中国家驴生长激素基因内含子2的遗传多样性分析

为了从分子水平揭示家驴的遗传多样性,本研究以中国7个家驴品种(临县驴、关中驴、新疆驴、广灵驴、淮北驴、德州驴、晋南驴)174个个体为试验动物,利用PCR-SSCP技术研究生长激素(GH)基因第2内含子的遗传多样性并进行序列分析.结果显示:第2内含子表现多态性,174个个体检测到3个单倍型,单倍型比例为1.7%.单倍型多样度以临县驴、淮北驴较高,分别为0.678和0.542.广灵驴与关中驴的单倍型多样度(Haplotype diversity,H)比较接近,分别为0.409和0.462.其次为德州驴和晋南驴,分别为0.355和0.304,新疆驴最低为0.077.对该片段的纯合型分别测序发现,B单倍型在第735位碱基G→C.A单倍型在869位碱基G→T.上述结果首次证实驴GH基因内含子2存在多态性.     

驴的产肉、理化指标及加工特性比较研究

旨在研究不同品种驴的屠宰性能、肉品理化指标和加工特性。本试验选取7月龄的关中驴、德州驴、广灵驴、庆阳驴、沁阳驴、疆岳驴、云南驴7个品种的母驴各6头,分别测定屠宰性能,背最长肌和臀肉中水分含量、蛋白含量、脂肪含量、剪切力以及熟肉率等指标。结果表明,7月龄阶段,德州驴宰前活重、胴体重、净肉重显著高于其他驴种(P0.05),净肉率显著高于关中驴、庆阳驴和云南驴(P0.05)。疆岳驴屠宰率显著高于关中驴、庆阳驴、泌阳驴和云南驴(P0.05)。广灵驴和关中驴两部位肉的脂肪含量达到了2%以上,其中背最长肌脂肪含量显著高于泌阳驴和云南驴(P0.05),臀肉脂肪含量显著高于其他驴种(P0.05)。广灵驴、关中驴和德州驴背最长肌的剪切力值显著低于泌阳驴和云南驴(P0.05)。德州驴两部位肉的熟肉率最高,其中背最长肌熟肉率显著高于广灵驴、关中驴和庆阳驴(P0.05),臀肉熟肉率显著高于广灵驴、关中驴、泌阳驴、庆阳驴和疆岳驴(P0.05)。综上表明,德州驴为具有良好肉用潜能的大型驴种。疆岳驴、广灵驴和泌阳驴也同样具有肉用开发潜能。广灵驴和关中驴储脂能力相对较好,具有成为高档原料肉的潜能。     

肉驴饲养管理技术探讨

1我国肉驴品种及利用现状1.1我国的主要驴品种我国的驴按体型大小分为大型驴、中型驴和小型驴。大型驴主要分布在陕西、山西、河北、山东的平原地区,品种有关中驴、德州驴、晋南驴和广灵驴等。中型驴主要分布在陕西、甘肃、山西及河北省的高原和河南中部平原,如佳米驴、泌阳驴、庆阳驴、淮阳驴等。小型驴主要分布在我国西北、长城以北和东北平原以及荒漠半荒漠的草地、宽广的农区平原地区,主要有新疆驴、西南驴、华北驴等。1.2我国肉驴的利用现状及选育的必要性我国的驴品种除关中驴、德州驴、晋南驴、广灵驴和泌阳驴等少数地方品种经过了系…     

