龙眼SNP高密度遗传图谱的构建及单果重QTL定位 |
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引用本文: | 张晨晨,石胜友.龙眼SNP高密度遗传图谱的构建及单果重QTL定位[J].中国果业信息,2022,51(2). |
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作者姓名: | 张晨晨 石胜友 |
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作者单位: | 中国热带农业科学院南亚热带作物研究所,中国热带农业科学院南亚热带作物研究所 |
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基金项目: | 广东省重点领域研发计划项目“现代种业”(2020B020220006);广东省自然科学基金项目(2020A1515011365);国家现代农业产业技术体系建设专项资金项目(CARS-32-02);中国热带农业科学院基本科研业务费项目(1630062020003) |
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摘 要: | 本研究以‘凤梨朵’ב大乌圆’的F1群体(FD)200 株杂交后代作为作图群体,结合父母本,利用RAD-seq技术开发大量SNP标记。采用Joinmap4.1软件构建遗传图谱,使用Mergemap进行整合获得整合图谱。并采用MapQTL软件对单果重进行QTL定位,确定QTL位点的数量、位置。结果表明:使用MergeMap软件对父母本连锁群进行整合,整合图谱共形成15个连锁群,总的遗传距离为2 873.39 cM,平均遗传距离为0.36 cM,包含8 014个SNP位点。在该图谱上监测到65 个与单果重性状相关的QTL位点,分布于lg1,lg3,lg4,lg5,lg8,lg10,lg14 连锁群上。本研究所构建的遗传图谱是目前龙眼上所建立的标记数量最多,密度最高的遗传图谱,为未来龙眼数量性状精细定位、图位克隆以及功能基因挖掘等研究提供了有力的依据。
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关 键 词: | 龙眼 高密度遗传图谱 高通量测序 QTL定位 |
收稿时间: | 2021/3/11 0:00:00 |
修稿时间: | 2021/4/26 0:00:00 |
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