贵州白山羊遗传结构的RAPD分析

用27条多态性引物对15份贵州白山羊个体基因组进行RAPD分析。结果共扩增出268条带，其中多态带为112条，多态频率在0～72．73％之间，平均多态频率为41．79％。单个引物获得的扩增带数在4～16条之间，平均每条引物扩增出9．92条带，扩增带分子量范围在230～2800bp。Nei氏公式计算品种内个体阃遗传相似指数平均为0．9156。结果表明：贵州白山羊个体间遗传变异较小，具有较高的遗传稳定性。     

贵州黑山羊遗传结构的RAPD分析

用27条多态性引物对15份贵州黑山羊个体基因组进行RAPD分析结果共扩增出258条带,其中多态带为119条,多态频率在0-77．78％之间,平均多态频率为46．12％．单个引物获得的扩增带数在4-14条之间,平均每条引物扩增出9．56条带、扩增带分子量范围为230bp-2800bp、用Nei氏公式计算品种内个体间的遗传相似性指数平均为0．9023结果表明：贵州黑山羊个体间的遗传变异较大,具有较丰富的遗传结构。     

应用RAMP标记分析长白山地区中国林蛙的遗传多样性

应用随机扩增徽卫星多态性DNA（RAMP）标记技术对长白山地区中国林蛙60个个体间遗传多样性进行了分析。以便为中国林蛙种质资源的保护和利用以及物种分化研究提供基础资料。结果表明：120个RAMP引物中。有14个引物组合可扩增出清晰且具多态性的条带。这14个引物组合共扩增出107条带,其中105条具有多态性,多态条带比率为98．13％。每个引物可扩增出3～10条多态性条带,平均7．5条。多态条带比率、Shannon多样性指数（I）以及Nei氏基因多样度（h）均显示长白山地区中国林蛙具有较为丰富的遗传多样性。RAMP标记遗传相似性系数（岱）变异范围为0．4860～0．8505,平均值为0．6634,以GS平均值0．6634为闻值,可将所有供试材料划分为10类,其中大部分个体归为同一类,群体内并没有形成较明显的遗传分化。     

麦洼牦牛的RAPD分析

用60个10碱基的随机引物对麦洼牦牛的基因组DNA进行了PCR扩增。有7个引物扩增出了清晰且具多态性的条带，条带总数为34，其中有25条为可变条带，表现出多态性，多态频率为74％。根据Shannon公式计算出的7个引物扩增带频率的群体遗传多样性指数分别为：1．7955（OPA10）、0．6726（OPA13）、0．5433（OPB07）、0．0739（OPB10）、0．9919（OPA04）、1．4015（OPC06）、1．4514（OPK12），平均为：0．99，其平均百分比差异均值（MAPD）为40．41％。     

36份新疆野生黄花苜蓿SSR 水平的差异性研究

以36份新疆野生黄花苜蓿为材料,采用SSR分子标记对其遗传多样性进行分析,以期为新疆黄花苜蓿资源评价和核心种质库构建提供基础数据。结果表明,9对SSR分子标记引物PCR共扩增出93条条带,每对引物扩增出的条带数变异范围为3~19条,平均10.33条/对,多态条带总数为86个,多态条带百分比为92.47%,平均多态性条带数为9.55,平均多态性比例为91.55%,表明居群间存在丰富的遗传多样性。POPGENE分析表明,在遗传相似系数0.611处可将36份野生黄花苜蓿材料划分为2个混合群体和4个特定类群,表明材料具有显著异质性。     

四川几个山羊品种(群体)与岩羊RAPD分析

以两组40个随机引物，筛选出16个重复性好的多态引物。对四川5个山羊品种、藏山羊两个生态类型、3个杂交群体和岩羊共计113只个体，进行随机扩增多态DNA(RAPD)分析。结果表明：16个引物扩增出67条带，其中54条带呈现多态。多态率为80．60％。山羊各群体共有条带为23条，山羊和岩羊共有条带为13条。岩羊有4条特异带。不同引物所扩增出的片段在各群体中分布频率不同。山羊群体间相似系数为0．8216—0．9362，其中，安哥拉山羊与建昌黑山羊杂交后代F2和F3之间相似系数最大。为0．9362。山羊各群体与岩羊相似系数为0．4996—0．5064。山羊群体间的遗传距离为0．0638—0．1784。山羊各群体与岩羊的遗传距离为0．4936—0．5403。高原型藏山羊与山谷型藏山羊间的遗传距离小(0．1005)、相似系数大(0．8995)。序列为TTCCGAACCC引物扩增出的片段为750bp，仅在高原型藏山羊中出现，可作为区分这两个生态类型的遗传标记。     

