| 运用模型分类法分析9个地方鸡品种间遗传结构和亲缘关系 |
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| 引用本文： | 李慧芳,朱云芬,韩威,宋卫涛,朱文奇,陈宽维.运用模型分类法分析9个地方鸡品种间遗传结构和亲缘关系[J].家畜生态学报,2008,29(5). |
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| 作者姓名： | 李慧芳 朱云芬 韩威 宋卫涛 朱文奇 陈宽维 |
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| 作者单位： | 中国农业科学院家禽研究所,江苏,扬州,225003 |
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| 基金项目： | 国家科技基础条件平台资助
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| 摘 要： | 以16个中度或高度多态性微卫星标记,运用基于模型分类法的 Structure程序推断9个地方鸡品种群体遗传结构,构建聚类图分析相互间亲缘关系,并鉴定群体中迁移个体和具有复杂遗传基础个体的分布.结果表明:Structure程序在预先未标明品种起源的条件下准确推断出9个地方鸡种群体所属类别,揭示按照体型外貌、地理分布等为依据划分的9个地方鸡品种类型,也真实反映了其在遗传上的差异.Structure聚类图在K=2时将9个地方鸡种分为轻体型的鸡种(包括茶花鸡、藏鸡、仙居鸡、固始鸡和白耳鸡)和重体型的鸡种(包括大骨鸡、北京油鸡、鹿苑鸡和萧山鸡)两个类别;K=4、5、6时北京油鸡、固始鸡、大骨鸡分离出来形成独立类群;仙居鸡与白耳鸡在K=6、萧山鸡与鹿苑鸡在K=7、藏鸡与茶花鸡在K=8时仍聚在同一类别中,这与9个地方鸡种的地理分布及形成历史相吻合.9个地方鸡品种群体中均有具有复杂遗传基础的个体分布,迁移个体只分布在藏鸡、萧山鸡和鹿苑鸡群体中.
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| 关 键 词： | 微卫星 地方鸡种 模型聚类法 Structure程序 |
Analysis of Genetic Structure and Relationship among Nine Chinese Indigenous Chicken Breeds by Using Model-based Cluster Method |
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| LI Hui-fang,ZHU Yun-fen,HAN Wei,SONG Wei-tao,ZHU Wen-qi,CHEN Kuan-wei.Analysis of Genetic Structure and Relationship among Nine Chinese Indigenous Chicken Breeds by Using Model-based Cluster Method[J].Acta Ecologae Animalis Domastici,2008,29(5). |
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| Authors: | LI Hui-fang ZHU Yun-fen HAN Wei SONG Wei-tao ZHU Wen-qi CHEN Kuan-wei |
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