不同鳞翅目昆虫细胞色素P450基因(CYPs)的比较基因组学分析

细胞色素P450(cytochrome P450,CYP)涉及许多昆虫生理功能,包括对信号分子的代谢、宿主植物的适应性及杀虫剂的抗性等.鳞翅目(Lepidoptera)昆虫的种类仅次于鞘翅目(Coleoptera),包含了大量的农业害虫.根据鳞翅目烟草天蛾(Manduca sexta L.)的基因组数据,开展CYPs的全基因组学分析,在该基因组中发现了110个可能的CYPs,可分为29个家族,其中有大量CYPs以串联重复形式排列.将分析所得序列与蝶类昆虫黑脉金斑蝶(Danaus plexippus L.)和模式昆虫家蚕(Bombyx mori L.)的CYPs进行比较基因组学分析,结果表明,在CYP2与线粒体集团(clan)中存在12对CYPs直向同源基因,而CYP3与CYP4集团的CYPs呈现种属特异性扩增趋势.通过比较分析鳞翅目昆虫与其他非鳞翅目昆虫的CYPs发现,鳞翅目昆虫之间不仅存在更多的直向同源基因对,而且鉴别出的直向同源基因群也更多,但出现新的家族与亚家族数量相对较少.不同鳞翅目昆虫基因组中的CYPs存在相当广泛的线性保守现象.这些不同昆虫间的比较基因组学分析将促进鳞翅目昆虫CYPs的研究,也有助于害虫治理新靶标的选择.     

胡桃楸、白桦纯林及其混交林土壤微生物特性研究

[目的]研究胡桃楸、白桦纯林及其混交林土壤微生物特性.[方法]以3种人工林土壤微生物为研究对象,采用稀释平板法、BIOLOG微平板法及土壤理化性质常规测定方法对3种林型内土壤微生物特性进行了研究.[结果]土壤微生物数量以胡桃楸林最多,且显著高于其他2种林型;微生物多样性指数则以混交林显著较高;微生物数量与多样性指数彼此间呈现出极显著的正相关性,并与土壤有机质、水解氮、速效钾也呈显著的正相关,而与其他土壤理化性质的相关性却并不明显.[结论]营建混交林不仅具有相对较高的物种多样性,而且较为稳定,因此混交林营造具有一定的现实意义和发展前景.     

黄土高原农牧交错区传统药用植物的民族植物学研究——以甘肃环县为例

目前黄土高原农牧交错区及其周边区域的民族植物学主要集中在食用植物方面,药用植物方面尚且缺乏系统研究。在此以黄土高原农牧交错区的环县为例,采用民族植物学的研究方法,通过对环县民族传统药用植物进行编目,查阅相关文献、访问当地群众,了解其当下的植物生长状况和多样性及当地人民对植物的保护与利用现状,提出保护与利用措施,为该地区的药用植物尤其传统药用植物的可持续发展提供理论依据。     

Diversity of Paenibacillus durus strains isolated from soil and different plant rhizospheres evaluated by ARDRA and gyrB-RFLP analysis

Strains belonging to Paenibacillus durus isolated from the rhizosphere of various grasses and from bulk soil were previously divided into five phenotypic groups (A1–A5) based on the fermentation pattern of six carbohydrates (A1: sorbitol (+), A2: dulcitol and tagatose (+), A3: starch and glycogen (+), A4: starch, glycogen and d-arabitol (+) and A5: negative for these carbohydrates). This study aimed to assess whether plant types select for specific P. durus phenotypic groups. For that purpose, polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism analysis of part of genes encoding 16S rRNA (ARDRA) and DNA gyrase subunit B (gyrB-RFLP) were used to produce genetic fingerprints. ARDRA and gyrB-RFLP data were clustered together to generate a dendrogram and two main clusters were observed. Cluster I showed a predominance of strains isolated from wheat, maize and sugarcane rhizospheres. Strains isolated from maize were distributed among the five patterns of carbohydrate metabolism, while strains isolated from sugarcane showed to be predominantly able to metabolize starch and glycogen. Neither sorbitol- nor arabitol-metabolizing strains were found in cluster II, which consisted of strains isolated from soil and from all plant species used. Our results suggest that the plants influenced the diversity of P. durus in their rhizospheres.     