新浦东鸡DNA指纹的随机扩增多态分析

利用随机扩增多态DNA指纹分析技术,由12个随机引物中筛选出3个具有多型的引物对28只新浦东鸡的基因组DNA指纹进行研究.结果表明3个引物共扩增出27条DNA片段,多型条带24条,其多型频率为0.593;其中H05引物扩增出DNA片段7条,其多型频率为0.259,G04引物扩增出DNA片段11条,其多型频率为0.408;V15引物扩增出DNA片段9条,其多型频率为0.333,3个引物扩增的DNA片段长度为489～1940bp.各位点的片段共享度分别是0.856,0.716和0.674;杂合度为0.549,0.695和0.727;平均百分差异为0.144,0.284和0.326;平均百分差异均值为0.251.     

宁夏滩羊体大品系遗传标记的研究

研究首先采用RAPD技术,利用混合基因池(DNA pool)法,对滩羊体大品系、普通品系进行DNA多态性分析。从100种具有10个碱基的随机引物中,筛选出84种引物在滩羊群体基因组中共扩增出358条带,其中22种引物扩增产物表现为多态(占22%),且扩增出32条有差异的条带,占总带数的8．94%(32/358);62种引物的扩增产物表现为单态(占62%)。滩羊体大品系的特异性条带5个,而普通品系的特异性条带7个。这些特异标记可以用来鉴定滩羊的2个品系。滩羊体大品系和普通品系间的遗传距离为0．136±0．087,表明2个品系之间的亲缘关系很近。     

利用ISSR标记分析几个家蚕品系的遗传多样性

利用ISSR技术对6个家蚕品种和2个不同地域的野桑蚕群体进行了遗传多样性分析。通过6条ISSR引物扩增，共检测到66个位点。平均每条引物扩增的条带数为11条，其中65条具有多态性，多态位点百分率为98.48％。基于Ne＆Li遗传算法计算出各品种间的遗传距离，家蚕品种问的遗传距离为0．4286—0．6491。根据遗传距离，用UPGMA方法进行了聚类分析。     

四川9个山羊品种(群体)与岩羊RAPD分析

以两组40个随机引物,筛选出16个重复性好的多态引物,对四川9个山羊品种(群体)和岩羊共计113只个体,进行随机扩增多态DNA(RAPD)分析.结果表明16个引物扩增出67条带,其中54条带呈现多态,多态率为80.60%.山羊各群体共有条带为23条,山羊和岩羊共有条带为13条,岩羊有4条特异带.不同引物所扩增出的片段在各群体中分布频率不同.山羊群体间相似系数为0.821 6～0.936 2,其中安哥拉山羊与建昌黑山羊杂交后代F2和F3之间相似系数最大,为0.936 2.山羊各群体与岩羊相似系数为0.499 6～0.506 4.山羊群体间的遗传距离为0.063 8～0.178 4.山羊各群体与岩羊的遗传距离为0.493 6～0.540 3.高原型藏山羊与山谷型藏山羊间的遗传距离小(0.1005)、相似系数大(0.899 5),序列为TTCCGAACCC引物扩增出的片段为750bp,仅在高原型藏山羊中出现,可作为区分这两个生态类型的遗传标记.     

