准《仔猪、生长育肥猪配合饲料》（GB/T5915-2020）中要求,仔猪配合饲料（体重为10～25kg）,粗蛋白质含量为15.0%～18.0%。仔猪配合饲料样品粗蛋白质含量多数都符合规定,但也有不合规定的,超出标准规定范围的比例为1.7%。产蛋鸡高峰期配合饲料粗蛋白质平均含量为16.9%,肉鸡配合饲料（适用于0～10日龄）粗蛋白质平均含量21.5%,肉鸡配合饲料（适用于22～35日龄）粗蛋白质平均含量20.5%,参照《产蛋鸡和肉鸡配合饲料》（GB/T5916-2020）要求,分别超出规定范围的比例为33.3%、12.5%和10%。     

盐胁迫对5份无芒雀麦苗期生长和生理生化的影响及综合性评价

为了明确不同无芒雀麦苗期耐盐能力的强弱,本研究选择5份不同株型的无芒雀麦作为供试材料。根据新疆土壤盐碱成分设置中性盐(M盐)：NaCl∶Na₂SO₄∶Na₂CO₃=1∶4∶0和碱性盐(A盐)：NaCl∶Na₂SO₄∶Na₂CO₃=1∶1∶8两种处理,于三叶期每盆一次性浇灌2 L电导率(EC)为20 ms·cm^-1的盐处理液,CK浇灌等量自来水。处理30 d后测定生长指标、叶绿素荧光特性参数、丙二醛(MDA)和渗透调节物质含量,并通过相关性分析、主成分分析、隶属函数分析对13个指标进行分析评价。结果表明：除F_v/F_m和F_v/F_o外,盐胁迫显著影响其余11个指标,且5份材料间差异显著(P<0.05);5份无芒雀麦的株高、茎粗、分蘖数、地上生物量、根冠比、MDA和脯氨酸含量在不同盐胁迫下表现出不同的适应变...     

12个地方鸡种肌肉脂肪酸相对含量比较及因子分析

试验旨在对12个地方鸡种肌肉脂肪酸相对含量比较及因子分析。文章基于前人研究结果对12个地方鸡种（白耳鸡、狼山鸡、萧山鸡、北京油鸡、乌骨鸡、余干黑鸡、崇仁麻鸡、三黄鸡、康乐鸡、藏鸡、武定鸡、大围山鸡）的营养成及肌肉脂肪酸含量进行分析。结果显示,三黄鸡的系水力、剪切力、pH值均优于萧山鸡、白耳鸡、北京油鸡。藏鸡肉的粗脂肪含量明显高于其他11个鸡种。三黄鸡、白耳鸡及藏鸡氨基酸营养价值较高。乌骨鸡的饱和脂肪酸相对含量最高（44.96%）,藏鸡的饱和脂肪酸相对含量最低（31.67%）。藏鸡的不饱和脂肪酸相对含量最高（68.22%）,狼山鸡和乌骨鸡不饱和脂肪酸相对含量最低（54.34%、54.43%）。主成分分析获得的前6个主成分可以解释全部变异的69.153%,第1、2、3主成分分别解释总变异的27.352%、25.371%、16.431%。基于主成分值的系统聚类图将12个地方鸡种归为4大类,余干黑鸡、三黄鸡、康乐鸡、崇仁麻鸡聚为一类,北京油鸡、藏鸡、武定鸡聚为一类,萧山鸡、大围山鸡、狼山鸡、乌骨鸡聚为一类,白耳鸡为独立分支。研究表明,藏鸡、余干黑鸡、三黄鸡不饱和脂肪酸相对含量明显高于饱和脂肪酸...     

超声辅助双水相体系优化辛夷总黄酮提取工艺及其抗氧化活性研究

试验旨在优化超声辅助双水相法提取辛夷总黄酮的工艺条件,研究其体外抗氧化活性。以总黄酮得率为指标,采用单因素和响应面试验设计优化最佳提取条件,DPPH自由基清除率初步评价辛夷总黄酮的抗氧化活性。结果显示,超声辅助双水相法提取辛夷总黄酮最佳提取条件为聚乙二醇（PEG1000）质量分数40%、硫酸铵质量分数30%、液料比40 mL/g、提取时间30 min;此条件下对建立的数学模型进行试验验证,验证结果预测值为6.78%,实际值为6.81%,预测误差为0.79%。辛夷总黄酮对DPPH自由基清除率达77.36%,具有良好的抗氧化活性。研究表明,超声辅助双水相法操作简便,黄酮得率高,适用于辛夷总黄酮的提取。     

