鸭肝脏基础型脂肪酸结合蛋白Lb-FABP基因的克隆、组织表达谱和序列特征分析

 【目的】克隆仙湖肉鸭肝脏基础型脂肪酸结合蛋白Lb-FABP基因的cDNA,并进行组织表达谱和蛋白结构分析,为肉鸭的分子育种提供基础资料。【方法】通过比较基因组学,采用RT-PCR和RACE技术,获得了Lb-FABP基因的cDNA序列全长序列;并采用半定量PCR分析了Lb-FABP基因在16个组织的表达;通过生物信息学方法预测了Lb-FABP基因的蛋白结构。【结果】仙湖肉鸭Lb-FABP基因的cDNA全长548bp,包括97bp长的5′非翻译区(5′UTR)和70 bp长的 3′非翻译区(3′UTR)以及381 bp开放阅读框(ORF,含终止密码子)。Lb-FABP基因组序列包括4个外显子和3个内含子,3个内含子分别长为991 bp、292 bp和713 bp。在所检测的16个组织中Lb-FABP基因mRNA均有表达,尤其在肝脏组织中的表达明显高于其它组织。Lb-FABP理化性质表明该蛋白为一偏碱性蛋白,无明显的信号肽和跨膜区域;蛋白二级结构主要由β折叠和少量的α螺旋、loop环构成,预测发现在第5—22氨基酸残基处存在一个细胞溶质脂肪酸结合蛋白活性功能区;其三维结构由反向平行的10条β链及2条短α链组成的有一开口的“蛋白桶”构成。Lb-FABP基因氨基酸序列与鸡的该基因氨基酸的相似性为97.0%,与其它非哺乳脊椎动物的同源性达80%以上,比对尚未发现哺乳动物存在该基因。【结论】成功克隆肉鸭Lb-FABP基因cDNA序列以及基因组序列,该基因在肝脏组织的表达高于其它组织,并获知在5—22氨基酸处存在其蛋白活性功能区。     

大花白猪种质特性及保护利用

大花白猪为脂肉兼用型,主要分布于粤北、粤中地区,具有适应高温多湿的环境、耐粗饲、早熟易肥、沉积脂肪能力强、肉质好、肉味鲜美、高繁殖力、发情症状明显、母猪的哺乳性能好等优良特性,被广泛用作商品猪生产的杂交母本,是我国优良地方猪种之一。     

猪胎儿成纤维细胞APOE基因的差异表达研究

[目的]研究APOE基因在不同代数的猪胎儿成纤维细胞中的差异表达。[方法]收集正常传代生长的第1、10、15、20、25、50代猪胎儿成纤维细胞,分别提取细胞总RNA。采用RT-PCR技术,检测不同代数猪胎儿成纤维细胞中APOE基因的表达。[结果]猪APOE基因在第1代猪胎儿成纤维细胞中表达水平最高,随着细胞代数的增加,表达量逐渐下降,到第50代表达量最低。[结论]APOE基因在不同代数的猪胎儿成纤维细胞中有选择性表达的趋势。     

猪胎儿成纤维细胞APOE基因的差异表达研究

[目的]研究APOE基因在不同代数的猪胎儿成纤维细胞中的差异表达。[方法]收集正常传代生长的1、10、15、20、25、50代猪胎儿成纤维细胞,分别提取细胞总RNA。采用RT-PCR技术,检测不同代数猪胎儿成纤维细胞中APOE基因的表达。[结果]猪APOE基因在第1代猪胎儿成纤维细胞中表达水平最高,随着细胞代数的增加,表达量逐渐下降,到第50代表达量为最低。[结论]APOE基因在不同代数的猪胎儿成纤维细胞中有选择性表达的趋势。     

高地隙施药机喷杆自动调平系统设计与试验

因田间地表起伏,高地隙施药机在作业过程中车体极易发生横滚方向的倾斜,同车体刚性连接的喷杆同时倾斜,甚至与作物、地面碰触,影响喷药均匀性和作业安全性.为此基于机电液一体化控制方法,设计了高地隙施药机喷杆自动调平系统.设计电控液压调平机构,使喷杆与车体柔性联接,实现在横滚方向上喷杆与车体的相对转动.采用姿态测量方法实时检测...     

3款猪50K SNP芯片基因型填充至序列数据的效果评估

【目的】利用猪 50K SNP（Single nucleotide polymorphisms） 芯片开展基因组育种已经得到了广泛的应用与认可。基因型填充可在不增加基因型检测成本的前提下大幅提高基因型数据量，有利于开展复杂性状的遗传解析与遗传评估。本研究旨在评估 3 款猪 SNP 芯片基因型填充至序列数据的填充效果。【方法】选用 3 款芯片共同检测的 48 头杜洛克猪群体作为填充的目标群体，260 头猪的全基因组测序数据作为参考群体，使用Beagle5.1 软件进行基因型填充，对比 3 款不同猪 SNP 芯片纽勤 50K、中芯一号 50K 和液相 50K 基因型填充至序列数据的填充效果。【结果】 3 款芯片原始的 SNP 数分别为 50 697、57 466 和 50 885 个。填充至序列后，未质控时位点填充准确性 （基因型一致性） 分别为 0.886、0.886 和 0.898，质控过滤 DR²（Dosage R-squared）<0.95 的位点后，填充准确性 （基因型一致性） 分别提升至 0.974、0.976 和 0.969，位点数分别为 3 39...     

