RAPD技术及其在畜禽育种中的应用研究进展

RAPD技术是近年来发展起来的一项分子标记技术。该技术以其快速、简便、高效等优点，已被广泛应用于品种(系)分类；群体的遗传多样性及其起源分化研究；亲缘关系鉴定；杂种优势预测；遗传图谱构建；基因定位；标记辅助选择等领域。本文综述了RAPD技术的原理、特点及其在畜禽种中的应用研究，并就RAPD技术的前景进行了展望。     

RAPD技术及其在畜禽育种中的应用研究进展

RAPD技术是近年来发展起来的一项分子标记技术。该技术以其快速、简便、高效等优点,已被广泛应用于品种(系)分类;群体的遗传多样性及其起源分化研究;亲缘关系鉴定;杂种优势预测;遗传图谱构建;基因定位;标记辅助选择等领域。本文综述了RAPD技术的原理、特点及其在畜禽育种中的应用研究,并就RAPD技术的前景进行了展望。     

家蚕基因组中的分子标记遗传图谱

遗传标记既是基因组研究的重要内容，又是构建遗传图谱、研究生物多样性、育种、基因定位与克隆等的基因。目前，已有多项分子标记技术用于家蚕基因组的研究，并构建了多种分子标记遗传图谱，包括限制性酶切片段长度多态性（简称RFLP）、DNA随机扩增多态性（简称RAPD）、扩增片段长度多态性（简称AFLP）、简单重复序列PCR（简称SSR－PCR）等。本文就分子标记技术构建的家蚕基因组分子标记遗传图谱进行了讨论。     

四倍体紫花苜蓿遗传图谱的初步构建

分别以早熟低产和晚熟高产苜蓿单株为父母本,通过人工杂交构建了四倍体紫花苜蓿(Medicago Sativa)F1遗传作图群体,采用单因子变量分析法,以降落式PCR和常规PCR结合的反应程序,建立了适宜于紫花苜蓿的分子标记扩增体系;应用130对SSR引物进行筛选,获得60对引物在父母本间存在多态性而被用于绘制遗传连锁图。采用PAGE电泳分析,对作图群体进行基因型分析。通过TetraploidMap软件对60个SSR标记进行连锁作图分析,有44个标记可以定位在8个连锁群上,占总标记数的33.8%,覆盖遗传距离979 cM,两标记间平均图距为22.25 cM,初步构建了四倍体紫花苜蓿遗传图谱的框架图,还需要进一步添加标记数量增大其饱和度,为重要性状的QTL定位奠定基础。     

SSR和SNP在畜禽育种中的应用进展

本文简要综述了国内外近两年微卫星标记(SSR)和单核苷酸多态标记(SNP)在动物育种研究包括遗传多样性、品种鉴定及血缘分析、遗传图谱构建、标记辅助选择中的应用进展,以期为我国畜禽分子育种的深入发展提供借鉴。其中遗传多样性的研究主要是利用SSR,我国对各种畜禽大部分品种群体遗传结构的研究已经趋于完成,这有利于更好的保护和利用我国固有的品种资源。国际上已经对猪、牛构建了标记密度较大的遗传图谱,在这些标记中,SSR占了绝大多数,其中鸭和马的遗传图谱构建在最近取得了较大进展。目前畜禽的QTL定位使用的标记主要为SSR。对候选基因的研究已经趋向于SNP的关联研究,许多新的候选基因被发现与畜禽的某些经济性状相关。     

畜禽遗传图谱及其在动物育种中的应用

自20世纪90年代欧美等国启动动物基因组计划以来,畜禽遗传图谱的构建取得了长足的进展,并对畜禽的育种改良正在和即将起着深远的影响。本文综述了用于畜禽遗传图谱构建研究的主要DNA分子标记,遗传图谱构建的基本程序,猪、牛、绵羊和鸡等主要畜禽遗传图谱研究的进展,并对遗传图谱在畜禽基因定位和标记辅助选择方面的应用进行了相应的讨论。     

分子遗传标记技术及其在动物育种中的研究进展

遗传标记经历了从传统的标记即形态学标记、细胞学标记、生物化学标记到现代分子标记的发展,分子标记具有很多优势,也促进了动植物育种、人类医学、基因定位以及构建遗传图谱的改革。遗传标记能应用于畜禽的遗传多样性分析、种质资源的鉴定、亲缘关系的研究、遗传图谱的构建、分子标记辅助选择和QTL定位等领域,文章主要综述了分子标记在标记辅助选择的应用。     