中国荷斯坦牛初产日龄遗传评估及全基因组关联分析

基于高通量SNPs测序的全基因组关联分析为奶牛繁殖性状相关基因的探索提供了契机。本研究基于课题组前期中国荷斯坦牛基因组测序芯片的结果,通过DMU(v 6.0)采用AI-REML结合EM算法的动物模型对北京地区2001-2011年10年间19 111头中国荷斯坦母牛初产日龄记录进行遗传参数估计,并应用PLINK(v 1.07)将大群估计的2 172头中国荷斯坦母牛初产日龄性状的育种值(EBV)作为表型值,进行基于无关群体设计的全基因组关联分析。通过全基因组水平的Bonferroni校正,共检测到1 700个SNPs与初产日龄显著相关。选取P值达到10-15的43个SNPs进行初步分析,其中12个位于X染色体上。显著SNPs上下游200kb范围内存在KLHL4、TRAM1、TRAM2、ZNF438、MATK等繁殖障碍疾病相关基因。7号染色体1 Mb(20.42~21.52 Mb)区域内多个SNPs位点与初产日龄显著相关。这些基因和区域可以作为影响初产日龄性状的重要候选基因和区域,为揭示奶牛繁殖性状的分子遗传基础积累了素材。     

鸡柔嫩艾美尔球虫病抗性主成分分析评估模型的建立

为建立鸡活体可测球虫病抗性综合评估模型,探索鸡球虫病抗性选育新方法,以京海黄鸡为试验材料,根据国内外文献选择15个球虫抗性评价指标,通过比较鸡柔嫩艾美尔球虫感染组和非感染组抗性指标的差异,进一步筛选活体可测指标,并进行主成分分析,通过各主成分和综合主成分与所有抗性指标的相关分析,筛选最优抗性综合评估模型,并进行模型有效性筛选。在所选的14个活体可测抗性指标中,有6个指标在感染和非感染组间存在显著或极显著的差异(P0.05或P0.01),他们分别是感染后第3—5天体增重、感染后第8天血浆中CAT、GSH-Px、MDA、SOD和IFN-γ的浓度;主成分分析建立了6个单主成分和累计贡献率大于80%的综合主成分的抗性评估模型,各抗性评估模型计算的综合选择指数与15个抗性指标相关分析的结果表明,第一主成分模型和7个抗性指标相关极显著(P0.01),2个相关显著(P0.05),特别是与盲肠病变记分相关极显著(P0.01),其余6个主成分评估模型只与15个抗性指标中的2~3个相关显著或极显著(P0.05或P0.01),且与盲肠病变记分相关均不显著(P0.05);经检验第一主成分模型选择指数值的分布为正偏态分布,排序后其大小与盲肠病变表现一致。因此,第一主成分模型fi1=-0.64Zxi1+0.31Zxi2+0.80Zxi3-0.05Zxi4-0.08Zxi5+0.59Zxi6可以作为鸡柔嫩艾美尔球虫抗性选择的最佳综合选择指数用于鸡的抗病育种。     

昆虫授粉能提高苹果品质和经济价值

<正>授粉昆虫在许多水果、蔬菜和田间作物的生产中发挥关键性作用。无论从国家还是从全球的角度来讲,很多研究都把昆虫授粉作为农业生产的一项很重要的生态系统服务。评估昆虫授粉的经济价值对于食品生产的可持续性和农场管理具有很重要的意义。     

河北省猪星状病毒4型全基因组测定及遗传进化分析

为了解河北省流行的猪星状病毒(PAstV)遗传特性和重组现象,设计了7对特异性扩增引物,利用RT-PCR方法进行全基因组序列扩增;应用DNAStar软件和MEGA 7.0软件对扩增得到的序列进行拼接和核苷酸同源性分析,并建立基于全基因组和ORF2基因的系统进化树;利用生物学分析软件对全基因组序列结构特点和重组现象进行分析。结果显示,成功扩增得到1株PAstV4 HB-SJZ全基因组序列;全基因组遗传分析显示,HB-SJZ株与PAstV4参考毒株同源性显著高于其他基因型毒株,为74.2%～81.0%,与匈牙利4型毒株WBAstV-1同源性最高(81.0%);基于ORF2基因分析显示,HB-SJZ株与PAstV4参考毒株同源性为64.8%～68.9%,与日本毒株PoAstV-VIRES-GX03-C3遗传关系最近(68.9%);重组分析显示,HB-SJZ株的ORF1基因与JPN Bu5 2014株和JPN Mol2-3 2015株存在重组现象。这一研究提示河北省流行的PAstV4是同物种重组毒株,为该病的流行病学调查提供科学依据,也为该病的防控提供理论基础。