以血清蛋白多态性分析六个驴品种的遗传结构和种间相互关系

采用垂直板聚丙烯凝胶电泳法,对我国6个著名驴品种广灵驴、关中驴、佳米驴、泌阳驴、庆阳驴、德州驴的血清转铁蛋白(Tf)、血清前白蛋白Ⅰ(Pa1)、血清后白蛋白Ⅰ(Po1)、血清后白蛋白Ⅱ(Po2)、血清淀粉酶(Am)、血清铜蓝蛋白(Cp)和血清白蛋白(Alb)的多态性进行了研究。从生化遗传多态性角度,对这些地方驴品种进行群体遗传分析,探讨它们间的遗传距离和品种的遗传相似性,以及对驴的起源、遗传分化等问题提供基础资料,可望为下一步驴遗传图谱的构建和进行标记辅助选择提供相关的基础。结果表明,6个品种中的7个酶座位中,血清后白蛋白I(Po1)、血清后白蛋白Ⅱ(Po2)、和血清白蛋白(Alb)、血清转铁蛋白(Tf)、血清淀粉酶,5个血清蛋白表现出丰富的多态性。根据F-统计量和Nm结果表明,泌阳驴与关中驴之间的Fst最大,Nm最小,两者间的遗传分化最大,基因流最小。相对另外4个品种,泌阳驴与关中驴之间还可进行一定的品种间的杂交组合。佳米驴与庆阳驴之间的遗传分化最小,Nm最大,基因流最大,两者相似性最高。而德州驴与广灵驴和佳米驴之间的遗传分化较小,基因流较大。德州驴同广灵驴和佳米驴间的相似性比较多,在进行杂交组合时,其效果受到一定的影响。     

庆阳驴mtDNA D-loop区遗传多样性及起源分析

【目的】研究庆阳驴养殖群体的遗传多样性与母系起源,了解其遗传信息,为保护庆阳驴种质资源、选育和遗传改良工作提供理论依据。【方法】随机选取133头庆阳驴,对其线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)D-loop区序列进行PCR扩增、测序及比对,并探讨庆阳驴的遗传多样性与母系起源。【结果】在获得的520 bp D-loop碱基序列中,AT含量(57.3%)高于GC含量(42.8%),表现出碱基的偏倚性;检测到38个变异位点,包含8个碱基对的转换;其核苷酸多样性(Pi)、单倍型多样性(Hd)、平均核苷酸差异(K)分别为0.01591、0.895和8.274,与欧洲家驴和中国家驴研究的平均值相比较低,说明该驴品种核苷酸变异较为贫乏。庆阳驴mtDNA D-loop区存在35个单倍型,单倍型之间的遗传距离为0.002～0.042。系统进化结果显示,庆阳驴存在2个线粒体支系,表明其具有2个母系起源,且遗传距离表明,庆阳驴与克罗地亚家驴之间的遗传距离较近。【结论】本研究从分子水平初步揭示庆阳驴核苷酸变异比较贫乏,杂交程度高,mtDNA遗传多态性正逐步丧失,应加强庆阳驴品种的遗传资...     

山东省驴产业发展现状

<正>1中国及山东省驴产业发展现状1.1中国具有丰富的驴品种资源中国驴的数量长期位居世界前列。据《马驴驼品种志》记载,我国有24个驴品种。按体型大小可以分为大型驴品种( 130 cm,德州驴、关中驴、广灵驴)、中型驴品种(110～130 cm,庆阳驴、佳米驴、泌阳驴)、小型驴品种(110 cm,新疆驴、凉州驴)。     

小毛驴为何越来越少?

<正>近年来,随着农业机械化水平提高,驴存栏量逐年减少。统计数据显示,我国驴存栏量已由上世纪90年代初的1100万头,下滑到现在的730万头。5大国家级优良品种德州驴、关中驴、广灵驴、庆阳驴、泌阳驴的数量萎缩更加严重,几乎到了濒临绝种的地步。预计到2030年我国的驴     

ASIP基因第3外显子349位点多态性与中国家驴毛色表型相关研究

本研究以16个品种680头中国家驴为实验群体,通过PCR-RFLP方法检测ASIP基因第3外显子349位点的多态性,并分析其多态性与中国家驴毛色的关联性。结果表明:中国家驴ASIP基因第3外显子存在c.349T>C突变,纯黑色的驴基因型以CC型为主,德州驴、渤海驴、广灵驴和庆阳驴中的纯黑色驴全是CC型;非纯黑色驴主要是TT和CT基因型,没有检测到CC基因型。利用ASIP基因第3外显子PCR-RFLP标记可以把家驴中纯黑色和非纯黑色驴分开,作为家驴中纯黑色驴早期选种的分子标记。     

