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利用双亲高密度SNP标记信息,在畜禽群体中进行亲子鉴定及亲本推断新方法的计算机程序开发,并使用模拟的600 000个SNP标记对该程序进行测试。结果表明:对系谱正确性进行鉴定时,SNP标记数大于100即可达到100%的亲子鉴定准确率;对错误的系谱关系进行潜在亲子关系推断时,SNP标记数大于300可保证100%的推断准确率。标记平均MAF较低会降低亲子推断准确率。在程序运行效率方面,当使用50 000的SNP标记对1 000条错误率为10%的系谱进行亲子鉴定和推断时,共耗时332.87s,且计算耗时与标记数及个体数呈线性变化。本研究基于孟德尔遗传原理,设计并开发了基于双亲及后代基因型的亲子鉴定及亲本推断程序,该方法运行速度快,操作简单,准确性高,值得在畜禽群体基因组相关研究方面进行推广应用。 相似文献
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在哺乳动物卵泡发育过程中,卵泡腔的形成和扩张、排卵、黄体化以及闭锁等伴随明显的组织重塑。卵泡膜细胞和颗粒细胞的细胞外基质及卵泡液中含有大量的明胶蛋白、纤维蛋白和Ⅳ型胶原蛋白等,这些活性蛋白为卵泡膜细胞和颗粒细胞的迁移、增殖和分化提供了必要条件。基质金属蛋白酶-2(matrix metalloproteinases 2,MMP2)和酶-9(MMP9)在其他MMPs、雌激素、凋亡和自噬信号通路的协同作用下,分解细胞外基质和卵泡液中的明胶蛋白、纤维蛋白和Ⅳ型胶原蛋白等,促进细胞凋亡和血管生成,使卵巢组织发生降解和重塑,进而影响卵泡膜细胞和颗粒细胞的功能、卵泡腔的形成及扩张,调控卵泡的生长发育。针对MMP2和MMP9调节卵泡生长、排卵、黄体化及闭锁的研究进展进行综述。 相似文献
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颗粒型复合酸化剂-康乐酸加工性能与饲养效果 总被引:1,自引:0,他引:1
在饲料中添加康乐酸这种颗粒型复合酸化剂,由于其良好的流散性及抗吸潮性能,添加到饲料中其混合均匀度比柠檬酸高。另一方面,添加康乐酸的饲料制粒效果比其他酸化剂优,在3.0mm环模下也能顺利制粒,相比之下添加柠檬酸的饲料在3.0mm环模制粒出现严重堵塞,加大了能耗,增加了饲料成本。添加康乐酸比添加柠檬酸仔猪日增重分别提高了6.5%和8.2%,料肉比平均下降3.1%。经济效益的分析结果表明:添加康乐酸比添加柠檬酸饲料成本降低45元/t;仔猪增重成本节省0.22元/kg。 相似文献
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瘦肉型种猪中心测定及其性能分析研究 总被引:3,自引:0,他引:3
本研究经 6年分 10批对 2 1个种猪场的 10 83头长白、大白和杜洛克后备公猪进行集中中心测定 ,测定性状包括日增重、校正背膘厚和饲料转化率等 3个生产性状 ;同时分析了测定季节对生产性能的影响 ,比较了各品种及不同年度的生产性能 ,结果表明日增重无显著差异 ,杜洛克的校正背膘厚在秋季极显著地高于春季 (P <0 .0 1) ,并且长白猪和大白猪也都有春季比秋季测定猪校正背膘厚较薄的现象 ,饲料转化率则杜洛克猪和长白猪在秋季极显著地优于春季 (P <0 .0 1) ,大白猪也是秋季显著优于春季 (P <0 .0 5 ) ;3个品种中以大白猪的性能最好 ,长白次之 ,杜洛克最差 ;各年度测定结果整体上以 2 0 0 0年较为理想 相似文献
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用RAPD标记分析6个品种猪的群体遗传结构 总被引:12,自引:1,他引:11
用140个10碱基随机引物对引入品种杜洛克猪、长白猪、大白猪、斯格猪及广东地方猪种蓝塘猪、大花白猪的基因组池DNA进行了RAPD分析,并从扩增产物表现为多态的引物中筛选出9个特异性强的引物进行个体DNA的RAPD分析。结果表明:(1)斯格猪与长白猪、蓝塘猪与大花白猪的相似系数较高,聚类关系较近;而个地方猪种与4个引入猪种之间则相应地较低、较远。在4个引入猪种中,除杜洛克猪外,另3个表现出与华南地方猪种相对较近的亲缘关系。(2)引物L-15、J-13可作为地方猪种与引入猪种区别的标记,I-09可作为猪性别区别的标记。(3)4个引入品种的群体内遗传变异程度普遍低于广东两地方猪种,尤以杜洛克猪群体内遗传变异最小;两地方猪种中,蓝塘猪的群体内遗传变异要小于大花白猪。 相似文献
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采用RT-PCR扩增与直接测序,对猪肌肉组织的一条表达序列标签(EST)(GenBank登录号为BM445313)进行SNP筛查.检测到2个新的SNPs,通过BLAST在NCBI非冗余数据库中进行同源性比对,发现该EST位于Myopalladin基因的3'UTR区.在猪参考家系SCAU-LL F2群体中对其中的一个SNP进行Csp61RFLP基因分型,并与胴体瘦肉率和皮脂率进行关联分析,结果表明基因型CT与CC的瘦肉率均值分别为46%和45%、皮脂率均值分别为42%和44%,在瘦肉率和皮脂率上的差异均达到了显著水平(P<0.05).由此可见,猪Myopalladin不同基因型对胴体性状有着重要影响,是猪育种应用中的一个潜在遗传标记. 相似文献
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用RAPD方法分析六个品种猪的亲缘关系 总被引:3,自引:0,他引:3
用140个10碱基随机引物对外来猪种杜洛克猪、斯格猪、长白猪、大约克夏猪及地方猪种蓝塘猪、大花白猪的基因组DNA进行RAPD分析,其中23个引物无扩增产物,66个引物的扩增产物表现为多态,51个引物的扩增产物表现为单态,扩增产物的电泳条带数在1~11条之间,平均为42条。从相似系数及聚类分析结果可以看出,斯格猪与长白猪、蓝塘猪与大花白猪的相似系数较高,亲缘关系也较近,而2个地方猪种与4个外来猪种之间则相应地较低、较远;在4个外来猪种中,除杜洛克猪外,另3个外来猪种又因曾直接或间接地引用过中国地方猪种作为育种素材,因而表现出与地方猪种相对较近的亲缘关系。 相似文献
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微卫星DNA标记与猪肉质性状的相关分析 总被引:8,自引:0,他引:8
测定了长蓝参考家系F2代个体的肉色、大理石纹、pH值和系水力4个肉质性状,同时测定了6号染色体的23个微卫星DNA标记,将不同基因型与4个肉质性状进行方差分析与多重比较.结果表明:肉色与大理石纹、pH值、系水力间的相关系数分别为—0.322、0.419、0.468,pH值和系水力间的相关系数最高,为0.737,差异极显著;MN006座位与影响pH值性状的QTL连锁,加性效应为0.108,MN004座位与影响大理石纹性状的QTL连锁,加性效应为0.125. 相似文献
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