固始鸡不同品系及部分外来鸡种遗传多样性的微卫星分析

利用10个微卫星标记,对固始鸡5个系和4个非固始鸡品系共9个群体的等位基因频率、遗传杂合度、群体间的遗传距离等进行了分析,并根据遗传距离进行了聚类分析。结果表明:星红褐鸡与绿壳蛋鸡被聚为一类,固始鸡慢羽系与快羽系被聚为一类,固始鸡被聚为一大类,罗曼鸡自成一类,艾维茵鸡也自成一类。     

用RAPD标记分析草地早熟禾遗传多样性

采用RAPD分子标记技术对从美国引进的12份草地早熟禾(Poapra tensis L.)品种的遗传多样性进行分析。结果表明,从60个随机引物中筛选的17个有效引物共扩增出104条带,其中多态性带65条,占总带数的62.5%,平均每个引物扩增出多态性带3.82条;利用NTSY S-PC软件计算品种间Jaccard遗传相似系数(GS),变化范围为0.362~0.971;用非加权组法(UPGMA)聚类分析,建立供试品种的分子系统树状图,以相似系数0.7为标准分为5类,其中新哥来德(NuGlade)、解放者(Liberator)、浪潮(Impact)、午夜(Midnight)、自由Ⅱ(Freedom Ⅱ)、超级伊克利(Total eclipse)和纳苏(Nassau)共7个品种聚为一类,兰神(Nublue)和美洲王(America)聚为一类,其余品种各自为一类;该结果对引进草地早熟禾品种资源评价与利用具有一定的参考价值。     

新疆桑种质资源随机扩增DNA多态性(RAPD)研究

选用重复性较好的 10个随机引物对保存于新疆的 16份桑种质材料进行了RAPD分析 ,共获得 139个RAPD标记。UPGMA聚类图和材料间的遗传距离显示 :新疆的药桑独聚为一类 ,与其它材料的遗传距离在 0 75 0以上 ;皮木 1号与其它材料也有较大的遗传距离 ,在 0 5 0 0以上 ;其余的 10份材料聚为一类 ,相互间的遗传距离均在0 5 0 0以下 ;92 0 4和 94 0 8等创新种质与杂交亲本西庆 1号、西庆 2号、洛玉 1号、洛山 1号有较高的相似系数。     

四川地方乌骨鸡种群遗传变异的微卫星DNA分析

利用10个微卫星标记，对四川不同地区5个乌骨鸡种群的等位基因频率、各群体的遗传杂合度、群体间的遗传距离等进行了分析，并根据遗传距离对这几个乌骨鸡种群进行了聚类分析。结果表明，各乌骨鸡群体的遗传多样性较为丰富，并具有较高的选择潜力。各乌骨鸡种群间有一定的遗传距离，UPGMA聚类分析表明，四川山地乌骨鸡黑羽系与川南山地乌骨鸡被聚为一类，草科鸡与旧院黑鸡被聚为一类。     

优质肉鸡S3系体尺和屠宰性状聚类分析

运用近似系数功能聚类法对12周龄优质肉鸡S3系的体尺和屠宰性状进行聚类,以分析性状间的关联性。结果表明:23个指标共聚为6类。其中,腿重率、胸肌率和翅膀率最先聚为一类,然后胸宽与之聚为一类,爪重、翅重、腿肌重、头重、胸肌重、心重、肝重聚为一类,肌胃重与腺胃重聚为一类,髋骨宽、腹脂重和屠宰率聚为一类,胫围、胫长、宰前体重、体斜长、胸深聚为一类,半净膛率和全净膛率聚为一类。     

樱桃属(Cerasus)REMAP标记的建立及贵州种质的亲缘关系分析

为丰富樱桃属分子标记，我们利用樱桃LTR引物和ISSR引物，筛选REMAP引物组合，建立了适合樱桃的REMAP标记的技术体系，并利用该标记对40个贵州地方樱桃种质亲缘关系进行分析。结果显示，适宜樱桃REMAP-PCR体系为： 总体系25 μL，MgCl2 2.0 mmol·L-1、 Taq酶0.75 U 、引物0.4 mmol·L-1 、模板DNA10 ng、dNPT 0.4 mmol·L-1，8%非变性PAGE对PCR扩增产物检测效果最好。利用上述体系筛选出10对REMAP引物组合，扩增出234个位点，平均多态性比率是92.29%。聚类分析显示，以相似性系数0.69为阈值，可以将供试材料分为3类：33种贵州地方栽培品种聚为一类，玛瑙红樱桃与4种野樱桃聚在一类，“红皮”樱桃与“青皮”樱桃聚在一类。     