河北省肉驴产业分析

正我国养驴业历史悠久,驴曾是重要的农业生产和运输工具。进入本世纪,随着农业机械化水平的提高,我国驴的存栏量快速下降,出现了驴资源危机的现象。据国家农业统计资料显示,1991～2007年间全国肉驴存栏量由1100万头减少到730万头。同时,我国的德州驴、关中驴、广灵驴、庆阳驴、泌阳驴等良种肉驴养殖量萎缩,致使种驴价格居高不下。但近年来,驴产品价格看涨,我国驴业发展缓慢的态势有所改观。     

河北省肉驴产业分析

正进入本世纪,我国的肉驴存栏量下降很快,出现了肉驴资源危机现象。据国家农业统计资料,1991—2007年全国肉驴存栏量已由1100万头减少到730万头。同时,我国的德州驴、关中驴、广灵驴、庆阳驴、泌阳驴等五大良种肉驴存养量萎缩非常严重,致使种驴价格居高不下。近年来,虽然随着驴肉驴皮消费需求的增加,驴产品价格看涨,我国驴业出现了加快发展的苗头,但是驴存栏数量下降,驴业基础薄弱、效益较低、发展迟缓的态势,仍     

德州驴与泌阳驴睾丸组织mRNA与microRNA表达鉴定与分析

试验旨在探究驴睾丸组织中mRNA和microRNA的表达模式，为中国地方驴的转录组研究提供遗传数据。利用RNA-Seq和生物信息学方法分析了中国地方驴睾丸组织表达基因和microRNA，并分析了泌阳驴和德州驴品种间差异表达基因及microRNA。结果表明，mRNA平均clean reads为57837506条，Small RNA平均clean reads为9952015条，分别占原始数据的96.34%和88.86%。在驴睾丸组织中共发现24751个表达基因及1074个表达microRNAs，其中，睾丸组织表达量较高的基因为LOC106836782、XLOC_066401、HSP90AA1、TNP1和COF2，表达量最高的microRNAs为eca-miR-143、eca-miR-21、eca-miR-99a、eca-miR-148a和eca-miR-26a。对泌阳驴与德州驴睾丸组织进行差异表达分析共发现102个差异表达基因及2个差异表达microRNAs，但未富集到功能条目，说明泌阳驴和德州驴品种间差异不明显。本研究提供了驴睾丸组织mRNA及microRNA表达模式和转录组学数据，并鉴定了泌阳驴与德州驴睾丸组织的差异表达mRNA和microRNA，对驴的遗传资源研究具有一定的科学意义。     

新疆驴和青海驴MSTN基因多态性分析

 为揭示中国家驴 MSTN 基因的遗传多样性,以新疆驴和青海驴为研究对象,根据GenBank上公布的马的 MSTN 序列,设计9对特异性引物,利用驴混合DNA池为模板对该 MSTN 基因部分序列进行PCR扩增和测序分析。结果显示,扩增出的驴 MSTN 基因部分序列长度为3242 bp,包括5'-UTR区(671 bp)、第一外显子(373 bp)、第一内含子(1825 bp)和第二外显子(373 bp)。在该基因中共发现4个SNPs,分别为65 bp处T→Ｃ（5'-UTR）,872 bp处A→G（第一外显子）,2017 bp处G→A (第一内含子),2395处C→G突变（第一内含子）。利用PCR-RFLP技术对新疆驴和青海驴共计80个样本进行基因分型,4个突变位点共检测到6种单倍型（H1-H6）,其中H1是最主要的单倍型。两个家驴品种 MSTN 基因的遗传多样性很丰富（H=0.6044）,这对中国驴的遗传资源保护具有重要作用。     

