运用模型分类法分析9个地方鸡品种间遗传结构和亲缘关系

以16个中度或高度多态性微卫星标记,运用基于模型分类法的Structure程序推断9个地方鸡品种群体遗传结构,构建聚类图分析相互间亲缘关系,并鉴定群体中迁移个体和具有复杂遗传基础个体的分布。结果表明：Structure程序在预先未标明品种起源的条件下准确推断出9个地方鸡种群体所属类别,揭示按照体型外貌、地理分布等为依据划分的9个地方鸡品种类型,也真实反映了其在遗传上的差异。Structure聚类图在K=2时将9个地方鸡种分为轻体型的鸡种（包括茶花鸡、藏鸡、仙居鸡、固始鸡和白耳鸡）和重体型的鸡种（包括大骨鸡、北京油鸡、鹿苑鸡和萧山鸡）两个类别;K=4、5、6时北京油鸡、固始鸡、大骨鸡分离出来形成独立类群;仙居鸡与白耳鸡在K=6、萧山鸡与鹿苑鸡在K=7、藏鸡与茶花鸡在K=8时仍聚在同一类别中,这与9个地方鸡种的地理分布及形成历史相吻合。9个地方鸡品种群体中均有具有复杂遗传基础的个体分布,迁移个体只分布在藏鸡、萧山鸡和鹿苑鸡群体中。     

运用模型分类法分析9个地方鸡品种间遗传结构和亲缘关系

以16个中度或高度多态性微卫星标记,运用基于模型分类法的 Structure程序推断9个地方鸡品种群体遗传结构,构建聚类图分析相互间亲缘关系,并鉴定群体中迁移个体和具有复杂遗传基础个体的分布.结果表明:Structure程序在预先未标明品种起源的条件下准确推断出9个地方鸡种群体所属类别,揭示按照体型外貌、地理分布等为依据划分的9个地方鸡品种类型,也真实反映了其在遗传上的差异.Structure聚类图在K=2时将9个地方鸡种分为轻体型的鸡种(包括茶花鸡、藏鸡、仙居鸡、固始鸡和白耳鸡)和重体型的鸡种(包括大骨鸡、北京油鸡、鹿苑鸡和萧山鸡)两个类别;K=4、5、6时北京油鸡、固始鸡、大骨鸡分离出来形成独立类群;仙居鸡与白耳鸡在K=6、萧山鸡与鹿苑鸡在K=7、藏鸡与茶花鸡在K=8时仍聚在同一类别中,这与9个地方鸡种的地理分布及形成历史相吻合.9个地方鸡品种群体中均有具有复杂遗传基础的个体分布,迁移个体只分布在藏鸡、萧山鸡和鹿苑鸡群体中.     

江西丰富的地方优质鸡品种资源何以转化成产业优势

一 江西省地方优质鸡品种资源丰富江西具有十分丰富的地方优质鸡品种资源。中国农业部2001年公示的国家级保护品种中，鸡的品种有11个，其中江西省就占了两个：泰和的丝羽乌骨鸡和广丰的白耳黄鸡，占了国家级保护鸡品种的1／5左右。此外，江西省还有许多优良的地方鸡品种，如近年来发展数量比较大的崇仁麻鸡和宁都黄鸡、     

贵州地方鸡种体重生长曲线的拟合分析

为探究贵州省赤水乌骨鸡、黔东南小香鸡、乌蒙乌骨鸡、威宁鸡和贵州黄鸡这5个地方鸡种生长发育规律,采用Logistic、Gompertz和von Bertalanffy 3种非线性模型对5个地方鸡种的生长曲线进行拟合,选取5个品种鸡各60只,公母各30只,测定0、2、4、6、8、10、12、14、16、18周龄时的体重。结果：5个品种鸡的生长趋势一致,3个模型均能较好地拟合5个品种鸡的生长变化情况,拟合度均在0.98以上,其中von Bertalanffy模型对5个品种鸡的生长曲线拟合效果最好;同时期的鸡体重以贵州黄鸡最重,黔东南小香鸡最轻,赤水乌骨鸡、乌蒙乌骨鸡和威宁鸡相近;5个品种鸡的拐点周龄分别为9.2、7.9、7.3、8.9和8.4,拐点体重分别为870.71、509.18、708.29、834.35和945.52 g。通过拟合的生长曲线模型对鸡体重进行评估,可为贵州省地方鸡的科学饲养、品种资源利用及选育提供依据。     

