日本脑炎病毒非结构蛋白功能的研究进展

日本脑炎病毒(Japanese encephalitis virus, JEV)为单股正链RNA病毒,可通过蚊虫为媒介引起人畜共患的急性中枢神经系统传染病,目前暂无特效治疗药物。JEV基因全长11 kb可编码3个结构蛋白(C、PrM、E)和7个非结构蛋白(NS1、NS2A、NS2B、NS3、NS4A、NS4B、NS5)。7个非结构蛋白占JEV编码蛋白质的大半,对于JEV发挥生物学功能有着重要意义。本文就JEV非结构蛋白功能进行了总结论述,以期为JEV分子生物学研究和防控提供参考。     

猪瘟病毒分子生物学研究进展

猪瘟病毒 (CSFV)是一种具有囊膜的 RNA病毒 ,在病毒分类上属于黄病毒科、瘟病毒属的成员 ,也是世界上危害最严重的猪的病原之一 ,被国际兽医局 (OIE)列为 A类动物传染病 ,因此开展猪瘟病毒分子生物学研究具有重要的经济意义。1　CSFV基因组结构和功能CSFV基因组为单股正链 RNA,长约 1 2 .3 kb,含有一个大的开放阅读框架 ,并由其编码一种约3 898个氨基酸的多聚蛋白 ,该聚蛋白在翻译的同时和翻译后经病毒和宿主细胞的蛋白酶加工成 1 2种成熟的病毒蛋白 ,其在聚蛋白上从 N端到 C端的顺序依次为 :Npro、C、Ems、E1、E2、p7、NS2、N…     

传染性法氏囊病病毒Rescue技术及其应用的研究进展

传染性法氏囊病病毒(Infectious bursal disease virus,IBDV)是一种小的、无囊膜的双股RNA病毒,基因组含A、B两个片段,大片段A(3.2～3.4kb)由两端的非编码区以及两个部分重叠的开放阅读框架(ORF)组成,其中较大的ORE编码一个分子量约为110kDa的多聚蛋白,该多聚蛋白经几步裂解加工后形成VP2、VP3和VP4蛋白,较小的ORF编码一个17kDa的非结构蛋白VP5,基因组小片段B(约2.8kb)编码90kDa的具有多功能酶活性的VP1.     

蓝舌病病毒基因产物及其生物学功能

蓝舌病病毒(bluetongue disease virus,BTV)是呼肠孤病毒科环状病毒属的双股RNA病毒,其核酸由3个大片段(L1～L3)、3个中片段(M4～M6)和4个小片段(S7～S10)等10个节段组成,分别编码7种结构多肽(VP1～VP7)和4种非结构多肽(NS1、NS2、NS3a、NS3b)。通过dsRNA基因组进行体外翻译,再根据各基因与所编码蛋白的关系,查明了各基因编码的蛋白质及其分子质量和功能。     

貉源阿留申病毒VP2和NS1蛋白的抗原性预测

旨在预测和分析貉源阿留申病毒(RFAV)VP2和NS1蛋白的抗原表位特征,筛选阿留申病毒属较保守的B、T细胞抗原表位。本研究对RFAV的近全长基因组进行克隆及测序,对其VP2和NS1基因编码蛋白的理化性质、二级结构、翻译后修饰位点和抗原表位进行预测,并将预测的修饰位点、抗原表位与其他阿留申病毒种的序列进行比较分析,筛选相对保守的修饰位点和抗原表位。结果显示,获得的RFAV基因组长4 327 bp,编码VP2蛋白的636个氨基酸,编码NS1蛋白的641个氨基酸。VP2和NS1蛋白均为亲水性蛋白,二级结构以无规则卷曲为主。在阿留申病毒属内,VP2蛋白有3个保守的B细胞抗原表位,3个保守的T细胞表位,8个保守的翻译后修饰位点;NS1蛋白有1个保守的B细胞抗原表位,2个保守的T细胞抗原表位和7个保守的翻译后修饰位点。本研究成功克隆了RFAV近全长基因组序列,全面对RFAV的VP2、NS1蛋白抗原表位、翻译后修饰位点进行预测,并分析其在阿留申病毒属内的保守和变异特征,为阿留申病毒免疫研究提供参考。     