利用微卫星标记鉴定德州驴亲子关系

试验旨在建立一套适用于德州驴亲子关系的鉴定体系。选取13个微卫星基因座作为标记,采集了53头德州驴血液样本,其中子代驴驹16头,候选父本13头,候选母本24头,用酚-仿法抽提血液基因组进行PCR扩增和基因扫描,并利用Peak Scanner Software v1.0软件读取基因型分型结果。对微卫星基因座的遗传多样性进行分析,利用似然法（Cervus 3.0软件）和排除法对个体间的亲子关系进行了鉴定。结果显示,13个微卫星基因座的平均等位基因数、平均观测杂合度（Ho）、平均期望杂合度（He）和平均多态信息含量（PIC）分别为6.846、0.689、0.671和0.625。期望杂合度与观测杂合度之差在0.002~0.088之间,差值较小。13个微卫星基因座的累计排除概率（EP）达到0.990以上。微卫星基因座具有高度多态性和较高的排除概率,适用于遗传分析和个体鉴定。利用Cervus 3.0软件基于似然法分析得到了16头子代驴驹的最似亲本,结合排除法对这16头驴驹及其最似亲本进行基因型比对,最终在53头德州驴中确定了11个亲子对。本试验建立了以13个微卫星位点作为核心标记,将似然法和排除法相结合作为主要分析方法的德州驴亲子关系鉴定体系,为育种工作提供参考资料。     

Study of the Genetic Origin of the Mexican Creole Donkey (Equus asinus) by Means of the Analysis of the D-Loop Region of Mitochondrial DNA

The aim of this work was to analyse the genetic origin of the Mexican Creole donkey, as well as its genetic diversity, by comparison with Spanish and African donkey populations by means of the D-loop region of mitochondrial DNA. To this end, the genomic DNA of 68 Mexican Creole donkeys from eight geographical regions in six States of the Republic of México and from a Sicilian donkey was obtained. By the polymerase chain-reaction technique (PCR) a fragment of 541 bp was amplified, corresponding to the most informative region of the mitochondrial DNA, the D-loop. The fragments were subsequently sequenced. The analysed sequences revealed 10 new Mexican haplotypes that were different from those of the Spanish and African breeds with which they were compared, showing high levels of genetic diversity. Analysis of the phylogenetic relationships in the different Creole varieties showed a tendency of origin towards Spanish breeds, mainly the Andaluza, Zamorano-Leonesa and Majorera from the Canary Islands; these in turn showed an African origin, seven Mexican haplotypes and three haplotypes similar to those analysed by Aranguren and colleagues (2004) of Spanish and African breeds being obtained. This work allows us to reach the preliminary conclusion that the origin of Mexican Creole donkey populations in the different states of the Republic of México is clearly of Iberian origin, the Spanish donkey breed Andaluza being the main one contributing to the populations of the Mexican Creole donkeys, followed by the Spanish breeds Zamorano-Leonesa and Majorera from the Canary Islands, and that the populations possess high levels of genetic diversity.     

中国四个地方驴品种mtDNA D-Loop部分序列分析与系统进化研究

对中国4个家驴品种95个个体的mtDNAD—loop部分序列进行测序。用clustalX软件进行同源序列比对。Dnasp4-10软件用于遗传多样性分析，计算单倍型多样度、核苷酸多样度、平均核苷酸差异。MEGA3．1软件采用邻接法构建系统进化树并进行系统发生分析。以欧洲驴线粒体基因组为对照（Genbank登录号为X97337），中国家驴4个品种95个个体385bp序列共检测到核苷酸多态位点33个，其中31个位点为转换，1个位点为颠换，1个位点有插入现象。95个序列由31个单倍型组成，单倍型比例为32．6％。德州驴单倍型比例最高为100％，凉州驴单倍型比例最低为42．42％。31个单倍型与引用Genbank已登录的13条序列构建系统发育树，发现31个单倍型聚为两支，说明中国家驴可能有两个母系起源。以欧洲野驴线粒体D—loop为对照（登录号为AF403063、AF403063、AF403065），揭示本研究涉及的中国家驴品种与非洲野驴的进化亲缘关系较亚洲野驴近，并且从分子水平证明中国家驴可能起源于非洲野驴中的索马里野驴分支。     

Study of the genetic origin of the Mexican creole donkey (Equus asinus) by means of the analysis of the D-loop region of mitochondrial DNA

