水稻基因组中分泌蛋白的初步分析

本文利用Signa1P3．0两种算法NN（neural network）和HMM（hidden markov model）对水稻基因组中59712个ORF进行了初步的筛选,其中有4433个ORF编码的蛋白具有分泌特性,占整个基因组的7．3％。4433个具有分泌特性的蛋白,在染色体的分布是不均一的。在1号染色体的所占的比例最多,为8．8％;而12号染色体上所占的比例最少,为5．0％。其中在具有分泌特性的蛋白中,酶类、非酶类和推测蛋白分别占具有分泌型信号肽蛋白的24．9％、45．7％和29．5％。     

白菜胞质雄性不育系叶绿体DNA的SSR分析

从烟草的36时叶绿体SSR引物中筛选出10对引物对白菜不育系和保持系的叶绿体基因组进行了SSR分析,发现两系间扩增片段的多态性较小,获得了1条只在不育系稳定出现的微卫星序列.此结果显示,不育系和保持系的叶绿体基因组间确实存在差异,此差异也许与细胞质雄性不育相关.     

长白山杜鹃花基因组DNA提取及RAPD体系的建立

采用改良的CTAB法提取杜鹃花的基因组DNA,所得的DNA纯度高、质量好,可用于RAPD分析.筛选出的杜鹃花RAPD反应的最佳体系为25μL反应体系中包括模板DNA20～200ng.引物10pmol,dNTPs100μmol·L-1,TaqDNA聚合酶0.5U,Mg2 2.5 mmol·L-1,10xbuffer缓冲液2.5 mmol·-1,其余部分用无茵超纯水补充.PCR扩增程序为94℃预变性5 min;94℃变性1 min,37℃退火1min,72℃延伸2min,40次循环;72℃最终延伸7min.应用优化后的反应体系PCR扩增获得的RAPD指纹图谱带型清晰,重复性好,为长白山杜鹃花品种鉴定、分类的研究提供了一定基础.     

简易快速从微量羊血中提取高质量基因组的方法

以碘化钾法为基础,建立了一种简单快速从微量羊血中提取高质量基因组DNA的改进方法。该方法提取的基因组DNA经0．6％琼脂糖凝胶电泳检测,DNA带整齐,无拖尾。OD260／OD280为1．81±O．13,浓度为（234±36．4）μg／mL,PCR扩增得到了满意的扩增效果。     

海洋贝类基因组DNA的提取改进及ITS2扩增

目前已报道的常见的基因组DNA提取方法有经典酚醇法、盐析法、碘化钾法、煮沸法等,其中酚醇法根据其裂解液的不同又有CTAB、SDS、ROSE等具体方法,本试验对经典的CTAB法进行了改进,从酒精保存的西施舌组织中提取得到质量高的基因组DNA,以此为模板扩增ITS2效果很好。     

北方山溪鲵精巢中性类固醇激素的免疫细胞化学研究

探讨3种性类固醇激素在北方山溪鲵精子发育过程中的调控作用.用免疫细胞化学方法对3种激素在山溪鲵精子发生周期不同时期在精巢中的细胞定位进行检测.结果表明雄激素分布在精原细胞的胞质中,尔后转移到精母细胞及精子细胞的核中;雌激素一直存在于生精细胞的胞质及核膜周围;孕激素分布在精原细胞及精母细胞的胞质中,随后在精子细胞的核质中有表达.雄激素在早期的精子发生和转型中起作用,而雌激素主要以非基因组效应参与生精细胞的增殖,孕激素在精子发育后期精子细胞的变态中起作用.3种激素以不同的方式调控精子的发生.     

Patterns of synonymous codon usage bias in chloroplast genomes of seed plants

Codon usage in chloroplast genome of six seed plants （Arabidopsis thaliana, Populus alba, Zea mays, Triticum aestivum, Pinus koraiensis and Cycas taitungensis） was analyzed to find general patterns of codon usage in chloroplast genomes of seed plants. The results show that chloroplast genomes of the six seed plants had similar codon usage patterns, with a strong bias towards a high representation of NNA and NNT codons. In chloroplast genomes of the six seed plants, the effective number of codons （ENC） for most genes was similar to that of the expected ENC based on the GC content at the third codon position, but several genes with low ENC values were laying below the expected curve. All of these data indicate that codon usage was dominated by a mutational bias in chloroplast genomes of seed plants and that selection appeared to be limited to a subset of genes and to only subtly affect codon usage. Meantime, four, six, eight, nine, ten and 12 codons were defined as the optimal codons in chloroplast genomes of the six seed plants.     

根瘤菌基因组内简单重复序列的分析

【目的】分析根瘤菌基因组中的简单重复序列（simple sequence repeats,SSRs）,为其在根瘤菌遗传多样性研究中的应用提供有益的信息。【方法】利用公共的微生物串联重复序列数据库资源,对已测序的3种根瘤菌基因组中SSRs的结构类型、分布、丰度等进行系统的比较分析。【结果】大豆慢生根瘤菌（Bradyrhizobium japonicum）、百脉根根瘤菌（Mesorhizobium loti）和苜蓿中华根瘤菌（Sinorhizobium meliloti）基因组中的SSRs分别为1 410个、859个和638个,3种根瘤菌基因组中长重复的四、五、六核苷酸基序更为丰富,变异性更高。数目最少的为单碱基重复。【结论】3种根瘤菌的SSR在结构类型和分布规律上均具有一定的相似性。     

烟草植株染色体倍数性与叶绿体数的相关性研究

为了提高气孔保卫细胞叶绿体计数法鉴定烟草花粉植株染色体倍性的效率,对烟草植株染色体数与气孔保卫细胞叶绿体数的相关性进行了研究．结果表明,各倍性烟草植株气孔保卫细胞叶绿体数平均值之比符合相应倍性间的染色体数的比值：叶绿体数的分布服从正态分布．