用RAPD标记分析高羊茅的遗传多样性

采用RAPD分子标记技术对从国外引进的15个高羊茅品种的遗传多样性进行了研究。从60个随机引物中筛选出12个有效引物,它们共扩增出85条DNA带,其中59条为多态性带,占69.41%,平均每个引物扩增出多态性带4.92条;利用NTSYS-PC软件计算出的不同品种间Jaccard遗传相似系数(GS)变化范围较大,为0.373~0.932;根据得到的遗传相似性矩阵进行非加权组法(UPGMA)聚类分析,建立高羊茅品种的分子系统树状图;以相似系数0.68为标准,可将所有品种分为3类,品种翠丽和贝克各自聚为一类,其余13个品种聚成一类。     

20份马蹄金种质资源遗传多样性RAPD和SRAP分析

以1份美国进口马蹄金(Dichondra repens)品种为对照,用RAPD和SRAP两种分子标记方法研究20份野生马蹄金种质资源的遗传多样性。结果发现,20条RAPD引物扩增出多态性条带130条,多态性比率为68.78％;22对SRAP引物扩增出175条多态性条带,多态性比率为72.31％,表明20份野生马蹄金之间具有较丰富的遗传多样性。聚类结果表明,RAPD标记将供试材料聚为两大类群,SRAP标记也将材料划分为两大类。两种标记下,供试材料呈现出较好的地域性分布规律,地理来源相近的材料能大致聚为一类,部分同聚为一类的材料在形态上也具有相似性。两种标记方法相关系数r0.01=0.910,二者存在极显著正相关,表明应用这两种技术对马蹄金遗传多样性与亲缘关系的分析具有较高的一致性和可信度。     

新疆家蚕种质资源RAPD多态性研究

以家蚕卵为材料。选用重复性较好的12种随机引物，对15份新疆家蚕种质资源材料进行了DNA多态性扩增(RAPD)研究，研究结果表明，新疆家蚕种质资源材料的DNA多态性较为丰富，共获得153个RAPD标记，系统聚类分析表明新疆家蚕种质资源材料的亲缘关系较近、在相似系数0．8的水平下聚为一类，遗传距离最大为0．3985，最小为0．1296。     

不同地方乌骨鸡种群遗传多样性的微卫星DNA分析

利用家禽基因组中的10个微卫星标记，对位于不同地区6个乌骨鸡种群的等位基因频率、各群体的遗传杂合度、群体间的遗传距离等进行了分析，并根据遗传距离对这几个乌骨鸡种群进行了聚类分析。结果表明，各乌骨鸡群体的遗传多样性较为丰富，并具有较高的选择潜力。各乌骨鸡种群间有一定的遗传距离，UPGMA聚类分析表明，黑凤乌骨鸡与白凤乌骨鸡最先被聚在一起，四川山地乌骨鸡黑羽系与川南山地乌骨鸡被聚为一类，草科鸡与旧院黑鸡被聚为一类。     

早熟禾属植物种间关系的RAPD分析

利用随机扩增多态性DNA（RAPD）技术对10种早熟禾植物进行了基因组DNA多态性分析，对30个OPRON公司十聚体随机引物进行多态性筛选，28个可产生多态性，18个引物产生的250个DNA片段，用于计算种间的欧氏遗传相似性系数分析，在Statistic统计软件按非加权算术平均数（UPGMA）进行聚类并构建系统发育树状图，结果，10种早熟禾植物种间的亲缘关系，其变幅主要在6．7－8．5之间；其中P.botryoides与P.psilolepis之间的遗传距离最小，为6．7，其次是P.sinattenuata与P.sphondylodes遗传距离较近，为6．8，而P．sikkimensis与P.pratensis,P.sikkimensis与P.psilolepis之间的距离最远，均为10．5，这与形态学分类结果基本一致，说明RAPD分析方法可从分子生物学角度为早熟禾属植物的系统学分类提供更为有利和可靠的证据。     