The aim of this work was to analyse the genetic origin of the Mexican Creole donkey, as well as its genetic diversity, by comparison with Spanish and African donkey populations by means of the D-loop region of mitochondrial DNA. To this end, the genomic DNA of 68 Mexican Creole donkeys from eight geographical regions in six States of the Republic of Mexico and from a Sicilian donkey was obtained. By the polymerase chain-reaction technique (PCR) a fragment of 541 bp was amplified, corresponding to the most informative region of the mitochondrial DNA, the D-loop. The fragments were subsequently sequenced. The analysed sequences revealed 10 new Mexican haplotypes that were different from those of the Spanish and African breeds with which they were compared, showing high levels of genetic diversity. Analysis of the phylogenetic relationships in the different Creole varieties showed a tendency of origin towards Spanish breeds, mainly the Andaluza, Zamorano-Leonesa and Majorera from the Canary Islands; these in turn showed an African origin, seven Mexican haplotypes and three haplotypes similar to those analysed by Aranguren and colleagues (2004) of Spanish and African breeds being obtained. This work allows us to reach the preliminary conclusion that the origin of Mexican Creole donkey populations in the different states of the Republic of Mexico is clearly of Iberian origin, the Spanish donkey breed Andaluza being the main one contributing to the populations of the Mexican Creole donkeys, followed by the Spanish breeds Zamorano-Leonesa and Majorera from the Canary Islands, and that the populations possess high levels of genetic diversity.     

中国家驴mtDNA D-loop 遗传多样性与起源研究

对我国12个家驴品种126个个体（包括引用26个个体）的mtDNA D-loop区399 bp进行分析,共检测到36种单倍型37个多态位点,其单倍型多样度为0.466 7-0.977 8,核苷酸多样度为0.001 2-0.028 5,表明我国家驴的遗传多态性丰富。与3条努比亚野驴、3条索马里野驴和6条亚洲野驴的序列构建NJ系统发育树,首次证明我国家驴的母系起源为非洲野驴中的索马里驴和努比亚驴,亚洲野驴不是中国家驴的祖先。本文还讨论了我国家驴可能的迁徙路线。     

驴辅助繁育技术研究进展

目前,驴产业正在由短期育肥向繁育兼顾的新型可持续发展模式转变,同其他畜禽品种类似,驴产业的转型也是以扩大优良种群和提高品种质量为前提基础,而数量的增加和质量的提高都离不开良种繁育这一关键环节。然而,母驴繁殖力低是制约驴产业成功转型的主要瓶颈之一。驴繁殖力低不仅导致现有驴群的扩繁速度慢,存栏量与日益增长的皮、肉、奶的消费需求之间差距越来越大,而且使新品种的培育周期延长。已有研究表明,辅助繁育技术在提高母驴繁殖性能和改良驴的遗传性状等方面发挥重要作用,如同期发情、排卵控制、人工授精和胚胎移植等辅助繁殖技术可大幅提高母驴的繁殖能力;同时,微卫星标记技术、线粒体DNA测序技术、单核苷酸多态性研究和全基因组选择技术等分子育种手段也能够进一步加快驴的遗传改良进程。文章简要介绍了驴的生殖生理,系统阐述了同期发情、排卵控制、人工授精、胚胎移植、分子标记辅助育种和全基因组选择等辅助繁育技术在驴上的研究进展,并对未来研究方向进行了展望,以期对提高母驴繁殖性能提供借鉴,为开展驴分子育种研究提供有效线索。     

The association analysis between Cytb polymorphism and growth traits in three Chinese donkey breeds

The aim of this study was to investigate the effects of haplotypes in Cytb (Cytochrome b) gene on growth traits in three Chinese donkey breeds, Yunnan donkey (YN), Dezhou donkey (DZ) and Liangzhou donkey (LZ). The samples were genotyped for the Cytb gene by single strand conformation polymorphism (SSCP), and association analysis was conducted with growth traits. The results show that in most cases the effects of the gene on growth traits were not significant and that for the three different donkey breeds, the effects of the gene are different. For YN donkeys, there was a significant effect of the gene on the rump width (P < 0.05) and the effect of genotype AA was larger than that of BB genotype (1.6 cm and 5.4% of the trait mean in YN donkeys, P < 0.05). For DZ donkeys, the effect of gene on body height was significant (P < 0.05). The results also verify that the SSCPs are caused by two cytosine to thymine and one guanine to adenine transitions, corresponding to amino acid substitutions of leucine for proline (L ↔ P) and isoleucine for valine (I ↔ V).