貉源阿留申病毒VP2和NS1蛋白的抗原性预测

旨在预测和分析貉源阿留申病毒（RFAV） VP2和NS1蛋白的抗原表位特征，筛选阿留申病毒属较保守的B、T细胞抗原表位。本研究对RFAV的近全长基因组进行克隆及测序，对其VP2和NS1基因编码蛋白的理化性质、二级结构、翻译后修饰位点和抗原表位进行预测，并将预测的修饰位点、抗原表位与其他阿留申病毒种的序列进行比较分析，筛选相对保守的修饰位点和抗原表位。结果显示，获得的RFAV基因组长4 327 bp，编码VP2蛋白的636个氨基酸，编码NS1蛋白的641个氨基酸。VP2和NS1蛋白均为亲水性蛋白，二级结构以无规则卷曲为主。在阿留申病毒属内，VP2蛋白有3个保守的B细胞抗原表位，3个保守的T细胞表位，8个保守的翻译后修饰位点；NS1蛋白有1个保守的B细胞抗原表位，2个保守的T细胞抗原表位和7个保守的翻译后修饰位点。本研究成功克隆了RFAV近全长基因组序列，全面对RFAV的VP2、NS1蛋白抗原表位、翻译后修饰位点进行预测，并分析其在阿留申病毒属内的保守和变异特征，为阿留申病毒免疫研究提供参考。     

牦牛病毒性腹泻病毒5′-UTR和E0基因的克隆与序列分析

20世纪80年代,西南民族大学"拉稀病"研究组从四川地区牦牛体内分离出牛病毒性腹泻病毒(Bovine viral diarrhea virus,BVDV),导致牦牛发生以腹泻、消化道黏膜脱落为主要症状的传染病.牛病毒性腹泻病毒(BVDV)与猪瘟病毒(CSFV)、羊边界病毒(BDV)同属黄病毒科瘟病毒属, 基因和蛋白质结构与其他瘟病毒一致,其基因组为单股正链RNA,大小约为12.5 kb,包括1个大的开放阅读框(ORF)和两侧的非翻译区(UTR).开放阅读框编码1个多聚蛋白, 在宿主细胞和病毒自身蛋白酶作用下, 进一步加工为成熟的蛋白, 包括结构蛋白C、E0、E1、E2.研究根据5′非翻译区(5′-untranslated region,5′-UTR)确定了牦牛牛病毒性腹泻病毒的基因型,对E0基因进行了序列分析,为进一步研究基因工程苗、有针对性地防治牦牛病毒性腹泻和制作诊断抗原奠定了基础.     

口蹄疫病毒3C蛋白酶的结构及功能研究进展

口蹄疫病毒能引起牛、羊等偶蹄动物发生高度接触性的传染病口蹄疲,该病常常影响着全球畜牧业的发展.FMDV是小RNA病毒科口蹄疫病毒属的成员,口蹄疫病毒为单股正链RNA病毒,病毒基因组全长约8.5 kb,基因组分为5'非编码区、3'非编码区和一个开放阅读框(ORF).基因组的中部是一大的开放阅读框,编码一多聚蛋白,多聚蛋白在翻译的同时,经二级裂解后,形成3种病毒结构蛋白(VP0,VP3和VP1)和8种非结构蛋白(L,2A,2B,2C,3A,3B,3C和3D).其中3C全长639 bp,编码213个氨基酸.3C蛋白酶是小RNA病毒的共同裂解酶,在多聚蛋白成熟过程中起着极为重要的作用,且在抗病毒药物打靶方面具有一定研究价值.因此,对3C蛋白酶的结构及功能研究进展进行综述很有必要.     