广西5个品种地方鸡肌肉氨基酸分析和营养评价

为深入了解广西地方鸡种肌肉的营养价值,本实验选取120日龄广西三黄鸡、南丹瑶鸡、广西麻鸡、广西乌鸡(东兰乌鸡)和霞烟鸡5个广西地方鸡种各20只,公、母各半,测定其胸肌和腿肌肌肉氨基酸的组成和含量。基于联合国粮农组织和世界卫生组织(FAO/WHO)标准模式谱对其营养价值进行评定。结果显示:在5个广西地方鸡种中,霞烟鸡的必需氨基酸含量、氨基酸总量和味觉氨基酸含量最高,分别为16.88、42.76、22.95g/100g;5个地方鸡种胸肌和腿肌的必需氨基酸含量存在一定差异,且胸肌显著高于腿肌;不同品种胸肌和腿肌的必需氨基酸/氨基酸总量(EAA/TAA)、必需氨基酸/非必需氨基酸(EAA/NEAA)均符合FAO/WHO提出的理想蛋白源标准;缬氨酸是广西三黄鸡的第一限制性氨基酸,蛋氨酸+胱氨酸是其他4个品种的第一限制性氨基酸。5个地方鸡种的胸肌和腿肌具有丰富的味觉氨基酸,风味氨基酸/氨基酸总量均高于50%,且腿肌比胸肌风味更佳。     

基于D-loop区序列分析的四川省三个地方鸡种遗传多样性及母系亲缘关系研究

为研究四川省少数民族地区泸宁鸡、米易鸡、草料鸡的遗传多样性及母系亲缘关系,通过PCR扩增、产物回收、测序的方法,获得各鸡种30个样本的mtDNA D-loop区的部分序列,利用DNAMAN、MEGA5、DnaSP、Network等生物信息学软件对测序结果进行分析.对90个个体mtDNA D-loop区589 bp的片段通过数据分析及聚类分析,构建了单倍型网络关系图及品种聚类图等.泸宁鸡、米易鸡、草科鸡具有较近的亲缘关系,推测3个地方鸡种起源于分布在印度支那半岛、泰国、苏门答腊的红原鸡Gallus gallus gallus亚种.     

中国部分地方品种鸡CD4和CD8α基因cDNA的克隆与序列分析

用Trizol分别提取4～6周龄白莱航鸡、狼山鸡、大骨鸡、北京油鸡、仙居鸡、茶花鸡、固始鸡和隐性白羽鸡胸腺细胞的总RNA，再用Oligo-dT纤维索富集mRNA后，用RT-PCR分别扩增出鸡CD4和cD8α基因cDNA。将PCR产物克隆进T载体后测序。序列分析显示不同品种鸡的CD4 cDNA序列完全一致；中国地方品种鸡与国外品种的白莱航鸡、RPL7系鸡在CD8α胞外区有6～13个氨基酸的差异，仙居鸡与其他5个中国地方品种鸡在CD8α胞外区有4～5个氨基酸的差异，狼山鸡、北京油鸡和隐性白羽鸡CD8α cDNA的核苷酸序列及推导的氨基酸序列完全一致。这些结果表明，中国地方品种鸡CD4基因序列高度保守；中国地方品种鸡与国外品种鸡的CD8α cDNA序列之间具有遗传多态性，而中国地方品种鸡之间CDSα cDNA序列遗传多态性低，为进一步研究CD4分子和CD8α链的结构和功能提供了条件。     

书讯

由中国科学院遗传研究所程光潮研究员、江苏家禽研究所黄凡美研究员等 5位专家合作撰写的我国第一部地方鸡种种质资源研究专著———《中国地方鸡种种质特性》一书 ,2 0 0 0年 1 0月已由上海科学技术出版社出版发行。该书集作者的多年研究成果 ,并收录了国内其它作者的有关研究资料 ,从我国地方鸡种的起源、分化 ,体型外貌 ,经济性状 ,生理生化特点以及血型、蛋白质 (酶 )多态、染色体、ＤＮＡ指纹等方面对我国近 30个地方鸡种的种质特性进行了系统、深入的阐述。它对深层次认识我国家鸡品种起源、分化 ,遗传相似关系 ,品种特性、特征具有理…     

鲁禽1号麻鸡的选育研究

以山东省优良地方品种琅琊鸡和石歧杂鸡、安卡红等为育种素材,培育出保持琅琊鸡体型外貌特征的专门化品种(系)5个。通过配合力测定,从6个杂交组合中筛选出鲁禽1号麻鸡的配套模式。培育的鲁禽1号实现了地方鸡种良好的体型外貌特征和肌肉品质与引进品种较高的生产性能的有机结合,开辟了地方优良品种的创新利用的新途径。     