扩增片段长度多态性（AFLP）在动物遗传育种中的应用进展

AFLP是一种新的分子遗传标记技术，它结合了RFLP和PCR技术的优点，具有RFLP的稳定性和PCR的高效性，被称为“最有威力的分子遗传标记”或“下一代分子标记”。相对于国外而言，我国在这方面的研究还比较少。本文综述了扩增片段长度多态性(AFLP)这种遗传标记的原理、技术特点、技术发展及其在动物遗传多样性、种质鉴定、遗传图谱构建、基因定位和标记辅助育种等研究中的应用。     

紫花苜蓿QTL与全基因组选择研究进展及其应用

四倍体紫花苜蓿是重要的豆科牧草之一,由于其复杂的遗传背景与二倍体作物相比遗传作图与重要性状数量性状位点(quantitative trait locus,QTL)定位研究相对滞后。然而,二倍体苜蓿的相关研究起步较早,已经建立了高密度遗传图谱和物理图谱,这些研究为四倍体苜蓿遗传作图与QTL定位奠定了基础。随着第三代分子标记与测序技术的快速发展,极大地促进了四倍体苜蓿的高密度遗传图谱构建与QTL定位研究,并借助分子标记辅助育种技术对提高苜蓿选育效率,加速育种进程具有重要意义。本文对苜蓿遗传图谱构建与QTL定位研究及发展趋势进行了总结,并对苜蓿关联作图与全基因组选择的研究进展及应用前景加以概述,旨在为读者就相关研究领域有较全面的了解。     

龙眼SNP高密度遗传图谱的构建及单果重QTL定位

本研究以‘凤梨朵’ב大乌圆’的F1群体（FD）200 株杂交后代作为作图群体，结合父母本，利用RAD-seq技术开发大量SNP标记。采用Joinmap4.1软件构建遗传图谱，使用Mergemap进行整合获得整合图谱。并采用MapQTL软件对单果重进行QTL定位，确定QTL位点的数量、位置。结果表明：使用MergeMap软件对父母本连锁群进行整合，整合图谱共形成15个连锁群，总的遗传距离为2 873.39 cM，平均遗传距离为0.36 cM，包含8 014个SNP位点。在该图谱上监测到65 个与单果重性状相关的QTL位点，分布于lg1，lg3，lg4，lg5，lg8，lg10，lg14 连锁群上。本研究所构建的遗传图谱是目前龙眼上所建立的标记数量最多，密度最高的遗传图谱，为未来龙眼数量性状精细定位、图位克隆以及功能基因挖掘等研究提供了有力的依据。     

扩增片段长度多态性(AFLP)在动物遗传育种中的应用进展

AFLP是一种新的分子遗传标记技术,它结合了RFLP和PCR技术的优点,具有RFLP的稳定性和PCR的高效性,被称为"最有威力的分子遗传标记"或"下一代分子标记".相对于国外而言,我国在这方面的研究还比较少.本文综述了扩增片段长度多态性(AFLP)这种遗传标记的原理、技术特点、技术发展及其在动物遗传多样性、种质鉴定、遗传图谱构建、基因定位和标记辅助育种等研究中的应用.     

SNPs在猪遗传育种中的应用

本文综述了SNPs在猪的标记辅助选择、评估遗传多样性、种质资源鉴定和管理、分子遗传图谱构建和基因定位、群体起源及亲缘关系分析等方面的应用.     

遗传标记多态性的意义及常用评定指标

１遗传标记多态性的概念上期介绍了遗传标记的基本概念，利用遗传标记可构建畜禽基因图谱、进行质量性状和数量性状基因位点的定位、亲属关系鉴定、群体结构的遗传分析和标记辅助选择等。要进行这方面的分析，遗传标记除了必须符合孟德尔遗传规律由亲代传给子代外，还必须...     

RAPD技术在动物遗传育种中的应用

随机扩增多态性DNA (randomamplifiedpolymorphic,DNA)是由Williams等 (1990 )提出的一种DNA多态检测技术 ,它以PCR为基础 ,用一系列不同的碱基随机排列的寡聚核苷酸为引物 (通常为 10bp)对所研究的基因组DNA进行单引物扩增。RAPD是分子水平上的一种标记方法 ,具有简单、快速、无须标记探针和杂交实验等优点 ,因而广泛应用于动物基因定位与构建遗传图谱、MAS、预测杂种优势、性别鉴定等研究领域。1　基因定位与遗传图谱的构建家畜中大多数有经济意义的性状都受多基因控制且表型呈现连续分布的数量性状。微效多基因在基因组的分布…     