口蹄疫病毒的抗原结构学的研究进展

正口蹄疫病毒(Foot and mouth disease virus,FMDV)属于小RNA病毒科口蹄疫病毒属,完整的病毒粒子由衣壳包裹着单股正链RNA构成。FMDV基因组全长约为8.5 kb,主要分为5'端非编码区、编码区、3'端非编码区和多聚腺苷酸(poly(A))。5'端非编码区的5端共价连接病毒自身编码的非结构蛋白(VPg),而且还包含有S-片段、poly     

猪乙脑病毒WHe株的PrM—E、NSl、E—NS2A基因的克隆及序列测定

本文通过RT—PCR扩增了猪乙型脑炎病毒wHe株主要抗原基因NS1(约1．14kb)、prM-E(约2．1kb)、E-NS1-NS2A(约3．0kb)，并将NS1、E-NS1-NS2A、PrM-E基因克隆、测序。与Cenbank发表的JEV基因序列进行序列分析，发现WHe株与其他12种典型的JEV强毒株的同源性在88．3％～99.4％之间。wHe株与K94P05株的同源性最低(88．3％)，与P3株的同源性最高(99．4％)，可认为wHe株是由P3株衍生而来的。在JEV基因组5’端389-3910的长3522nt的决定JEV抗原性的C-prM-E-NS1-NS2A区中，wHe株与P3株仅有21个碱基不同，其中的14个单碱基突变为同义突变，另外7个为错义突变，导致相应的氨基酸序列(1173个)中的6个氨基酸发生了变异，其中的5个氨基政变异出现在含有各关键的抗体中和决定簇的E蛋白内，另一个位于NS1蛋白内。     

金刚烷胺在禽流感病毒M2基因原核表达中的作用

禽流感病毒(Avian Influenza virus，AIV)为正粘病毒科A型流感病毒，其基因组是由8个分节段的单股负链RNA组成，分别编码8个不同功能的蛋白，PB1、PB2、PA、HA、NP、NA、M1和M2及非结构蛋白NSl1和NS2。M2基因位于AIV基因组的第7个节段上，包含14～39和728～995两个部分，其初始转录产物在剪切40～727位的内含子后，拼接成成熟的mRNA后翻译成M2蛋白。M2蛋白是禽流感病毒的跨膜蛋白，具有H^ 离子通道的功能，     

水貂阿留申病毒结构蛋白与非结构蛋白的研究进展

水貂阿留申病毒(Aleutian mink disease virus,ADV)是一种主要侵染水貂的自主复制型细小病毒,是一种在水貂中广泛存在的重要病原体。病毒粒子的蛋白分为结构蛋白(VP1、VP2)和非结构蛋白(NS1、NS2)两类。VP1蛋白对病毒粒子产生感染性有重要作用;VP2蛋白是主要免疫功能区,能刺激机体产生中和抗体;NS1和NS2主要参与病毒的复制和基因的表达调节。文中对近年来国内外学者关于水貂阿留申病毒结构蛋白和非结构蛋白的研究情况进行归纳和总结。     

猪水泡病病毒非结构蛋白编码区的克隆与序列分析

以猪水泡病病毒(Swine vesicular disease virus，SVDV)HK’70为材料，用特异性引物扩增出非结构蛋白编码区的4个重叠目的片段，连接于pMD 18-T载体，转化JMl09感受态细胞。经对重组质粒双酶切、PCR鉴定、序列分析表明，HK’70非结构蛋白编码区核苷酸长4002nt，氨基酸长1334aa；与J1’73、H／3’76、SVDV(Seechrn等测株)、NET／1／92的核苷酸同源性分别为98．6％、98．3％、98．3％、91．2％，推导氨基酸序列的同源性分别为98．9％、99．1％、99．2％和97．2％。     