放牧干扰对草甸草原羊草植株及根际土壤植物寄生线虫多样性的影响

对人畜干扰下的草甸草原羊草根、茎、叶及根际土壤中植物寄生线虫进行了研究,结果表明,草甸草原羊草根、茎、叶及根际土壤中植物寄生线虫种类(属)有:类短体属(Pratylenchoicles)、叉针属(Bolendorus)、野外垫刃属(Aglenchus)、螺旋属(Helicotylenchus)、矮化属(Tylenchorhynchus)、头垫刃属(Aphelen)、盘旋属(Bursapbrelenchus)、粒属(Anguina),居民点周围羊草根、茎、叶及根际土壤中的线虫种类(属)及数量高于围栏内羊草;居民点周围羊草根、茎、叶及根际土壤中的稀有种的多样性指数(H’)、均匀度指数(J)、丰富度指数(SR)显著低于围栏内,而植物寄生线虫成熟度指数(PPI)显著高于围栏内;植物寄生线虫稀有种多样性指数(H’)、均匀度指数(J)、丰富度指数(SR)、植物寄生线虫成熟度指数(PPI)可作为指示受干扰的植物及草地的线虫生态特征指标.     

研究土壤微生物多样性的PCR条件优化(英文)

[目的]对PCR-DGGE法的试验条件进行优化,以更好地分析土壤微生物遗传多样性。[方法]改良高盐法提取土壤DNA,改进引物设计,改变PCR反应过程中退火温度、扩增体系,比较PCR扩增结果。[结果]经过改良的高盐法提取的土壤微生物DNA效果更好。PCR扩增选择20μl体系条带单一,易于操作。退火温度选择在55℃时无非特异性扩增,35个循环次数易于后续DGGE分析。[结论]已经优化的PCR基因扩增体系特异性高且稳定可靠。     

新疆饲料乳酸菌的多样性与系统进化分析

[目的]对新疆吐鲁番地区常用饲料样品(玉米、苜蓿、小麦)的乳酸菌资源进行初步调查及多样性分析。[方法]利用平板分离法分离3种饲料原料中的乳酸菌,再以MRS+CaCO3固体培养基进行筛选。对所分离得到的80株乳酸菌进行形态学观察、生理生化检测生理生化和16S rDNA基因序列鉴定可知8,0株乳酸菌分属于2个属,即乳杆菌属、肠球菌属;7个种,即干酪乳杆菌(lactobacillus casei)、鼠李糖乳杆菌(lactobacillus rhamnosus)、副干酪乳杆菌(lactobacillus paracasei)、肠道球菌(Entercoccus faecium)、耐久肠球菌(Entercoccus durans)、植物乳杆菌(lactobacillus plantarum)、海氏肠球菌(Entercoccus hirae)。3种饲料原料中干酪乳杆菌和肠道球菌普遍存在。除了这2种乳酸菌外,小麦中还有鼠李糖乳杆菌、副干酪乳杆菌、植物乳杆菌。苜蓿内有植物乳杆菌、副干酪乳杆菌、海氏肠球菌、耐久肠球菌。玉米内有植物乳杆菌、耐久肠球菌。[结论]新疆吐鲁番地区不同饲料中乳酸菌存在较大的多样性,干酪乳杆菌、肠道球菌等乳酸菌为饲料发酵的关键菌群,该试验结果为饲料乳酸菌资源开发及饲料乳酸菌应用提供了一定的理论基础。     

海拉尔东大泡迁徙鸟类资源初步调查

2009年5～10月对海拉尔东大泡迁徙鸟类资源进行了调察,记录鸟类种类和数量,分析鸟类组成及生境。共记录到鸟类7目11科21种。东大泡鸟类无论物种数、个体数量还是多样性指数、均匀度指数都很高。影响这一区域鸟类分布和多样性的最主要因素为水资源分布。     

贵阳花溪河流域藻类植物调查及多样性评价

[目的]研究贵阳市花溪河流域水环境的现状以及藻类植物多样性组成。[方法]以3次常规监测数据为基础,应用多样性指数H、丰富度指数d和均匀度指数J,于2010年9月～2011年3月间对花溪河流域5个监测段面的藻类多样性和花溪河流域的水质现状进行了跟踪观测。[结果]共鉴定出浮游藻类282种,附着藻类286种,均以硅藻种类最多,其次是蓝藻和绿藻,甲藻和隐藻种类最少。各监测段面的H、d和J平均值分别为3.71～4.13、6.37～11.03、0.85～0.90,水体无污染;藻类植物平均细胞密度最大值出现在2011年3月花溪大坝段面的土壤上,达到了14.974×106cells/L;流域TN、TP含量超标,COD变化明显,pH值变化不明显,水体偏碱性。[结论]花溪河流域的生物多样性较好,群落结构较复杂,水质属于清洁型。     

宁夏AM真菌的多样性及与环境因子的关系

综述宁夏多种生态环境中AM真菌种群落多样性。通过对多种土壤因子、土壤类型、植被类型与AM真菌多样性、孢子密度以及菌根侵染率的关系比较,探讨环境因子对AM真菌多样性的影响。研究表明,宁夏不同土壤类型区域中AM真菌种类及分布在一定程度上是与植被类型、植物多样性和土壤肥力特征相对应的。