AFLP fingerprinting for paternity testing in ducks

1. The accuracy and reproducibility of AFLP fingerprinting was investigated in the duck (Anas Platyrhynchos), using a multicolour fluorescent labeling technique. The fluorescent labelling fragments were separated on a capillary electrophoresis-base ABI PRISM 3100 Genetic Analyzer. 2. A total of 337 AFLP peaks with 103 of them being polymorphic markers were generated by 16 sets consisting of EcoRI/TaqI primer pair combinations. The number and size range of AFLP polymorphisms detected per primer pair varied from 3 to 11 and 58 to 290 bp, respectively. About 30.6% (103/337) of AFLP peaks were detected polymorphisms, with an average of 6.4 polymorphic markers per primer pair. 3. The clear polymorphic peaks were amplified with EcoR+AC/Taq+AC primer combinations. The AFLP peaks showed high reproducibility. From the family testing, we found that the fingerprints of all the offspring were derived from one or other parent. Therefore, we conclude that AFLP fingerprinting might be a suitable method for duck paternity testing.     

哈萨克羊、阿勒泰羊、巴什拜羊遗传多样性的AFLP分析

利用11对AFLP引物组合,检测了哈萨克羊、阿勒泰羊、巴什拜羊池DNA遗传变异,构建了各品种的AFLP DNA 指纹图谱,根据AFLP分析结果,统计了每个引物组合在各品种中检测到的多态性条带,计算了3个品种的遗传相似系数,并据此构建了UPGMA聚类关系图,分析了它们的遗传关系.结果表明:11对AFLP引物组合在3个地方绵羊品种中共检测到310条带,平均每个引物组合产生28.18条带,变化范围在25～34条,其中多态性条带32条,占扩增总带教的10.32%,每对引物平均扩增多态性带2.909条.品种间的遗传相似系数以哈萨克绵羊与阿勒泰绵羊的最高(O.699),哈萨克绵羊与巴什拜绵羊最小(0.592),聚类结果与这些羊的育成史、分化及地理分布一致.     

超细型细毛羊基因组DNA的AFLP检测研究

利用AFLP标记对超细型细毛羊品系纯度进行检测,旨在为评价该品系细毛羊的遗传特性,采用TaqⅠ和EcoRⅠ双酶切,利用6对引物对24只细毛羊基因组DNA进行分析,共获得226个AFLP标记,1对引物获得的标记数在29~50之间,新吉超细型细毛羊相似系数AFLP研究结果为0.914~0.982,本研究为评价新吉超细型细毛羊遗传稳定系数提供了相关的参数。     

Mapping of expressed sequence tag markers with a cDNA-amplified fragment length polymorphism method in Japanese quail (Coturnix japonica)

In our previous study, a Kobe‐NIBS Japanese quail (KNQ) linkage map was constructed mainly using amplified fragment length polymorphism (AFLP) markers. In order to compare chicken and quail chromosomes, we developed expressed sequence tag (EST) markers derived from cDNA‐AFLP fragments and localized these markers on the linkage map. Using a total of 128 AFLP primer combinations, 24 polymorphic bands were obtained between a neurofilament‐deficient mutant quail line male and a muscular disorder quail line female, which were the parents of the KNQ resource family. Nine of the 24 markers were mapped by linkage analysis. These markers were mapped to seven linkage groups, namely 1, 2, 3, 6, 8, 15 and 42. A subsequent homology search using chicken genome sequences strongly suggests that these linkage groups correspond with chicken chromosomes 1, 2, 3, 5, 15, 23 and 26.     

地方鸡种与隐性白羽鸡遗传变异的AFLP指纹

利用6对AFLP引物组合对我国12个地方鸡种和引进鸡种隐性白羽鸡进行了遗传检测,统计了每个引物组合在各个品种中检测到的多态性条带和特异性条带,计算了13个鸡种的遗传相似系数和遗传距离,并据此构建了UPGMA聚类关系图,分析了所研究鸡种的遗传关系.结果表明:6对AFLP引物组合在13个鸡种中共检测到290条多态性条带,平均每个引物组合产生48.3奈多态性标记,同时在每个品种群体中还检测到了数量不等的特异性条带,其中寿光鸡和东乡黑鸡最多,为9条,旧院黑鸡、兴义矮脚鸡和隐性白羽鸡最少,为1条.13个鸡种聚为4类,其中隐性白羽鸡单独聚为一类,鸡种间的遗传相似系数及聚类结果与各个鸡种的地理分布、现实状况相吻合,从而表明AFLP指纹用于我国地方鸡种的遗传多态性分析、品种鉴定及品种间亲缘关系分析是可行的.     