用裁截的E2重组蛋白作为抗原建立ELISA检测猪瘟病毒抗体

猪瘟 ( CSF)是猪的一种传染性致死性疫病 ,该病在家猪群和野猪群中流行传播 ,造成地方流行性感染。猪瘟病毒 ( CSFV)是黄病毒科瘟病毒属成员之一 ,本属中还有另 2种具有经济重要性的病毒 :边界病病毒 ( BDV)和牛病毒性腹泻病毒( BVDV)。瘟病毒属成员在结构上和抗原性上密切相关。 CSFV的基因组为长约 1 2 .3kb的正极性RNA,其编码为单一多蛋白 ,形成成熟的病毒蛋白。CSFV感染后 ,在猪体内产生抗结构蛋白 E2 、Erns及非结构蛋白 NS3抗体。囊膜糖蛋白 E2 是CSFV最具免疫原性的蛋白。为在无疫区进行CSF监测 ,或开展 CSF扑灭计划…     

猪源口蹄疫病毒China99/S株基因组全长cDNA的构建及其感染性鉴定

提取猪源FMDV China99/S组织样品总RNA,利用设计的引物对,分段进行扩增,获得覆盖全基因组的4个重叠片段(A、B、C和E),然后用BsmB Ⅰ/Xma Ⅰ、Xma Ⅰ/BamH Ⅰ、BamH Ⅰ/Not Ⅰ、Hpa Ⅰ/Kpn Ⅰ分别双酶切A、B、E、C,并纯化回收,依次定向克隆到带有聚合酶Ⅰ的pPⅠ cDNA3.1(+)转录载体内,最终得到重组质粒pP1-FMDVcDNA3.1(+);然后对该质粒进行序列测定.结果表明,China99/S株基因组全基因组序列长8 116 nt(含Poly(C)和Poly(A)片段),其中5′NCR长1 064 nt,蛋白编码区核苷酸序列为6 318 nt,编码1个由2 106个氨基酸组成的聚合蛋白,3′NCR长93 nt,其后是含有38个A碱基的Poly(A)尾.其中5′NCR引入含41个C的Poly(C)片段.将pPⅠ FMDVcDNA3.1(+)用脂质体转染法导入BHK-21细胞,传代培养,可以观察到典型的FMDV致细胞病变效应.利用CPE、电镜、动物试验、RT-PCR和序列测定进行检测,结果表明,从该系统中成功拯救出具有感染性的猪源FMDV China99/S株重组病毒.     

乙型脑炎病毒NS1’蛋白编码框的扩展对病毒毒力的影响

通过分析乙型脑炎病毒(Japanese encephalitis virus,JEV)基因组中核糖体移码序列,在对NS2A基因实施同义突变基础上,设计2组引物,通过PCR突变方法,依次删除移码后NS1’基因开放阅读框的终止密码子,并将突变片段替换JEV感染性克隆pJEHEN中相应片段,获得了2株突变全长克隆。经体外转录合成RNA,再以RNA转染细胞,拯救出两株突变病毒vJET1和vJET2。通过RT-PCR扩增突变病毒中含突变位点的基因组片段,测序证实了vJET1基因组3690位核苷酸存在由T向A的突变,vJET2基因组3690位和3819位核苷酸均存在由T向A的突变。将vJET1和vJET2感染Vero细胞后,Western blot检测显示,两株突变病毒表达的NS1’蛋白均出现延长现象。生长曲线显示,与亲本病毒vTHen相比,突变病毒增殖速度均出现下降。动物实验显示,与vTHen相比,vJET1和vJET2对小鼠的神经毒力与神经侵袭力也出现下降。上述结果表明,NS1’编码框的延伸降低病毒在体外培养细胞上的增值速度,也减弱了病毒对小鼠的毒力。     

