应用PCR方法快速检测黄瓜细菌性角斑病菌

黄瓜细菌性角斑病是黄瓜上的一种重要细菌病害,其病原为丁香假单胞菌黄瓜致病变种(Pseudomonas syringae pv.lachrymans),目前未见到该病害特异性PCR检测方法的报道。通过分析丁香假单胞菌(P.syringae)不同致病变种glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase 1(gap1)基因序列设计得到一对Psl特异性PCR引物。利用该引物对丁香假单胞菌不同致病变种、假单胞菌属其他种及其他属的共46株菌株进行了PCR扩增,结果表明,所有不同来源的12株黄瓜细菌性角斑病菌均得到179bp的目标片段,而所有其他参试菌株均无扩增条带,PCR检测的灵敏度为7.5×103cfu/mL。利用该方法可从接种后发病的黄瓜叶片总DNA中检测到特异条带,而健康叶片无条带。该引物的PCR检测方法可直接用于植株总DNA的检测,无需进行病原菌的分离培养,快速简便,适用于进出境检验检疫及种苗健康检测等。     

松材线虫rDNA-ITS2的TaqMan探针实时荧光PCR检测

以松材线虫rDNA -ITS2为靶区 ,建立松材线虫的TaqMan探针实时荧光PCR检测方法。对松材线虫大量DNA和单条线虫的检测结果表明 ,探针检测松材线虫和拟松材线虫时 ,前者产生明显的荧光信号 ,后者无荧光信号 ,表明探针具有高度的特异性 ;探针检测到最低模板浓度为 1pg·μL- 1 ,DNA测序结果与实时荧光PCR结果一致     

半巢式-RT-Realtime PCR检测李痘病毒

李痘病毒(Plum pox virus,PPV)是我国重要的植物检疫性有害生物。本研究根据PPV中CP基因(coat protein gene)的保守序列,设计了3条PCR引物和1条TaqMan探针,建立了半巢式-RT-RealtimePCR检测PPV的方法。该方法有机地结合了巢式PCR和实时荧光PCR技术;3条引物形成的2套PCR体系相互验证,有效提高了结果的准确性;荧光探针有效提高了检测的灵敏度。实验结果表明,本方法准确、灵敏、简便、快速,检出低限可达37fg/μL植物总RNA。     

双重数字PCR在转基因水稻检测中的应用

本研究基于微滴式数字PCR(droplet Digital PCR,dd PCR)技术,针对转基因水稻Bt汕优63外源基因建立了双重数字PCR检测方法。该方法在常见的转基因品系中具有很好的特异性,转基因样品绝对定量检测范围为0.5%～100%,定量检测限可达0.5%、定性检出限可达0.05%。与目前的标准检测技术相比,双重数字PCR具有更低的定量检出限,可以更好的满足实际检测的需要。     

柑桔黄龙病病原16S rDNA克隆、测序及实时荧光PCR检测方法的建立

克隆并测定了中国柑桔黄龙病病原16SrDNA基因序列，经同源性比较，表明属于柑桔黄龙病菌(Liberobacter asiaticum)亚洲种中一个新株系(中国厦门株系)。依据获得的16SrDNA特异序列，建立了柑桔黄龙病病菌检测的实时荧光PCR方法，并应用此方法对柑桔样品进行了检测。结果显示，该检测方法具有快速、特异、敏感、重复性好等优点。该方法为柑桔黄龙病的检测，特别是早期诊断、检疫和病害的综合治理奠定了基础。     

2014～2015年中国进境植物疫情截获情况

本文对2014~2015年中国进境植物疫情截获情况进行数据统计,重点分析不同检疫业务类型、有害生物类别、来源地的疫情截获数据和检疫性有害生物截获情况。分析表明:进境植物疫情截获数据持续增长,疫情主要来源渠道为进境货物,废纸携带有害生物风险增高,昆虫、杂草、真菌为截获次数最多的有害生物类别,美国、巴西、澳大利亚是截获有害生物次数最多的来源国。     

进境玉米种子携带玉米褪绿斑驳病毒的检测与鉴定

 Imported maize seeds were planted in a quarantine greenhouse and two seedlings with chlorotic mottle symptoms were observed. The ELISA results showed that the two seedlings reacted positively with antibody against Maize chlorotic mottle virus (MCMV). The positive samples were further identified by RT-PCR method and the 711 bp size target bands were amplified specifically. The similarity range of nucleotide sequence of both RT-PCR product and six MCMV coat protein genes was 97%-99%. The amino acid sequence homology was 97.88%-99.89%. Based on the above results, the virus was identified as MCMV. It was the first time that MCMV was intercepted from imported maize seeds.     

利用双重PCR-DHPLC技术检测水稻细菌性谷枯病菌的研究

本研究建立了一种应用双重PCR结合变性高效液相色谱技术(polymerase chain reaction-denatured high performanceliquid chromatography,PCR-DHPLC)检测水稻细菌性谷枯病菌的方法。根据水稻细菌性谷枯病菌ITS序列(internal tran-scribed spacer)和gyrB基因序列,设计两对特异性PCR检测引物,对水稻细菌性谷枯病菌株和非水稻细菌性谷枯病菌株分别进行PCR-DHPLC及双重PCR-DHPLC检测,同时进行检测灵敏度及阳性菌株的同源性分析。结果显示,PCR-DHPLC检测的特异性强,灵敏度为菌浓度4×102cfu/mL,7株水稻细菌性谷枯病菌PCR产物同源性一致。该方法能简便、灵敏、高特异性地对水稻细菌性谷枯病菌进行高通量的自动化检测。     

青岛藻华的形态学观察和分子鉴定

2008年5月下旬,青岛周边海域出现大面积的藻华现象,对青岛3处海滨采集样品进行形态学观察,初步鉴定属于同一种浒苔属浒苔(Enteromorpha prolifera),藻体从深绿色到浅绿色,管状或扁压,膜质,丛生,主枝明显,分枝细长众多;藻体细胞大小不均一,有多个蛋白核。但是根据对质体基因rbcL和核基因ITS的系统发生学分析显示它属于典型的LPP(Ulva linza-procera-prolifera)复合种。     

三系杂交水稻真伪及纯度实时PCR技术鉴定的研究

杂交水稻的研究和推广为国民经济的发展起到了重要的作用，并已经在东南亚地区推广。如何建立一套快速、准确的杂交水稻真伪及纯度检测体系一直是困扰着口岸检疫人员的技术难题。实时荧光PCR技术是近年来新兴的检验技术。我们通过对已报道的雄性不育特异片段R2-630WA进行PCR验证，发现其可以作为鉴定杂交稻不育胞质的分子标记。依据此片段设计并合成一对引物和一条TaqMan荧光探针，对17个水稻品种进行实时荧光PCR检测。结果表明：此探针可以特异扩增三系杂交稻F1及不育系，并可初步用于三系杂交稻的纯度检测，由此建立了一套准确、快速的三系杂交稻鉴定体系。