4个牦牛品种的RAPD遗传多样性研究

研究采用RAPD分子标记技术对麦洼、九龙、大通和天祝白牦牛等4个牦牛品种共124头牦牛进行了遗传多样性分析.结果表明:①每个RAPD引物扩增的DNA片段数在18～33个,且所有品种均表现多态,标记多态频率平均为38.63%,检测片断大小在0.25～5 kb之间;②用Shannon多样性指数公式计算牦牛品种的遗传多样性指数(H0),结果显示九龙、麦洼、大通、天祝白牦牛的遗传多样性指数分别为0.311、0.262、0.252和0.216;③采用Rogers遗传距离公式分析4个牦牛品种间的遗传距离(DR)结果:天祝白牦牛与九龙牦牛遗传距离最大(0.0414),与大通牦牛的距离最小(0.0383);④根据DR值,将4个牦牛品种聚为两大类,九龙牦牛聚为一类,其它3个牦牛品种聚为一类.大通牦牛和天祝白牦牛在较近的水平上首先聚为一类,然后与麦洼牦牛聚为一大类.     

柞蚕部分品种及杂交种的RAPD分析

对柞蚕生产上的部分品种及杂交种进行RAPD分析表明 :供试的柞蚕品种未按体色系统聚类 ,而是按品种的来源聚类 ,胶蓝、烟 6、青黄、方山黄 1号、789聚为一类 ,青 6号、选大 1号、沈黄 1号聚为一类 ;来源相同、体色相同的品种间遗传距离小 ,亲缘关系较近。柞蚕亲本及杂交种F1代的RAPD标记为显性标记 ,通过筛选特定的随机引物 ,应用于柞蚕杂种优势的研究是可行的。     

利用微卫星标记分析五个家兔群体的遗传多样性

利用15个微卫星座位,分析了新西兰白兔、德系安哥拉兔、美系獭兔、齐卡G系肉兔、福建黄兔5个家兔群体的遗传多样性。结果表明：15个微卫星位点的平均等位基因数和平均有效等位基因数分别为7．400±1．639个和5．694±1．470个;5个家兔群体的平均基因杂合度和平均多态信息含量分别为0．7367和0．6994;新西兰白的平均基因杂合度和平均多态信息含量最高,福建黄兔最低。5个家兔群体的平均总近交系数（F_is）为-0．03,群体内平均近交系数（F_is）为-0．151,群体平均分化系数（F_is）为0．105（P〈0．001）。采用UPGMA法进行聚类分析,5个家兔群体聚为三类：新西兰白兔和德系安哥拉兔聚为一类;齐卡兔G系和美系獭兔聚为一类,福建黄兔独自为一类。     

中国高羊茅种质资源遗传多样性的RAPD分析

高羊茅是广泛应用的冷季型草坪草,但有关我国高羊茅种质资源遗传多样性的研究十分匮乏。本研究利用RAPD分子标记技术,对采自我国云南、贵州、青海、湖北等地的26份逸生高羊茅种质资源进行了遗传多样性分析。试验筛选出引物20条,共扩增出179个条带,其中177个为多态性带,平均每个引物扩增出多态性带8.85条,多态性条带比率(PPB)为98.88%。材料间遗传相似系数为0.419~0.966,说明我国逸生高羊茅种质资源具有丰富的遗传多样性。根据聚类分析结果,可将26份中国本土高羊茅材料分为三大类,其中来自云南省的高羊茅基本聚在同一类,来自其余省份的高羊茅种质资源的聚类结果与其地域分布没有明显联系。     

