云南金花茶转录组序列分析及功能注释

【目的】深入研究云南金花茶优良性状、基因功能和基因分布特征,可为云南金花茶乃至山茶属植物功能基因的探索以及该物种的遗传保护提供基础生物信息学理论参考。【方法】采用Illumina Hi Seq 2000技术,对云南金花茶叶片进行转录组测序及相关数据分析,在对测序数据整理、de novo组装后,获得Unigene序列,继而利用相关生物信息学数据库进行序列比对。【结果】组装后,共获得95 979条Unigenes,其中N50(拼接转录本不小于总长50%的长度)为1 660 nt,平均长度为1 124 nt,Q20和Q30序列(处理后质量高于20和30的碱基)分别占96.39%和91.28%。经比对,在Nr、Nt、Swiss-Prot中能得到注释的Unigene分别为58 830、43 623、44 315条。在GO中,有41 905条(43.66%)Unigenes注释224 129个GO功能,将其分为3个大类和56亚类,所占比例最多的为生物过程这一类功能。在KOG中,有23 499条(24.48%)Unigenes注释26 430个KOG功能信息,将其分为26个基因功能大类,其中表达量较高的分别是一般功能基因和翻译后修饰、蛋白质转化、伴侣功能的相关基因。另外,共有23 214条(24.18%)Unigenes在KEGG中得到注释,根据其涉及的相关通路可将其归为19个亚类,其中以代谢通路较为丰富。此外,利用相关数据库和ESTScan软件对云南金花茶转录组Unigene进行CDS比对和预测,共预测到26 428条CDS,其长度集中在100～500 nt,占总CDS的82.10%。【结论】云南金花茶所含基因信息丰富,利用分析得到的所有注释信息可以更深层次地探索其基因组信息和基因分布情况。     

推进科研单位数据治理体系构建的思考和建议

全球范围内,运用大数据推动经济发展、完善社会治理、提升政府服务和监管能力正在成为趋势.作为我国科技创新重要主体之一,当前科研单位的成果产出数量逐年增多,科研数据的搜集、整理和运用能力凸显不足,严重影响科研管理效率和科技服务水平.在信息化时代,借助信息化手段实现科研数据的高效管理和有效利用,建立科研数据治理体系,是我国科研管理人员面临的一项重要任务.文章提出了构建以体制机制建设、标准化数据库建设、数据采集与录入、数据分析与挖掘、科研服务能力提升为主要任务的科研数据治理体系,并以北京农业信息技术研究中心为例,对其近几年进行的相关实践探索进行阐述,以期为实施数据治理推进科研单位科技创新发展提供参考.     

一根楠木老料可换一辆车广西濒危古木遭盗伐调查

广西鹿寨拉沟自然保护区内一棵有数百年树龄、树蔸直径近2米的楠木近日遭盗伐。被盗伐的楠木是拉沟自然保护区内树龄最长，也最为粗壮的一棵楠木，在保护区内被誉为“楠木王”。 一个不到半平方米的金丝楠木茶盘，市场价就达数万元；一根楠木老料，就可能换得一辆轿车…”近年来，随着一些收藏者对古树名木工艺品近乎痴迷的热捧，这些制品价格飙升，也推动了盗采盗伐现象猖獗。     

固态发酵魔芋飞粉生产酵母蛋白饲料的研究

对魔芋飞粉固态发酵生产酵母蛋白饲料进行研究。单因素试验和正交试验优化的固态发酵培养条件:豆粕添加量为20%,葡萄糖淀粉酶添加量为0.3%,培养基含水量为50%,装料量为30g,接种量为1.5%,发酵温度为25℃,发酵时间为60h。优化后的发酵产品中酵母数可达到61.43亿/g,粗蛋白质含量可达34.02%,天门冬氨酸和苏氨酸等16种氨基酸含量均明显增加。在此基础上进行浅盘扩大培养,发酵产品中酵母数可达到60.10亿/g,粗蛋白质含量可达33.77%。     

黄龙县举办国家蜂产业技术体系中蜂饲养管理培训会

<正>5月27日,由国家蜂产业技术体系延安综合试验站牵头,黄龙县养蜂试验站举办了中蜂饲养管理培训会,来自全县7个乡镇3个社区和延安市黄龙山林业局、桥山林业局的168名中蜂养殖人员参加了这次培训。国家蜂产业技术体系岗位科学家、中国农业科学院蜜蜂研究所、博士生导师李建科教授进行了实地考察指导和技术培训。     