山东省家禽品种资源保存现状及对策分析

正我国是世界上家禽遗传资源最丰富的国家之一,我国现有176个地方家禽品种,其中鸡109个、鸭34个、鹅30个、特禽3个。培育品种46个,其中鸡41个、鸭4个、鹅1个;引入品种12个,其中鸡5个、鸭2个、火鸡2个、鸽1个、鹌鹑2个。而我国许多的优良地方品种都具有国外家禽品种所不及的优良性状,这些优良性状是育种的可贵     

新江汉鸡的饲养管理

1新江汉鸡（土鸡） 新江汉鸡作为地方品种之一，具有开产早、产蛋多、耗料少等优点。成鸡一般体重约1．5千克，64周龄产蛋210个。产蛋期日平均耗料85～90克，平均蛋重50克。     

三个品种蛋鸡的蛋品质比较分析

选用30-35周龄的蛋鸡三个品种:东乡绿壳鸡、伊莎鸡和仙居鸡.在相同的饲养条件下,随机收集3个品种蛋鸡同日所产新鲜蛋各5枚,连续5周,总共525枚.测定了蛋重、蛋白高度、蛋黄颜色和哈氏单位等蛋品质指标.结果表明:平均蛋重的大小为伊莎鸡＞东乡绿壳鸡＞仙居鸡;蛋白高度,两个地方品种蛋鸡之间无显著差异,二者均与伊莎鸡存在极显著差异;蛋黄颜色,东乡绿壳鸡与仙居鸡、伊莎鸡均存在极显著差异;哈氏单位,三者之间均无显著差异.通过比较地方优良品种蛋鸡与国外引进品种蛋鸡的鸡蛋品质指标,为禽蛋产品的利用和开发提供参考.     

活体基因库为31个珍贵鸡种“备份”

正日前,在江苏省扬州市江都邵伯镇家禽科研产业基地,31个优秀地方鸡种在陆续"自身净化",被筛选出的优秀、健康后代,将被"备份"到位于仪征市月塘镇的国家地方禽种资源基因库。目前,已有4~5个鸡种完成"自身净化",今后每年还将有3~4个优秀鸡种陆续完成净化。这批从全国各地选拔的31个优秀地方鸡种,是邵伯家禽科研产业基地5万多只鸡中的     

七个鸡种蛋品质比较分析

鸡蛋品质是鸡蛋生产者和消费者都非常关注的性状,为分析蛋品质在鸡种内及鸡种间的差异,本试验测定了5个地方鸡种和2个国外蛋鸡品种各30个蛋共12项常规蛋品质指标。分析结果表明:遗传背景对蛋品质影响较大,2个国外鸡种的蛋重、哈氏单位等指标高于地方鸡种,而地方鸡种在蛋形指数、蛋壳质量、蛋黄颜色以及蛋黄比率上占优,国内蛋用鸡种改良可以选择蛋黄性状为重点选育方向。7个鸡种中,海兰白蛋鸡的蛋壳厚度、蛋壳强度、蛋黄重是最大的,但海兰褐蛋鸡却与之完全相反,两者之间差异显著(P<0.05)。从品种内差异角度来看,商业化鸡种蛋品质变异系数小,国内鸡种整齐度有待进一步提高。     

基于RAD-seq简化基因组测序的19个地方鸡种遗传进化研究

旨在基因组水平上揭示地方鸡种的遗传进化,发掘重要种质特性基因。本研究利用简化基因组RAD-seq测序鉴定19个地方鸡种(每个品种按照家系选取30个个体,10公、20母)基因组SNP标记,计算观察杂合度(Ho)、核苷酸多样度(Pi)、近交系数(Fis)、遗传分化系数(Fst)和基因流(Nm)等遗传统计量指标,分析地方鸡种的遗传多样性和遗传结构,并通过选择信号检测鉴定基因组受选择基因。结果表明,在19个地方鸡种中鉴定出400 562个SNPs标记。瓢鸡(PJ)和文昌鸡(WC)的遗传多样性最为丰富,观察杂合度(Ho)分别为0.246 8、0.243 0,核苷酸多样度(Pi)分别为0.278 1、0.265 5;河南斗鸡(DJ)的遗传多样性相对匮乏,Ho为0.156 0,Pi为0.175 2;东乡绿壳蛋鸡(DX)和边鸡(BJ)的近交系数最高(Fis0.160 0)。瓢鸡与文昌鸡、惠阳胡须鸡(HX)、藏鸡(ZZ)、大围山微型鸡(WX),惠阳胡须鸡与文昌鸡,藏鸡与茶花鸡(CH)间的遗传分化最低(Fst0.100 0),对应的基因流最高(Nm0.240 0)。河南斗鸡与其它品种间的遗传分化均处于较高水平,与其中15个品种间的Fst0.200 0、Nm1.000 0。遗传聚类分析(2个引入品种做外群)将地方鸡种总体上分为5类,与品种形成历史和地理分布基本吻合。通过选择信号分析,在19个地方鸡种合并群体中检测出9个常染色体上的26个区域受到选择作用,包含31个受选择基因。这些受选择基因广泛参与免疫系统调节、生殖机能调控、应激响应、代谢等生物学过程。利用基因组SNP标记能更全面准确地揭示地方鸡种的遗传多样性和遗传结构,选择作用主要体现在对地方鸡种抗逆抗病特性、配子活力及行为等方面的塑造。     

