水稻基因组中分泌蛋白的初步分析

本文利用Signa1P3．0两种算法NN（neural network）和HMM（hidden markov model）对水稻基因组中59712个ORF进行了初步的筛选,其中有4433个ORF编码的蛋白具有分泌特性,占整个基因组的7．3％。4433个具有分泌特性的蛋白,在染色体的分布是不均一的。在1号染色体的所占的比例最多,为8．8％;而12号染色体上所占的比例最少,为5．0％。其中在具有分泌特性的蛋白中,酶类、非酶类和推测蛋白分别占具有分泌型信号肽蛋白的24．9％、45．7％和29．5％。     

不同保鲜剂对香石竹切花保鲜效果的研究

用5种保鲜剂对香石竹切花进行了处理,测定其瓶插寿命、鲜重变化和花径等综合指标。结果表明:配方为50 g/L蔗糖+150 mg/L柠檬酸+50 mg/L硝酸银的保鲜效果最好。     

根癌农杆菌Ti和AT质粒基因组中的分泌型信号肽分析

利用SignalP3.0和PrediSi软件结合L值和TMHMM筛选,对根癌农杆菌(Agrobacteriumtumefaciens)C58Cereon菌株的Ti和AT质粒所编码的745个ORF编码蛋白中的信号肽进行了预测,发现35条为分泌型蛋白,其中6条属于RR-motif型信号肽,2条蛋白的信号肽为细菌素-信息素型信号肽,新注释了24条分泌型信号肽,其中1条来自Ti质粒,23条来自AT质粒的蛋白。这些信号肽N结构域的长度变化为2￣19aa,平均为6.8aa,H结构域的长度变化为8￣34aa,平均为17.1aa。     

Analysis of Sec-type Signal Peptides in the Ti and AT Plasmids of Agrobacterium tumefaciens C58 Cereon

利用Signal P3.0和PrediSi软件结合L值和TMHMM筛选，对根癌农杆菌(Agrobacterium tumefaciens )C58 Cereon菌株的Ti和AT质粒所编码的745个ORF编码蛋白中的信号肽进行了预测，发现35条为分泌型蛋白，其中6条属于RR-motif型信号肽，2条蛋白的信号肽为细菌素-信息素型信号肽，新注释了24条分泌型信号肽，其中1条来自Ti质粒，23条来自AT质粒的蛋白。这些信号肽N结构域的长度变化为2~19 aa,平均为6.8 aa，H结构域的长度变化为8~34 aa，平均为17.1 aa。