鸭甲肝病毒GX株全基因组序列测定及VP1蛋白生物信息学分析

为探讨鸭甲肝病毒(DHAV)GX株基因分型特点及主要衣壳蛋白(VP1)的生物学特性,本试验对其进行全基因组序列测定,并应用分子生物学软件将DHAV GX株与DHAV 3个血清型参考毒株进行序列比对分析。结果显示,其基因组全长7 800 bp,由5'和3'非编码区(UTR)和一个大开放阅读框(ORF)组成。其中,5'UTR和3'UTR的长度分别为652和369 bp;ORF长度为6 756 bp,编码2 251个氨基酸长的多聚蛋白,其编码产物至少有12个(VP0/VP3/VP1/2A1/2A2/2A3/2B/2C/3A/3B/3C/3D);在分类地位上DHAV GX株属于DHAV-3,其与DHAV-3参考株核苷酸、氨基酸同源性最高;与DHAV-3 FS株亲缘关系最近,在同一较小分支上。DHAV GX株结构蛋白VP1以第195—201、211—221位氨基酸区段为B细胞优势表位的可能性较大。提示,VP1基因可作为研制DHAV基因工程疫苗的优势候选基因。     

蓝舌病毒结构与组装机制研究进展

蓝舌病毒(Bluetongue virus,BTV)是一种以媒介昆虫为传播媒介侵染野生反刍动物和家畜的世界范围流行的病原微生物。BTV颗粒是由10个基因片段组成的双股RNA病毒,分别编码7个结构蛋白(VP1-VP7)和至少4个非结构蛋白(NS1、NS2、NS3/3a和NS4)组成的连续蛋白质层的复杂结构,BTV已被作为大型无囊膜dsRNA病毒研究的模型系统。近年来,通过反向遗传学(RG)、低温电子显微镜(Cryo-EM)、蛋白晶体结构解析等研究分析方法,为BTV病毒蛋白结构、病毒蛋白之间功能关系、病毒组装/拆卸等方面取得了相当大的研究进展,该文对BTV病毒衣壳蛋白结构、核心蛋白的组装、基因组RNA组装等方面机制进行了综述。     

新城疫病毒基质蛋白第23位苯丙氨酸对病毒复制与细胞致病性的作用

副黏病毒科的副流感病毒5型(Parainfluenza virus5,SV5)和腮腺炎病毒(Mumps virus,MuV)的基质蛋白(Matrix protein,M)都编码FPIV-like晚期结构域(Late-domain,L-domain),L-domain中的苯丙氨酸(Phenylalanine,F)对病毒出芽与复制有很重要的作用。新城疫病毒(Newcastle disease virus,NDV)M蛋白也包含潜在的L-domain23FPIV26,但23F对NDV的出芽及复制的作用尚不明确。本试验应用反向遗传学技术,以NDV ZJ1株为母本病毒,拯救一株M蛋白F23A突变的重组病毒ZJ1F23A,并在DF1细胞上对ZJ1F23A的复制性能和细胞致病性进行评价。结果显示,ZJ1F23A在DF1上的复制水平显著低于母本病毒ZJ1,ZJ1F23A对DF1的致病性比ZJ1弱。试验结果说明NDV M蛋白23F对病毒复制及病毒的细胞致病性具有重要作用。     

猪瘟病毒N~(pro)蛋白及细胞内环境改变对其IRES活性的影响

位于猪瘟病毒(CSFV)基因组5'端非翻译区(UTR)的内部核糖体进入位点(IRES)在调控CSFV基因组的翻译中发挥重要的作用,为探索CSFV自身蛋白以及细胞内环境改变对IRES活性的影响,本研究构建了包含CSFV IRES在内的荧光素酶报告基因质粒,采用编码CSFV非结构蛋白N~(pro)和NS5A蛋白表达重组质粒转染细胞,或通过葡萄糖剥夺、氨基酸剥夺、氧化应激、血清饥饿等条件分别处理细胞,结果显示N~(pro)蛋白比之前报道的NS5A蛋白具有更显著的IRES抑制效果,并且抑制程度呈浓度依赖性;氨基酸剥夺、氧化应激及血清饥饿时可以显著降低CSFV IRES的活性,而葡萄糖剥夺对其活性无显著影响。本研究明确了CSFV非结构蛋白N~(pro)以及细胞内环境的改变可以调控IRES的活性,为进一步阐明CSFV复制增殖的分子机制提供新的实验依据。