安徽省3个地方鸡品种的遗传多样性分析

运用微卫星标记对淮南麻黄鸡、皖南三黄鸡和五华鸡3个地方品种遗传多样性进行了分析.在5个座位中,共检测到23个等位基因数,平均有效等位基因数为1.5396,杂合度为0.2920,多态信息含量为0.4156.3个地方品种中,淮南麻黄鸡遗传多样性最低,五华鸡遗传多样性最高.根据5个微卫星座位等位基因频率计算群体遗传一致度和标...     

贵州本地纯种土鸡几种内源激素生化指标的测定

20几年前贵州畜禽品种资源调查结果,有5个本地鸡品种列入《贵州省畜禽品种志》,其中包括产于黔西北的威宁鸡、黔北的竹乡鸡、黔东南的小香鸡、黔西南的矮脚鸡和黔中部地区的高脚鸡。这几个地方鸡品种在个体大小、体型结构、羽色性状等均存在较大差异。近年来的研究发现激素与细     

用微卫星标记分析贵州地方鸡种的遗传多样性及亲缘关系

利用20个微卫星座位对贵州12个地方鸡种和隐性白洛克进行遗传分析,得到各品种的等位基因频率、平均杂合度、多态信息含量及品种间的Nei氏标准遗传距离,并进行了聚类分析。结果表明:13个鸡种在各微卫星座位上的遗传杂合度均有差异,平均遗传杂合度为0.6885(贵州地方鸡种为0.6915);平均多态信息含量为0.6297(贵州地方鸡种为0.6326),说明贵州地方鸡种遗传多样性较隐性白洛克丰富。UPGMA聚类分析结果显示,13个鸡种分为2大类群,隐性白洛克独自构成一个类群,12个贵州地方鸡种为另一个类群,12个贵州地方鸡种进一步可分为4个小类群。研究结果对贵州地方鸡种资源的评估、保存和利用具有一定的指导意义。     

我国黄羽肉鸡生产与发展问题探析

我国幅员辽阔,蕴藏着极其丰富的优良鸡种资源。《中国家禽品种志》收录的27个地方品种中,肉质细嫩鲜美的地方品种有惠阳胡须鸡、清远麻鸡、茶花鸡、霞烟鸡、桃源鸡、武定鸡、静原鸡、鹿苑鸡、萧山鸡、寿光鸡、浦东鸡和北京油鸡等,此外,各地尚有一些未收录《中国家禽品种志》中的品种,如海南文昌鸡、广东阳山鸡等。这些地方鸡大多具有适应性强、耐粗放管理、抗病性强、肉质好等特点,但遗传类型并不相似,生产性能普遍较低。据统计资料表明,我国目前黄羽肉鸡年产量为15亿只,其中广东省为8亿只。快大型白羽肉鸡在广东省所占的市场份额由20世纪80…     

南疆地区四种地方鸡外貌特征及繁殖性能比较

本文对新疆天山南麓4个地方鸡外貌特征及500日龄产蛋数、孵化率、21周龄体重、体尺进行两两比较。结果显示,拜城油鸡和阿合奇县地方鸡外貌特征比较接近,和静县地方鸡和塔什库尔干县地方鸡各具独特性;阿合奇县地方鸡500日龄产蛋数最多,塔什库尔干县地方鸡最低,阿合奇县地方鸡、塔什库尔干县地方鸡与拜城油鸡差异显著;4个地方鸡孵化率无显著差异;和静县地方鸡21周龄体重与阿合奇县地方鸡、塔什库尔干县地方鸡差异显著;塔什库尔干县地方鸡胫长和胸宽与其他3个鸡种差异显著,阿合奇县地方鸡胸骨长与塔什库尔干县地方鸡差异显著。