利用RAPD标记鉴定草地早熟禾种质资源的遗传多样性

草地早熟禾是一种重要的冷季型草坪草,广泛种植于温带地区,且拥有众多的商品品种和丰富的野生资源。本研究收集了国内外72份草地早熟禾材料,对它们苗期的株高、叶宽、叶色及分蘖情况进行了考察,结果显示材料间的表型差异显著。此外,又在材料间进行了RAPD扩增产物的多态性鉴定,20条引物共扩增出115条多态性条带,多态性比率达91%。UPGMA聚类显示,材料被聚成两大类:一类为4个国内品种/系(“沪夜”、“沪青”、“沪禾2号”和“杂禾”),另一大类为剩余的所有材料。当遗传相似系数增大后,后一大类分成3组,组Ⅰ以国外引进品种为主,组Ⅱ和组Ⅲ则集中了更多的野生材料。RAPD聚类分析结果与材料背景来源之间存在一定程度的相关,但与苗期表型性状没有相关性。     

浙江省主栽脐橙的品质和RAPD分析

为了解浙江省不同主产地脐橙的品质现状及亲缘关系，本研究对从5个栽培地引种的17个脐橙样品的理化品质性状进行分析，同时进行基因组DNA多态性分析， 从300个引物中筛选出具有丰富多态性的17个10bp的随机引物，共扩增出109个DNA片段，片段大小在200bp-2800bp之间，其中多态性谱带为65条，占59.63%，表现出较为丰富的RAPD多态性，根据遗传距离，利用UPGMA构建了品种亲缘关系树状图。结果表明，浙江省不同产地的脐橙品种固形物含量在12%-15.25%，朋娜维生素C含量较纽荷尔低，朋娜平均裂果率达14.48%，纽荷尔平均裂果率为4.04%，其它脐橙品系的裂果率平均为10.08%，浙江省纽荷尔脐橙总体品种特性较朋娜和其它脐橙品系佳。结合脐橙品质和遗传距离，将浙江省主产17份脐橙材料可聚成三大类群，Q001，Q002，Q003，Q006，Q007，Q0013之间的亲缘关系较近，为朋娜品种，Q0011，Q0015，Q0016，Q0017，可分为一类，为纽荷尔品种，其它品系的脐橙归为一类。     

甘肃新选育党参品系与主栽品种的RAPD分析

采用RAPD分子标记技术,分析了新选育党参（Codonopsis pilosula）8个品系和2个主栽品种的遗传多样性和亲缘关系。结果显示,14条引物共扩增出159个位点,其中多态位点26个,多态性位点比率为46.43%,材料间遗传相似系数范围在0.771 9～0.964 9,说明甘肃省主栽党参品种资源具有较丰富的遗传多样性。根据聚类分析结果,党参品种DS6与所有其他供试材料的亲缘关系最远,可单独聚为一类;DS3与DS8的亲缘关系最近,其相似系数为0.964 9。     

湖南省10个现行栽培桑树品种的AFLP指纹图谱分析

利用扩增长度多态性(AFLP)分子标记技术,构建湖南省现行推广的10个桑树品种的指纹图谱,作为该省区桑树遗传育种辅助选择和品种鉴定的重要依据。从36对AFLP引物中筛选出带型丰富、多态性较高的5对引物对10份桑树品种材料进行扩增,共检测到344条多态性条带,多态性比率达27.88%。品种之间的遗传相似系数以及UPGMA聚类分析结果与基于形态学方面的分类结果一致,在遗传相似系数0.79处,10个桑树品种聚为3类:三倍体品种湘桑6号单独聚为一类,其余9个品种聚为一类,其中广东桑品种苗33又单独聚为一类,8个鲁桑品种聚为一类。     

基于GBS技术的不同鸽种群体进化分析

为了研究不同鸽种群之间的遗传多样性，本研究利用简化基因组(GBS)技术对太湖点子鸽、塔里木鸽、银王鸽、石歧鸽、豫中鹁鸽进行测序，共获得有效数据44.49 Gb，平均测序深度为0.88×，共检测到361 937个高质量SNP位点；通过对SNP进行系统进化树和主成分分析，可大致将5个鸽种群划分为4个大类，银王鸽与石歧鸽聚为一类，新疆塔里木鸽、豫中鹁鸽和点子鸽均各自聚为一类，表明鸽种群间的亲缘关系主要受地域起源影响。本研究结果在分子水平为鸽群亲缘关系分析和系统分类提供理论支撑，并为我国地方鸽种质资源的开发和利用提供了科学依据。