RAPD技术及其在动物遗传育种中的应用

20世纪80年代,由于分子生物学的迅猛发展,限制性酶切片段长度多态性分子克隆、DNA重组技术,尤其是PCR技术的兴起和新的电泳技术的不断完善,从而使各种分子标记应运而生,并在此基础上发展了多种DNA检测技术,诸如:扩增片段长度多态性(AFLP)、随机扩增多态性DNA(RAPD)、单链构象多态性(SSCP)、简单重复序列(SSR)、测序的标记位点(STS)、数目可变的串连重复序列(VNTR)等等,所有这些技术将为动植物育种、遗传图谱的构建、分子克隆、基因定位等各个方面带来革命性的变化。而RAPD技术由于其在检测DNA多态性上具有独特的方式和…     

红三叶遗传图谱构建及抗白粉病基因QTL定位

本研究以感(岷山红三叶)、抗(澳大利亚红三叶品种♀Sensation×Renegade♂杂交新品系“甘农PR1”)白粉病红三叶材料为父母本杂交并种植成苗经人工接菌后筛选出抗、感白粉病的F₁群体为作图群体,利用AFLP标记构建红三叶高密度遗传图谱,并利用区间作图法对抗白粉病QTL进行了定位分析,可以为红三叶抗白粉病基因克隆和转基因等分子辅助育种奠定基础。结果表明,149个AFLP标记构建得到的遗传图谱包含7个连锁群(LG1,LG2,LG3,LG4,LG5,LG6和LG7),遗传图谱的总距离为640.5 cM。其中,LG1连锁群的遗传距离(140.6 cM)和标记间平均距离(9.4 cM)均最大;LG4连锁群的遗传距离(55.2 cM)和标记间平均距离(1.8 cM)最小。应用区间作图法对红三叶抗白粉病基因进行QTL分析定位,共检测到5个抗白粉病相关QTL位点(qrp-1,qrp-2,qrp-3,qrp-4和qrp-5),其中qrp-1、qrp-2、qrp-3和qrp-4位于LG4连锁群上,qrp-5位于LG5连锁群上。5个QTL位点对抗白粉病的贡献率为29%~90%,qrp-1对红三叶白粉病抗性的贡献率最大(90%),为主效QTL。     

基于SRAP分子标记构建的菊苣遗传连锁图谱

基于SRAP标记,以遗传关系和表型差异大的菊苣亲本PI 651947和PI 652007杂交获得的84个F₁单株为作图群体,进行连锁图谱的构建。采用Map Manager QTX b20软件进行连锁分析,分别构建了PI 651947和PI 652007的分子连锁框架图,共获得77个SRAP标记,其中父本遗传图谱涉及4个连锁群,包含19个标记,图谱总长为450.9 cM,标记间平均图距为23.7 cM。母本遗传图谱涉及13个连锁群,包含58个标记,图谱总长为1404.8 cM,标记间平均图距为24.2 cM。研究结果可为菊苣重要农艺性状QTL定位奠定基础,为菊苣分子育种研究提供了基础信息。     

RAPD标记技术及其在牧草研究中的应用

介绍了RAPD标记的发展、原理、方法、特点和不足，并且对它在遗传图谱的构建、基因定位、品种和品系的分类及鉴定、作物育种等研究领域中的应用作一简述。     

高丹草遗传图谱构建及农艺性状基因定位研究

本文以高丹草(So rghumSudan grass)(314A×ZKSD)的F_2:3家系作为构图群体, 构建了高丹草AFLP和RAPD遗传图谱。将248个F_2:3家系按随机区组重复3次的田间设计在两个试验点种植, 考察了包括产量在内的10个重要农艺性状。利用复合区间作图法分析10个性状的数量性状基因座位(QTL)以及基因效应值和基因作用方式, 并采用遗传分离分析法进行多世代联合分析, 主要结果如下。     

利用连锁不平衡进行畜禽QTL定位的研究进展

一般家养畜禽群体规模小、选择强度高，连锁不平衡（linkage disequilibrium , LD）现象普遍存在，尤其在杂种或新培育品种群体中更为突出。随着分子遗传学的发展，我们可以直接选择影响性状的基因或包含基因的染色体区域（QTL），可分型的遗传标记和QTL之间是否存在连锁不平衡是畜禽群体中QTL定位和应用的关键。目前，畜禽群体中用基因组范围内SNPs的连锁不平衡精细定位影响畜禽重要经济性状的QTL正受到广泛关注。作者从LD定位QTL的原理、畜禽群体中LD程度、利用LD进行QTL定位的试验设计及统计分析方法、LD在畜禽QTL精细定位中的应用等几个方面进行了综述。并进一步阐述了畜禽群体中利用LD进行标记辅助选择（MAS）的策略，对LD在畜禽QTL定位及标记辅助选择方面的应用进行了新的探讨。