南疆部分地区全舍饲养殖模式下驴消化道寄生虫流行病学调查

为了研究南疆地区规模化全舍饲养殖模式下驴消化道寄生虫的感染情况,并评价目前规模化全舍饲驴养殖场所采用驱虫方案的效果,本试验采集阿克陶县和泽普县4个规模化全舍饲养驴场917头驴(n=917)的粪样共1 834份,运用虫卵形态观察法检测消化道寄生虫,对优势虫种进行统计学分析,运用PCR方法鉴定体内排出的主要成虫;同时,根据养殖场现行驱虫方案在春季和秋季分别对驴群进行2次伊维菌素驱虫试验,连续观察5 d,记录排虫情况并计算消化道寄生虫感染率。结果显示：镜检观察到6种消化道寄生虫;经PCR鉴定体内主要排出马副蛔虫。4个规模化养殖场中,马圆线虫、毛细线虫、马副蛔虫和细颈线虫为驴消化道优势虫种,其冬春(夏秋)平均感染率分别为67.5%(79.6%)、52.9%(71.3%)、40.9%(45.3%)和14.5%(15.7%),表现出明显的季节特征,夏秋季节毛细线虫、马圆线虫、马副蛔虫感染率和感染强度显著高于冬春季节(P<0.01);寄生虫感染率与驴年龄存在相关性,夏秋季节驴驹马圆线虫、马副蛔虫感染率均极显著高于成年驴(P<0.001),冬春季节驴驹马圆线虫、毛细线虫和马副蛔虫感染率均显...     

园林用茶树容器苗快速繁育技术

<正>短穗扦插育苗是当前茶树品种繁育的普遍方式,能很好地保持品种原有的优良特征、特性。但该技术仍存在育苗周期较长、繁殖系数较低、受自然条件制约等缺点,特别在江浙一带,茶树短穗扦插繁殖一般均需12个月以上才能出圃。同时,茶树短穗扦插繁殖需要挖取地表15cm以下发育程度较好、无塥土的心土作为苗床用土,易造成水土流失和破坏生态环境。容器育苗技术是近年来快速发展的农业新技术,容器苗具有成活率高、缓苗期短、栽植不受季节     

仔猪雷极氏普罗菲登斯菌的分离鉴定及系统进化分析

为了解猪雷极氏普罗菲登斯菌(P.rettgeri)的生物学特性、致病性及16SrRNA基因系统进化关系,从发生严重腹泻、血便的哺乳仔猪群的内脏器官中分离到1株病原菌,根据形态特征、培养特性、生化特性、16SrRNA基因序列分析鉴定为P.rettgeri。小鼠攻毒试验证实,该分离菌株对试验小鼠有较强致病力,哺乳仔猪回归试验可复制出与临床上相似的典型症状,并从发病死亡小鼠及哺乳仔猪中分离到攻毒菌株。系统进化分析表明,分离菌株与雷极氏普罗菲登斯菌系统进化关系最为密切,其16SrRNA基因序列与雷极氏普罗菲登斯菌代表菌株的同源性在97.3%~99.6%之间。药敏试验结果表明,分离菌株对头孢哌酮钠、头孢噻肟钠、头孢曲松钠、头孢唑啉、头孢呋肟、头孢吡肟、阿莫西林、链霉素、氨曲南、诺氟沙星、左氟沙星、恩诺沙星、卡那霉素、氨苄青霉素、米诺环素、链霉素、阿米卡星等多数药物敏感。首次报道了雷极氏普罗菲登斯菌可以引起哺乳仔猪严重腹泻,提示在仔猪腹泻中应注意该菌感染的诊断、监测和防控。     

浅谈如何拓宽缉毒犬的使用范围

缉毒犬使用工作作为打击毒品犯罪的一种有效手段,发挥着其不可替代的作用。但是随着情报信息技术以及便携式X光机、Υ射线仪等高新技术仪器的广泛应用,使得我国缉毒犬使用工作普遍存在使用范围较窄、使用用途单一、使用效率、效益均不高的情况,这严重制约了我国缉毒犬使用工作的发展。只有充分挖掘出缉毒犬高效、快捷、灵活、凶猛的特性,全方位、多领域的使用缉毒犬,才能更好的打击毒品犯罪,彰显缉毒犬本色。一、密切结合毒品犯罪发展新变化,积极拓宽我国缉毒犬使用范围     

毛白杨优良无性系生长型和遗传力动态与选择的研究

研究毛白杨无性系生长型与遗传力动态模型,提出试验选择时机以7、8年起为宜。估算三个地点的选择指数(I_i)分别为4.50,3.50和2.50,被选择的39、38、90、9803、001优良无性系平均材积育种增益在30%以上。预测的10—15年的育种增益高于现实评价。