鹿苑鸡微卫星和AFLP指纹分析

利用20个微卫星标记和6对AFLP引物组合对地方鸡种鹿苑鸡进行了遗传检测,结果表明鹿苑鸡在20个微卫星位点上共检测到118个等位基因,基因频率分布在0.0125～0.5500之间,平均每个座位检测到5.9个等位基因.20个微卫星座位的平均杂合度为0.7366,平均多态信息含量为0.6953;6对AFLP引物组合在该鸡种中共检测到245条多态性条带,平均每个引物组合产生40.8条多态性条带;鹿苑鸡群体变异大,具有丰富的遗传多样性.     

大足黑山羊地方类群多胎性AFLP标记研究

利用分子标记技术AFLP标记,从15对引物中选取扩增效果较好的11对引物,对11只极端多胎个体和6只极端非多胎个体DNA进行扩增,共扩增出766个条带,平均多态率5.36%,其中引物E42/T48中1条294bp的条带在极端非多胎个体中均出现,而在极端多胎个体中只在1个个体中扩增出来,表现出极显著的差异。对差异片段回收、克隆、测序,设计4对引物,对基因组扩增后发现,产生差异片段的原因是片段内部有较长序列的插入或丢失,产生310bp和265bp2个等位基因,其中310bp纯合等位基因的初产羔羊数显著高于310bp和265bp杂合等位基因的初产羔羊数,在大足黑山羊地方类群内可能作为多胎性状分子标记。     

应用分子标记AFLP建立不同猪种间遗传关系

作者首先在实验室建立了猪的AFLP分析体系。经过筛选,利用16对引物组合构建了中国6个常见猪品种中共计20个样本的AFLP分析图谱,通过统计分析,得到了6个猪品种的遗传距离,并由此构建了聚类分析图。在此基础上,得到了一些品种特异性的片段,这些片段为进一步寻找这些品种特异性的分子标记提供了可能。     

基于AFLP的燕麦遗传多样性研究

采用ＡＦＬＰ分子标记技术对来自中国、加拿大、澳大利亚和欧洲等国家的３４个有代表性的饲用燕麦品种及８个裸燕麦品种进行遗传多样性分析,从３０ 对ＥｃｏＲＩ／ＭｓｅＩ引物组合中筛选出５ 对多态性和清晰度较高的引物组合,共获得２６８条带,其中多态带１８５条,平均多态性检出率为６９．０％,Ｅ ＡＧＧ／Ｍ ＣＴＡ 的扩增效率最高达７８．６％。由Ｎｅｉ’ｓ指数（ｈ）估测,供试品种平均变异为０．１６６４,平均Ｓｈａｎｎｏｎ’ｓ信息指数估计值为０．２２０６;４２个燕麦品种间遗传相似系数为０．４８８１～０．９８８０,遗传距离的变化范围是０．０１２０～０．７１７２。通过ＡＦＬＰ 数据构建燕麦的ＵＰＧＭＡ 系统树,在遗传相似系数０．７４８水平,所有供试品种可聚为６类。皮燕麦与裸燕麦在遗传相似度０．５９处被明显分为２类,与形态学分类结果一致。由ＡＦＬＰ揭示的品种间遗传关系与品种实际来源基本一致,品种的遗传距离与其地理分布关系密切。     

野生狗牙根种质资源的AFLP遗传多样性分析

利用AFLP标记对采自非洲以及中国四川、重庆、云南、贵州和西藏五省区的共44份野生狗牙根材料进行遗传多样性分析。10对引物共扩增出462个条带,其中多态性条带有452条,多态性条带比率为97.64%,材料间的遗传相似系数(GS)范围为0.64~0.95,平均GS值为0.76。根据研究结果进行聚类分析和主成分分析,可将供试材料分成五大类,分类结果与材料的地理分布大致相符,呈一定的地域性分布规律。由此可见,丰富的地理生态条件造就了狗牙根资源丰富的遗传多样性和明显的地域性分布规律。