杜洛克猪生长性状全基因组关联分析及候选基因鉴定

旨在对杜洛克猪生长性状进行全基因组关联分析及候选基因鉴定。本研究选用361头杜洛克种公猪作为试验群体，对达100 kg体重日龄、达100 kg平均日增重、达100 kg活体背膘厚和达100 kg眼肌面积性状进行测定，基因型信息使用50K单核苷酸多态性阵列进行分型，质控后得到31 618个SNPs。使用GCTA软件利用基因组信息对各生长性状进行遗传参数估计，使用R软件rMVP包FarmCPU模型进行全基因组关联分析，鉴定与生长性状相关的基因组区域和候选基因。结果表明，达100 kg体重日龄、达100 kg平均日增重、达100 kg活体背膘厚和达100 kg眼肌面积性状的遗传力分别为0.27、0.29、0.16和0.11,属于中等遗传力性状，达100 kg体重日龄和达100 kg平均日增重的遗传相关和表型相关值均为-0.99,为强负相关关系。全基因关联分析结果表明，在达100 kg体重日龄和达100 kg平均日增重性状上共检测到3个显著SNPs,均位于10号染色体上。使用最小显著差数检验法对显著SNPs的等位基因型进行多重比较，显著SNPs rs81237156、rs81424502和rs...     

壹号黑猪胴体性能及肉品质分析

试验旨在探索自主培育品种壹号黑猪的肉质特性。在日龄235.83 d、体重125.68 kg时屠宰6头阉割公猪，测定其胴体性能、脂肪酸和氨基酸组成情况。结果表明：壹号黑猪的瘦肉率和肌内脂肪分别为53.01%和3.86%；肌肉中必需脂肪酸（EFA）和多不饱和脂肪酸（PUFA）含量分别为7.83%和10.08%，多不饱和脂肪酸与饱和脂肪酸的比例（P:S）为0.25；采用味道强度值（TAV）评估背最长肌肌肉主要的非挥发性呈味物质及贡献，氨基酸中以Glu的TAV值最高为121.67，是壹号黑猪肌肉鲜味的主要贡献者，其中甜、鲜、酸和苦味氨基酸TAV值分别为228.23、177.98、189.29、200.42，肌肉中以甜味氨基酸TAV值最高。参考FAO/WHO模式进行评价，壹号黑猪背最长肌氨基酸比值系数分（SRC）76.55，是优质的动物蛋白质来源。     

大白猪眼肌面积、估计瘦肉率和背膘厚的加权一步法全基因组关联分析

旨在使用加权一步法全基因组关联分析方法，充分利用群体的表型、系谱和基因型信息，探索与大白猪眼肌面积、估计瘦肉率和背膘厚相关的候选基因。本研究收集21 754头大白猪眼肌面积、估计瘦肉率和背膘厚的表型记录数据，其中基因型数据个体共1 259头。通过方差分析和加权一步法全基因组关联分析，确定性状显著相关的数量性状基因座(quantitative trait locus, QTL)。并进行基因注释、GO(gene ontology)功能和KEGG(kyoto encyclopedia of genes and genomes)通路富集分析。计算结果表明，大白猪眼肌面积、估计瘦肉率和背膘厚的遗传力分别为0.450 6±0.017 3、0.496 8±0.017 4和0.475 8±0.017 2。利用加权一步法全基因组关联分析，定位到与眼肌面积显著相关的候选QTL区域10个，与估计瘦肉率显著相关的候选QTL区域8个，与背膘厚显著相关的候选QTL区域12个。后续基因注释、GO功能和KEGG通路富集分析显示，与眼肌面积相关的候选基因36个，共富集到7个条目；与估计瘦肉率相关的候选基因29个，共富集...     

大白猪乳头数对繁殖性状的影响及其遗传参数估计

本研究主要对大白猪的繁殖性状和乳头数进行遗传参数估计，评估遗传趋势和表型趋势，并探究乳头数对母猪繁殖性状的影响。将乳头数作为繁殖性状的固定效应，对影响大白猪繁殖性状的固定效应进行方差分析，运用DMU软件的DMUAI和DMU4模块，利用单/多性状动物模型估计大白猪繁殖性状和乳头数的遗传参数，并评估这些性状的遗传趋势和表型趋势。结果发现，乳头数对校正21日龄窝重的影响在P<0.05水平显著，对校正21日龄均重的影响在P<0.001水平显著；大白猪乳头数的遗传力为0.156±0.023，属于中等遗传力性状，各繁殖性状的遗传力范围为0.010～0.092，属于低遗传力性状；各繁殖性状遗传相关的范围为-0.306～0.978，表型相关的范围为-0.055～0.970；各繁殖性状的遗传趋势和表型趋势均为先下降后上升，表明该群体的繁殖性状早期选育成效不佳，但在选育后期有所提升。乳头数和校正21日龄均重的遗传趋势和表型趋势波动比较大，表明这2个性状在该群体中并未被选育，在后期选育时，该群体应注重乳头数的选育，以提高大白母猪的繁殖性能。